Viruses: 55002940
Help
Entry
55002940 CDS
T40000
Symbol
HOU12_gp42
Name
(RefSeq) Dickeya phage Katbat; internal virion protein with endolysin domain
KO
K21508
Autographiviridae peptidoglycan hydrolase [EC:4.2.2.-]
Virus
2320191
Dickeya phage Katbat
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SLT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55002940
NCBI-ProteinID:
YP_009811910
RS:
NC_048057
UniProt:
A0A385IFH5
LinkDB
All DBs
Position
NC_048057:29584..33546
Genome browser
AA seq
1320 aa
AA seq
DB search
MAYDKNKPSDLDVYFKQASDSEGVSYDYLRKLSFNESSFNVNAQSPTGPRGPMQMTKATA
RALGLVVSDDGSVDERTDPAKAIPAGARHLADLTRKFGGDELKAALAYNQGEGRLGSTQL
KAYDSGDFGKISAEGLNYMRKLSDVAKSPQLDALTQYGGIRPKADAFTVDEATKSWGEVQ
PAVKAGVGLPEGHEMGIQGAEVPAPNKPFSEQFWDQHHETISEAEDKGLLFGTKAAIEAN
TQNSPLGMAIRAARVDNSWDLFKDVITPTKWNSHVWTPEELSRIQKEVKNPAYMSVVTGG
SPENLDALIKLANENADLDAKAANSGAGAKVIGGVLGASLDPLSYVPLAGNAYKGASLLK
RAVSVGAQTAGLSVGSEFLRTNIAGGEAHYTEAAVGGFVFGAGLSSIADGLSKVATDNPF
HGTVTRLQNREDARLSGGENPGVMPIQEGEQMLEHAGVPYAHAVNDGDVRLQDGTILSAS
NPVNPETMRRFAEVNPEKSAYGIKTAGMTELGLRLLSSEDTAIRGIAQDLVRSPVGMQSG
SNGKFGATASDIVERLRSGDNRAENALYDAMKTALKDPEWSTGAFKTSAVGARQTIYQRA
VEAIERPENIAKLTDNEKKVMTVIKDMMDAKYEMLTNPSMFGRNDAIPVLQKSRHVGTYV
PNVYSRELKHGLIAKLGSPEAAQKAIASSWLKSYHTRPEVKARIDEHLAGTGETKVEVTP
AMVEKYAMDKAYGISHSDQFHVSSNVDDQLAMSDQSLTGLENNQFLEARQLFDSDLKTTL
PDGSEFSVNMLRDFDMRRIIPAYNRRVNGDIAIHGATGKTTKQLKDEILALKQKADGTGI
GANRQETDALADTLKVLTGRGRRSPDGALGTMLRSLADLSFFAKNAYMGVQNLTEIAGMI
ANGNVRALANGVPYLGELMNRTRVLPAKEVKELHSMMFGKEVDDLMRPTRQDLIEKLREF
SPASQTTANIVGTIKFGTQELAAKSPWTKVLNGTTNYLIDAGRQGVLSDILDNAVKGRNS
RWLKENYLKSASVSPEQAAGIKALIKEHVVRNADGSYTMPNKQAFSNDPRAMDLWRLGDK
IADEVMLRPHKLSLQDSQAFGPFARLMLQFKSFTIKSLNSKFLRSFYEGSKNGRALDTAL
TWAISGGLAGTYYVAQAHLKAASLPKEQQSEYLKKALNPNMVSYAALSRGSYLGAPLGVF
NLVAGPLGYDPAKMVRSSVLPQAEEKRPDRPVKGFAVGSDPIQNFMTGVLQQVPGAGWAA
NAFGTGYNLSGYLNSNKSLDERDYLTGMMNTSRELVPNDPITQQILLHMYQNGGIHLNGK
NT seq
3963 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcctacgataagaataaaccatcagaccttgatgtgtactttaaacaggcttcagat
agcgagggagtatcctatgactatctccgcaagctgtctttcaatgagtccagcttcaat
gtgaacgctcagtctcctacgggtcctcgtggcccaatgcagatgaccaaggctaccgct
cgtgctctgggtcttgttgtctctgatgatggctcagtggatgagcgtactgacccggct
aaggctatccctgctggtgctcgtcaccttgcagaccttacccgtaagtttggtggtgat
gagcttaaggctgctcttgcttataatcagggtgagggccgcttaggttccactcagctc
aaagcctatgattcaggtgacttcggtaagattagtgctgaaggtctgaactatatgcgt
aagctcagtgacgtcgctaagtctcctcagttggatgctctgactcagtatggtggtatt
cgcccaaaggctgatgccttcactgttgatgaggctaccaaatcttggggtgaggttcag
ccagcggtgaaggccggagtaggtttaccagaaggtcacgaaatgggaatccaaggggcc
gaagtaccggctcctaataagccattctctgaacagttctgggaccagcatcatgagact
atctcagaggctgaagataaaggcctgctgtttggaaccaaagcggccattgaggctaac
actcagaactcacctcttggcatggctatccgtgctgctcgtgtggataactcatgggac
ctctttaaggacgtcatcacgcctaccaaatggaacagccacgtatggacacctgaggaa
ctctctcggattcagaaggaggtcaagaatccagcctatatgagtgttgtcactggtggc
tctcctgagaaccttgacgccctcattaagttagcaaatgagaatgctgaccttgatgct
aaggctgcaaactctggtgctggtgctaaggtgattggtggagtccttggggcctctctg
gaccctctgagctatgtcccacttgctggtaatgcttataaaggtgcaagcctgttgaag
