Viruses: 54983178
Help
Entry
54983178 CDS
T40000
Symbol
HOS17_gp40
Name
(RefSeq) Enterobacteria phage T3; internal virion protein with endolysin domain
KO
K21508
Autographiviridae peptidoglycan hydrolase [EC:4.2.2.-]
Virus
10759
Enterobacteria phage T3
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SLT
DUF3759
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54983178
NCBI-ProteinID:
YP_009792967
RS:
NC_047864
UniProt:
R4TJC4
LinkDB
All DBs
Position
NC_047864:28805..32761
Genome browser
AA seq
1318 aa
AA seq
DB search
MDKYDKNVPSDYDGLFQKAADANGVSYDLLRKVAWTESRFVPTAKSKTGPLGIMQFTKAT
ANALGLRVTDGPDDDRLNPELAINAAAKHLAGLVGKFDGDELKAALAYNQGEGRLGNPQL
EAYSKGDFASISEEGRNYLRNLLDVAKSPMAGQLETFGGITPKGKGIPADVGLAGIDHSQ
KVTQELPESTSFDVKGIEQEAPAKPFAKDFWETHGETLDEYNSRSTFFGFKNATEAELSN
SVAGMAFRAGRLDNGFDVFKDTITPTRWNSHIWTPEELEKIRTEVKNPAYINVVTGGSPE
NLDDLIKLANENFENDSRSAEAGLGAKLSAGIIGAGVDPLSYVPMVGVTGKSFKLINKAL
VVGAESAALNVASEGLRTSVAGGDADYSGAALGGFVFGAGMSAISDAIAAGLKRSKPETE
FDNEFIGPMMRMEARETARNANSTDLSRMNTDNMKFEGEHNGVPYEDLPTEKGAVVLHDG
SVISANNPINPKTLKEFSEVDPEKAARGIKLAGFTEIGLKTLGSDDADIRRVAIDLVRSP
TGMQSGASGKFGATASDIHERLHGTDQRTYNDLYKAMSDAMKDPEFSTGGAKMSREETRY
TIYRRAALAIERPELQKALTPSERIVMDTIKRHFDTKRELMENPAIFGNTKSVSIFPESR
HKGTYVPHVYDRHAKALMIQRYGAEGLQEGIARSWMNSYVSRPGVKVRVDEMLKELHGVK
EVTPEMVEKYAMDKAYGISHSDQFTNSSIIEENIEGLVGIENNSFLEARNLFDSDLSITM
PDGQQFSVNDLRDFDMFRIMPAYDRRINGDIAIMGSTGKTTKELKDEILALKAKAEGDGK
KTGEVHALMDTVKILTGRARRNQDTVWETTLRSINDLGFFAKNAYMGAQNITEIAGMIVT
GNVRALGHGIPILRDTLYKSKPVSAKELKELHASLFGKEVDQLIRPQRADIVQRLREATD
TGPVVANIVGTLKYSTQELAARSPWTKLLNGTTNYLLDAARQGMLGDVISATLTGKTTRW
EKEGFLRGASVTPEQMAGIKSLIKEHMVRGEDGKFTVKDKQAFSMDPRAMDLWRLADKVA
DEAMLRPHKVSLQDSHAFGALGKMVMQFKSFTIKSLNSKFLRTFYDGYKNNRAIDAALSI
ITSMGLAGGFYAMAAHVKAYALPKEKRKEYLERALDPTMIAHAALSRSSQLGAPLAMADL
VGGVLGFESSKMARSTILPKDTMKERDPNKPYTSREVMGAMGSNLLEQMPSAGFVANVGA
TLMNAAGVVNSPNKATEQDFMTGLMNSTKELVPNDPLTQQLVVKIYEANGVNLRERKK
NT seq
3957 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataagtacgataagaacgtaccaagtgattatgatggtctgttccaaaaggcggct
gatgccaacggggtctcttatgaccttttacgtaaagtcgcttggacagagtcacgattt
gtacccacagctaaatctaagactggaccattaggcataatgcaattcaccaaggcaacc
gctaatgcccttggtctgcgagttacagatggtccagacgacgaccgacttaaccctgag
ttagctatcaacgctgccgctaagcaccttgcaggtctggtaggtaaattcgacggtgat
gaacttaaagctgcccttgcatacaaccaaggcgagggacgcttgggtaatccacaactt
gaggcatactctaagggagacttcgcgtccatctctgaggaaggacgtaactatctgcgt
aaccttctggatgtcgctaagtcaccgatggctggacagttggaaacttttggaggtatc
accccaaagggtaaaggcattccggctgacgttggactagctggaatcgaccacagtcag
aaagtaacacaggaacttcctgagtccacaagttttgacgttaaaggtatcgaacaggag
gctccggcgaaaccattcgccaaggacttttgggagacccacggagaaacacttgatgag
tacaacagtcgttcaaccttcttcggattcaaaaatgctaccgaagctgaactctccaac
tcagtcgctgggatggctttccgtgctggtcgcctcgataatggttttgatgtgtttaaa
gacaccattacgccgactcgctggaactctcacatctggactccagaagagttagagaag
attcgaactgaggttaagaaccctgcgtatatcaacgtggtaactggtggttctcctgag
aatcttgacgacctcattaagttggctaacgagaactttgagaatgactcacgctctgcc
gaagctggactgggtgccaaactgagtgctggtattatcggtgctggtgtggacccactc
