KEGG   Viruses: 5076280
Entry
5076280           CDS       T40000                                 
Symbol
SPCFV_gp1
Name
(RefSeq) Sweet potato chlorotic fleck virus; RNA dependent RNA polymerase
  KO
K26628  Betaflexiviridae RNA replication polyprotein
Virus
263004  Sweet potato chlorotic fleck virus
SSDB
Motif
Pfam: Vmethyltransf RdRP_2 Viral_helicase1 Peptidase_C23 AAA_22 2OG-FeII_Oxy_2 AAA_19 AAA_14 AAA_30 AAA_33 Adeno_IVa2 ATPase_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 5076280
NCBI-ProteinID: YP_164258
RS: NC_006550
UniProt: Q5L4G0
LinkDB
Position
NC_006550:63..6335
AA seq 2090 aa
MSLTFRSPAEEALSSFSSVEQSQITRKALATFISIEEREHTFFNYAVKIHAKERLTNAGI
YLSPVSPVPHSHPVCKVLENYLLYKVLPSIIDNSFFFVGIKDNKFAAFKTREPKLDIVTC
INRFVTSHDKNRYFGWRSAKCSVSEFSTTVDKSPCLKDLVPQVLSQRARNIFLHDEIHYW
SRRELITFLEVAKPERVIATLVFPPEILAGSKVSLNRWCYEYEIRECGRNSANGVFNFRA
AFRGDSGKTLFFYPDGVRAEGYEQPLDSGYLLKTRRIVCNDGTVYSVDIVCFKFAHHLIS
ITRGSFVGRSSRSFGDFEAITTRGLSKVSSNMKDAYPICYTTVNRIYRYLRSLVKPDVQS
AVSKLSQTVGEPTGAEIKFVEEFSKLVISTHSVNNLIGKDDFKVLQGLVAGTLPRMFAQK
FKEFRAISLDEFICELAPYSFNVDLVDLKSDTCLDFIFYDVTYGSVTKDPAVLMDKVFTE
GAEGVRLNGLYYCDEPHTHVLELSGAAATGLFSRFIRAYLGNLQHQYSMENLKECICNFK
RWFKISKILGLSFYSMEEETAFRVYRRVRAGKFIRREVMYQRDGLIWFLNRDPKKRGKWY
SGNTKFITGDDRGIAKVDVDVLRIFRRVLIEFTETSKKLIQVEPDKDLPCPLSKSAPQDG
IDEALENSKDSGASIGPLLGTTLSGTAINPEGGDVEEERAFRDEATRRIKEMMSVQATVI
SEIRFEGLKIPIYKLRTLGPLTFNLTDNLGNRVASWYTKGKSVAYSYKGGSHEAKDWLDM
FNNLLILNGLPTDYYDSVLVQEYRAGGGINFHKDDEEIFERGAKVLTVNLNGQCYFSFSS
PKETVSFELVEDSYFEMPRDFQEKYYHGVQGCSMGRISMTFRRLSSTNESGVTKPQSTVP
IEQSGNPTETQNDNKGDSESRDTEASGNSEGGGDDAIEVGQFGYDKHKLANLNLVVKKYC
ESEMSRMLLSKKVVAECNYEGLNRICAYELGLNEQYVKEKADHFEQVLPIKSAEMISDFI
SDHNLDACLYNLMGVTKMFNLQVVLFIPTHCLMIQVEGNNGRVIELAWDVSAQSIKLLRC
ANDCCIRAVADALERPTEQVIEVLRCKGGTDLMEEVTSGQGLELEHFEQVLTLFDICGVC
FGDFDTVLNEGGRLLFYFYVEDGHVEHFVKNRSSSKDKIEALKNREDLLDLKRQDGTIGA
RGGGTFKFRRGRKGFDSKNNYILDLSAIKPASTSLKFISTEQRFSLIKNSLLVGDTGVLF
DKNFDKIGLLESRGWNEWSGMIGVILGVYGCGKSTLFKKLVSKNPRAYIHIVSPRKALAS
EMKLALEESSDAQVRRRGHNTTVSTFERFVQRALQSKFRCDALLIDEIQLYPPGYLDLVV
NLVNPKEGTVFLIGDPCQSDYDSLRDRLTFSNIKPDIEMLLEDKEYKYNFLSRRFRNKNF
IGRLNCVFDESLMNFEEPYVICNSFEECRALAPKYHETFLVSSFEEKKVVSVEFPNCEQI
LTFGESTGRNFRYGTLVITGTSRYVNEKRWVTALSRFSHNLAFLNLTGYGIENVCQQYSG
LALNRFLTAKAGPNELMESLPGKPVLTKGFTSRMGKDYQVKELKLQGDPWLKTMINLGQL
EDFQEEEMGEIISQIESVKTHVPLSYLEGVRATWNDRFKAKEDREFKIKGLITDQFADEH
