Viruses: 54988851
Help
Entry
54988851 CDS
T40000
Symbol
HOS80_gp044
Name
(RefSeq) Lactobacillus phage Semele; exonuclease
KO
K27443
Herelleviridae exonuclease
Virus
2079433
Lactobacillus phage Semele
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
AAA_23
SbcC_Walker_B
Rad50_zn_hook
DUF7575
Zn_ribbon_9
Zn_Ribbon_1
Zn_ribbon_3
PHA_synth_III_E
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54988851
NCBI-ProteinID:
YP_009798389
RS:
NC_047926
UniProt:
A0A2K9VCZ6
LinkDB
All DBs
Position
NC_047926:51759..53660
AA seq
633 aa
AA seq
DB search
MKLESVDIQNFRSIGKVKLSLDNQGLILIQGVNMDKDDGSSNGAAKSSLYYAIIYALYGK
TPKGTAGDDIVNNKIGKNTHCIVEFSHRGIKYTVARYRKDKDNKNKVLLYRDGEEITKAS
NKLTDEYIVDIIGMNITTMLNSLVFGESSVNRFSEATDKERKEILEDITNIAIYKRALDI
VKEDAATNKLNIDKANNELSSAVNHKDSMMQYIDRFKQEQKDYANQLAKAEATVTKCKEA
VDNIGYTDEDLDKEEENYQNDLTVLQHKFDKANTVKSSTEVNAKLSALASKAGQIANQQR
ISKDNLNKAKQAYTELANASVPRCPHCGHKLDEEHRKQELERITNDGKQARESYDESTRM
LLTAKKASDLLNTKLSEIEKFNSSIKPKLKLINKDINSVRNSITKVINRRNKLASSKHDV
VQAKQWLEELKQRAPKNNGDFESEKDLNKHIKESTDKVSKLEAKEKQFNDLKVVFSDKGV
KSHVLDLVTPYLNSQANYYLSILTNGTISVNISTQSESKSGNVSDKMSVEVSSVDGGSAY
NELSTGEQKRVNLAISLSLQDYVLSKNPEINLNVFDEIFDGLDEDGIMQVMKLLKERNKN
IGTILVISHNQALRDMFTNSITIKKKDGISYVD
NT seq
1902 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattagaatctgtagatattcagaattttaggtcaattggaaaagttaaattgtca
ctagacaaccaaggtcttattctaatccaaggcgttaacatggataaggatgatggttct
tctaatggggcagcaaaatccagtttgtattacgctattatctatgcgctatatggtaaa
actccaaaaggtactgctggagatgatatcgttaacaacaaaataggtaaaaatactcac
tgtattgtagagttttctcatcggggtattaaatatacagttgcacgctatcgaaaggat
aaggataataagaataaagtattgctataccgtgatggcgaagagattactaaagcttct
aataagctaactgatgagtatatagttgatattattggtatgaatataactactatgctt
aattccttagtatttggtgagtcaagtgttaaccggttctcagaagcaactgataaagag
cgtaaagaaattctagaagatattactaatattgctatttataagcgagcgctagatatt
gttaaagaagacgcagccactaataagctaaatattgataaggctaacaatgagctatct
agtgctgttaaccacaaagacagtatgatgcagtatattgatagatttaagcaagaacaa
aaagattatgctaatcagctagctaaggcggaagcaacagttaccaagtgcaaggaagct
gttgataacattgggtatactgatgaagatttagataaggaagaagaaaactatcagaat
gatttgactgttttgcaacataaatttgataaagcgaatacagttaagagtagtacagaa
gtaaacgccaagctgtctgcacttgcatctaaagcgggacaaattgctaatcagcaaagg
attagcaaagacaaccttaataaagctaagcaggcatatacggagctagctaatgcgagt
gtacctcgttgtcctcattgtggtcataagctagacgaggagcatcgtaagcaggaatta
gaacgaattactaatgatggtaagcaagctagagagagctatgacgaatcaactaggatg
ttattaactgctaagaaggctagtgaccttctaaatactaagttgagtgaaattgaaaag
tttaatagtagtattaagccaaaattgaaattaattaataaggatattaattctgttaga
aacagcattaccaaagttattaacaggcgcaataagctagctagctctaagcacgatgtt
gttcaagctaaacaatggttagaagaactaaagcagagagcaccaaagaacaatggcgat
tttgaaagtgaaaaagatttaaataagcatatcaaggaatctactgacaaggtttctaag
ttagaagctaaagaaaaacaatttaatgacttaaaagtagtattctccgataagggggtt
aaatcacatgtgttagacttggttactccatatttaaactcacaagctaactactactta
tcaatattgacaaatggtactatttctgttaatattagtacacagtcagaatcaaaatca
ggtaatgtatctgataagatgtcagttgaagtgtcatcagttgatggcggctcggcttat
aatgaattatcaactggtgaacagaagcgggtaaacttggctatctccttgtcactacag
gattatgtattgtctaagaatccagagattaacctgaatgtttttgatgaaatatttgat
gggttggatgaagacggaattatgcaagttatgaaattattaaaagaacggaataagaat
attggaactatcctagttatttctcacaatcaggctttacgggatatgttcacaaattca
ataacaattaagaaaaaggatggaattagctatgttgactaa
DBGET
integrated database retrieval system
