Viruses: 4155881
Help
Entry
4155881 CDS
T40000
Symbol
COGV_gp080
Name
(RefSeq) Choristoneura fumiferana granulovirus; VP91 capsid
Virus
56947
Choristoneura fumiferana granulovirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Baculo_VP91_N
H_lectin
WIT1_2_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
4155881
NCBI-ProteinID:
YP_654501
RS:
NC_008168
UniProt:
Q1A4L6
LinkDB
All DBs
Position
NC_008168:complement(69986..71956)
Genome browser
AA seq
656 aa
AA seq
DB search
MLSISSVLLVIILFLAVYLFYNKFVINDFNNESYLTRLNVLKEYLKLVGGENRDVVPSKL
AFVTDVQKNKYVVTYFDTNTLKIIGGEVKDETKEIFNFATQSFESVNTNPDAASISFLVN
DNKKFVVHADDGDLIMECNNNGVFDGKQCAVPSICEGANIKLPLTEERLNRLIFNTHQAQ
QRPFNEINESKHHPTAYIQCDTNMVPHIEECLNGETFVDNKCVYDPTIITNGQGTVIFYN
HAKLTKFNLENNHIDTNFNKHHNNLRISEPEVIEKEIKLKNSPEKIALIKRQNYSTKNVS
NVFDEKLNFKKKIALIKHNVKYFTKNKPKLIKEKFNLKNSPEKIALIKHEVKNFAKNIEQ
NNYMIPVNYVHPFDILPCIKHGVGYKFTTNKLANTQFLECLDNNNLFLHTCKSVVDSKFE
CDQEMDCMQFDNGTGSVINTINSFNITFDTGKSVCKDYKIKQILECDTGDFVTTKSFNHP
LQVKLNLNLPKQIYDADADACMDYDVQKISVTNDGFTIDVVNYPELKTSMIGRVSKILNR
KMFDKTDKITSFVTYSRDVDEIAMNPNNFNALDCFDDKQIVVDILDNTKYNFCNNNMLDE
EIHLKLNEYVENGIVKKDLNYKGQCHYKKGEDYFNLYHRQIDGYNCFFTIPKTFEL
NT seq
1971 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctatcaatttcttctgtactgttggtcataattctttttttggcagtctatttgttt
tacaacaaatttgttataaacgattttaacaatgaatcttacttgacaagattaaacgtt
cttaaagaatatttaaaactggtgggaggtgaaaatcgcgatgttgtgccatcaaaattg
gcttttgtcacagatgtacaaaaaaataaatatgttgttacatattttgacacaaataca
cttaaaattattgggggtgaggtaaaagatgaaactaaggaaatatttaattttgcgact
caatcttttgaatcagtaaacactaatcccgacgccgcaagtatcagttttttagtaaac
gataataaaaaatttgtggttcacgcggacgatggtgatttgataatggaatgtaataat
aatggcgtttttgatggcaaacaatgtgcggtgccttcgatatgcgaaggtgccaacatt
aaattaccgttaaccgaagaacgtcttaatagattgatttttaacactcatcaggctcaa
caaagaccgttcaacgaaatcaacgaatcaaaacaccatcccacggcgtacattcaatgt
gacacaaacatggtgccacacattgaagaatgtttgaatggagagacttttgtcgacaat
aagtgtgtttatgatcccactattattacaaacggtcaaggtactgtaattttttataac
catgcaaaattaacaaaatttaatttggaaaacaatcacattgacacgaactttaataag
catcacaacaatcttagaataagtgaacccgaagtaattgaaaaagaaattaaattaaaa
aactcacctgaaaaaatcgcgcttataaaacgtcaaaattatagtacaaaaaatgtgtcc
aatgtttttgatgaaaaattaaattttaaaaaaaaaatcgcgctcattaaacacaacgta
aaatattttacaaaaaataaacccaaactaattaaggaaaaatttaatttaaaaaattca
ccggaaaaaatcgcgctcattaaacatgaggttaaaaactttgccaaaaatattgagcaa
aataattatatgattccggtcaattatgtgcatccttttgatattttaccctgtataaaa
cacggcgtaggctacaaattcacaaccaataaattggccaacacgcaatttttagaatgt
ttggacaataacaatctatttttgcacacttgcaaaagtgtggtggactcaaaatttgaa
tgtgatcaagaaatggattgtatgcaatttgacaacggcacaggttctgttataaatact
ataaacagttttaatattacatttgatactggaaaaagtgtttgtaaagattataaaatt
aaacaaatattagagtgtgatacaggagatttcgtgaccacaaaatcatttaatcatcct
cttcaagttaaattaaatctaaaccttcctaaacaaatttatgacgcggacgcagatgct
tgtatggattacgatgtacaaaaaattagtgttaccaatgacggttttactattgacgtg
gttaattatcccgaattgaaaactagtatgataggaagagttagtaaaatactaaataga
aaaatgtttgacaaaactgataaaatcacctcttttgtaacttatagtcgagacgttgac
gaaattgcaatgaatccaaacaatttcaatgcattagattgttttgacgataaacaaatt
gtagtagacattttggataataccaaatataatttttgcaataataacatgctcgatgaa
gaaattcatttaaaattaaatgaatacgtcgagaatggaattgtgaaaaaagatttaaac
tacaaaggtcaatgtcattacaaaaaaggcgaagattattttaatttatatcacagacaa
attgatgggtacaactgcttttttaccattcctaaaactttcgaactttaa
DBGET
integrated database retrieval system