SKNNGFKLTNAAERFAAIYPRHKSGDTATFLMGVRKRLRFSKPAVECAKYRDAACFGPFM
LKEFLKRVPIRPGRSSVFFDKAVQDFEEKKTAKSTATIENHSGRSNLDWKIDTGLVFMKS
QNCTKFENRFRDAKAAQTIVCFHHIVLARFAPFIRYIEMKVNEALPKNYYIHSGKSLDEL
NNWVIGNDFTRVCTESDYEAFDASQDAYILAFEICLMEHLCLPRDLIEDYKYIKTHLGSK
LGNFSIMRFSGEASTFLFNTIANMLFTFLKYDLNGSESICFAGDDMCANRRLTLKTEHDG
FLSKLKLKAKVCFTSSPTFCGWNLSFYGIYKRPELVFERLCIAKENGNFKECLDNYAIEL
SYAYKLGEKVLPLMDESAVQSYYQCIRIIIQWKHLLKSKIALDFANSVKA
NT seq 6273 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctcttacttttcgctctcctgctgaagaggcactatcctccttctcatccgtcgaa
caatcccaaattacgcgcaaagctcttgccacgttcataagcattgaagagagggaacac
actttctttaattatgctgtcaagatacatgccaaggaacgtttgacgaatgcagggata
tacctctcccctgtttcaccagtaccacattcacatccagtatgtaaggtattagagaat
tatcttctgtacaaagttctcccaagtattatagataatagtttcttctttgttggtata
aaggataataagtttgcagcttttaaaactagagaaccaaagctagatatagtcacctgt
attaatagatttgtcacaagtcatgataagaataggtactttggttggagatcggcgaaa
tgtagtgtgtctgaatttagcactacagtggataagtcgccatgtttaaaggatttagtt
ccccaagtgctaagccaacgtgctagaaatatatttctgcacgatgagattcactattgg
agtcgtagggaactcattactttcttagaggtagccaagccagagagggtcatagccaca
cttgtgtttccaccagagatattggcgggttccaaggtgagcttaaatagatggtgttat
gagtatgagattagggagtgcggtagaaatagtgctaatggagtgtttaattttagggca
gcatttcgtggcgatagtgggaaaacccttttcttttatccagatggagtaagagctgag
gggtatgaacagccacttgattcaggctatctgctcaagactaggagaatagtgtgcaat
gatggtaccgtctatagtgtagatattgtatgctttaagtttgcacaccaccttataagt
ataactaggggtagtttcgtcggcaggtcatctagatcttttggtgattttgaagcaatt
accacaaggggtctaagtaaagtctcatcaaacatgaaggacgcctaccccatatgctac
actactgtaaatagaatatatagataccttaggtcattagtgaagccagatgttcagtct
gctgtgtcaaaattatcacagactgtaggagaacccacaggggcggaaattaaatttgtg
gaggagttctcaaaattggtcatcagcactcacagtgtgaacaatttaataggtaaagat
gattttaaagttctgcaaggtcttgttgcagggacattaccaagaatgttcgcacaaaaa
ttcaaggagtttagggctattagccttgacgaattcatatgtgagttagcaccttattct
tttaatgtggacctagtcgatctcaaaagtgatacatgcttagattttatattctatgat
gtcacttatggctcggtcactaaggatcctgctgtgcttatggataaggtgttcactgaa
ggtgccgagggagtgagattgaacggtctttactactgtgatgaaccgcacacacatgtc
ttggagctgagcggagcagccgcaactggacttttcagtcgatttatcagagcgtatctt
ggtaatttgcagcaccagtatagtatggaaaatcttaaggagtgcatctgcaattttaaa
agatggttcaaaatcagcaagatattgggtctctcgttttattctatggaggaagagaca
gccttcagagtctaccggagagtgagagctggaaaatttatccgtagggaagtgatgtac
caaagggacgggctcatttggttcttgaatagggaccccaaaaaacggggcaaatggtac
