Viruses: 54997223
Help
Entry
54997223 CDS
T40000
Symbol
ORF_108, HOT69_gp159
Name
(RefSeq) Cyanophage S-TIM4; structural protein
Virus
1048189
Cyanophage S-TIM4
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Mtd_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54997223
NCBI-ProteinID:
YP_009806365
RS:
NC_048015
UniProt:
A0A345AWG1
LinkDB
All DBs
Position
NC_048015:95209..101919
Genome browser
AA seq
2236 aa
AA seq
DB search
MANRIQLRRGGAQEWANSNPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNT
ANTLVQRDADGNFSAGTITSTVIGNSSTASRLASSRQIQLSNEVTASGVFDGSQNLNLSA
ELALVSTLPHYDGTSSPSATYNKVTVDAKGRVTNAQDFTASNNGTLADYGLDGTNEGTSA
QPYDLDLVALAGLTTTGMISRTASNTVATRAITGTATRISVSEGAGISGNPTIDMITTAV
TAGNYNTESLTSVSGAGGNGEPFGTATVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATAAEGSKYAS
YNAGTTYVRYDIIANASKVYQAITGIAAGAGAPTHSSGDSGGWRYLAAEATEQKGLASFA
QEDFDVDANGHVTIATAGVDNTQLQNNKLIFTDGNAVENFELDNELTTSTANTGFNKLNF
IKINNTSGGLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGSVAQTLNKTGDGNLTFTT
TQNSSSARSLTVSASNSGSGTSTVTITAEDVVDIDASDSNGKVHVEDSRFQDNYIATSNA
TMHLDPGDDRATSGLVRVHGDLQVDGTTTTINSTVTTIDDPIITLGGDTAPGSDDNKDRG
VEFRYYDNQARIGFFGYDDSYTDLGGHVGGFTFLHNATNTSEVFSGTASGITAGNLKLTT
NTNSTSNTTGDLVVAGGVGIGDDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVFQGASKTLSLN
NGSGTTKIQLHTTTGNVEIGGILTNTGAIDANSTLNVAGIVRFEDTDEPTVAQNGGTGLY
EIQSNDYGAFRFDGGGYVEGDTVFNSDVFINGVLNQRDSATESFGNRNYLNIRYKLRSGS
SAAYTPSYASDNTSNLRIFGGAGIQTDLHIGDDLYIGKLNSGDSVSFQVLGESGNTTTQG
TLTVEGQATINDSLIVNASNENFKIQNGSAADKFTVDTDNGNTVIQGSLNVNGVTDIDAD
FAVRNGTTDKFFVDNVTGNTNIEGTLTADGHTELNSTLNVDNNTTLGSQLTVTGNSEFNG
TVDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLTVQGETQIIDSLIINASNEEFAVQNGS
GVDKFTVDTDNGNTNIIGTLTVADATQINNTLGVSNVVTLTRNTQQTLTGSYSADGAFKL
TGGAGIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDDVTITADNKMFKVQNA
SAANKFTVDTDNGNTDIQGTLDVAGDVTASSDLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTIDDPVI
TVGGDTAPASNDGKDRGIEFRYYDGSAKIGFFGFDRSSSQFQFLTSATNTSEVLSGTDGA
LRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTDKINNLNADLLD
GATTATAATASTVVLRDSSGDFAANQITAASAAGSGAGFLGNASTADAWKTARTLTISGV
VSGSVVIDGSENETLTTTYVDADITALAAMSGTGYVVRTAANTYAQRTLQVTASSGITLT
NADGVSGNTTINVASASSNSANNLVLRDGSGNFAAGTITAALTGNVTGNVTGNVTGQVSD
ISNHDTGDLTEGSNLYYTNERVDDRVNALITAGTGITKVYDDAANTYTLTVTQSDINTDN
VTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNVTEGSTNLFTTAARTRT
HFTYGTGITHSSGTLSVTQSDINTDNITEGSTNLFITNERVDDRVNALTVAGTGVSKTYD
DAAGTLTLAVDFSEFNTGNITEGSNLYFTNTRADARADLKVAAATGSNLDLSSKSTSDLS
