Viruses: 55006204
Help
Entry
55006204 CDS
T40000
Symbol
HOU44_gp043
Name
(RefSeq) Salmonella phage STG2; replication origin binding
Virus
2480623
Salmonella phage STG2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Herpes_ori_bp
Flavodoxin_3
DEAD
DUF445
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55006204
NCBI-ProteinID:
YP_009815016
RS:
NC_048089
LinkDB
All DBs
Position
NC_048089:complement(44066..46855)
Genome browser
AA seq
929 aa
AA seq
DB search
MFSILQGHAGFSRDLGTGLWKEIKVEDHTFAKQFSASHPEGKPVSMPFKFDVIDEVDPQS
LVEMLPLMRRLTSDPHIVAVRGRCLAPKINVRRKKGNFNVSNPSHIIAMDVDGIVDTGGC
NKFDLVGMARHIIKMLNSISEDMFPLDAGFIAHASSSAGLKPGIRMHLILESNVKVTQGQ
IKFLFTSINESSRQKYGFDIADLAYYSSVQLHYFADPLFIDGIVDPFKAEGASRLVFVKG
SKVNLPNNLVDYETTRGEFKEEFFSLLDQIKGKKAASDKVEETISELEEADDGVYLRIIP
KLYHRALEDGVDFGWLEKEIRPALSEYIATKDNSRNIQDYFNNGRKQALKAFVNNSKREI
PEVLKGVPLRRLETNSLETDNFLKLNTVPPENHMTFVKASLGTGKTTAVVRWLDSGVIEG
NFLAITNTRALVSSNAKKFGAGQYDKSVDMLNFKRGAINRMSTTIHSLHKFKSFIGQIDA
IFIDECDAVMNDLLFAPVVKNRRECIQVLRDILATAKIIILSDGDISAETIEAYGSLIEF
DKPVAFYNHHRKMLSKAHAYEFPDESSIWVALQTSLEMGEKSILVSDCGPDELNEKGMAL
RRNTGALVKEIHSNSTSDVDIRRILDYTTNELIDQQIDCLLCSPSVTSGVDFNYFDNVFV
ITRTSNQAPNMRFQAIRRDRGAQNIYYFIDKSTSGFSAGSEQYNIDEGWVELAQQLYARR
RELESRNYTSTLRYYLLDQGATIDIFSESWGTIEGAGKEYIEERIKAILYSTPEYCAPRH
ADAYEAKLLLVRYYHLDSIKDVTVEHVEQYIKDKPNDRAAFFHKMHDMFWEDIKKCSNVT
IKPFIEALKNKKKDFFLKTGQSANSKYARMYLGMMGIGKDLNTEKIVDWYRTYCKIECMP
VPVKFMTDEERQMHEEALAELGARNDSEE
NT seq
2790 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttttccatcctacaaggtcacgcaggattttcacgcgatctaggtacaggtttatgg
aaagagattaaggtagaggatcatacctttgctaagcagttctctgcgtctcatccagaa
ggtaaaccggtatctatgccattcaaattcgatgtaattgatgaggttgatccgcagtcc
ctagtagaaatgcttcctcttatgagacgtttaacgtctgaccctcatatcgttgcggta
cgaggtcgttgtcttgcacccaaaattaatgtgcgacgtaagaagggcaactttaatgta
tctaacccaagtcacattattgcaatggacgttgatggtattgtagatacaggtggttgt
aacaagtttgatcttgttggcatggcacgtcatattatcaagatgttaaatagtattagt
gaggatatgtttcctcttgatgccgggtttattgctcatgcatcatcttcagctggctta
aaaccaggtattcgaatgcacttaatactagaatctaacgtcaaggtaacacaagggcag
atcaagttccttttcacatctatcaatgaaagtagtagacaaaagtacggttttgatatt
gccgacttagcttattactcttcagttcagcttcactatttcgcagatcccttatttatt
gatggtatagtcgatccgtttaaggcggagggtgcgtcacgtttggtgtttgttaagggt
tcgaaagtaaatttacctaataacctagtggactatgaaacaactagaggtgagtttaaa
gaggagttcttctctttgttagatcaaattaagggtaagaaagcagcctcagataaggta
gaagaaaccattagtgagttagaagaagctgatgatggagtgtatttacgtattattcca
aaactttatcatagagctttagaggacggtgttgattttggttggttagaaaaggaaatt
agaccagctctatctgagtatattgcaactaaagataacagccgtaatattcaagactac
ttcaataatggtcgtaaacaggcattgaaagcgtttgtgaataattctaaacgtgagatt
ccagaagttctgaaaggagttccacttcgtagactagaaactaactctctggaaacggat
aacttcctgaagttaaatacagtgccaccagaaaaccatatgacgtttgtaaaagctagt
cttggtactggtaagaccactgcggttgtacgttggctagactctggagttattgaaggt
aatttccttgctatcacgaatacccgggcattagtatcttcaaatgcgaagaaattcggt
gctggtcaatatgataaatcagtagacatgcttaatttcaagcgtggtgcgattaatcgt
atgtcaaccactatccactccttacataagttcaaaagctttattggtcagatcgatgcc
atctttattgatgaatgtgacgcagtaatgaatgacctattattcgccccagttgttaaa
aaccgtcgtgaatgtattcaggttcttcgagatattcttgcaactgcaaaaatcataatt
ctatctgatggtgatattagtgctgaaacgattgaagcctatggttctttgattgagttt
gataaaccagttgcgttctataaccatcaccgtaaaatgctgtcaaaagctcatgcttat
gagttccctgatgaatccagtatttgggttgcacttcaaacatccctagagatgggtgag
aaatcgatcctagtatctgactgcggaccagatgaactgaatgaaaaaggaatggcatta
cgtcgtaatacgggtgcgttagttaaagaaattcactcaaactctacgtctgatgtagat
atccgacgtattctggattatacaactaatgagctaattgatcaacagattgattgttta
ttatgtagtccatctgtaacaagtggtgttgactttaactattttgataacgtatttgtt
atcactcgaacctcaaaccaagcaccaaacatgcgttttcaggcaatcaggcgcgaccgt
ggtgctcagaacatttattattttattgataaatctacgagtggattctctgctggttcc
gagcaatataatatcgatgagggttgggtcgagttagctcagcaactgtacgcacgccgt
cgtgagctggaatctaggaactatactagcaccttgcgttattatctgcttgatcagggt
gcaactatcgatattttcagtgaaagctggggaactatcgagggagcaggtaaagaatat
attgaagagcgaatcaaagctattctatactcaactcctgaatactgcgcaccacgtcat
gcagatgcatatgaagctaagttactattggtacgttattatcatctggattctatcaaa
gacgtaacagtggaacacgttgaacagtatatcaaggataaaccaaacgatagagctgca
ttcttccataagatgcacgatatgttctgggaagatattaagaagtgttcaaatgtaaca
atcaaaccatttattgaagctcttaagaataagaagaaggatttcttccttaagacaggt
caaagtgctaactcaaaatatgctcgtatgtatctaggcatgatgggtattggtaaagat
ctgaatacggaaaagattgtggactggtacagaacttactgtaaaatcgaatgtatgccg
gttccagttaagtttatgacagatgaagaacgtcagatgcatgaggaagctcttgctgaa
ttgggggctagaaatgacagtgaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system