KEGG   Viruses: 54998634
Entry
54998634          CDS       T40000                                 
Symbol
54, HOT82_gp054
Name
(RefSeq) Gordonia phage Ronaldo; tail length tape measure protein
Virus
2250397  Gordonia phage Ronaldo
SSDB
Motif
Pfam: TMP_3 SLT TMP_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 54998634
NCBI-ProteinID: YP_009807750
RS: NC_048028
LinkDB
Position
NC_048028:22393..27948
AA seq 1851 aa
MAIELAQAYVSLHIESKDVPKEVGQALGGNQTQREATKAGEKSGGKFASGMGKVLLGAGA
AVGAAGGAAIGGALASGFSRLSKIEEAKSKLTGLGNTSMATSEAMDSALQSVQGTAYGLD
DAATIAASAMAAGVKPGKELTNYLKLTADTASITGASLSDTGRVMNNVTTLNNAYNDSLQ
VLAQRGLPIYTWLSEELGVSTAAVKDLAKEGKISAAVFQRAIAKHVSGAALDAGDTVQGS
FENMVTAVTRLGAAFLEPSFKRGPGLIAGITTRIDALAPTVRNLGMDVDDTIFNKLIPGL
EKGYAAAKPWAEMQWKSGIGLALQEAGDAIQELTPAVKDLFKATGLGGGAAGVSMFGFIT
AGVQAFTAGLEAVTPLIKSVSGFLAEHTGIVKAAVGAYLTFKFAQMALGGLRAGWAQTAA
ASGGALARMRAGMSTANIQGGVLTRTVSGIFTTAGAAAATTARPISAINTLLRGTGTSAA
VSGRELSRISTNLQNWGSSTTPIIAGTNRQISTFGSNTRTAATNTGTLGQRFANAGRNAL
TAGGQMAKAIGSTLGLTAAIVGVGMLAQSWSDARANSQRYAASLKDVEKAQSTAFNALIA
SRGETTPDVVAATAEQVKGVEDALNSVKGPAWHQRLGDFFQPSGEDSFSIGNIPGLGPDM
PEKLSKPSRMQENHDDSQRALKVMDALKITTEEMGVAVSGTSLQWQTMRDRLTAAGDGGN
YLLSKMVPLRIEHEASAKAARELAPGTMELGRAIDIMGDSSASASTKLKALKEAMDAANP
QGDRASGMAAYGEAIRQVQNEIGNLSGVVIRADGSLDTVNESGAKLYATLRSLAEGAGQA
AVSGNMEDMKRVAQENEQVFRQLADATGLSIGKIKELYGTFGGKTVDITMSLANQPEIIS
QLGFIKSQLDGVKTNVPITIGADQVTKDTEAYLTGLGIKVDRLADPSGKTVKINAQSEGA
EAALAGVMQKIIEFNNSNPEANMDLNTARFNLKAGEATDALTRLKNSDATPQPVDLIIDK
LLQGKQISVQELAVLSATTANPKVALEAKEVMAKIQAINDALDQAARERRARIVMEELRT
GQMTSEQFGQNFDRNIRSRANENGSITMDHFANGGFKHINKPTKADIYQGRGAGTVFAES
KTKGEAYIPLAPEKRGRSSQILGTVAKAFGFQLLKNGQSKVNLNKGNPNPKDFKGTVVNG
MRVYADGGISIDDFDALARGEIHGNVPLQGAPYVWGGVHWGDCSGAMSAFSNLAAGLPPW
GSRWATGSAEGELKRRGFTMGRGSDGDLRFGWHNNGVGHTAGTLPSGANVEMGGANNGGA
YNGSVGADDGQFTNHAYMSGFGGGYDYSSPEGEDKGGYVIRPDGSFYYDPNLNTSGGSNS
TIVGPFDGGGNTDSISGLFGSAASAAVAGQVSDILGVFGIPDQPSQLAAYNEYIDARKGY
LSGMLEKLNKEEREKNGGTDGTGSKLKDGSASPLERQELKDKKDQLKRSYDDAKFERSMK
YDEAKDMLADKYRPKGSDKNAYRRELDELEDRYKREEFDKEREYDDAVDALERGLTNKYL
RNDQPGTSAPESETGAQQSGPQEQVINYNPAAGAGQWAPYVARVLTMLGLDQALGDKVIA
QIDIESKGDPRAVNEGYSAGGGHPSGLLQTLPDTFNAFKSGQLSSDIFDPMANIYAGCNY
ANNDPKYKDRGIAGIWPTTAGYAKGGPVSGKGTGTSDEIPLWASNGEFIVDAATTKAAGA
LLPHLNGNPKLAAAVSDFVMGTGNLAKQYSPQIGIAAGVADAVNSTAVGAARQIQSTATG
FANQFRHNAPANSTVDNRVMIESISAKDADDIARKIARNQRVRAMTYSGRP
NT seq 5556 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggccattgaactagcacaggcgtacgtctccctacatatcgagtccaaggacgttccc
aaggaagtgggacaagccttggggggcaaccaaactcagagggaggcgacgaaggcaggc
gaaaaatctggcggcaaattcgcttccggtatgggcaaagtcctactaggtgcaggtgcc
gctgttggtgctgctggtggcgctgccatcggtggtgctttggcatcaggcttttcacgc
ctctctaagattgaagaggccaaatccaagctaacaggtttgggtaatacttccatggca
