Viruses: 5141788
Help
Entry
5141788 CDS
T40000
Symbol
TNAV2c_gp078
Name
(RefSeq) Trichoplusia ni ascovirus 2c; hypothetical protein
Virus
328615
Trichoplusia ni ascovirus 2c
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
AEP_C962R
PriCT_2
D5_N
PRIMA1
TF_AP-2
Mito_fiss_reg
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5141788
NCBI-ProteinID:
YP_803301
RS:
NC_008518
UniProt:
Q06VK3
LinkDB
All DBs
Position
NC_008518:78456..81596
Genome browser
AA seq
1046 aa
AA seq
DB search
MLPRILRRTDCEQTATLVALEHNTCDSIDVGKYAVDSIQYERFLEYYVDLVERGKANLAE
IPSHCSPIRLDIDLKVLSNETGTESFSPRPPSALYTKNDVINIVDCLHKAIKSMKTKNYQ
NDDAEGEQDGDDNDIAYILLEKPPRLDKQYVKHGFHIHTVNGWVTANALRSIISTMKNMI
GDYTFKCGILAHDAIDDVTNKPWLMYGSTKASNMLPYLVTNAYKFEKTTNQWRSILPHDI
LNVINDHSEFMNVEYTPNRWNDPKHHKGIILQTWIYALSIRMSVVNSKRFRIHIKSDNID
DEGASTSSSHAVKRTYSRREAEEHYNEQHNVSQDDDDDDDNLPILSQRLLNSNADDYCNN
LSIWLNALNISRATEQSDWMKTFWAILNCVDEGKITQDQGFHLFDEFSSRCNEKYDAMEV
AHMWNQQLTEKNTKKRLARKAKITVGTIIHNLKKDNPVIWKNILSTTKNSSSSSSSTTTT
KRRRLQNVESLPQPPLPPPPPPPPSESSSSNSSCYFRDESPLNDENEDEDIDFTILSDTD
VDIANVFLKAWKKKIMYLDDVMFKFNGTLWKYAQEEDAFLRRALTVWVEKFKRIADDHVQ
ELKQVEVNEAMAIVNDGGGSRNRTLPKKQPVTRAEYLQKVIDSIWRKCKNSNTQSGIVKA
IKTICTTGAGHDEMVQMDNNENLTAFEDMVFCNETLTMRNGRPEDMLSRCLKCKYIPYEQ
LEPEAIEFVNIFYSSLFPDKEICEYFQLSCSQIFGGRNVFKQYQVWTGVGNNGKSMCIKL
FETMLGRLFSKLNKSVLTSLKHNIGAANPDMYRLRGVRMVVTDELAKSDELNVGQTKLLS
GGDSFIARDLYQKSTQMATIKAQFIPIIVCNDLPLLRDPDEAAWRRERVIPFESYFAYSN
ELEIPEEIPKERIQMRDDNIMVKINKYMPAFASCLLKKYIDFEKLRRSSPYNDDCCEKIP
AKVLLGIKRHRLQQNIIRIVIDTKFSYDPTSNEILTFERLCVLVNDHKRKGRPVELNEII
RTTRELSTLRNYECTQEGVIGLLPLY
NT seq
3141 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgcctagaatactgcgccgtaccgattgtgagcagaccgcgactttggttgcttta
gaacataacacgtgcgatagtatagatgttggaaaatatgcagtggatagtattcaatat
gaacgatttctagaatactatgttgatttagtagaacgaggtaaggctaatttagccgaa
ataccttctcattgttctccgatacgtttagacattgatctcaaagtgttaagtaatgaa
actggtactgaatcgttttcaccgagaccaccatcggctttgtatacaaagaatgatgtt
atcaatatcgtcgattgtttgcataaagctatcaaatcaatgaaaacaaaaaattatcag
aatgatgatgctgaaggagaacaagatggggacgataatgatatagcatatatactcctc
gagaagcctccgcgactagataagcaatatgtaaaacatggatttcacatacacacggtt
aacggttgggttacagccaatgctcttagatcaatcatatcaactatgaagaatatgatt
ggtgactacacatttaaatgtggtatattagcacatgatgctattgacgatgtaacaaat
aaaccttggttaatgtatggtagtacaaaggccagtaacatgttaccttatttagtcaca
aatgcttataaattcgaaaaaactaccaaccaatggagatcaatattaccacatgacatt
ttgaatgtaatcaatgatcatagtgaatttatgaatgtcgaatatacaccgaaccgttgg
