Viruses: 54979457
Help
Entry
54979457 CDS
T40000
Symbol
HOR63_gp48
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_EcoS_CEB_EC3a; tail protein
KO
K26977
Enterobacteria phage tip attachment protein J
Virus
1933774
Escherichia phage vB_EcoS_CEB_EC3a
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
FNIII-A_GpJ
Phage_Tail_Tip
Phage-tail_3
fn3
IFT20
SF-assemblin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54979457
NCBI-ProteinID:
YP_009789332
RS:
NC_047812
LinkDB
All DBs
Position
NC_047812:20873..24289
Genome browser
AA seq
1138 aa
AA seq
DB search
MIKTNMRLRDMAEEIKIYGAKGGSQKQHQPVEQEDNLISLNKVKVLLAVADGEVDSNFSM
KDLYLADVPVQNQDGSYNYEGVRAEFRAGTQYQEYIAGLDGANSEIQASREITNDTPYII
AVNNTQLSAIRIKLFWPRLVKQESNGDLNGITCEYAIDLSVNGGAYQEYTRGVANGKTTT
GYDRSIRVNLPAEFDSALVRIRKITADSTSSTLVNGMQITTYQEVIDAKFRYPLTALVYV
EFGSDLFPNGIPTISIKKRWKLIQVPTNYDPETRTYSGTWNGLFKMAWSNNPAWVLYDLV
TNRRYGLDQRELGVEIDKWGLYEAAQFCDQMVPDGKGGMEPRYLCDMVVQNKVEAYTLIR
DICSIFRGLTFYDGEKIGIVVDKPRNPSYIFTNDNVVNGLFSRTFASDKSLYTTANVQFD
DVENNYQQDVEPVFELEATRRFGFNPVDLTAIGCTRRSEANRRGRWLLKTNLRSETISFT
TGLEGMIPMIGEVIAVNDAAWSSNYQLNLSGRIESVQGLQVFTPFKVDAAPGDRILLNKP
DGSPEARTIASVSEDGRTINLNTAFSFVAQPDTVFAIDKDNLALQQYVVTGIQKADSDGS
DSFQYTITAVEYDPNKYDEIDYGVNIVDRPTSIVEPDRLSPPENLTVSSYSKVVQGLSVE
TMVIGWDKAPYAKTYNVQWRKENGNWINVPRTASTEVDIEGIYAGIYDVRVRSVSDTENV
SAWSDIVTVSLTGKIGRPSAPTVITASNDEVFGIRVKWGFPDGSGDTAYTELQQVADNGD
GTYNPDNASLLTLLPYPAYEYWHTPIQPGKVIWYRARLIDRIGNTSDWSNFSRGMSTDDA
NIINDYIKVDIEGSEGFKYLEQNAIQKNQDIQNQAESILENALANDTDVRRMTKENGKRK
AEYVQAVNLIADETQARVEALTQLKAQIDDEVVASITEVQTALATETEARTTSDTQLSAR
IGDNEAALNQKLDAFANATSTGVQYGISLGLKYNGQTYSSGMSMELVGTGGNVRSQFIFD
ANRFAISNGIGSGSGQWQLPFVVENGNVIIQSAVIGDGSISNAKIGNFIQSNNYVAGTTG
WRIDKSGSAELSNATVRGNLYANNGNFAFNGTNNTVQINNNGITVNLPNGGRVVVGVW
NT seq
3417 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaaaacaaacatgaggcttcgtgatatggctgaagagattaagatttatggtgct
aagggtggtagccagaagcagcaccaaccagtggagcaggaagacaacctcatttcacta
aacaaggttaaggttttgcttgctgtcgctgacggagaggtggattcaaacttctcaatg
aaggatttataccttgctgacgttcccgtgcaaaaccaggatggtagctacaactacgaa
ggtgttcgcgctgagttccgtgctggcacgcagtatcaggaatatatcgctggtcttgat
ggtgccaactcagagattcaggcttccagagaaatcacgaacgataccccgtacatcatt
gcggttaacaatactcagctatcagcgattcgaattaagctattttggcctcgactagtt
aaacaagagagtaacggtgacctgaatggtataacttgcgagtatgcaattgacctttcc
gttaatggtggtgcttaccaggaatacactcgcggagttgctaacgggaagaccactaca
ggttacgaccgcagcattcgcgtgaaccttcctgcagagtttgatagcgcattggttcgc
atccgtaagattacagcagattcaacaagtagcacgctggttaacggaatgcagattaca
acctatcaggaagtaatcgacgctaaattccgctatccgcttacggcacttgtttatgtt
gagttcggctctgacttgttccctaacggcatcccgacaatctcaatcaagaagcgatgg
aagttaattcaggtcccaacgaactatgatcctgagactagaacctacagcggcacgtgg
