Viruses: 4155876
Help
Entry
4155876 CDS
T40000
Symbol
COGV_gp071
Name
(RefSeq) Choristoneura fumiferana granulovirus; helicase-1
KO
K21242
Baculoviridae DNA replication helicase [EC:5.6.2.-]
Virus
56947
Choristoneura fumiferana granulovirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Baculo_helicase
RNA_helicase
His1_capsid
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
4155876
NCBI-ProteinID:
YP_654492
RS:
NC_008168
UniProt:
Q1A4M5
LinkDB
All DBs
Position
NC_008168:59763..63131
Genome browser
AA seq
1122 aa
AA seq
DB search
MSVEDIMNSYENVNETKNLSHNYWYFRNSQNKMVRHQCNDAVFFFKLLMSTLPTQHTWSM
VPNFCSTRVIPFIPYKDYLDLLSKNPNMFEFKTLRNNDIGKVLRVGEYMVWPELSANFLG
WTLYLFINMGYKLPALIPLCHHHDLGNFNLLSNNNHNIDISCKIVRGDQLLFTNTATVPK
YEVLTFDSDTRIYFGSEYVFSKKMWFDFLVNDDSIKTGTFLPDYQFVCQSIDFESLRWID
PCIIPSPFDVEMNNNNTIDTLSPCSKFEIDINNTVDECLKVINEMMLAKCSPSLNNENIL
KFYLTNNKYSTLYILIICIWQYCEATIKMHNQYELEDILYFVKTLCEKLTSDETVFIDHT
VYFSTEKMAKNFLNSLQFFVTPDHGMEQFFDSVSAYFALHLSIFKKTGVWSINSSSIKEA
SDVDITTKSVGFYKKIKINKFDYIFTGGIYENYKNKKDHTIAGIYSACPEVTVSELVFNK
TLNFYMTQSGLFDVCKKIYKEPCPFIVMSTLKKNFISKNQTYLEKDTFKQLYNSINMDLT
LLKIYHARKFLVEFYNVVNNINDCQVVGEKMSTVRQDLIFKWKELVGWLLDCKGTDIVLL
ILKLKDQLTQPIGNIISLAVNVDVLGLKAAIICHLLWPNSSIEKFFWALLCSHYHDFEDW
LEGCDFEVSENVFKNKKKITEGMIYILKRVEYGEDNMDGRVKEMIRNAGECDDKKYEYLR
ILKNVGSYYKKYEKIVNEYNVWSDVLIEYRKNESMYNWLTRFYIRMFLRDLPGNVSEISN
VVMGYTYFRVFTNYHTNNSKALINFCASLIIPFDYEKMCIVLSSKPNCGKSSLWELLSTI
ILVYKQDKEHYKHNKNEKDEKVKKYESQLYVMNEAQLITKAYLKGIVDSTKIDQARCNYG
VMEKFNSTYKTLICNNDEDKIFVTDGYDRACSNRLGQMYFDHEFNESKPFSGSVYEHHIR
KRYCEERDIVSKLAEPVKAFLANVVMYNCDPNDGQLYYKCILQGDNSYKYNKKCLYIYNT
TLEALLYVMNVKECKSAPEFSEEKLIDLIKCAEKYVPHMLHYKRRKHVSVDVLCAEFRRK
YNSSSRFYNSDTKMYNGLQISLDEKYFMKFPPKFKANVDEDV
NT seq
3369 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgtcgaagacattatgaattcttatgaaaatgtgaatgaaacaaaaaatttgtca
cacaattattggtatttccgaaactctcaaaataaaatggtcagacaccaatgcaacgat
gcggtgtttttttttaaattattgatgtcaactttacccacgcaacacacatggagcatg
gtgcctaatttctgcagcactagagtgataccgtttataccatataaagattatttggat
ttattgagcaagaacccgaatatgtttgagtttaaaacattgcgcaacaatgacattgga
aaagtgttgcgtgttggagaatacatggtgtggccagaattaagtgcaaattttttggga
tggactttatacttatttatcaatatgggttacaaactacccgccttaattccgttatgt
catcatcacgacttgggtaattttaatttattatccaataataaccataacattgacatt
tcgtgtaaaattgtgcgtggtgatcaattgttgtttaccaacactgccactgtgcccaaa
tatgaagttttaacttttgactcggacacaagaatttatttcgggtccgagtacgttttt
tcgaaaaagatgtggtttgattttttggtaaacgacgattccatcaaaactggaactttt
ttgcctgattatcagtttgtatgccaaagtattgattttgaaagtttgcgttggatagat
ccttgcattataccgtcaccatttgatgttgaaatgaacaacaataacactattgacact
ttgtcaccatgttcaaagtttgaaattgatattaacaacactgtagatgagtgtttaaaa
