Viruses: 54998634
Help
Entry
54998634 CDS
T40000
Symbol
54, HOT82_gp054
Name
(RefSeq) Gordonia phage Ronaldo; tail length tape measure protein
Virus
2250397
Gordonia phage Ronaldo
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
TMP_3
SLT
TMP_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
54998634
NCBI-ProteinID:
YP_009807750
RS:
NC_048028
LinkDB
All DBs
Position
NC_048028:22393..27948
Genome browser
AA seq
1851 aa
AA seq
DB search
MAIELAQAYVSLHIESKDVPKEVGQALGGNQTQREATKAGEKSGGKFASGMGKVLLGAGA
AVGAAGGAAIGGALASGFSRLSKIEEAKSKLTGLGNTSMATSEAMDSALQSVQGTAYGLD
DAATIAASAMAAGVKPGKELTNYLKLTADTASITGASLSDTGRVMNNVTTLNNAYNDSLQ
VLAQRGLPIYTWLSEELGVSTAAVKDLAKEGKISAAVFQRAIAKHVSGAALDAGDTVQGS
FENMVTAVTRLGAAFLEPSFKRGPGLIAGITTRIDALAPTVRNLGMDVDDTIFNKLIPGL
EKGYAAAKPWAEMQWKSGIGLALQEAGDAIQELTPAVKDLFKATGLGGGAAGVSMFGFIT
AGVQAFTAGLEAVTPLIKSVSGFLAEHTGIVKAAVGAYLTFKFAQMALGGLRAGWAQTAA
ASGGALARMRAGMSTANIQGGVLTRTVSGIFTTAGAAAATTARPISAINTLLRGTGTSAA
VSGRELSRISTNLQNWGSSTTPIIAGTNRQISTFGSNTRTAATNTGTLGQRFANAGRNAL
TAGGQMAKAIGSTLGLTAAIVGVGMLAQSWSDARANSQRYAASLKDVEKAQSTAFNALIA
SRGETTPDVVAATAEQVKGVEDALNSVKGPAWHQRLGDFFQPSGEDSFSIGNIPGLGPDM
PEKLSKPSRMQENHDDSQRALKVMDALKITTEEMGVAVSGTSLQWQTMRDRLTAAGDGGN
YLLSKMVPLRIEHEASAKAARELAPGTMELGRAIDIMGDSSASASTKLKALKEAMDAANP
QGDRASGMAAYGEAIRQVQNEIGNLSGVVIRADGSLDTVNESGAKLYATLRSLAEGAGQA
AVSGNMEDMKRVAQENEQVFRQLADATGLSIGKIKELYGTFGGKTVDITMSLANQPEIIS
QLGFIKSQLDGVKTNVPITIGADQVTKDTEAYLTGLGIKVDRLADPSGKTVKINAQSEGA
EAALAGVMQKIIEFNNSNPEANMDLNTARFNLKAGEATDALTRLKNSDATPQPVDLIIDK
LLQGKQISVQELAVLSATTANPKVALEAKEVMAKIQAINDALDQAARERRARIVMEELRT
GQMTSEQFGQNFDRNIRSRANENGSITMDHFANGGFKHINKPTKADIYQGRGAGTVFAES
KTKGEAYIPLAPEKRGRSSQILGTVAKAFGFQLLKNGQSKVNLNKGNPNPKDFKGTVVNG
MRVYADGGISIDDFDALARGEIHGNVPLQGAPYVWGGVHWGDCSGAMSAFSNLAAGLPPW
GSRWATGSAEGELKRRGFTMGRGSDGDLRFGWHNNGVGHTAGTLPSGANVEMGGANNGGA
YNGSVGADDGQFTNHAYMSGFGGGYDYSSPEGEDKGGYVIRPDGSFYYDPNLNTSGGSNS
TIVGPFDGGGNTDSISGLFGSAASAAVAGQVSDILGVFGIPDQPSQLAAYNEYIDARKGY
LSGMLEKLNKEEREKNGGTDGTGSKLKDGSASPLERQELKDKKDQLKRSYDDAKFERSMK
YDEAKDMLADKYRPKGSDKNAYRRELDELEDRYKREEFDKEREYDDAVDALERGLTNKYL
RNDQPGTSAPESETGAQQSGPQEQVINYNPAAGAGQWAPYVARVLTMLGLDQALGDKVIA
QIDIESKGDPRAVNEGYSAGGGHPSGLLQTLPDTFNAFKSGQLSSDIFDPMANIYAGCNY
ANNDPKYKDRGIAGIWPTTAGYAKGGPVSGKGTGTSDEIPLWASNGEFIVDAATTKAAGA
LLPHLNGNPKLAAAVSDFVMGTGNLAKQYSPQIGIAAGVADAVNSTAVGAARQIQSTATG
FANQFRHNAPANSTVDNRVMIESISAKDADDIARKIARNQRVRAMTYSGRP
NT seq
5556 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccattgaactagcacaggcgtacgtctccctacatatcgagtccaaggacgttccc
aaggaagtgggacaagccttggggggcaaccaaactcagagggaggcgacgaaggcaggc
gaaaaatctggcggcaaattcgcttccggtatgggcaaagtcctactaggtgcaggtgcc
gctgttggtgctgctggtggcgctgccatcggtggtgctttggcatcaggcttttcacgc
ctctctaagattgaagaggccaaatccaagctaacaggtttgggtaatacttccatggca
