Viruses: 5228375
Help
Entry
5228375 CDS
T40000
Symbol
GTPV_gp111
Name
(RefSeq) Goatpox virus Pellor; hypothetical protein
KO
K25274
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 133 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
376852
Goatpox virus Pellor
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
rpo132
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_5
RNA_pol_Rpb2_4
RB_A
NOB1_Zn_bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5228375
NCBI-ProteinID:
YP_001293307
RS:
NC_004003
LinkDB
All DBs
Position
NC_004003:106252..109722
Genome browser
AA seq
1156 aa
AA seq
DB search
MDQRLGYKFLSPDPKIGVFYRPLHFQYKSYSNFINYRLQEILSVKRTILSFKNDTEKIII
EIDNIKVTPPEYSPIIASIKGKSYDALVTFTVNIYKEVMTKDGTTITKISSYEGNDSHLI
KIPLLIGYGNKNPLDTAKYVVPNVIGGVFINKQSVEKVGINLVEKLTTWPKFRVIKPNAF
TFSFSSVSPAHILPTKYRHYKILMDLSQLDNCYISSTKTFITVNIILLVQYLSRVSLSFI
KHSLSYDMPSEISYLVNTIIESTKELIKTINDFDIDTYINDLIISEYNKQKSQLMLEEFK
HEMINNFLPHMNDTPNQLKGFYIMSLLRKFIYCIYYTSRYPDRDSMVCHRVLTYGKYFEI
LAHDELENYIGNIRTDIINNHKNRGTYSVNIHVLTTPGFNHAFSGLLSGKFKKTDGSYRT
HSHYSWMQNISIPRSVGYYPDQVKISKMFSVRKYHPSQYAYFCPSDVPERGPQVGLVSQL
SVLTSITNICTNEYLELEKKICNYIRSYNHNDISYFETGYYITLENSLIASLNPNLVDDF
VIDFRRKKRMNYFGNLEIGITLVNDHMNEIRINIGGGRLIRPFLVIDNGNLIMDEISSEL
EFKIDDMTFSDIQKEFPHVIEIVDIEQFTFSNVCESVQKFRALPKSEKCKYHLCDFPAEF
KDGYVASSLVGINHNSGPRAILGCAQAKQAISCLSSDIRNKIDNGIHLIYPERPIVISKA
LETSKIAVNCFGQHVTIALMSYKGINQEDGIIIKKQFVERGGLDIITAKKHQVEIPLENF
NNKERVKSTAYSKLESNGLVRLNAFLESGDAIARNISSRTLEDDFVQDNQISFDISDRYT
DMYQSRVERVQVDLTDKVKVRVLTMKERRPVLGDKFTSRTSQKGTVAYIADETELPYDEN
GIKPDVIINSTSIFSRKTVSMLIEVILTSAYASKPYNNDGQNRPICFPSSNETSIDTYLD
FAKRCHRDRYPSLSDDDINDKMFCDTILYDPETDKPYSSKIFMGPIYYLRLRHLTQDKAT
VRCRGKKTKLIRQANEGRRRGGGIKFGEMERDCLIAHGAANTITEVLKDSEEDYQDVYVC
ENCGDITAQIQGNKVCIRCSKQNLSTILTKVDTTHVAKVFITQMNARGVKVKLEFEKRNP
LFYKPLDVVDLSPSFL
NT seq
3471 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaccaaagattaggatataagtttctttctcctgatccaaaaattggagtattttat
agaccgttacattttcaatataaatcgtattcaaactttattaattacagattacaagaa
attttatcggttaaaagaactatattgtcgtttaaaaatgacactgaaaagattataatc
gaaattgataatataaaagtgacaccgccagagtattcacctattatagctagcataaaa
ggaaagagttatgatgcattagtaacatttactgtgaacatttataaggaagtaatgaca
aaagatggaactactataaccaaaattagtagttatgaaggtaatgattctcatttaatt
aaaataccattattaataggttatggaaataaaaacccattggatacagcaaaatatgtt
gttccaaatgttatcggtggtgtatttattaataaacaatctgttgaaaaagtaggaata
aatttagtagaaaaattaacaacatggccaaaatttagagttattaaaccaaatgcgttt
actttttctttttcatcagtttcaccggctcatatactaccaactaaatatagacattat
aaaatactaatggacttatctcaattagataattgctatatttcatcgactaaaacattc
ataacagttaatataattttattggttcaatatttatctagagtaagtttaagctttata
aaacacagtttatcttatgacatgccttcagaaatttcgtatttggttaacacaataata
gaaagtacaaaagaattgataaaaacgataaacgattttgacattgacacatacattaat