cgtgctgtgtctgtaggcgctcagactgctggccttagtgttggctcagagttcctgagg
actaacattgcgggtggtgaggcccattacactgaggctgctgtaggcggctttgtgttt
ggtgctggtctctcaagcattgctgatggactctctaaggttgccactgataatcctttc
catggaacagtgactcgcttacagaaccgtgaggatgctcgactgtctggtggtgagaat
ccgggtgtgatgcctattcaggaaggtgagcagatgctggaacatgctggagtgccttat
gctcacgctgtaaatgatggtgatgttcgtcttcaggatggcaccattctctctgcatcc
aatccagtgaaccctgagaccatgaggagattcgctgaggtgaaccctgagaagtcagct
tatggtatcaagactgctgggatgactgagctgggattgcgcctgctgagttctgaagat
accgctatccgtggaatcgctcaggacttagtgaggtctcctgtagggatgcaatcaggg
tctaatggcaagtttggagccactgcttcggatatcgttgagcgtcttcgttcaggtgat
aaccgtgctgagaatgctctctatgacgccatgaagacagctcttaaggaccctgagtgg
tccactggagccttcaagacctctgcggttggtgcccgtcagactatctatcagagagct
gtagaggccattgagcgtcctgagaacatcgctaagctaaccgacaatgagaagaaggtg
atgactgtcattaaggatatgatggatgcaaagtatgagatgctcacgaacccttctatg
tttgggcgtaatgatgcaatccctgtgctccagaagtctcgccatgttgggacctacgtg
cctaacgtctactctcgtgagctgaagcatggcctaattgctaagctgggttctcctgaa
gctgctcaaaaggctattgcctcaagctggctgaagtcttaccatacgcgtcctgaagtt
aaggctcgtattgatgagcatctggctggaaccggtgagactaaggtagaggttactcct
gcaatggttgagaagtacgctatggataaagcctatggtatctctcattctgaccagttc
catgtatcctctaacgtggatgaccagttggctatgtctgaccaatcactgaccggcctt
gagaacaatcagttccttgaagctcgtcagctctttgattcagacctgaagactactctg
ccagatggctcagagttctctgtgaacatgctccgtgacttcgatatgcgtagaatcatc
ccagcgtacaaccgtagggttaatggtgatattgctatccatggggcaaccggtaagacc
actaagcaacttaaggatgagattctggctctgaagcagaaggctgatggtactggcatt
ggtgcaaatcgtcaggagactgatgctctcgccgatacccttaaggttctcactggtcgt
ggtcgtcggtcacctgatggcgctctgggaaccatgctccgctctttggctgacttatcg
ttcttcgctaagaatgcctacatgggtgtgcagaacctcacagagattgctgggatgatt
gccaatggtaacgtccgtgctctggctaatggtgttccgtatctgggtgagctgatgaac
aggactcgtgtactccctgctaaggaagtcaaagagctgcactcaatgatgtttggtaaa
gaggttgatgacttgatgagacctactcgtcaggacctcattgagaagctccgtgagttc
tctcctgcgtctcagactacagctaacatcgtgggaaccattaagtttggtactcaggag
ctggctgctaagtctccatggactaaggtgctcaatgggaccactaactatctcattgat
gccggtcgtcagggtgtactgagtgatatcttggataatgctgttaaaggtagaaactca
aggtggctcaaggagaactatctgaagtctgcgagtgtctctcctgagcaggcagcaggc
attaaggcgctcattaaggaacatgtggttcgtaatgctgatggctcatacaccatgcct
aacaagcaggcgttctcaaatgaccctcgcgctatggacctgtggcgtctcggtgataag
attgcggatgaagtaatgctacgtcctcataagctgagccttcaggactcccaagcgttt
ggcccatttgctcgcttgatgctccagttcaagagcttcaccattaagtcactaaactct
aagttcctccgtagcttctatgagggttctaagaatggacgtgctcttgatacagctctg
acttgggctatttcaggtggacttgctggaacctactacgtggctcaggctcatctcaaa
gctgcttcgcttcctaaggaacagcagtcagagtacctgaagaaagctctgaaccctaac
atggtcagctatgcggctctgtctcgtggctcctacttaggtgctcctctgggtgtcttc
aacctcgtggctggtccattaggttatgaccctgctaagatggtccgttcctcagtgctt
cctcaggctgaagagaagcgtcctgaccgtcctgttaaaggctttgcggtaggctctgac
cctatccagaactttatgacaggtgttctccagcaggttcccggtgcaggctgggcggct
aatgcctttggtacaggttacaacctctcaggatacttgaactccaataagtctcttgat
gagcgtgattacctgacaggcatgatgaacacaagccgcgagctggttcctaatgaccct
atcactcagcaaatccttctccatatgtatcagaatggtggcatccatctgaacggtaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
