Viruses: 54991610
Help
Entry
54991610 CDS
T40000
Symbol
HOT17_gp40
Name
(RefSeq) Pectobacterium phage Jarilo; internal virion protein with endolysin domain
KO
K21508
Autographiviridae peptidoglycan hydrolase [EC:4.2.2.-]
Virus
2163634
Pectobacterium phage Jarilo
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SLT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54991610
NCBI-ProteinID:
YP_009801102
RS:
NC_047963
UniProt:
A0A2S1GT04
LinkDB
All DBs
Position
NC_047963:30406..34389
Genome browser
AA seq
1327 aa
AA seq
DB search
MSYDKTKASQFDGLFQKAADTHGVSYDFLRKTLYNESSFNPNAKSKTGPKGIAQFTTGTA
RALGLNARDAGIDDPLDDRYNPELAIDAAARHMSDLVRKYDGDELKAALAYNQGEGTNGA
SQIEAYENGDYSKISPEGRNYMRNLMDVASSPRKGSLEAFGGINPPASGIPASEAFKGLS
KAPKVTQAQDLPQSTGISFEGVQQAEPNVPFTKDFWSKTGTTMDEMEKRSTFFGFGSAVE
AQLDNSALGVAVRAARVDDGYDVFKDTMTPTKWNSYTPTPEDIEKLRNSKLPPSYYNVVT
GGNGENWDELIKLAERNYATDQRAADAGMGAKLAAGVVGAGVDPLSYVPLVGIAGKGIKV
VNKALIVGSQTAALGVASEALRSSVAGGDAHYADAALGGLIFGAGMSAVTDVATGALRRS
GSPESELNEFAASAHRMEGRETAINNGSADPTLMNTQGATFTQTSSGVQVTQVPNQLGAV
ALPNGAILSGTNPTNPQTIQQFAAIDPERAAPGIKLGGFTEIGLKVLSSDTPEVRGLASD
LVRSPTGMQSGSSGKFGPVASDIHERLHATDQRTYNQLYDAARIAMDDPKYTLGAMRMSR
EEIKQDVFKTAALAIENPSLQANLSKAERDVMGIIKAHFDTKRELMENPAAFGDGRAVSI
FPDSRHKGTYVPNVYDRSSKVLNVRQWGADGLQEMISKSWLSSYHLRPATKARVDDYLAE
LNGLASPKDVTPEMVVKHSMDKAYGISHTDDFTSSSVIDDNITGLVGIENNSFLEARNLF
DSDVPITLPNGETFSVNDLRTFDMGTLMPAYDRRVNGDIAIMGGTGKTTVELKDAIMALD
KKAEGNGKLKGEVEALKDTVKILTGRARRNQDGAFETLARGLNDLTFFSKNFYMGPQNIT
EISGMVAKGNVSAVLHGIPVVRDLATRTSPVSASELKDIHSALFGRELDDLIRPKRIDVV
NRLREASDTSSALAQVVGTFKFGTQELAARSPWTKTLNGTANYILDASRQGVLGDVAKAA
FGGKGSKFGKDNFLKSASISQDQWKGIKQLFLDHATRGPDGQFTITNKKAFSMDPRAMDL
WRLADKVADETMLRPHKVSNQDSVAYNAGVKMIMQFKNFTIKSLNSKFIRSFYESTKNNR
AIDMALTHVLSLGIAAGYFAMQAHVKAYSLQEHQRKDYLKKALNPTMLGYAAVTRSSHLG
APFAIPSMIAGAAGFQEANMLRSTILPKDDSKAPKDKAAKSRAVAADIMGSIGAQIPSVG
YIGSVGATALNAAGVLNASSKPTERDYMTGLMNSTRELVPNDPLTQQLLMRIYEANGVYI
KAEPKAN
NT seq
3984 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttatgataaaactaaggccagtcagttcgatggtcttttccagaaagcggcagac
actcatggtgtttcctatgacttcctgcgtaagactctgtacaacgagagtagtttcaat
cctaacgccaagtccaagaccgggcctaagggtatcgctcagttcactacaggaaccgca
agagccttgggcctcaacgctcgtgatgctgggattgatgacccgctagatgatcgctac
aaccctgagctggctattgatgcagctgcacggcatatgtctgacctagtgcgcaagtat
gatggtgatgaactcaaagcagcccttgcgtataaccaaggcgaaggcactaatggtgca
tctcagattgaggcgtatgagaatggagactattcgaagatatctcccgaaggccggaac
tatatgcgcaacctaatggatgtagctagtagccctcgtaaggggtcactggaggcgttc
ggtgggattaatccaccagccagtggtatccctgcaagcgaggcattcaagggtctatca
aaggcccctaaggtgactcaggcgcaggacttaccgcagtctacaggaatcagctttgag
ggagtccaacaggctgaacctaatgttcccttcacgaaagacttctggtctaagacaggg
accacgatggatgagatggagaagcgttcgacgttcttcggattcggtagcgctgtagag
gcgcagctggataactcagccttaggtgtagcggtgcgagcggcccgtgtggatgatggt
tatgatgtctttaaggacactatgaccccaaccaaatggaacagctacacgccaactcct
gaggatatcgaaaagctgcgcaactctaagttgcctccaagttactacaacgtggtgaca
ggtggtaatggcgagaattgggatgagctgattaagctggctgagcgcaactatgcgact
gaccagagagcagctgatgcaggtatgggtgccaagttagcagcaggcgtggtaggcgct
ggcgttgacccgttaagctatgtgcctcttgtaggcatcgctgggaaaggcatcaaggtg
