Viruses: 54995130
Help
Entry
54995130 CDS
T40000
Symbol
HOT55_gp106
Name
(RefSeq) Salmonella phage SP3; replication origin binding
Virus
2053625
Salmonella phage SP3
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Herpes_ori_bp
DEAD
DUF445
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54995130
NCBI-ProteinID:
YP_009804537
RS:
NC_048001
UniProt:
A0A2H4PIX4
LinkDB
All DBs
Position
NC_048001:57108..59894
Genome browser
AA seq
928 aa
AA seq
DB search
MFSILQGHAGFHRDLATGIWREVKAEDYLFAKRFSSKHPEGKPASMPFKFDVIDEVDPQT
LVEMLPLMRRLTSDPHIVAVRGRCLAPKNNVRRKKGNFNVSNPSHIIAMDVDGIVDTGGC
NKFDLVGMARHIIRMLNSISEDMFPLDAGFIAHASSSAGLKPGIRMHLILESNVKVTQGQ
IKFLFTSINESSRQKYGFDIADLAYYSSVQLHYFADPLFTDGIVDPFKAEGASRLVFVKG
SKVNLPNNLVDYETTRGEFKEEFYSLLDQIKGKKAASDKVEETISELEEAEDGVYLRIIP
KLYHRALEDGVDFAWLEKEIRPALSEYIATKDNSRNIQDYFNNGRKQALKAFVNNSKRDI
PDVLKGIPLKKLETNSLETDNFLKLNTVPPEGYMTFVKASLGTGKTTAVVRWLDSGVIKG
NFLAITNTRALVSSNAKKFSAGQYDKSVDMLNFKRGAIDRMSTTIHSLHKFKSFIGQIDA
IFIDECDAVMNDLLFAPVVKQRRECIQVLRDILATAKIIILSDGDISAETIEAYGSLIEF
DKPVAFYNHHRKMLSKAHAYEFPDESSIWVALQTSLEMGEKSILVSDCGPDELNEKGMAL
RRNTGALVKEIHSNSTSDVDIRRILDYTTNELIDQQIDCLLCSPSVTSGVDFNYFDNVFV
ITRTSNQAPNMRFQAIRRDRGAQNIYYFIDKSTSGFSAGSEQYNIDEGWLELAQQLYARR
RELESRNYTSTLRYYLLDQGATIDIFSESWGTIEGAGKEYTEERIKAILYSTPDYCAPRH
ADAYEAKLLLVRYYHLESIKDVTVEHVEQYIKDKPNDRAAFFHKMHEMFWEDIKKCSNVT
IKPFIEALKGKKKDFFLKTGQSANPKYARMYLGMMGIGKDMNTENIVDWYRTYCKIECMP
IPYKFMTDEEKHMHDEAMAELGARNDSE
NT seq
2787 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttctcaatcctacaaggtcatgcaggatttcatcgcgatttagccacaggcatttgg
cgagaagttaaagcagaagactatctttttgctaaaagattttcctcaaagcatcctgaa
ggtaaaccagcttcaatgcccttcaagtttgatgtaattgatgaagttgatcctcaaacc
ctagtagaaatgctccctcttatgagacgtttaacgtctgaccctcatatcgttgcggta
cgaggtcgatgtcttgcacctaaaaataatgtgcggcgtaagaagggcaactttaatgta
tctaatccaagtcatataattgcaatggatgtggatggtattgtagatacaggtggttgt
aacaagtttgatcttgttggcatggctcgacatattattagaatgttaaatagtattagt
gaggatatgtttcctcttgatgcagggtttattgctcatgcatcgtcttcggctgggcta
aaaccaggtatccgaatgcacttaatactagaatctaatgttaaagtaactcagggtcaa
atcaaattcttatttacatctatcaatgaaagtagtagacaaaagtatggctttgatatt
gccgacttagcttattactcttccgtacagctccattattttgcagatccgttatttacc
gatggtatagtagatccgtttaaggcggagggtgcttcacgtctggtatttgttaagggt
tctaaagtaaatttacctaataatctggttgactatgaaacaactagaggtgagtttaag
gaggagttctactctttactcgatcaaattaaaggtaaaaaagctgcctccgataaagta
gaggaaactatcagcgaactagaagaagctgaggatggagtgtatctacgtatcatacct
aaactctatcacagagcgttagaggatggtgttgattttgcatggcttgaaaaagaaatc
cgtccagccttatcagaatatattgcaactaaagataatagtcgtaatattcaagattac
tttaataacggtcgtaaacaggctctgaaagcgtttgttaataattctaaacgcgatata
cctgatgttttaaaaggtattccacttaaaaagctagaaactaattctctagaaactgat
aatttcttgaaattaaatactgtgccaccagaaggttatatgacttttgtaaaagcaagt
ctaggtacaggtaaaactacggcggttgtgcgttggttagattcaggagttattaaaggt
aatttcttagcaattaccaatactcgagcactggtatcttcaaatgctaagaaatttagt
gcaggacaatatgataagtctgtagatatgcttaattttaagcgtggtgctattgaccgt
atgtccacaactatccactctttgcataagttcaagagttttattggtcaaatcgatgca
atctttatcgatgaatgtgatgctgtaatgaatgacctattattcgccccggttgttaaa
caacgtcgtgaatgtattcaggttcttcgggatattcttgcaactgcaaaaatcattata
ttatctgatggggatattagtgcagaaacaattgaagcatatggttccttgattgagttc
gataaaccggttgcattttataatcatcaccgtaaaatgctatcaaaagctcatgcttat
gagttccctgatgaatccagtatttgggttgcacttcagacttctctagagatgggggag
aaatctatcctagtatctgactgtggaccggatgagctgaatgagaagggtatggcatta
cgtcgtaatacgggtgcgttagttaaggaaatccactcaaactctacatctgatgtggat
attagacgtattctggattacacaactaatgagctaattgatcaacaaattgattgctta
ttatgtagtccatccgtaacgagtggtgttgacttcaactattttgataacgtattcgtt
atcactagaactagtaaccaagcgccaaacatgcgtttccaagcaatcaggcgcgaccgt
ggtgctcagaacatttattattttattgataaatctacgagtgggttctccgcaggttct
gaacaatataacattgatgaaggttggctggagttagcacagcaattatacgcacgtcgt
agggagctggagtctaggaactatactagtactttacgttattacttgcttgatcagggt
gcaactattgatattttcagtgaaagctggggaactatcgaaggtgcaggtaaagagtat
acagaagagcgaatcaaagccattttgtactcaactcctgattattgtgccccccgccat
gcagatgcgtatgaagctaaactacttcttgttcgctactaccatcttgagtctattaaa
gatgtaacagttgagcatgttgaacaatatatcaaggataaaccgaatgatcgagcggca
ttcttccataagatgcacgagatgttctgggaggatattaagaagtgttcaaatgttact
atcaaaccgttcatagaagctctgaaaggtaagaagaaagatttcttccttaaaacaggt
cagagtgctaacccaaaatatgcaagaatgtatcttggtatgatgggtattggtaaagat
atgaacacggagaatattgtagactggtacagaacctattgtaaaatcgagtgtatgcca
attccatataagtttatgactgatgaggagaaacatatgcatgatgaagcaatggcagag
ctaggtgctagaaatgacagtgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