gtgattaacgagatgatgctggccaaatgctcgccttctctgaataacgaaaatattttg
aaattttatttgaccaacaataagtattctactttatatattttaattatttgcatatgg
caatattgcgaagctacgataaagatgcacaatcaatatgaattggaggatattttatat
tttgtaaaaacgctttgtgaaaaattaactagcgacgaaacggtttttattgatcacact
gtttatttttccactgaaaagatggcaaaaaactttttaaacagtttacaattttttgta
acgcctgatcatggaatggagcaattttttgattctgtgagcgcctattttgcattgcac
ttaagtatttttaaaaaaacaggagtttggtctataaattcgtcgtcgatcaaagaagcg
tctgacgttgacattactactaaaagtgtgggtttttacaaaaagattaaaattaacaag
tttgattatatttttactggtggtatatacgaaaattacaaaaacaagaaagatcacacc
atcgctggaatatatagtgcttgtccggaggtgacagtttcagagttggtgtttaataaa
acgctaaatttttatatgacacagtctggtttgttcgatgtgtgcaaaaaaatatacaaa
gaaccttgcccttttattgtaatgtcaacgttaaaaaaaaattttatttctaaaaatcaa
acatatttggaaaaggatacattcaaacaattgtacaattccattaatatggatttgact
cttttaaaaatttatcatgcgcgtaaatttttggtggaattttataatgtggtaaataat
attaatgattgtcaggtggtgggagaaaaaatgtcgacggtcaggcaggatttgattttt
aaatggaaagaattagtcggttggttgcttgattgtaaaggcaccgacattgttttgtta
attttaaagttgaaggatcaactgacccagccaataggaaatattatttcacttgctgtt
aatgtggatgtgttgggtctaaaagctgctattatatgtcatcttttgtggccaaattct
agtatagaaaaatttttttgggcgctattgtgtagtcattaccacgattttgaagattgg
ttggagggttgtgattttgaagttagcgagaatgtgtttaaaaacaagaaaaaaattacc
gagggcatgatttatattttgaagcgcgtggaatatggagaagataatatggatggtcgt
gttaaagagatgattcgaaacgcgggggagtgtgatgataaaaaatatgagtatctcaga
attttaaaaaacgttggttcgtattataaaaaatacgaaaaaattgtaaacgaatacaat
gtgtggagtgatgtgttaattgaatacagaaaaaatgaaagtatgtacaattggttgacg
agattttatattagaatgtttctaagagatttgcccggaaatgtttctgaaatttcaaat
gttgtaatgggctatacttattttcgagtttttactaattatcatactaacaattctaaa
gctctaatcaacttttgcgcttcgcttatcataccgtttgattatgaaaaaatgtgtatt
gtgttgtcgtcaaaaccaaattgcggtaaatcttcattatgggaattgctgagtactata
atattggtttacaaacaggacaaagagcattacaagcataataaaaatgaaaaggacgaa
aaggtaaaaaagtatgaatcgcaattgtatgtaatgaacgaagctcagttaataacaaaa
gcttatttaaagggcatagttgacagtaccaaaattgatcaggcgcgttgtaattacggt
gttatggaaaaatttaacagcacttacaagactctaatttgcaacaatgatgaagataaa
atatttgtaactgacggttacgatcgagcgtgtagtaatcgtttaggacaaatgtacttt
gatcatgaatttaacgaaagcaaaccttttagtggtagtgtgtacgagcatcacattcgt
aagcgttattgtgaagaacgagatattgtgtcgaaattagcggaaccggtaaaagctttt
ttagccaatgtggtaatgtacaattgcgacccaaatgatggtcaattatattacaaatgt
attttgcaaggtgacaacagttataaatataataaaaaatgtttgtacatatataacact
acattagaggcgcttttgtatgtcatgaatgtcaaagaatgcaaaagcgcgcctgaattt
agtgaagaaaaattgattgatttgatcaaatgcgccgaaaagtatgtgccgcatatgttg
cattataaaagacgaaaacatgtaagtgttgacgttttgtgtgccgaatttaggcgcaaa
tacaattcatcttcgagattttataattctgacaccaaaatgtataacggtttacaaata
agtttagatgaaaagtattttatgaaatttcctcctaaatttaaggcaaacgttgacgag
gatgtgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