aatggcctgttcaaaatggcgtggtcaaacaaccctgcctgggttctttatgacttagtg
acaaaccgccgatatggtcttgatcagcgagagcttggtgtagagattgataaatgggga
ctgtatgaagctgcgcaattctgcgaccagatggtgccggatggtaagggtggaatggaa
ccgcgatatctatgcgacatggttgtacagaacaaggttgaggcctacacactaattcgt
gacatttgctcaatctttcgtggactgactttctatgatggagaaaagattggtatcgtg
gttgataaacctcgcaatccatcttacatcttcactaatgataacgttgtaaacggatta
ttcagccgcacttttgccagcgataaaagcctttacactacggcaaacgttcagtttgat
gatgtggagaacaactatcagcaggatgttgagccagtatttgagctcgaggctactcgc
cgatttggttttaacccggtcgacctaacggcaattggatgtacgcgaagaagtgaagca
aacagacgcggaagatggctactgaaaaccaacctgagaagcgaaactatcagcttcact
accgggttggaaggcatgattccgatgattggtgaggttattgcggttaatgacgctgca
tggtcgagcaactaccagttaaacctttccggtcgtattgaatcagttcagggattgcag
gttttcaccccgttcaaagttgacgcggcaccgggtgacagaattcttctgaacaagcct
gacggaagcccggaagcaagaactatcgccagcgtttcggaagatggtagaactatcaac
ctgaatactgcttttagttttgtagctcagcctgacactgtattcgcaatcgataaggat
aatctggcgcttcagcagtatgttgtgaccgggattcaaaaagcagattctgatggttcg
gattcattccagtatacgattaccgcggtggagtatgacccgaacaagtatgacgagatt
gactacggcgttaacattgttgaccgtccaacttcaattgtggaacctgacagattatcg
ccaccagaaaacctgaccgtgtcaagttatagtaaggttgttcagggcttgtcggttgag
acgatggttatcggatgggataaggctccatacgctaaaacctacaatgttcaatggagg
aaagaaaatggtaactggattaacgtacccagaacagcaagtacagaggttgatatcgaa
ggtatttacgcaggaatctatgacgttagggttcgcagcgtatcagatactgaaaacgtg
tctgcctggtctgacattgtaactgtatcactaactggcaagattggtcgtccctctgca
cctacggttatcacggcatcaaatgatgaagtatttggtatccgtgttaagtggggtttc
cctgatggctctggcgatactgcttatactgaacttcagcaggttgctgataatggtgat
ggtacatacaatcctgataacgcaagtttgcttacgttacttccgtacccagcctatgaa
tactggcatacgccaattcagccaggcaaggttatctggtatcgcgcaagattgattgac
agaatcggaaatacgtctgattggtctaatttctcaagaggcatgagtactgacgacgcc
aacattatcaatgattacatcaaggttgatattgagggttctgaaggattcaaatacctc
gagcagaatgcgattcaaaagaatcaggacattcagaatcaggcagagtcaattcttgag
aacgcattagctaatgacactgatgttcgtcgcatgactaaggagaatggcaaacgtaag
gctgaatatgttcaggcggtgaatctcatagctgatgaaactcaggcgcgtgtagaagct
ctaacgcagcttaaggcgcaaattgatgatgaggtcgttgcatcaattactgaagttcag
acagcgttagcaaccgagacggaggcaagaactacatccgacactcagctatcagcaaga
attggtgataacgaggcagcgttaaaccagaagctggacgcttttgctaacgccacatcg
actggcgtacagtacgggattagccttggcctgaaatacaatgggcagacttattcatcc
gggatgagcatggagcttgttggcaccggtgggaatgttcgcagccagttcatttttgat
gcaaacagattcgcgatcagtaacggcattggctctggttccggtcagtggcagctcccc
ttcgttgtcgagaacggaaacgtaatcatccagagcgcagtaatcggtgatggttcaatc
agtaacgcgaagattggtaactttattcagtcaaataactatgtggcaggaactacaggc
tggaggattgataaatcaggaagtgcagagctaagcaacgccactgtaagaggtaatctt
tacgctaacaatggtaacttcgcattcaacggaaccaataacactgttcagattaacaac
aatggaattacggtaaacttaccgaacggaggtagagttgtagttggagtgtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
