Viruses: 55003053
Help
Entry
55003053 CDS
T40000
Symbol
HOU14_gp44
Name
(RefSeq) Dickeya phage Luksen; internal virion protein with endolysin domain
KO
K21508
Autographiviridae peptidoglycan hydrolase [EC:4.2.2.-]
Virus
2320192
Dickeya phage Luksen
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SLT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55003053
NCBI-ProteinID:
YP_009812021
RS:
NC_048059
UniProt:
A0A385IFT3
LinkDB
All DBs
Position
NC_048059:30186..34148
Genome browser
AA seq
1320 aa
AA seq
DB search
MAYDKNKPSDLDVYFKQASDSEGVSYDYLRKLSFNESSFNVNAQSPTGPRGPMQMTKATA
RALGLVVSDDGSIDERTDPAKAIPAGARHLADLTHKFGGDELKAALAYNQGEGRLGSTQL
KAYDSGDFGKISAEGLNYMRKLSDVAKSPQLEALTQYGGIVPKANAFTVDEATKSWGEVQ
PAVKAGVGLPEGHEMGIQGAEVPAPNKPFSEQFWDQHHETISEAEDKGLLFGTKASIEAN
TQNSPLGMAIRAARVDNSWDLFKDVITPTKWNSHVWTPEELSRIQKEVKNPAYMSVVTGG
SPENLDALIKLANENADLDAKAANSGAGAKVIGGVLGASLDPLSYVPIAGNAYKGASLLK
RAVSVGAQTAGLSVGSEFLRTNIAGGEAHYTEAAVGGFVFGAGLSSIADGLSKVATDNPF
HGTVTRLQNREDARLSGGENPAVMPIQDGEQILEHAGVPYAHAVNDGDVRLQDGTILSAS
NPVNPETMKRFAEVNPEKSAYGIKTAGMTELGLRLLSSEDTAIRGIAQDLVRSPVGMQSG
SNGKFGATASDIVERLRSGDNRAENALYDAMKTALKDPEWSTGAFKTSTVGARQTIYQRA
VEAIERPENIAKLTDSEKKVMTVIKDMMDAKYEMLTNPSMFGRNDAIPVLQKSRHVGTYV
PNVYSRELKHGLIAKLGSPEEAQKAIASSWLKSYHTRPEVKARIDEHLAGTGETKVEVTP
AMVEKYAMDKAYGISHSDQFHVSSNVDDQLAMSDQSLTGLENNQFLEARQLFDSDLKTTL
PDGSEFSVNMLRDFDMRRIIPAYNRRVNGDIAIHGATGKTTKQLKDEILALKQKADGTGI
GANRQETDALADTLKILTGRGRRSPDGALGTMLRSMADLSFFAKNAYMGVQNLTEIAGMI
ANGNVRALANGVPYLGEMMNRTRVLPVKEVKELHSMMFGKEVDDLMRPTRQDLIEKLREF
SPASQTTANIVGTIKFGTQELAAKSPWTKVLNGTTNYLIDAGRQGVLSDILDNAVKGRNS
RWLKENYLKSASVSPEQAAGIKALIKEHVVRNADGSYTMPNKQAFSNDPRAMDLWRLGDK
IADEVMLRPHKLSLQDSQAFGPFARLMLQFKTFTIKSLNSKFLRSFYEGSKNGRALDTAL
TWAISGGLAGTYYVAQAHLKAASLPKEQQSEYLKKALDPNMVSYAALSRGSYLGAPLGVF
NLVAGPLGYDPAKMVRSSVLPQAEEKRPDRPVKGFAVGSDPIQNFMTGVLQQVPGAGWAA
NAFGTGYNLSGYLNSNKSLDERDYLTGMMNTSRELVPNDPITQQILLHMYQNGGIHLNGK
NT seq
3963 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcctacgataagaataaaccatcagaccttgatgtgtactttaaacaggcttcagat
agcgagggagtatcctatgactatctccgcaagctgtctttcaatgagtccagcttcaat
gtgaacgctcagtctcctacgggtcctcgtggcccaatgcagatgaccaaagctacagct
cgtgctctgggtcttgttgtctctgatgatggctcaattgatgagcgtactgacccggct
aaggctatccctgctggtgctcgtcaccttgcagacctgacccataagtttggtggtgat
gagcttaaggctgctcttgcatataatcagggtgagggacgcttaggctccactcagctt
aaagcctatgattcaggtgacttcggtaagattagtgccgaaggtctgaactatatgcgt
aagcttagcgacgtcgctaagtctcctcagttggaagctctgactcaatatggtggtatt
gtcccaaaggctaatgccttcactgttgatgaggctaccaaatcttggggtgaggttcag
ccagcggtgaaggccggagtaggtttaccagaaggtcacgaaatgggaatccaaggggcc
gaagtaccggctcctaataagccattctctgaacaattctgggaccagcatcatgagact
atctcagaggctgaagacaaaggtctgctgtttggaaccaaagcgtccattgaggctaac
actcagaactcacctcttggcatggctatccgcgctgctcgtgtggataactcttgggac
ctctttaaggacgtcattacgcctaccaaatggaacagccatgtatggacacctgaggaa
ctctctcggattcagaaggaggtcaagaacccggcctatatgagcgttgttactggtggc
tctcctgagaaccttgacgcactcattaagttagccaatgagaatgcagaccttgatgct
aaggctgcaaactctggggctggtgctaaggtgattggtggagtccttggagcttctctg
gaccctctgagttatgttcctattgctggtaatgcttacaaaggtgcaagcctgttgaag
