Viruses: 54980055
Help
Entry
54980055 CDS
T40000
Symbol
HOR70_gp44
Name
(RefSeq) Pectobacterium phage PPWS4; internal virion protein with endolysin domain
KO
K21508
Autographiviridae peptidoglycan hydrolase [EC:4.2.2.-]
Virus
1961914
Pectobacterium phage PPWS4
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SLT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54980055
NCBI-ProteinID:
YP_009789905
RS:
NC_047819
UniProt:
A0A250KAA8
LinkDB
All DBs
Position
NC_047819:30279..34298
Genome browser
AA seq
1339 aa
AA seq
DB search
MAKYDENKPSEFDSLYQSSAASAGANPRLLRAQGFHESSFNPKAVSPTGPRGIAQFTKGT
ARALGLNVFDEDNPNDDRYNPEKAIPAQARLMADLTKKFGGDELKALLAYNQGEGKIGAA
QLEAYDRGDYAKISPEGLGYMRNMSAYAKSPNTAKLEAFAKLSNPKTLDQSMSHIAMPET
KAKLEAPELGGLTLATGRSSITEEVGTDFRQEFDKQHGKKAKGEDKGETLGDFESRDEGF
KNPFRGQGQAIETEFANSAVGTGYRAFRDGDSDLLTSVMTPSRWNTHQFSPDEIEYIRNN
LKDANYLSVVSGSDSETLEEAVKLANDNYENDLKNADGGWGAHLAAGVLGAAVDPFTYAP
MGFVGKGAKLINKTLKVGAASGAASVASEALRTNVSGGEGHYGMAFAGGAILGGGLTLAF
GRGARDADVVPNEPNPFMPTARRLEARETARNTDGVDGSKVNTEDRGFPSSHDGVDYAMH
PTEEGAVILKDGTVLAAENPLNPNTARDYASLNHNGEAARAAPSVALGSMSSIGQVTNRS
LNPEIRSVASELFRPEVGTVSGASGRYGFVVDEGIERLGAQDNRFFQKYDDVVKDVLKDP
EYSMSGMRQREAQIAVQREAAELIESGGKPKTPAMQRLMDALNDFYSTKQAYMENPAMLS
GNSKAKSLLSTHWGGKYVQVVYDKFALRTARQRLGNEGLQEAIAKSWIASAHMRPETMTR
VKRIIVERSEGKLKTPNDVTPEMIEKYAMDKAYGISHSDDFTASSLVDQTIDSKLTGIEN
NKYLEARSGFDGDVPVPMADGTMFRVNDLRDYDLGRLMPSYARSVNGNVSLMAGTGRTML
EQKNIIQGLADKARASGDPQLIKEVNALKEGMKLIAGHARRDPDGAFGTLMRSLSDLAYF
TKNFWMGPMNFTEIGAMVAKGNVRAALRHIPVINDLMYRRKAVSATTAREMTATLFGRDI
DESIRPSRMDFVDSLKENSAVNNWAAQMVGSIRYGTSTLASKSPASWLLRESSNYIGNTA
RQGVIGDVADSVLRGKNSRWMDAKYLKSAAITKEQAEGIRQLIRDHMELGVDGKFTLKDS
KAFSQDPRSNDLWRLGQHTANETFLRPSRIGLQNQKAFGWAGQMVAQFKNFIIRSINGRL
VKSFYETTKNGRAVDMAAATVISIGLASAFHIMRSHVDAYRLPQGDRDDYLNKALSPQMV
GYAGLSRSSHLGGVFTPVQFLGPFVGFNDANMVRTSIAPQAPIEKQPKNKALKGADVAKS
FGGELMNQIPAVGLVGSAVAAGSNLYDSVTSNNKPTQLEMNTGALKATQQLVPNDPLTQQ
IIMWMYADAGLNTKISTKK
NT seq
4020 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaagtatgatgagaataaaccaagtgaatttgatagcttgtaccaaagctcagca
gcgtcagcgggggctaaccctcgcttgttacgtgcccaaggattccatgagtccagcttc
aatcctaaagcagtctctccgactggcccaaggggtatcgctcagtttactaagggcaca
gcccgagctttgggtcttaatgtatttgatgaggacaatcctaacgatgaccgttataac
cctgagaaggcaattcccgcgcaggctcgactgatggctgacctcaccaagaaatttggt
ggggatgagcttaaagcgctccttgcgtacaaccaaggggaaggtaaaattggtgctgca
cagttggaagcatacgaccgtggggattacgctaagatttcccctgaaggcttgggctac
atgcgcaacatgtcagcttatgctaagtcccctaatacggcaaaactggaagcgttcgct
aagttatccaacccaaagacccttgaccagtccatgagtcatatcgctatgcctgaaact
aaggctaagctggaggctcctgaacttggtggcctcactctggctactggtcgttcatca
atcactgaggaggtcggaacggacttccgtcaggagttcgataagcagcacggtaagaag
gccaaaggggaagataaaggtgagacattgggtgactttgagtctcgcgatgagggcttt
aagaaccctttccgtggtcaaggccaagcgattgagactgagtttgctaactctgcggtg
ggcacagggtatcgtgccttccgtgatggtgactcggacttattgacctctgtcatgaca
cctagtcgctggaacactcaccagttctcaccggatgagattgagtacattaggaacaac
ctgaaggacgccaattaccttagcgttgtctctgggtctgactctgagacactcgaagaa
gccgttaagttggctaacgacaactacgagaatgaccttaagaacgctgatggcggctgg
ggagcacatcttgcagctggcgtattaggtgcggctgttgacccctttacgtacgcccca
