Viruses: 54974734
Help
Entry
54974734 CDS
T40000
Symbol
HOQ97_gp12
Name
(RefSeq) Vibrio phage Vc1; putative internal virion-like protein
Virus
1480731
Vibrio phage Vc1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RuBisCO_activase_AAA_helical
CHASE3
DUF4355
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54974734
NCBI-ProteinID:
YP_009784712
RS:
NC_047746
LinkDB
All DBs
Position
NC_047746:11607..15293
Genome browser
AA seq
1228 aa
AA seq
DB search
MAELERRSLLDRTPTHVPLSILNEEYQPPTPDVEEPSIGDVWDAATYRHWVGESLGRNYA
AQETGTDPEYSVSMQQLTEYNDKGYTEQELEFLSGSTSNENLAHRETQIANDRQAVQTIQ
QAGVSGMAVETVAAVFDPSMIPMMFVGAPTALGTKSTTLGKIGWSMLRGAGEGVLSEYML
KQGDTQRTSQDLLYSAVGGMAFSGAIDLSVLGAGAARNALKRADTVEGTQRAAFNDFDRG
TGYQKADDVLKNYQQDPVARKRTLTEKEVIDTLRAEAGERIDVLSPKKVKKLKDEFRAYK
KSKLELIEKIKARPKLKPTARKAEIKQLEDAIARRQNELDDKINLNKAGVQSNASIDALQ
QGKVPDAMMARYKQLKAESGEFDVTGNKMDKITAGHKIAPTEEEPDPVLMQSVGAMRTRT
EFDDIQTWDSLLSESDVDEITSALSASEELGSTLPRNNKIGEVPQGLRSLYTELDGAPDQ
ATRGLNAMLLKNPQRTTKGLQSAEELADTLFHRAVPDYLDYTNAFDAYAKDRGVGRFDIG
KRNELEQEFDRETVMMQVSGNLLSNKPVDGDSAVMLGAKARSRLYEQGLKNNQDYNVVGF
DKIKHRHEYHSVVFDQDNLRRMTGEHADFIYDAIASAYQTGAIRLTRENAIRLAETQVAR
TMAVKGKANKSFDRFMSDAEFKKIEEELSAQGVERDIINDIKESLFDAEKMGEISPRAMF
SLRPNLKARSGDVWLVDLLDTGIARNMKYVSDSAANAGLASNGFHSRHQFQRAVASARDA
AINSLRNDVDLYKGEKAGKQAEKALADVVEGRYANKLDEALRLLYREPLEDGDGLKDVTR
LLRKATSVTRLRTTGLATLPEGATASVRNGIINTLRQIPATRWFDFRESSVTKDKFMMDF
SRTFSATGHQEYLFGRKFYNGSDFDDATKDSLKRVDKNLGHALDVTMTVNGFKTFQHGGE
EMVARSIVNNLRDMSMKGEVTSNIRSSLIDVGGMSEEQVERMVKHFKDNDMDVFDSVRLM
DADLHNSLSTAVRNTIGHSYLRMSIGEQPAYMNKEMGKIMTTLMSFTIGSYEKMLMRGIK
NERAVLLSITAGQAVLGYGALVANTYIQAQGMEDSKRRKYINEKLSSEGMFWGTMARVGV
FATPIIPLQILNTVGALPEEMKGAGRMGGVQSSALVADALQATSAAGQLAFKNQNKREQE
ADWNAIKRVLPWYNSTMYNLTIGTATKD
NT seq
3687 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgagttagaaaggcgttctctgcttgacagaacaccaactcatgtacctctttcc
attctgaatgaggaatatcaaccaccaacaccagatgtagaagaaccgagcatcggtgat
gtgtgggatgctgctacatacaggcactgggtaggggagtctcttggtcgtaactacgca
gctcaagagacagggactgacccagagtattcagttagtatgcagcaacttacggagtat
aatgataaaggctatacggaacaagagcttgagttcttatctggcagtacgtcgaatgag
aacctagctcaccgtgaaacacagatagcaaatgaccgacaagcagtgcagactatacag
caagctggtgtatctggaatggctgtagagacagttgctgctgtctttgacccatctatg
ataccgatgatgttcgtaggagcaccgaccgctcttggcactaagtctactactcttggt
aagattgggtggtctatgctacgtggtgctggtgaaggtgtgctatctgagtacatgctt
aagcaaggtgatacccagagaacaagccaagatttactgtattctgctgtaggtggtatg
gctttctctggcgctattgacttgtcggtacttggtgctggtgctgcacgtaatgcactt
aaacgtgctgatacagtagaaggcacgcaacgagctgccttcaatgacttcgacagaggc
actggataccagaaggctgatgatgttcttaagaactaccagcaagacccagtggctcgt
aagcgtacactgactgagaaagaagttattgacactctacgtgcagaagctggtgagcgt
attgatgtactatcacctaagaaagttaagaagctaaaggatgagtttcgtgcttacaag
aagtcaaagcttgaactaatcgagaagattaaagctagacctaaactgaaaccaacggct
cgtaaggcagagattaagcagctagaagatgctatagctagaagacagaatgagcttgat