agctatgttcctatggtcggtgtgactggtaagagctttaagttaatcaataaggctctt
gtagttggtgccgaaagtgctgcgctgaacgttgcatccgaaggtctacgtacctccgta
gctggtggtgacgctgactactcaggggctgctttaggtggctttgtgtttggtgctggt
atgtccgcaatcagtgacgctatcgctgctggactgaaacgtagtaaacccgaaactgag
ttcgacaatgagttcatcggacctatgatgcgaatggaagcccgtgagaccgcacgcaac
gcaaactctacggacctctctcgtatgaacactgataacatgaagtttgaaggtgagcat
aacggagtaccttatgaggaccttcctactgagaagggcgctgtggtactgcacgatggc
tccgttataagtgcaaacaacccaatcaaccctaagaccctcaaagagttctctgaggtt
gaccctgagaaggctgcgcgaggaatcaaacttgctgggttcaccgagataggcttgaag
accttggggtctgacgatgctgacatccgcagagtggctatcgacctcgttcgctctcct
actggtatgcagtctggtgcctcagggaagttcggtgcaacagcttctgacatccatgag
agacttcacggtaccgaccagcgtacttataatgacttgtacaaagcaatgtctgacgct
atgaaagaccctgagttctctactggcggagctaagatgtcccgtgaagaaactcgctac
actatctaccgtagagcggcactggctattgagcgtccagagttacagaaggcactcact
ccgtctgagagaatagttatggacactattaagcgtcactttgacaccaagcgtgaactt
atggagaacccagcaatcttcggtaatacgaagtctgttagtattttccctgagagtcgc
cacaaagggacttacgttcctcacgtttacgaccgtcatgcaaaagcactgatgattcaa
cgctacggtgccgaaggtttacaggaaggtattgctcgttcgtggatgaacagctacgtc
tccagacctggggtcaaggtcagagtcgatgagatgcttaaggaattacacggggtgaag
gaagtaacaccagagatggtagagaagtacgctatggataaggcttacggtatctcccac
tcagaccagttcaccaacagttccataatcgaagagaacattgagggcttagtaggtata
gagaacaactcattccttgaggcacgtaacttgtttgattcggacctatccatcactatg
ccagacggacagcaattctcagtgaacgacctaagggacttcgatatgttccgcatcatg
ccagcgtatgaccgccgtatcaatggtgacatcgctatcatggggtctacagggaaaacc
actaaggaacttaaggatgagattttggctctcaaagcgaaagctgagggagacggtaag
aagactggcgaggttcatgctctaatggataccgttaagattcttactggtcgtgctcga
cgtaatcaggacactgtgtgggaaaccacattacgttccatcaatgacctagggttcttc
gctaagaacgcctacatgggtgctcagaacattacggagattgctgggatgattgtcact
ggtaacgtgcgtgctctcggtcacggtatcccaattctgcgtgacaccctctacaagtct
aaaccagtttccgctaaggaactcaaggaactccatgcgtctctgttcggaaaggaggtg
gaccagttgattagacctcaacgtgctgatatagtgcagcgtctaagggaagcaactgat
acagggcctgttgtggcgaacatcgtaggtaccttgaagtattccacacaggaactggct
gctcgctctccgtggactaagctgctgaacggaaccactaactaccttctggatgctgcg
cgtcaaggtatgcttggggacgttattagtgccaccctaacaggcaagactacccgctgg
gagaaagaaggcttccttcgtggtgcctccgtaactcctgagcagatggctggcatcaag
tctctcatcaaggaacatatggtacgtggtgaggacgggaagtttacagttaaggacaag
caagcgttctctatggacccacgggctatggacttatggcgactggctgacaaggtagct
gatgaggcaatgctgcgtccgcataaggtgtccttacaggattcccatgcgttcggagca
ttaggtaagatggttatgcagtttaagtctttcactatcaagtcccttaactctaagttc
ctgcgaaccttctatgatggatacaagaacaaccgagcgattgacgctgcgctgagcatt
atcacctctatgggtctcgctggtggtttctatgctatggctgcacacgtcaaagcatac
gctctgcctaaggagaaacgtaaggagtacttggagcgtgcactggacccaaccatgatt
gcccacgctgcgttatctcgtagttctcaattgggcgctcctttggctatggctgaccta
gttggcggtgtcttagggttcgaatcttccaagatggctcgctcaacgattctgcctaag
gacaccatgaaggaacgtgacccaaacaaaccgtacacctctagagaggtaatgggagct
atgggttcgaaccttctggagcagatgccttccgctggctttgtggctaacgtaggggct
accttaatgaatgctgctggtgtggttaactcacctaacaaagcaaccgagcaggacttc
atgactggattgatgaactctaccaaagagttagtgcctaacgaccctcttactcaacag
cttgtggttaagatttatgaggcgaacggtgttaacctgagggagcgtaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