EGTNQYYTETRVQAKLDNAYEQLRAMLTNLATSTTLNLNLSGDPTPGAVVTTGVSVGGGG
GFTAGTAVATSGSATGSGLTVDTTVDSDGNITAAAVNAGGSGYLITDTVTVTNPNAGKIL
TLNLATLSGGTGYSSATGVAVTGGDGSSATVDITASAGAITNVTVNNGGTGFAAGNTITI
ANANATGVKTLGSISAAGSGYSTGTAIATSASASGSGATLNITSVNASGGITGVAINDDG
SGYAASEVLTITNANASGIATVGNIGAADASRTAGTYNLGTSDYGTEASGANATFTVVVD
SNGAASITVTDDGSGFIANETITVADAQLGGGGGAALTFDVTAIHGSTATVPVSAIHGNG
ATVNVATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVNTVDGFFKKGE
VVSANDVTTLTISSFS
NT seq
6711 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatagaattcaattaagaagaggtggcgcacaggaatgggcgaactctaacccg
actcttgcacaaggtgaattgggtatcgaacttgacacgggtcgttttaagatcggtgat
ggtgtatctgcatggaacaccttaaggtacgaacgtcctgtagagtctacatctaatact
gcaaatactttagtccaaagggatgctgatggtaacttctctgcaggtaccattacttct
actgttattggtaactcgtctactgcgtctagacttgcttcatctagacaaatccaactc
tctaatgaggttactgcttctggtgtatttgatggttctcaaaacttaaatctatctgct
gaattagcacttgtttctactttaccacattacgatggtacatcatctccctcagcaact
tacaataaggtaactgttgatgctaaaggtagagtaacaaacgcacaagattttactgct
tctaacaatggtactcttgctgattatggtcttgatggaaccaatgaaggaacatctgca
caaccatatgatttagacttagttgctttagcaggtttgaccactactggtatgatctct
agaactgcttctaatactgtagcaactagagcaattactggaactgccacaagaatctct
gtaagtgagggtgcaggtatttctggtaacccaactattgatatgattaccactgctgtt
acagcaggtaactataatacggaatccctgacatctgtatctggtgcaggtggaaatggc
gaaccctttggtaccgctacagttaacgctactaagtttactgttgatgcctatggtaga
ttgacaagtgcaacaaatgtgcctatcgctactgctgcagaaggtagtaagtatgctagc
tataatgcaggtactacttacgttagatatgacatcattgctaacgcatcaaaagtttac
caagccatcactggcattgctgcaggtgcaggtgcacctactcatagtagcggtgactct
ggcgggtggagatatctcgctgccgaagcaacagagcagaagggattggctagttttgca
caagaagatttcgacgttgacgcgaacgggcacgtcacgatcgccaccgcaggagtagat
aatacacaactacaaaataataaacttattttcacagatggaaatgctgttgaaaatttt
gaattagataacgaacttacaacttctaccgccaacactggttttaataaattaaacttt
attaaaatcaataatacttctggcggtttattatttggtgctaataatactggtgatagt
ggtgcaggtgagatcgatgtaaacgtacgttcttactttagcgatcctgatatcacttta
gatggttcagttgcacaaactctaaacaaaactggtgatggtaatcttactttcacaact
actcaaaactcatcatctgcaagatctttaacagtttcagcatcaaactctggttctgga
actagcacagttacaattactgcagaagatgttgttgatattgatgcctcagattcaaac
ggaaaagttcatgtcgaagattctagattccaagataactacattgctacgtctaatgcc
actatgcaccttgatcctggtgatgatcgtgctactagtgggttagttcgtgttcatgga
gatttacaggtagatggtacgactacgacaattaattcaacagttacaacaattgatgat
cccattattactcttggtggcgatactgctccaggtagtgatgacaataaagatcgtgga
gttgaattcagatactacgacaatcaagcaagaattggattctttggttacgatgattct
tacaccgacctcggaggacacgtcggaggatttacatttttacacaacgccacaaatact