tctggaaatactaaatttattactggggatgaccgcggcattgcgaaagtggacgtagat
gtgctacgcattttcagaagagtgctgattgagtttactgagactagcaaaaaattaatc
caggtggagccagataaagatcttccatgcccacttagcaaatctgcaccacaggatgga
attgatgaagcactagaaaattcaaaggacagtggtgctagcattggtcctcttttaggt
acaacactctcagggactgctatcaatccggaaggtggagatgtggaggaggaaagagca
ttcagagatgaagccactagaaggatcaaggagatgatgagtgtgcaagcaacagttatt
agtgaaattagatttgaaggattgaaaatcccaatttacaagttgcgcacattagggccc
cttacatttaatcttacagacaatttgggcaatagagtcgcatcatggtacacgaagggc
aagtccgtggcgtatagctacaaaggtggatcacacgaggccaaagattggttggatatg
ttcaacaatttactaattttgaatggtctaccaactgaytattatgacagtgtactagtg
caggagtatagagccggcggaggtatcaattttcacaaagacgatgaggaaatatttgaa
aggggggctaaagttctcaccgtcaatttaaatggccagtgctacttctctttctcgagt
cccaaggaaacagtgtcttttgaattagtggaggattcatattttgagatgccaagagat
ttccaagagaaatattatcatggggttcagggatgttccatgggaagaatttcaatgaca
ttccggagattgagcagtacgaacgaaagtggggtgactaaacctcaatctacggtgcca
atcgagcagagcggcaatcccactgaaactcaaaatgataataaaggggatagtgaatcc
agggacactgaagcgagcggaaattctgaaggaggtggcgatgatgccattgaagtgggc
caatttggttatgacaagcacaaattagcgaacctcaacctggtcgtaaagaagtactgt
gaaagtgagatgagtagaatgttgttaagcaagaaagtggtggcagagtgtaattatgaa
ggcctcaataggatctgcgcctatgaactaggtttgaacgagcaatatgtcaaagaaaag
gcggatcatttcgagcaagtattgccaatcaaatcagctgagatgatatctgacttcatc
tcagatcacaatcttgatgcttgcttgtacaatctaatgggagtaactaagatgttcaat
ttgcaagttgtattattcatcccaactcactgcctaatgatccaagtggaaggcaacaac
ggcagagtcattgaactcgcttgggatgtaagtgcacaatctattaaattactccggtgt
gctaatgattgctgcataagagccgtggcggacgcactcgaaagaccaactgagcaagtt
attgaggtactgagatgcaagggtggcacagatcttatggaagaagtgacttcgggtcaa
ggccttgaattagaacactttgagcaggtgctcactctctttgatatttgcggggtgtgc
ttcggtgattttgacacagtgctaaatgagggaggtagacttctattctatttttatgta
gaagatggacatgttgagcacttcgtcaagaacagaagttccagcaaagataaaattgag
gctttaaagaatagagaagacctcttggatctcaaaaggcaagatggaacaattggagct
agaggaggtggcacctttaaattcaggagaggtcgaaaggggttcgattccaagaataac
tacattttggacctatctgcaatcaaaccggctagcaccagtctcaagttcataagcacg
gagcagagattcagtctgatcaaaaacagcctgcttgttggtgatacaggtgtgctcttc
gacaaaaattttgacaaaattggactgttagagtcaaggggatggaatgagtggagcgga
atgataggggttatccttggtgtgtacggttgtgggaagagcacactattcaagaagctc
gtgagtaagaatcctagggcctatattcatattgtgtcgccccgtaaggcccttgctagt
gaaatgaagctagctctagaagagagcagtgacgcgcaagttcggagaagaggccacaat
accactgtgtccacatttgagcgtttcgttcagagagcattgcaaagtaagttcagatgt