acaagtgaagccatggattccgcattgcaatccgtccaaggaacagcctatggattggat
gatgctgcaacgattgccgcgtcagctatggcggcaggcgtcaagcccggtaaggaactg
acgaattaccttaaactgacggcagatacagcgtccatcactggtgcgtccctgtcggat
accggccgcgtgatgaacaatgtcacgacgctaaacaacgcttacaacgattctttgcag
gttctcgctcagcgcggattgcctatctacacttggctttccgaggagctaggcgtttcc
acggcggcggtgaaagaccttgccaaggaaggaaagatttcagcggctgtatttcagcgc
gctattgcaaagcatgtttcaggtgctgccctagacgctggtgatacggttcagggttcg
ttcgaaaatatggtgaccgctgtaacccgtttgggcgcagcgtttttggagcctagcttt
aagcgtggccccggactcatcgcgggaatcactacccgaatcgatgctctcgcaccgact
gttcgcaatttgggaatggatgtcgatgacactattttcaataagctaattcctggtctc
gaaaagggatatgccgctgctaagccttgggctgaaatgcagtggaaatccggaattggc
ttggcgctccaggaagctggcgatgccatccaggaattaaccccagccgtgaaggacctg
tttaaggcaacaggtttgggtggtggcgctgctggcgtttccatgttcgggttcattacc
gctggcgtacaagcgtttacggctggactagaagccgtcactcctctcatcaagtcggtt
tcaggattccttgctgaacatacgggaatcgtgaaagccgctgtcggagcgtatcttaca
ttcaagtttgcacagatggcccttggtggtctgcgtgcaggttgggcacagactgctgcc
gcttccggtggggcacttgcccgtatgcgtgcaggaatgtctaccgctaacattcagggt
ggcgttctaacccgtactgtctcaggcattttcaccacggctggtgctgctgccgcgact
actgcccgtcctatctccgctattaataccctcctacgtggaaccggtactagcgcagcg
gtttccgggcgtgagctttcgagaatcagtactaacctacagaattggggtagctctacc
accccgatcattgctggtacgaatcgacagatttctacgttcgggtccaatacccgtact
gccgcaacgaataccggaactctgggtcagagattcgctaacgctggacgcaacgcgctt
actgctggcggacaaatggctaaggctatcggtagcactctcggtttgactgccgctatt
gttggcgtgggtatgctggcccaaagttggtctgacgcaagggctaacagccagcgctat
gccgcttctctgaaagatgttgagaaagcacagtccaccgcgtttaacgctctaatcgct
tctcgcggtgaaacaacccctgatgtggttgcagctaccgcggaacaggttaagggcgta
gaggatgctctgaatagcgttaagggtcccgcttggcatcagcgtttgggtgatttcttc
cagccttccggtgaggattcattctctatcggaaacattcccggccttggcccggacatg
cctgaaaagctttccaagccttcacgcatgcaagagaaccatgatgattctcagcgtgcg
ctaaaggtgatggatgccctaaagattactaccgaagaaatgggcgttgccgtttccggt
acttctctacagtggcagaccatgcgcgacaggctaactgccgcaggtgatggtggtaat
tatcttctgtcgaagatggttccgctacgtatcgagcatgaggcttccgctaaggctgct
cgtgaattggctcctggcacaatggaattgggccgcgccatcgacattatgggtgactct
tcggcttccgcttcgacgaagctaaaggctctcaaagaggcgatggacgccgctaatccc
cagggcgacagggcttctggtatggctgcctatggcgaagcaattcgtcaggtgcagaat
gagattggcaatctgtctggcgtggtcattcgcgctgatggttcgttggataccgtaaac
gaaagtggcgcaaagctttacgctactctccgctctctcgccgagggtgccggtcaggca
gcggtcagcggaaacatggaagacatgaagcgcgttgctcaggaaaatgagcaagtgttc
cgccaattggccgatgccacagggctttccatcgggaagatcaaggaactttacggaacc
ttcggtggtaagactgtcgatatcacgatgagtctagccaatcagcctgagattattagt
cagcttggctttattaaatctcagcttgatggtgtgaaaaccaatgtgccgattaccatt
ggcgcagaccaggttacgaaggacactgaagcctatctaaccggactcggaattaaggtt
gaccgcctagccgatccatctggtaagacggttaagattaatgcacaatccgaaggcgca
gaagctgcacttgccggagtgatgcagaaaatcatcgagtttaataactcgaatcccgaa