tcagaggtctttagtggaactgcgtcaggtataactgcaggtaatttaaaacttacaaca
aatactaactcaacatctaatactacaggagacttagtagttgcaggtggtgttggtatt
ggagatgatgttaatattggtggattactagatgtagatggcacattccgtgctaatagc
acatctagatttgatgataatattgtattccaaggtgcttctaagacattatcattgaat
aatggtagtggaacgactaaaatacaactccacactactacaggtaatgtagaaattggt
ggtattttaacaaatactggtgctattgatgcaaacagcactttgaatgtcgcaggtatt
gttcgttttgaagatacagatgaaccaactgttgcacagaatggtggaactggtctttat
gaaattcaatcaaatgattatggtgcatttagatttgatggtggtggatatgttgaaggt
gatacagtattcaacagcgatgtttttattaacggtgttctaaaccaaagagatagtgct
acagaatcattcggtaatagaaactatctaaacatcagatataaattacgttctggttca
agtgcagcgtatactccttcatatgcatctgataatacctctaacttgagaatctttggt
ggtgcaggtattcaaactgatctccatattggtgatgatctttatattggtaaactaaac
tctggtgacagtgtttcattccaagtattaggagagtcaggtaatacaactactcaagga
acattaactgttgaaggtcaagcaactattaatgactctctaattgttaatgcttctaac
gaaaactttaagattcaaaatggatctgctgcagataaatttacagttgatactgataat
ggtaatactgtaattcaaggatcattgaatgttaacggtgttactgatattgatgctgat
tttgcagttagaaacggaacgactgataaattctttgtcgataacgtaactggtaatact
aatattgaaggtacgttgactgctgatggtcatactgaattaaattcaacacttaatgtt
gataataatacaacacttggttcacaacttacagtaactggtaactcagagttcaacgga
actgtagatgttgatgcaaactttgcagtcagatcaggaactactgataagatgactgtt
gcatcttctacaggtaacatagcaactgatggaacactaacagttcaaggtgaaacacag
atcattgactctcttattatcaatgcatctaacgaagagtttgcagttcagaatggttct
ggagttgataaatttactgtagatactgataacggtaatacaaatattatcggaacatta
acagttgctgatgctactcaaattaataatactcttggtgtttctaacgttgtaacctta
acaagaaacactcagcaaactctgactggatcttattctgctgatggtgcattcaaacta
actggtggtgcaggtatcggtaaaaaccttgctgttggtgaaggtctaagagtatatgga
ggcactgaacttactggtgctcttgatcttaataatagtgctgatatatctggtgcttta
gtaactcatgatgatgttactatcactgcagataataagatgttcaaggtgcagaatgct
tctgcagcgaacaagtttacagtcgataccgataatggtaacactgatattcaaggaaca
ttggatgttgcaggtgatgtaactgcatcatctgaccttacagtcacaggaaatcttaca
gtcaatggaacaacaactactgtcaattctacggtcacaacaatcgatgaccctgttatt
actgttggtggtgatacagcacccgcgtctaatgatggaaaggatcgtggtattgaattt
cgttattatgatggttctgctaaaatcggtttcttcggttttgatagatcatcctcccaa
ttccaattcttaacaagtgcaacaaatacttctgaagttctctcaggaacagatggtgct
ctaagagcaggtagtttaaatcttactggtgcgggcacatctcttgatgttgatgctaat
gcaaacattgatggcacactgactgtagatggtcagattatttcacaagtatcttcaggt
cctgctcttgttatcccaacaacagataagattaataatcttaacgcagacttactagat
ggtgctacaaccgcaactgctgcaactgcatccacagttgttcttcgtgattcatctggt
gattttgctgccaatcaaatcactgctgctagtgctgcaggatctggtgcaggtttctta
ggaaacgcatccactgctgacgcatggaagactgctagaacactcaccattagcggtgtt