gacaagattaatctgaacaaggctggtgtacaaagcaatgcttcgattgatgcgctacaa
caaggcaaagtaccagacgctatgatggctcgttacaagcagcttaaagctgagagcggt
gagttcgatgtaacaggtaataagatggataagattaccgctggtcataagattgcacct
actgaggaagagccagacccagtgcttatgcagtctgttggtgctatgcgtactcgtact
gagttcgatgatatccagacttgggattcgcttctctctgagtcagatgttgatgagatt
acttcagcactttcagcatcagaagagttaggctcaacacttcctcgtaacaacaagata
ggtgaagtgcctcaaggtcttcgttctttgtacactgaacttgatggagcacctgaccaa
gcaactcgtggtcttaatgcgatgctccttaagaaccctcagcgtacaactaaaggtttg
cagtctgctgaagaactggctgatacattgttccaccgtgcagttccagattaccttgac
tacaccaatgcgtttgatgcttatgctaaagaccgtggagttggtaggtttgatattggt
aagcgtaatgagcttgagcaagagttcgaccgtgagactgttatgatgcaggtatctggt
aatctcttgagcaacaagcctgttgatggtgacagtgcagtaatgttaggtgctaaggct
cgctctcgtctgtatgagcaaggtcttaagaacaatcaagattacaatgtagttgggttc
gataagattaagcacagacatgagtaccactctgttgtgttcgaccaagacaacctaaga
cgtatgactggtgaacatgccgactttatctatgatgctattgcaagtgcgtatcagacg
ggtgctataagactaactcgtgagaacgcaatcagactagcagagactcaggttgctcgt
actatggcagttaagggtaaggctaacaaatcatttgacagattcatgtcagatgcggag
ttcaagaagattgaagaagagctaagtgctcaaggtgttgaacgtgatattatcaacgac
atcaaggagtctttgttcgatgcagagaagatgggagaaatctcacctcgtgcaatgttc
tctctacgtcctaacctaaaagctcgttcaggtgatgtgtggcttgttgacttactagat
acaggcatagcacgtaacatgaagtatgtgtctgactcagccgctaatgctggcttggca
tctaatggcttccactcaaggcaccagttccaacgtgcagtcgcttcagctcgtgatgca
gctattaactcccttcgtaatgatgttgacttatataaaggagagaaggctggtaagcaa
gcagaaaaagctctggctgatgtagttgaaggtagatacgcaaacaaacttgatgaggca
ttacgtctgctgtatcgtgagccactagaagatggtgacggtcttaaggatgttactcgt
ctacttcgtaaggctacgtctgttacacgtctacgtaccacaggtctagctacattacct
gaaggtgcaactgcttcagtgcgtaacggtatcattaatactcttcgtcagattccagct
actcgttggtttgacttcagagagtctagtgttactaaggataagttcatgatggacttc
tcacgcacattctctgctactggacaccaagaatacttgttcggtcgtaagttctacaac
ggctctgacttcgatgacgcaactaaggatagtctaaagcgtgttgataagaacctaggt
catgcacttgatgttactatgacagtgaatggattcaagactttccagcatggtggtgaa
gagatggtagctcgttctatcgtcaacaacctacgtgatatgtctatgaaaggcgaagta
acttctaacatccgtagctctcttattgatgttggtggtatgtcagaagagcaagtggaa
cgtatggtcaagcacttcaaagataacgacatggatgtgttcgattcagtacgccttatg
gatgctgacttgcacaactcccttagcactgctgtgcgtaacactatcggtcactcgtac
ttgcgtatgtccatcggtgagcagccagcttacatgaacaaggagatgggtaagattatg
actactcttatgtctttcaccattggttcatatgagaagatgcttatgcgtggtattaag
aatgaacgtgctgttcttctttctataactgctggtcaggctgtccttggttacggtgcg
ctagtagctaacacgtacatccaagcacaagggatggaggatagtaagcgacgtaagtac
atcaatgaaaagttgagtagtgaaggcatgttctggggtacgatggcacgtgttggtgtg
ttcgcaactccgattataccactacagattcttaacacagttggtgcattgccagaggaa
atgaaaggtgcagggcgtatgggtggtgttcaatcatctgccctagttgctgatgcacta
caagctacttctgctgctggacagcttgcattcaagaaccaaaacaaacgagagcaagag
gctgactggaatgcaatcaagagggttcttccttggtacaatagtacgatgtacaatctc
acgattggaactgctaccaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