gtaaataaggctcttattgttggctcacagacagcagcattaggcgtagcttcagaggct
ttacgttcctcggtggcaggtggtgacgcccattatgcagatgcagccttaggtggactc
atcttcggcgcaggcatgtcggctgtgactgatgttgccacaggagctttacgtcgctca
gggtctccagagagtgaacttaatgagttcgccgcaagtgctcaccgaatggaaggtaga
gagacagcaatcaataatggttcagctgacccaaccttaatgaacactcagggtgcaacc
ttcacgcagacctcaagtggcgtacaggtgacccaagtacctaaccagctgggagccgta
gcgttacctaatggtgccatcctatcagggaccaatccgactaaccctcagactatccag
cagttcgcggcgatagaccctgagcgtgcagcacccggtatcaagcttggaggcttcact
gagattggccttaaggtactctcatcagatacgcctgaagttcggggcttagcgagtgac
ttagtgcgtagccctacagggatgcaaagtgggtcttcaggtaagttcggtccggttgct
tcagatatccatgagcgccttcacgctacagaccagcgaacctataaccagctgtatgat
gcagcgcgtattgctatggatgacccgaagtataccttaggtgctatgcgcatgagtcgt
gaggaaatcaagcaggatgtctttaagaccgctgcgttagctattgagaacccatcgctt
caagccaacttgtcgaaagctgagcgtgacgttatgggtatcattaaggcgcacttcgac
accaagcgtgagctaatggagaacccggcagcgttcggcgatgggagagctgtgagcatc
ttccctgatagtcgccataaagggacctatgtacctaacgtttatgaccgctcttcaaag
gtccttaacgtgcgacagtggggcgctgatggtcttcaggagatgatatcgaagtcgtgg
ctatccagctatcacctgcggcctgcaactaaggctcgtgtggatgactatctggctgag
cttaacggcctagcgagtcctaaggatgtgacgccagagatggtcgttaagcattctatg
gataaggcttatggtatctcccacactgacgacttcacgtcttcatcggtcattgatgac
aatatcactggtctggtcggtattgaaaacaacagcttccttgaggctcgtaacttgttc
gactccgatgtgcctatcacgctacctaatggtgagaccttcagtgttaacgacttgcgg
accttcgacatgggaaccctaatgcccgcatatgaccgccgcgtgaatggtgacattgct
atcatgggtggaaccgggaagaccacagtggaacttaaagacgctatcatggcgctcgat
aagaaagctgaagggaacggcaagctgaagggtgaagtagaagcactcaaggataccgtg
aagattctcactggtcgtgctcgtcggaatcaggatggtgccttcgagactctggcgcgt
gggctgaatgacctaacgttcttctctaagaacttctatatgggtcctcagaacatcaca
gagattagcgggatggtagctaaagggaacgtaagcgcagtccttcatgggattcctgtg
gtgcgtgacctagcgacccgtacctctccggtatctgcaagtgagcttaaggatatccac
tcagcactcttcgggcgtgagcttgacgacctgattcgaccaaagcgcatcgatgtagtc
aatcgtcttcgtgaggcttcagatacaagcagcgctcttgctcaggtcgtaggaaccttt
aagttcggcacgcaggagttagcagcacgctccccgtggaccaagacgcttaacgggacc
gctaattacatccttgatgcttctcgtcagggtgtgcttggtgatgtcgctaaggcagct
ttcggtggcaaagggtctaagttcggtaaggacaacttcctgaagtctgcaagtatctca
caagaccaatggaagggaatcaagcagctattccttgaccatgcaactcgtggtcctgac
ggtcagttcacgattaccaacaagaaggcctttagcatggacccgcgagctatggacctg
tggcgactggctgacaaggttgctgatgagaccatgttgcgtcctcataaggtttccaat
caggactccgtggcgtataacgctggggtgaagatgattatgcagttcaagaacttcacc
atcaagtcactcaactccaagttcatcaggagcttctatgagtccacgaagaacaaccga
gcgattgacatggcactgacccacgtcctctctttaggtatcgccgctgggtactttgcg
atgcaggctcacgttaaagcgtacagcctccaagagcaccagcgtaaagactacctgaag
aaagccttgaatccgaccatgttaggatatgcagctgtcactcgtagctcacacttgggc
gcacctttcgctatcccttcgatgattgcaggcgcagcaggcttccaagaggccaacatg
ctgaggtctacgattcttcctaaggatgactcaaaggctcctaaggacaaagcagccaag
agtcgtgctgtagcagctgacatcatgggttccattggtgcgcagattccatcggtaggt
tacatcgggtctgtaggagcaactgctctgaacgcagcaggtgttctcaacgccagcagc
aagccaaccgagcgagactacatgacaggcttaatgaattccacccgcgagttagtccct
aatgaccccttgacgcagcaactcttgatgagaatctatgaggcgaatggcgtatacatc
aaggcggaacctaaggctaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