gtatctggttctgtagtcatcgatggaagtgaaaatgaaacacttacaacaacttatgtt
gatgcagacatcactgctctagcagcgatgagtggaactggttatgtcgtacgaactgct
gctaacacttatgcccaaagaactctccaagtcaccgcatcgtctggaatcactcttact
aacgctgatggcgtttctggtaatactacaattaacgttgctagtgcatcttctaattct
gcaaacaacctcgtcctaagagacggatctggtaactttgctgcaggaactatcactgct
gccttaactggtaatgtcacaggtaatgtaactggtaacgttactggtcaggtatctgat
atctcaaaccatgatactggtgatcttactgagggatctaacctctactacactaatgaa
agagttgacgatagagtcaatgctcttattactgcaggaactggtattactaaggtttac
gatgacgctgcaaatacatatacactgactgtaactcagtcagatatcaatactgataat
gtaactgaaggatcaacaaatctattcacaactgctgctagaactagaactcatttcaca
tatggaactggtatcacacatagttctggaactttatcagttactcagtctgatattaat
actgacaacgtaactgaaggatcaactaacctctttactactgctgctagaacaagaaca
cactttacatacggaactggtattacacacagttctggaactttatcagttacacaatca
gatatcaacactgataatattactgaaggttctacaaacctattcattactaatgaacgt
gttgatgatagagtcaacgccttaactgttgcaggaactggtgtaagtaagacatatgat
gacgctgcaggaactctaactttagcagttgactttagtgagtttaatactggcaatatt
acagagggttctaacctttactttacaaacactcgtgctgatgcaagggcagacttgaaa
gttgctgctgcaactggttcaaaccttgatctttcttctaagtctacttccgatctttct
gaaggaactaatcaatactatacagaaacaagagttcaagcaaaacttgacaatgcttat
gagcaactaagagcaatgttaactaaccttgcaactagcaccactctaaatcttaacttg
tctggtgatcctacacctggcgcagtcgttaccactggtgttagtgttggtggtggcggt
ggatttactgcaggaactgcggttgctacatctggttcagcaactggatctggattgact
gttgatactacggttgatagtgatggaaacatcactgctgctgcggtaaatgcaggtggt
tctggatatctaattactgatactgtcacagtcactaaccccaacgcaggtaagattctt
acattgaacttggcaacattatcaggtggaacaggttattcatctgctactggagttgca
gtcactgggggtgacggttcttctgcgactgttgacattactgcatctgcaggtgctatc
actaacgtaacagttaataacggtggaacaggattcgctgcgggtaatactataactatt
gctaatgctaatgctactggagttaagactcttggatctattagtgctgcaggatctgga
tattcaacaggaactgccattgcaacatcagcgtccgcatctggatctggagcaacatta
aatatcacttctgtcaatgctagtggtggtatcactggtgttgcaatcaacgatgatgga
tctggttacgctgcatctgaagtcttgacaattactaatgctaacgcatctggtatcgca
acagtaggaaacattggtgctgctgatgcatcaagaactgcaggaacctataacttaggc
acatctgattatggaactgaagcatctggtgccaacgcaacattcactgttgttgttgat
tcaaatggtgctgcttctatcaccgtaacagatgatggtagcggatttatcgccaatgaa
actatcacagttgctgatgctcaacttggtggtggcggtggtgctgctcttacattcgat
gtaacagcaatccatggtagcactgctacagttccagtatctgcgattcatggaaacggt
gcaacagttaatgtcgctaccgttgcaacaaatgcaactctaactctaactgacatcaca
acgatggaagttggagcaacagttacaggtgctacttctggcaccacaggtgttatcact
gctctgggaactaaccagatcactgtcaataccgttgacggattcttcaagaaaggagaa
gtcgtcagtgctaatgatgttactacacttactatctcctcattcagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