gccaatatggacctcaatacagctaggttcaatcttaaagcgggagaagccactgatgct
cttacgcgccttaagaattcggatgcaacgcctcagcctgttgatctaatcatcgataag
ctcttgcagggcaagcagatttccgtacaggaacttgctgttctgagtgccactaccgct
aaccccaaggttgcgctagaagctaaagaggttatggctaagattcaggccatcaatgat
gccttggatcaggcagctcgtgagcgtcgtgcgcgaattgtcatggaggagttgcggact
ggccagatgaccagcgagcaattcggccagaactttgatcggaatatccgttctcgcgcc
aatgagaatggttccatcactatggaccatttcgctaatggtggatttaagcacatcaac
aagccgaccaaggcagacatctaccaaggtcgtggtgccggaacggttttcgctgagtcg
aagactaagggcgaagcctatattccgctcgcgcctgaaaagcgtggtcgcagttcacaa
atcctaggcacggttgcgaaagcctttggcttccaactacttaagaacggtcagtcaaag
gttaacctcaacaagggtaacccaaatcccaaggacttcaagggaaccgtcgttaatggt
atgcgcgtgtatgccgatggcggtatttcaattgatgactttgatgctctggctcgtggt
gagattcacggtaatgtcccactacagggtgccccctatgtttggggtggcgtccattgg
ggtgactgttcgggcgctatgtctgcgttctcgaatcttgctgcgggacttccgccttgg
ggttcgcgatgggctaccggctccgctgagggtgaactaaagcgtcgtggtttcacgatg
ggtcgaggctccgatggtgatctacggtttggttggcacaacaacggagttggtcatacg
gcaggaacgctaccctctggcgctaacgtcgagatgggtggcgcgaataatggtggcgca
tacaatggttcggttggtgctgacgatggtcagttcacgaatcatgcctacatgtcaggc
ttcggtgggggctacgactattcgtcccccgagggagaagataagggcggctatgttatt
cgtccggatggttcgttctattacgatcctaatctgaacacgagtggcggtagcaattcc
actattgtcggacctttcgacggtggcggtaatacggattccatttccggcctgttcggt
tcggcagcgagtgctgctgtggcagggcaggtttcggatattctaggtgtcttcggtatt
cccgatcagcctagtcagctagctgcatacaacgaatacattgatgcccgcaagggttat
ctttcgggaatgcttgaaaagctgaacaaggaagaacgtgaaaagaacggtggcacagac
ggtaccggctctaagctaaaggatggttctgcgagtcctcttgaacgtcaagaacttaag
gacaaaaaggaccagctaaagcgttcatatgatgatgctaagtttgaacgtagcatgaag
tatgacgaagctaaggacatgcttgccgataagtatcgacccaagggttccgataagaat
gcttatcgtcgtgagttggacgaactcgaagatcgttacaagcgtgaggaattcgacaag
gagcgcgaatatgacgatgcggtcgacgctctcgaaagaggcttgaccaacaagtatctt
cgtaacgatcagcctggtacgtctgcccccgaatccgaaactggcgcacagcaatccggc
ccacaagagcaggttattaattacaaccctgccgctggtgctggacagtgggcaccctat
gtggctcgtgttctcacgatgcttggtcttgatcaagccttgggggacaaggtcattgct
cagattgatattgaatctaagggtgatccgcgtgccgtcaatgagggttattctgctggc
ggtggccatccttcgggtctattgcagactcttccggatacgttcaatgcgtttaagtct
gggcaattgtcttcggatatctttgatcctatggcgaacatttatgcgggttgtaactac
gcaaacaatgatcccaagtataaggatcggggcattgctggaatctggcctacgacagcg
ggttacgccaagggtggacccgttagcggcaagggtaccggaacctctgatgagattcct
ttgtgggcatcgaatggtgaattcattgtcgatgctgccactaccaaggctgctggcgct
ttgctgccacaccttaacggtaatcctaagttggctgctgctgttagcgacttcgtaatg
ggcacaggcaatttggctaagcagtattctccgcaaatcggcattgctgctggtgtcgcg
gatgctgtgaattccacggctgtgggtgctgcccgccaaatccaaagtaccgcaacaggt
ttcgcaaaccagttccggcacaacgctcctgctaattcgacagtggataaccgagtaatg
atcgaatccatttcggctaaagatgcagacgatatcgctagaaagattgctcgtaaccaa
cgtgttcgggctatgacatattcagggaggccatga
DBGET
integrated database retrieval system