acaagtgaagccatggattccgcattgcaatccgtccaaggaacagcctatggattggat
gatgctgcaacgattgccgcgtcagctatggcggcaggcgtcaagcccggtaaggaactg
acgaattaccttaaactgacggcagatacagcgtccatcactggtgcgtccctgtcggat
accggccgcgtgatgaacaatgtcacgacgctaaacaacgcttacaacgattctttgcag
gttctcgctcagcgcggattgcctatctacacttggctttccgaggagctaggcgtttcc
acggcggcggtgaaagaccttgccaaggaaggaaagatttcagcggctgtatttcagcgc
gctattgcaaagcatgtttcaggtgctgccctagacgctggtgatacggttcagggttcg
ttcgaaaatatggtgaccgctgtaacccgtttgggcgcagcgtttttggagcctagcttt
aagcgtggccccggactcatcgcgggaatcactacccgaatcgatgctctcgcaccgact
gttcgcaatttgggaatggatgtcgatgacactattttcaataagctaattcctggtctc
gaaaagggatatgccgctgctaagccttgggctgaaatgcagtggaaatccggaattggc
ttggcgctccaggaagctggcgatgccatccaggaattaaccccagccgtgaaggacctg
tttaaggcaacaggtttgggtggtggcgctgctggcgtttccatgttcgggttcattacc
gctggcgtacaagcgtttacggctggactagaagccgtcactcctctcatcaagtcggtt
tcaggattccttgctgaacatacgggaatcgtgaaagccgctgtcggagcgtatcttaca
ttcaagtttgcacagatggcccttggtggtctgcgtgcaggttgggcacagactgctgcc
gcttccggtggggcacttgcccgtatgcgtgcaggaatgtctaccgctaacattcagggt
ggcgttctaacccgtactgtctcaggcattttcaccacggctggtgctgctgccgcgact
actgcccgtcctatctccgctattaataccctcctacgtggaaccggtactagcgcagcg
gtttccgggcgtgagctttcgagaatcagtactaacctacagaattggggtagctctacc
accccgatcattgctggtacgaatcgacagatttctacgttcgggtccaatacccgtact
gccgcaacgaataccggaactctgggtcagagattcgctaacgctggacgcaacgcgctt
actgctggcggacaaatggctaaggctatcggtagcactctcggtttgactgccgctatt
gttggcgtgggtatgctggcccaaagttggtctgacgcaagggctaacagccagcgctat
gccgcttctctgaaagatgttgagaaagcacagtccaccgcgtttaacgctctaatcgct
tctcgcggtgaaacaacccctgatgtggttgcagctaccgcggaacaggttaagggcgta
gaggatgctctgaatagcgttaagggtcccgcttggcatcagcgtttgggtgatttcttc
cagccttccggtgaggattcattctctatcggaaacattcccggccttggcccggacatg
cctgaaaagctttccaagccttcacgcatgcaagagaaccatgatgattctcagcgtgcg
ctaaaggtgatggatgccctaaagattactaccgaagaaatgggcgttgccgtttccggt
acttctctacagtggcagaccatgcgcgacaggctaactgccgcaggtgatggtggtaat
tatcttctgtcgaagatggttccgctacgtatcgagcatgaggcttccgctaaggctgct
cgtgaattggctcctggcacaatggaattgggccgcgccatcgacattatgggtgactct
tcggcttccgcttcgacgaagctaaaggctctcaaagaggcgatggacgccgctaatccc
cagggcgacagggcttctggtatggctgcctatggcgaagcaattcgtcaggtgcagaat
gagattggcaatctgtctggcgtggtcattcgcgctgatggttcgttggataccgtaaac
gaaagtggcgcaaagctttacgctactctccgctctctcgccgagggtgccggtcaggca
gcggtcagcggaaacatggaagacatgaagcgcgttgctcaggaaaatgagcaagtgttc
cgccaattggccgatgccacagggctttccatcgggaagatcaaggaactttacggaacc
ttcggtggtaagactgtcgatatcacgatgagtctagccaatcagcctgagattattagt
cagcttggctttattaaatctcagcttgatggtgtgaaaaccaatgtgccgattaccatt
ggcgcagaccaggttacgaaggacactgaagcctatctaaccggactcggaattaaggtt
gaccgcctagccgatccatctggtaagacggttaagattaatgcacaatccgaaggcgca
gaagctgcacttgccggagtgatgcagaaaatcatcgagtttaataactcgaatcccgaa
