Viruses: 54983386
Help
Entry
54983386 CDS
T40000
Symbol
HOS21_gp48
Name
(RefSeq) Rhizobium phage RHEph02; endolysin
Virus
1220602
Rhizobium phage RHEph02
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Hydrolase_2
Hib_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54983386
NCBI-ProteinID:
YP_009793171
UniProt:
L7TKJ7
LinkDB
All DBs
Position
NC_047868:32532..35771
Genome browser
AA seq
1079 aa
AA seq
DB search
MADLGRREVVSDPLALNPREKGPDRSLPTYGVRNPQLSAGDAASKQGMQALGAIDGLMAI
ATKVFDKQADNAVTEGKIGWMQGKTQAEIAKTGGQYGEQGWQSMESVNSAQGWFAQEMDF
LTNGDGKTMDPDTYRKHVMESQKNALKNLPKDPVARKAWAAAFDGYAPRLAGSQVEAHNQ
YNKDRAFTGFQNMLMGGADTNSDASVPTQDGNFRVSQSPVAEPVNATGNDRDIVIRTMLG
EAAGEGAEGMAAVAHVIVNRSRDPRWSNSLQGVALQENQFSAWNKGAGGNDPLKWDSNSP
AYKRAGEIYDAVVSGHHVDPTGGAVYYYSPSGMNALVAEGSQSNTVPPWLAAATKEMGGQ
VRLGNHIFTGKSAGSRATGGGAMSRDAFGRPVATAGSDVADGPKGAEAYAAPEAVSTPSR
GSQIQRQIMNSPLDPVSKSKALSKAIVLKLDAGDDNLLNDSGGIATMVALGADQADIDAV
YKAKQRFDEKKDKEYDSTFERARSDLISRVQNGDLDSADKIQGALDEFYNQYHGTEADAK
SLARQAYAEFARADKDTVVPLELRNLGASLYDKLQSGLITPEEAGQGLIDYGKRNPGIKK
SVIDSYVGKMYDLKQQMINQDRAKMETELEKQNKEKEVINRAQGALLRGSGLKGLDGTVR
IPDEDNPGKTKEVTGEEYGVYALQKNTKDNLQRQVQQGKMTPEQAAVEYNKTVYENLADQ
GVYDKQFGRQVSAAVSGELIGKDGKPTEAAMHALDWYMQLRDNPKVGGDYLAGTIEDDAA
RTLLETAAQMYDGRANIADSLVRANTILNANPDALTDIRKATEVETNVSFKASQAVGDML
DRGNWMARLINGQDWDPERISKMATGNMEKLTAWVADRSKTYQLQNSKEPINVSVVKAKD
DLARNSIVMGDSVIVGDERKKTRLDQVMGLEGYDRTAPNDALTEYLASGAGSKHWGVLWD
DQTGLRMGKNSDGSMPIWLFHKNQPRVQVTYNPEFKQIEVQLYKKDGSDETVPFKPMMLD
PKILGDRYKQVKSLDKGGYLSRTTRTVVDDFATASQNHTAVQGAADAGAAMGKMFKPKQ
NT seq
3240 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgacttaggtcgtcgtgaggtcgtaagtgatcctctcgcactaaatccaagggag
aaggggcctgatcgttccctccctacatatggtgtacgtaatccgcagcttagcgcgggt
gacgccgcctccaagcaaggaatgcaagcactcggtgctatcgacggcctaatggctatt
gctaccaaggtattcgataagcaggcagacaatgctgttactgagggtaagattggctgg
atgcagggtaagacccaagcagagatagccaagactggtggacagtatggtgaacagggc
tggcagtctatggagtctgtcaattctgcacaaggctggtttgcacaggaaatggacttc
ctcaccaatggtgacggtaagactatggacccggacacgtatcgtaagcacgtgatggag
tctcagaagaacgcacttaagaacctgccaaaggaccctgtagctcgtaaggcatgggca
gctgcattcgatgggtatgccccgcgtctagctggatcgcaggtagaagcacataaccag
tataataaggacagagcattcactggtttccagaacatgcttatgggcggtgctgatact
aactctgatgcatccgtgcctacacaggacggtaacttccgcgtctcacagtcgcctgtg
gctgagcctgtgaatgctactggtaatgatcgtgatatcgttatccgtactatgctcggc
gaggccgctggtgaaggtgcagagggtatggcagcagtggcacacgttattgttaaccgt
tctcgtgaccctagatggtctaactctctgcaaggtgtagctctacaagagaaccagttc