gacgcactgctcattgatgagatacaactttatccacctggttatctggatttagttgtc
aatctggtgaatcccaaggaggggactgtctttcttattggagacccttgccaaagtgat
tatgactctttgcgggacaggttgactttcagcaacattaaaccagatattgagatgtta
cttgaagataaggagtacaaatataacttcctcagtcgcagatttagaaataagaatttc
attggcaggttgaattgtgtgtttgatgaaagcctgatgaattttgaggaaccttacgta
atatgcaatagtttcgaggaatgtcgtgccctcgcaccaaaataccatgagacattcctt
gtgtcaagttttgaggagaagaaggtagtttcagtggagtttccaaattgtgaacagatc
ctcacgtttggtgaatcaacagggcggaacttcagatatggtacactggttataacgggc
acatcgaggtatgtcaatgagaagaggtgggtaactgctctaagtaggttctcacacaat
ctagcgttcctcaacctaactggttatggaattgagaatgtctgccagcaatattcagga
ttagccctaaatagatttctgacggcgaaggcaggtccgaatgagttgatggagagtctc
ccagggaaaccagtgctaactaaaggattcacaagtaggatgggcaaggactatcaggta
aaggaattgaaattgcaaggggacccatggttaaagacaatgataaacctggggcagtta
gaagatttccaagaggaagagatgggtgaaattattagccaaattgagtcagtaaagacg
cacgtaccactatcatacctagagggagtgagagccacatggaatgaccgatttaaggct
aaagaagatagggagtttaaaattaaaggtttaataactgatcaatttgctgatgagcac
tcaaagaacaatggctttaaactaaccaatgctgccgagagatttgcagccatctaccca
aggcataagagtggtgacacagcaacattcctaatgggtgtcaggaaaagattgagattt
tcaaagccagctgtggagtgtgccaagtatcgagatgccgcctgttttgggccgttcatg
cttaaagagttcctaaaaagagtgcctatcagaccagggaggtcaagtgttttttttgat
aaggctgtgcaggacttcgaggagaagaaaactgcaaaaagtactgccactattgagaat
cactctggtcgctcgaacttggattggaagatagacacaggcttggtgttcatgaagtcc
cagaattgcactaaatttgaaaacaggtttagagatgctaaggctgcgcaaactattgtt
tgtttccaccacattgtcttagctagatttgcgccctttatcaggtatattgaaatgaag
gttaatgaggcgctcccaaagaattattatatccacagtggtaagagccttgacgagtta
aataattgggtcattggcaatgatttcacaagagtgtgcacagagtcggattatgaggcc
ttcgacgcatcacaagacgcctatattctggcctttgagatctgcctcatggaacatttg
tgtcttcccagagacctaattgaggattacaagtatatcaagacacatttgggctctaag
ttgggaaatttttctataatgagattctcaggtgaagcatcaacattcctcttcaacact
attgccaacatgttgttcacttttttgaaatatgatttgaatggttcagagtcaatctgc
tttgcaggtgatgatatgtgtgcgaacaggaggttaacacttaagacagagcatgatggt
tttttaagcaaattgaaattaaaagctaaagtctgctttacatcatcaccgactttttgt
ggctggaaccttagtttctatgggatatataagaggccagaattagtttttgagagactc
tgtatagcaaaagaaaatggcaatttcaaggaatgcctggataattatgcaattgaactc
tcctatgcttacaaactgggtgagaaggtgctccccttgatggacgagagtgctgtgcag
agttactatcagtgtattaggataataatccaatggaagcacttgttaaaaagtaaaatc
gctttagattttgctaatagtgtgaaagcttag

DBGET integrated database retrieval system