aatgatcctaaacatcataaaggaataatattacagacatggatttatgcgttaagtata
cgtatgagtgtagtgaattcaaagcgttttaggatacatataaaaagtgacaacattgat
gatgaaggagcatcaacgtcttcttcacatgccgttaaacgtacatacagtcgtagagag
gctgaagaacattacaacgaacaacataatgtcagccaagatgacgatgatgatgatgat
aatttaccaatattgagtcaacgtttactcaattcgaatgctgatgattattgtaataat
ttatcgatatggttgaatgctttgaacatatccagagccacagaacaaagtgattggatg
aaaacattttgggcaatactgaattgtgtagatgaaggtaaaataactcaagatcaggga
tttcatttatttgacgaatttagttcgagatgtaatgaaaaatatgatgcaatggaagta
gctcacatgtggaatcaacagttaactgaaaagaataccaagaaacgtcttgctcgtaaa
gcaaaaatcaccgtgggaactattatacataatttaaaaaaagataatcctgtaatttgg
aagaatattttatcaactacgaagaattcgtcgtcgtcttcttcttctacaactacaaca
aaaagaagacgtttacaaaatgttgaatcactaccacaaccacctctaccaccaccgccg
ccgccgccgccatcagagtcatcatcgtccaattcgagttgttattttagagatgaatcc
cctttaaacgacgaaaatgaagatgaagacatagattttaccatattatccgacactgat
gttgatatcgccaatgtattcttgaaggcgtggaaaaagaaaatcatgtatttggatgat
gtgatgtttaaattcaacggcaccctatggaagtatgctcaagaagaagatgcattccta
agaagagcattaactgtgtgggttgaaaaatttaaaaggatagccgatgatcacgtacaa
gaattgaaacaagttgaagttaatgaagcaatggccattgtgaacgatggaggtggttca
aggaatcgtacattacctaagaaacaaccagtaacgagagcggagtatttacaaaaagtt
attgattccatatggagaaaatgtaagaacagcaacacacaatccggcatagtgaaggcg
ataaaaactatatgcaccaccggagctgggcacgatgaaatggttcaaatggataacaat
gaaaatttaacagcattcgaggatatggtattttgtaatgaaactttaaccatgcgtaat
ggtagacctgaagacatgttaagtcgttgtctaaaatgcaaatatataccatatgaacaa
ttggaaccggaagccattgaatttgtgaatattttttactcatcgttatttccagacaaa
gaaatatgtgaatactttcaattatcatgcagccaaatattcggaggtcgtaatgtattt
aaacagtatcaagtatggacaggtgttggaaataatggaaaatcgatgtgtataaaattg
ttcgaaacgatgttgggtcgtctattctccaagttgaataaatccgtgttaacaagtttg
aaacacaacatcggagctgcaaatccagacatgtaccgcttacgcggtgtgagaatggta
gttaccgatgaactggctaaaagtgatgaattgaatgtgggccagacgaagcttctgtcc
ggaggtgactcctttatagccagagatttatatcagaaatcaactcagatggccaccata
aaagctcaatttattcctatcatagtgtgtaatgatttaccattactccgggatcctgac
gaagcagcgtggagacgtgaaagagtaataccattcgaatcgtattttgcctacagtaac
gaattagagatacctgaagaaataccaaaagaaagaatacaaatgagagatgataatatc
atggtaaaaattaacaagtatatgccagcgtttgcttcgtgtctactgaagaaatacatt
gactttgaaaaattacgaagatcatcaccttataatgatgattgttgtgagaaaatacca
gcaaaagtattactcggcatcaagagacatagattacaacaaaatattattagaattgtg
atagataccaaatttagttacgatccaacgtcaaatgagattttgacattcgaaagactg
tgtgtgttagtcaacgaccacaaacgcaaaggaagacctgtggaattaaacgaaatcatc
agaacgacgcgagaattatctacattgagaaactacgaatgcacacaagagggtgttatc
ggtctgttacctttatattaa
DBGET
integrated database retrieval system