tcggcatggaacaagggtgcaggtggtaacgatcctcttaagtgggatagtaactctccg
gcctataagcgtgctggtgagatttacgacgctgttgtatctggacaccatgtagaccct
acaggtggtgcagtatattactactctccatctggtatgaatgcactggttgcagaaggt
tctcagagtaacactgtgcctccgtggcttgcagcagctactaaggagatgggtggtcag
gttcgtctaggtaaccatatattcactggtaagtctgcgggctctagggcaacaggcggt
ggggctatgtctcgtgacgcctttggtaggccggtagcaactgcgggtagtgacgtagct
gacggcccgaagggcgcagaggcgtatgctgctccggaagctgtatcgactcctagcagg
ggctcacagatacagcgccagattatgaactcaccacttgatcctgtatccaagtctaag
gcgttgagtaaggctattgtgcttaagcttgatgctggtgatgacaatctgcttaatgat
tctggtggtattgccactatggttgcactcggtgctgatcaggcagacattgatgcagta
tacaaggccaagcagcgcttcgacgagaagaaggataaggaatacgatagtacgtttgag
cgtgcacggtctgatcttatttctcgtgtacagaacggtgatctggattccgctgacaag
atacagggagcactggatgagttctacaaccagtaccatggtacagaagcagatgctaag
tcgcttgctcgtcaggcatacgctgagtttgctcgtgctgacaaggacacagtagttcca
ctagagctgcgtaaccttggtgctagcctgtatgataagctgcagtctggactgattact
ccggaagaagcaggtcaaggtcttatcgattatggtaagcgtaatcccggtattaagaag
tctgtaattgatagctatgtcggtaagatgtacgacttgaagcagcagatgattaatcag
gatcgcgccaagatggagacggaacttgagaagcagaataaggagaaggaagtaattaac
cgtgcacagggtgctttgcttcgtgggtctggtcttaagggtcttgatggtactgtccgc
atacctgatgaggataatccgggtaagactaaggaagtcactggtgaagagtacggtgta
tatgcactgcagaagaacaccaaggacaatctacagagacaagtgcagcaaggtaagatg
actcctgagcaagctgctgtcgagtacaataagaccgtgtacgaaaaccttgcagatcaa
ggcgtgtatgataaacagttcggtcggcaggtttctgctgctgtatctggtgagcttatc
ggcaaggatggtaagcctactgaggctgctatgcatgcgcttgactggtatatgcagctt
cgtgataacccgaaggtaggtggtgattatctcgccggtactatcgaggatgacgctgct
cgtactctgcttgagactgctgcacaaatgtatgacggacgtgctaatattgctgactcc
cttgtacgtgctaatacgatcctgaacgctaatccagacgcacttacagatattcgcaaa
gctactgaggttgagactaatgtcagcttcaaggcttcgcaggctgtgggtgatatgctg
gatcgtggtaactggatggctcgtctaatcaacgggcaggattgggaccctgagcgtatc
agcaagatggctaccggtaacatggagaagcttactgcatgggtagctgatcgttctaag
acttaccagttgcagaacagtaaagagcctattaacgtctctgtagtcaaggctaaggac
gaccttgctcgtaactcgattgttatgggtgacagtgttatcgttggtgatgaacgcaag
aagacacggctcgatcaggtcatgggtctggaaggttatgatcgtaccgcaccaaatgat
gctctgactgagtatcttgcatctggcgctggttctaagcattggggtgttctgtgggat
gaccagactggtcttcgcatgggtaagaactcggatggtagtatgcctatctggctgttc
cataagaaccagcctagagtacaggtcacgtataatcccgagtttaagcagattgaggta
cagctgtataagaaggacggctctgatgagactgtacctttcaagcctatgatgcttgat
cctaagatcctaggtgatcgttacaagcaggtaaagagccttgataagggcggctacctg
agcaggactactcgcacggtagtagacgactttgcaactgcttctcagaaccatactgct
gtgcagggtgcagctgatgcaggcgcggctatgggcaagatgttcaagcctaaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system