cgcgctgtgtctgtaggcgctcagactgctggccttagtgttggctcagagttcctgagg
actaacattgcgggtggtgaagctcactatactgaggctgctgtaggcggctttgtgttt
ggtgctggcctctcaagcattgctgatggactctctaaggttgccactgataatcctttc
catggaacagtgactcgcttacagaaccgtgaggatgctcggttgtctggtggtgagaac
ccggcagtgatgcctattcaggatggagagcagattctggaacatgctggagtgccttat
gctcacgctgtgaatgatggcgatgttcgtcttcaggatggaaccattctctctgcatcc
aatccagtgaaccctgagaccatgaagcgattcgccgaggtgaaccctgagaagtcagct
tatggtattaagactgctgggatgactgagctggggttacgcctgttgagttctgaagat
accgctatccgtggaatcgctcaggacttagtgaggtctccagtagggatgcaatcaggg
tctaatggtaagtttggagccactgcttcggatatcgttgagcgtctacgttcaggtgat
aaccgtgctgagaatgctctttatgatgccatgaagaccgctcttaaggaccctgagtgg
tccactggagccttcaagacctctactgtgggtgctcgccagactatctatcagagagct
gtggaggccattgagcgccctgagaacatcgctaagctgacagacagtgagaagaaggtg
atgactgtcattaaggatatgatggacgccaagtatgagatgctcactaatccctctatg
tttgggcgtaatgatgctatccctgtgctccagaagtctcgccatgttgggacgtatgtg
cctaatgtgtattctcgtgagctgaagcatggcttaatcgctaagctgggttcacctgag
gaggctcagaaggctattgcctcaagctggttgaagtcttaccatacgcgtcctgaagtt
aaggctcgtattgatgagcatctggctggaaccggtgagactaaggtggaggttactcct
gcgatggttgagaagtatgctatggataaagcctatggtatttctcactctgaccagttc
catgtgtcctctaacgtggatgaccagttggctatgtctgaccaatcactgaccggtctt
gagaacaatcagttccttgaagctcgtcagctctttgattcagacctgaagactactctt
ccagatggctcagagttctctgtgaacatgctccgtgacttcgatatgcgtagaatcatc
ccggcatacaaccgtagggttaatggtgatatcgctatccatggggcaaccggcaagacc
actaagcagcttaaggatgagattctggctctgaagcagaaggctgatggtactggcatt
ggtgcaaatcgtcaggagactgatgctcttgcagatacccttaagattctcacaggtcgt
ggtcgtcggtcacctgatggcgctctgggaactatgctccgctcaatggctgacttatcg
ttcttcgctaagaatgcctatatgggagtgcagaacctcacagagattgccggtatgatt
gccaatggtaacgtccgtgctctggctaatggtgttccgtatctgggtgagatgatgaac
agaactcgtgtgctccctgtgaaggaagtcaaagagctgcactcaatgatgtttggtaaa
gaggttgatgacttgatgagacctactcgtcaggacctcattgagaagctccgtgagttc
tcccctgcgtctcagactacagctaacatcgtgggcaccattaagtttggtactcaggag
ctggctgctaagtcaccatggactaaggtgctcaatgggaccactaactacctcattgat
gctggtcgtcagggcgtcctgagtgatatcttggataatgctgttaaaggcagaaactca
aggtggctcaaggagaactatctgaagtctgcgagtgtctcacctgagcaagcggcaggc
attaaggctctcattaaggaacacgtggtgcgtaacgctgatggctcgtacaccatgcct
aacaagcaggcgttctcaaatgaccctcgtgctatggacctgtggagactcggtgataag
attgcagatgaagtaatgctgcgtcctcataagctgagccttcaggactcccaagcgttt
gggccatttgctcgcttgatgctccagtttaagaccttcactatcaagtcactgaactcg
aagttcctccgtagcttctatgagggttctaagaatggacgtgctcttgatacggctctg
acttgggctatctcaggtggacttgctggaacatactacgtggctcaggctcatctcaaa
gctgcttcgcttcctaaggaacagcagtcagagtacctgaagaaggctctggaccctaac
atggtaagctacgcggctctgtctcgtggctcctacttaggtgctcctctgggtgtcttc
aacctcgtggctggtccattaggttatgaccctgctaagatggtccgctcctcagtgctt
cctcaggctgaagagaagcgtcctgaccgtcctgttaaaggctttgctgtaggctctgac
cctatccagaactttatgacaggtgttctccagcaggttcccggcgcaggttgggcggct
aatgcctttggtacaggttacaacctctcaggatacttgaactccaataagtctcttgat
gagcgtgactatctgacaggcatgatgaacacaagccgtgagctggttcctaatgaccct
atcactcagcaaatccttctccatatgtaccagaatggtggcatccatctgaacggtaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