atgggattcgtagggaaaggcgctaagttgatcaataagacacttaaggttggtgctgct
tcaggtgctgctagtgtagcgtctgaggcactacgcactaacgtgtctggtggtgagggt
cactacggtatggcgttcgctggaggtgctatacttggaggtggcttaacgttagctttc
gggcgtggtgctcgtgatgctgatgtggttcccaatgagcctaacccattcatgcctaca
gccagacgcttagaagcccgtgagacagcccgtaatactgatggtgttgatggctcaaag
gtgaacactgaggacaggggcttcccgtctagtcatgatggtgttgattacgctatgcat
ccaacagaagagggcgcagtgattctcaaagacggcacagtgttagcagctgagaaccca
cttaacccgaacaccgcaagggactacgcttcgttgaatcataatggtgaagctgcgcgc
gcagctccaagtgttgctttaggtagcatgtcatccattggtcaagttacaaaccgctca
cttaaccctgagattcgtagtgtggcctctgagttgttcagaccagaagtagggactgtg
agtggtgcttcaggtcgttatggcttcgtagtggatgaagggattgaacgcttaggcgct
caagataaccgattcttccagaagtacgatgatgtcgttaaggatgttcttaaagaccct
gagtattccatgtcaggaatgaggcagcgtgaagctcagattgctgttcaacgtgaagct
gcggaactgattgagtcaggtggtaagcctaagaccccagcaatgcagagactcatggac
gctctcaatgacttctacagcacaaagcaggcctacatggaaaacccagcgatgcttagc
ggcaactctaaggccaagtccctattgagcactcattggggcggcaagtatgtccaagtg
gtgtacgataagtttgcccttcggacagcacgtcaacgattaggcaatgagggtctccaa
gaggccatcgctaagagctggattgcgtctgctcatatgcgccctgagacaatgactcgt
gttaagagaattatcgtagagcggtctgaaggtaagctgaagacacctaatgacgtcact
ccagagatgattgagaagtacgctatggataaggcgtatggtatcagtcacagtgacgac
tttacggcgtcctcattggttgaccaaacgattgactccaagctgactggtattgagaac
aacaagtaccttgaggctcgttcgggctttgatggtgacgttccagttcctatggctgat
ggtacgatgttccgagtgaatgaccttcgtgattatgacctcgggcgtttaatgcctagt
tatgcccgctcagttaatggtaacgtatcactaatggctggcacaggtcgcactatgctt
gaacagaagaacatcattcaaggtctggccgataaggctcgtgcctcaggcgacccacag
ttaatcaaggaagttaacgctctcaaagaaggcatgaagttaatcgctggccatgcgcgt
agagaccctgatggtgcctttggtacactgatgcgctccttgagtgacttagcgtatttc
actaagaacttctggatggggccgatgaacttcactgagattggcgcaatggtcgctaag
gggaacgtaagggcagctctgcgccacatccctgtgattaacgacctaatgtaccgccgt
aaggctgtcagcgctaccacagcccgtgagatgaccgctacgttgtttggtcgcgatatt
gacgaatctatcagacctagccggatggacttcgtggactctcttaaagagaactctgcg
gtgaacaattgggcagcacagatggtaggctctattcgttacggcacctcaacgctggcc
tctaagtctccagcttcatggctactccgtgagtcttcgaactacattggtaacacagct
cgtcaaggtgtgattggtgatgtggcagactcagtgttgcgcggtaagaactccagatgg
atggacgcaaagtatcttaagtctgccgctatcactaaggagcaggctgaaggtatccgt
cagttaatccgcgaccatatggagctgggagtagacggtaagttcacccttaaggattcc
aaggcattctcgcaagaccctcggagtaatgacctgtggcgtctcggccagcatacagcc
aatgagaccttcctacgtccaagccgtatcgggttgcagaaccagaaggcgttcggttgg
gcaggccagatggtagctcagtttaagaacttcatcattcgttcaatcaacggtcgtctc
gttaagtcattctatgaaaccactaagaatggtcgtgcagtagacatggcagcagccact
gtgatttccattgggttggcctcagcgttccacatcatgcgctcacacgttgacgcttac
aggttacctcaaggtgaccgtgatgattatctgaataaggctctaagcccccagatggta
ggttacgctggcctgtctcgaagctctcacttgggcggtgtgtttacccctgtgcagttc
ctcgggccgtttgtgggattcaatgacgctaacatggtgaggacttctatcgcacctcaa
gcgcccattgagaagcagcctaagaataaagcccttaagggcgctgatgtggctaagtcg
tttggtggagagttgatgaatcagattccggcagtaggccttgttggtagcgctgtggca
gcaggttcaaacctgtacgactcagtgacgtccaacaataaaccgactcaactggagatg
aacactggcgctctcaaggccactcagcagctcgtccctaatgacccactgactcagcaa
atcattatgtggatgtacgctgacgctggtcttaataccaagattagcaccaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
