Viruses: 54970533
Help
Entry
54970533 CDS
T40000
Symbol
QLX29_gp142
Name
(RefSeq) Staphylococcus phage Staph1N; PolAn/PolAm/PolAc
KO
K26645
Herelleviridae DNA polymerase
Virus
1195076
Staphylococcus phage Staph1N
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
DNA_pol_A_exo1
DUF4291
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54970533
NCBI-ProteinID:
YP_009780616
RS:
NC_047722
LinkDB
All DBs
Position
NC_047722:join(102288..103157,103956..105314,106397..107386)
Genome browser
AA seq
1072 aa
AA seq
DB search
MKVLILFDHIREEHFSVSKDGSVKSNVLNTPNGKTLKKLLEKCSNLKRDKTNRDYDIDFL
YNAVPTPIRNDYGKIIKYQDVKQAEVKPYYERMNNIIIDNSYDMVIPVGKLGVKYLLNVT
AIGKVRGVPSKVTIENGTSSHDVWVLPTYSIEYTNVNKNSERHVVSDLQTVGKFVEQGEE
AFKPKEVSYELVDNIERVREIFNKEVKNDNYDGVDITAWDLETNSLKPDKEGSKPLVLSL
SWRNGQGVTIPLYKSDFNWENGQDDIDEVLELLKNWLASKEDIKVAHNGKYDIKFLMSTE
NFKDFESIQDTKVGWYLAVTQEVKESLRLSDLAYEVTDVGGYDKPLEDFKLWFVTKLLRF
FSDKIKEIQKENKKIAKKEYDVKAPEYKEWLENKLNETVVELDDTEKKFRVSELEKKYIQ
LGLSPEIVNMNLVMDNDEFINIAEQSPEYMGLSDYAKSYTLNTAINLINEYRDVKDVVND
IDGGNFNYDWFPIELMHPYASGDTDVCRRIHCDVIKKLKEQDRPKSMHLLEVNYPRLTKS
LARIESNGLYCDLDYMKENDESYESEMAKNHATMREHWAVKEFEEYQYNLYQMALEEHEK
KPKDRDKDIHQYRDKFKDGKWMFSPSSGDHKGRVIYDILGIQLPYDKEYVKEKPFNANVK
EADLTWQDYKTDKKAIGYALDNLELKDDVKELLELLKYHASMQTKRNSFTKKLLNMINKQ
KRTLHGSFSETGTETSRLSSSNPNLQNLPAHTSDVNKFDYKHPIKRSFVSRFENGVLLGS
DYSALEMRIIGLFTKDPDMLQSFLNGEDIHKATASIVYNKPVEEVTKEERQATKAVNFGL
AFGESPFSFAGKNNMEVSEAEEIFEKYFQTKPSVKTSIDNVHEFVQQYGYVDTMHGHRRF
IRSAQSTDKKIKNEGLRQSFNTIIQGSGSFLTNMSLTYLDDFIQSRNLKSKVIATVHDSI
LIDCPPEEAKIMAKVTIHIMENLPFDFLKAEIDGKEVQYPIEADMEIGLNYNDMVEYDEE
EIDTFNSYQGYIKYMMNLQTLEDYKESGKLTDEQFEKATNVVKSEKHIYQEI
NT seq
3219 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtattaatcttatttgaccacattagagaagagcatttttctgtaagtaaagat
gggagtgtgaaatctaatgtactaaatacacctaacggaaaaacacttaagaaattactt
gagaagtgttctaacttaaagagagataaaacaaacagagattatgatattgattttctc
tacaatgcagtacctacacctattagaaatgactacggtaaaatcattaaataccaagat
gttaaacaagcagaagtaaagccatactatgagagaatgaataatattattattgataat
tcttatgatatggtaattcctgtaggtaaactaggtgttaaatacctattaaatgttaca
gctattggtaaagtaagaggtgtaccaagtaaagtaactattgaaaatggaacatcttct
catgatgtgtgggtattacctacttatagcattgaatatactaatgtaaataaaaatagt
gaacgtcatgtagtatcagatttacaaacagttggtaagtttgtagagcaaggagaagag
gcatttaaacctaaggaagtatcttacgagttggtagataacattgaaagagtaagagaa
atattcaataaggaagtaaagaatgataattatgatggggtagatattaccgcatgggac
ttagagactaactcattaaaacctgataaagaaggaagtaaacctttagtactatctcta
tcatggagaaatggtcaaggtgtaactatacccttatacaaatcagactttaactgggaa
aacggtcaagatgatattgatgaagtcttagaattgcttaagaattggttagctagtaaa
