Viruses: 54968949
Help
Entry
54968949 CDS
T40000
Symbol
HOQ64_gp153
Name
(RefSeq) Cyanophage S-RIM12 isolate RW_01_0310; baseplate wedge subunit
Virus
2790347
Cyanophage S-RIM12 isolate RW_01_0310
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
54968949
NCBI-ProteinID:
YP_009779061
LinkDB
All DBs
Position
NC_047715:48279..50771
Genome browser
AA seq
830 aa
AA seq
DB search
MNVPLPVDQATTVEFREYPLSEIRNSSINYQIDKRDSVAIMHPSIALPAVSGGGLPPASG
ATCGKVFRAATCLDVSQWVYDYVPNELSFDLGFSDRYFSYLYDTSDNAGHVGIACYYLET
RNSTNTTASTPASGTEGQPDYVAGTPGVSTTTSSTVCKPCTAFTCATSKTTISYSGTENV
TGDPDAPHPTLFAIGTDSDKVVVSYDSLSTTIPNGVTDMEFSYDGVTYTDVWDQTTQAGL
VYDSPQNPFVTGQNQLTDFEIYDLDVGLATGFRIKVAITSIADDTAEPGPTFSGVRWQIT
ELMDPGADYAVGTVIPLTYAYTKPDNTVVNLTMNLKITGVGPTTSVLSQAGFNILRVGDT
LNGHTVTRAFHTDIDNFPYHVIYLNGSGSNFVKDTQYTSDRNHVVTAHAGFGIIDRGILV
GKYEFSDKSIQYSTVDVDKNAPDVFNTLKQPDVTLSVSNGRVTGATIVSGGAGWKDGATL
SVSSPQDAFKFELDDDGRVESVVTNPKNESNIAKLEGTFTNGVLTAVTVVDGGKGYNTVL
TNVDEDGNEYTEENLPTVFVSDIVNYKTSTAPNAAYEPEKADDYMDTLGKFPQDISPELE
NQIFSGFDQDPKYIDNIPASNINQKRDPERLKIDKQPQRLYSAASVDEYRETYELKGDLT
EDILAPDFDSSIKDAVLKGYNDEVNARKEHSDALVQEVIPESTIGNEALIETVQGTFNDI
PVASTYTKYFMKQYRPDPTSEVTLKVTLGCEVAQAGCGHVPCSPVPSVGSTTNNPDGSTD
VVTFTPQVGPLGGGCRNWSATGNLPILHDMTSSGNTFREACDAFGNPYAT
NT seq
2493 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatgtaccattacctgtagatcaagcaaccactgtagagtttcgtgagtatccactt
tcagagattcgtaatagtagtatcaactatcagattgataagagagatagtgttgcgatt
atgcacccaagtattgcattaccagcagtatctggtggcggtttacctcctgctagtggt
gcaacctgtggaaaagtgtttagagcagcaacttgtcttgatgtaagtcaatgggtctat
gattatgtacctaatgagttatcgtttgacttaggatttagtgatcgatatttttcgtat
ctatatgacacatcagataatgctggtcatgttggtattgcttgttattacttagagact
agaaatagtacaaataccactgctagtactcctgcaagtggtacagaggggcaacctgat
tatgttgctggcactcctggtgtatcaactacaacttcatcgactgtttgtaaaccttgt
acagcatttacatgtgctacaagtaagactactatatcctattctggtacagaaaatgta
acgggcgaccccgacgcgccgcatcccacattatttgcaattggtacagattcagataaa
gttgtagtatcatatgattcgttaagtaccacaataccaaatggtgttactgatatggag
ttttcatatgatggtgtaacttatactgatgtatgggatcagacaacacaagcaggtctt
gtatacgattcacctcaaaatccatttgtaactggtcaaaatcaattaactgactttgaa
atttatgacttagatgttggtcttgcgacaggattccgaattaaagttgctattacatca
attgcagatgacactgcagaacctggacccaccttttctggtgttagatggcagattaca
gaactcatggaccctggagcagattatgcagtaggtacagtaattcctttgacgtatgca
tataccaaaccagacaatacagttgttaatttaacaatgaatttaaagattactggagtt
ggtcctactacatcagtattatctcaggcaggatttaatattctaagagtaggtgatact
cttaatggacatacagtaactcgtgcttttcatactgatattgataattttccatatcat
gtcatttatttgaatggtagtggtagtaattttgttaaagatacgcaatatacatctgat
aggaatcatgtagttactgcacacgcaggatttggcattatagacagaggaatactagtt
ggaaagtatgaattttctgataaatctatacaatatagcactgtagatgttgataaaaat
gcaccagatgtgtttaatactcttaaacaaccagatgttactctatcagtatcaaatgga
cgagtaacaggtgccacaatcgtctctggaggtgctggatggaaagatggtgctactctt
tcggtaagttctccgcaagatgcttttaaatttgagctagatgatgacggtcgtgtggaa
tccgtagtaacaaaccccaaaaacgagtctaatattgctaaattagaaggaacttttact
aatggagtgctaactgcggtaactgtagtcgatggcggtaaaggatataacacagtattg
acaaatgtggacgaagatggtaatgaatataccgaagaaaatctacctaccgtgtttgtg
agtgatattgtaaattataagacaagtactgctccaaatgcagcatatgaacccgaaaaa
gcggacgattatatggatacattgggtaaatttcctcaagatatctctccagaactagaa
aatcaaatttttagcggatttgaccaggatcctaagtatattgataatattcctgcatca
aatatcaatcaaaaacgcgatcctgagcgattaaaaatcgataaacaaccgcagagacta
tattctgcggcatctgtcgatgaatatagggaaacttatgagttaaaaggtgatttaaca
gaggatattctcgctcctgactttgatagtagtattaaagatgctgtcttaaagggttat
aatgatgaagttaatgcaagaaaggaacattctgatgcattggtgcaagaagtaatccct
gagtctacaattggtaatgaagcattgattgaaacagttcaaggtacatttaacgatatt
ccagttgcatcaacgtatactaaatattttatgaaacaatatcgtccagatccaacttcg
gaggttacactgaaagttactcttggttgtgaagttgctcaagcaggatgtggacatgtt
ccatgctctcctgtaccatctgtagggagcactacaaataatcctgatggttctacggat
gtggtcacatttactccacaagtaggacctttggggggtggttgtagaaactggagtgca
actggaaacttacctattttgcatgatatgacttcatctggcaatacttttcgtgaagca
tgtgatgcttttggaaatccttacgctacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