gatttaataatatctgaatataataaacaaaaatcgcaattaatgttggaagaatttaaa
catgaaatgataaataattttctaccacatatgaatgacacacctaaccaactaaaaggt
ttttatattatgtcattattaagaaaatttatttattgtatttactacacgtctagatat
cctgatcgtgattcgatggtctgccatagagttttaacatatggaaaatactttgaaatt
ttagcacatgacgagttagaaaattacataggaaacatacgaacagacattatcaataat
cataaaaatagaggaacttattcagtaaacatacatgtattaacaacaccgggatttaat
catgcgttttctggattattaagtggaaagttcaaaaaaacagacggtagttacaggact
cactcacattattcttggatgcaaaatatatccattccaagaagtgttggttattacccg
gatcaggttaaaatttctaaaatgttttcagtaagaaaatatcatccaagtcaatatgca
tacttttgtccttcagatgttcctgaaagaggtccacaagtaggtttagtgtcacaatta
tctgttcttacatctattaccaatatatgcacgaatgaatatttagaattagaaaaaaaa
atttgtaattatatacgatcatataaccataacgatataagttattttgaaactgggtat
tatataacattagaaaattcattaattgcttctcttaatccaaatttggtcgatgatttt
gtcattgattttagaagaaaaaaaagaatgaactattttggcaacttagaaataggaatt
acattggttaatgatcatatgaacgaaattagaattaacataggagggggtagattaatt
agaccatttttagttattgataatggtaatcttatcatggatgaaatatcttcagaactt
gaatttaaaatagatgatatgacattttctgatatacaaaaagaatttccacatgttatt
gaaatagttgacattgaacaatttacatttagcaatgtatgtgaatcagtgcaaaaattt
agagctcttcccaaatctgaaaaatgtaaatatcatttgtgtgactttcctgccgaattt
aaagatgggtatgttgcatcttcactggttggtataaatcataattctggccctagagct
attttgggatgcgcacaagcaaagcaggccatatcttgtttaagttcagatatacgaaat
aaaatagataatggtatccatttgatttatccagaaagacctattgttattagcaaagca
ttagaaacatctaaaatcgcggtaaattgctttgggcaacatgttactattgcattaatg
tcttataaaggaataaatcaagaagatggtattattattaaaaaacagtttgtagaacgc
ggaggtttagacataataactgctaaaaaacatcaggtagaaatcccattagagaatttt
aataataaagaaagagttaaatctacggcttactcaaagttagaaagtaatggcttagta
agactaaatgcgtttttagaatcaggagacgctattgccagaaacatatcgtcgcgaaca
ttagaggatgattttgttcaagataaccaaattagttttgacatatctgatagatatact
gatatgtatcaatcacgggttgagagagttcaggtagatctaacagacaaagtaaaagtt
agggttttgacaatgaaagaaagacggccagtattaggtgataaatttactagtagaact
agtcaaaaaggaacagtagcgtatatagcagatgaaacagaattaccatatgatgaaaat
ggaattaaaccagatgttataattaattctacatctatattttcaagaaaaacggtttct
atgttaattgaagttatattaacatcagcgtacgcaagtaagccatataataatgatggt
caaaacagaccaatatgcttccctagtagcaatgaaaccagcattgatacatatttggat
tttgccaaaagatgtcacagagatagatatccaagtttatcagacgatgatataaatgat
aaaatgttttgcgatacaattttatatgatcccgaaacagataaaccttattcgtcaaaa
atatttatgggtccgatatattatcttagattgcgtcacctaactcaggataaggcaaca
gttcgatgccgaggtaaaaaaacaaagctaatacgtcaagctaacgaagggcgtcgacga
ggcggtggtattaaatttggagaaatggaaagggattgtttaatcgcacacggtgcagca
aacacaataacagaagtattaaaagattcggaagaggactatcaagatgtgtatgtttgt
gaaaactgtggagatataacagcacagatacaaggaaataaagtttgtattaggtgctct
aaacaaaatttatctactatactaaccaaagttgatacaacacatgtggcaaaggttttc
ataactcaaatgaatgcaagaggcgtgaaggttaaactggagtttgaaaaacggaaccca
ttattttataaacctctggatgtggtagatttaagtcctagttttttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