gaagatattaaagtagcacataacggtaaatatgatattaagttcttaatgagtactgaa
aactttaaagattttgagagtattcaggatactaaagtaggttggtacctagctgttacc
caagaagttaaagaatctttaagattatctgatttagcttatgaggttacagatgtcgga
ggctatgataaaccattagaagactttaaattatggtttgttactaagttattaagattc
ttctcagataaaattaaagagatacagaaagaaaataaaaagattgctaagaaagagtat
gatgttaaagctcctgaatataaagaatggttagagaataaattaaatgaaacagtagta
gaactagatgatactgagaaaaaatttagagttagtgaattagagaaaaagtatattcaa
ctaggtctttcacctgaaattgtaaatatgaatttagttatggataatgatgaattcata
aatattgcagaacaatcacctgagtacatggggttatctgactacgctaagtcttacacg
ttaaatactgcaattaatttaattaatgagtatagagatgtaaaagatgtagttaatgat
attgacggaggtaactttaattatgattggttccctattgagttaatgcatccatacgca
tcaggagatactgatgtatgtagaagaattcattgtgatgtaattaagaaacttaaagaa
caagatagacctaagtcaatgcatttattagaagttaattacccaagacttactaagtct
ttagctagaattgaatcaaatggtttatattgtgacttagattatatgaaagaaaatgat
gagtcatacgagtctgagatggctaagaaccatgctacaatgagagagcactgggctgtt
aaagaatttgaagaataccaatacaatctttaccaaatggcgttagaagaacatgagaaa
aagccaaaagatagagataaagatatccatcagtacagagataaatttaaagatggtaaa
tggatgttttccccaagttccggagaccataaaggtagagtaatttatgatattctagga
attcaattaccttatgataaagaatatgtcaaggaaaaaccatttaatgctaatgttaaa
gaagcagaccttacttggcaggactataaaacagacaagaaagctattggttatgcgtta
gataatttagaattaaaagatgatgttaaagagcttcttgaattacttaaatatcatgct
agtatgcagacaaaacgtaattcatttactaagaaattacttaatatgattaataaacaa
aaacgaacattacatggttctttttctgagacaggcacagagacatcaagactaagtagt
agtaaccctaatttacaaaacttacctgcacacacatcagatgtaaataagtttgattac
aaacatccaattaaacgttcatttgtttctagatttgaaaatggagtactgctagggtcc
gactatagcgccctagagatgcgtattatcggattatttactaaagaccctgatatgcta
caatcattcttaaatggggaagatatccataaggctactgcaagtattgtttacaataaa
ccagtagaagaagtaactaaagaagaacgacaagcaactaaagcagttaacttcggatta
gcctttggtgaatcacccttctcatttgcaggtaaaaataatatggaagtaagtgaagca
gaagaaatatttgaaaagtatttccaaacaaaaccaagtgtaaaaacttctattgacaat
gtacatgagtttgtgcaacaatatggttatgttgatacaatgcacggacatagaagattt
atccgttcagcccaatcaacagataaaaagataaaaaatgaaggtctaagacagtcattt
aacactatcatccaaggttcaggtagtttcttaacaaacatgtctttaacttacttagat
gattttattcaatctcgtaatttaaaatcaaaagttattgccacagtacatgatagtatc
ttaattgattgtcctcctgaagaagctaaaattatggctaaagtgacaattcatattatg
gaaaacttaccatttgatttcttaaaagcagaaattgatggaaaagaagtacaatatcct
attgaagccgatatggaaattgggttaaactataatgatatggttgaatatgatgaggaa
gaaatagatacatttaattcttaccaaggttatattaagtatatgatgaatttacagacc
ttagaagattataaagagtcaggtaaactaacagatgaacaatttgaaaaggctactaat
gttgttaaaagtgaaaaacatatttatcaagaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system