gccaatatggacctcaatacagctaggttcaatcttaaagcgggagaagccactgatgct
cttacgcgccttaagaattcggatgcaacgcctcagcctgttgatctaatcatcgataag
ctcttgcagggcaagcagatttccgtacaggaacttgctgttctgagtgccactaccgct
aaccccaaggttgcgctagaagctaaagaggttatggctaagattcaggccatcaatgat
gccttggatcaggcagctcgtgagcgtcgtgcgcgaattgtcatggaggagttgcggact
ggccagatgaccagcgagcaattcggccagaactttgatcggaatatccgttctcgcgcc
aatgagaatggttccatcactatggaccatttcgctaatggtggatttaagcacatcaac
aagccgaccaaggcagacatctaccaaggtcgtggtgccggaacggttttcgctgagtcg
aagactaagggcgaagcctatattccgctcgcgcctgaaaagcgtggtcgcagttcacaa
atcctaggcacggttgcgaaagcctttggcttccaactacttaagaacggtcagtcaaag
gttaacctcaacaagggtaacccaaatcccaaggacttcaagggaaccgtcgttaatggt
atgcgcgtgtatgccgatggcggtatttcaattgatgactttgatgctctggctcgtggt
gagattcacggtaatgtcccactacagggtgccccctatgtttggggtggcgtccattgg
ggtgactgttcgggcgctatgtctgcgttctcgaatcttgctgcgggacttccgccttgg
ggttcgcgatgggctaccggctccgctgagggtgaactaaagcgtcgtggtttcacgatg
ggtcgaggctccgatggtgatctacggtttggttggcacaacaacggagttggtcatacg
gcaggaacgctaccctctggcgctaacgtcgagatgggtggcgcgaataatggtggcgca
tacaatggttcggttggtgctgacgatggtcagttcacgaatcatgcctacatgtcaggc
ttcggtgggggctacgactattcgtcccccgagggagaagataagggcggctatgttatt
cgtccggatggttcgttctattacgatcctaatctgaacacgagtggcggtagcaattcc
actattgtcggacctttcgacggtggcggtaatacggattccatttccggcctgttcggt
tcggcagcgagtgctgctgtggcagggcaggtttcggatattctaggtgtcttcggtatt
cccgatcagcctagtcagctagctgcatacaacgaatacattgatgcccgcaagggttat
ctttcgggaatgcttgaaaagctgaacaaggaagaacgtgaaaagaacggtggcacagac
ggtaccggctctaagctaaaggatggttctgcgagtcctcttgaacgtcaagaacttaag
gacaaaaaggaccagctaaagcgttcatatgatgatgctaagtttgaacgtagcatgaag
tatgacgaagctaaggacatgcttgccgataagtatcgacccaagggttccgataagaat
gcttatcgtcgtgagttggacgaactcgaagatcgttacaagcgtgaggaattcgacaag
gagcgcgaatatgacgatgcggtcgacgctctcgaaagaggcttgaccaacaagtatctt
cgtaacgatcagcctggtacgtctgcccccgaatccgaaactggcgcacagcaatccggc
ccacaagagcaggttattaattacaaccctgccgctggtgctggacagtgggcaccctat
gtggctcgtgttctcacgatgcttggtcttgatcaagccttgggggacaaggtcattgct
cagattgatattgaatctaagggtgatccgcgtgccgtcaatgagggttattctgctggc
ggtggccatccttcgggtctattgcagactcttccggatacgttcaatgcgtttaagtct
gggcaattgtcttcggatatctttgatcctatggcgaacatttatgcgggttgtaactac
gcaaacaatgatcccaagtataaggatcggggcattgctggaatctggcctacgacagcg
ggttacgccaagggtggacccgttagcggcaagggtaccggaacctctgatgagattcct
ttgtgggcatcgaatggtgaattcattgtcgatgctgccactaccaaggctgctggcgct
ttgctgccacaccttaacggtaatcctaagttggctgctgctgttagcgacttcgtaatg
ggcacaggcaatttggctaagcagtattctccgcaaatcggcattgctgctggtgtcgcg
gatgctgtgaattccacggctgtgggtgctgcccgccaaatccaaagtaccgcaacaggt
ttcgcaaaccagttccggcacaacgctcctgctaattcgacagtggataaccgagtaatg
atcgaatccatttcggctaaagatgcagacgatatcgctagaaagattgctcgtaaccaa
cgtgttcgggctatgacatattcagggaggccatga

DBGET integrated database retrieval system