Viruses: 55014200
Help
Entry
55014200 CDS
T40000
Symbol
HOV44_gp104
Name
(RefSeq) Rheinheimera phage Barba5S; portal protein
Virus
2849599
Rheinheimera phage Barba5S
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Portal_Mu
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55014200
NCBI-ProteinID:
YP_009822695
RS:
NC_048187
LinkDB
All DBs
Position
NC_048187:52269..53741
Genome browser
AA seq
490 aa
AA seq
DB search
MEEENLNLEKGDNPVPRIRMSEYGTTGLKVFSDQIFEEDRPELRGTGWIKEVRKMRNDPV
VSAGVELLQMWMQRGIPEIVPYSESEEDVKRAKFIEQCMYDMEHTFDDLMKDITSNVWYG
YAPIEKVFKKRLANQSKYNDGLIGWKKLPIRSQDTVVEWKTDDTGRNITHLIQDINSVTS
GERLNRLLFTYPAGEVEIPMEKVLNFRYNGTRGNPEGRSPCKSIWGAYKYRCQIELDEAI
GVQRNLNGVPVYYAPAQYMSPDAKPHEKAVYESIKNQIRNYQNNEQAGFVIPNIYDEHSK
QRLFSLEPLEVKGSNQYNTNDIIKRYDLKILTMLFADILMMGQTSTGSFALSGSKTNLVE
MNIQRRLKEIATVFEQDLFKQTFELNGWDSKRLPTIKFTFPEDHNPDEFGKLIQRIGSIN
FIPRTPDMVGWVAKAMGYPDWKKFAEMEQKELDELFTDNESGSGEGQGSSGTGTTQSGGA
SSSTNSNNAS
NT seq
1473 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaagaaaatttaaaccttgagaaaggggataatcctgttccaaggattcgtatg
tctgagtatggtacaaccggacttaaagtattttcagaccaaatctttgaagaggataga
cctgaattacgcgggactggttggattaaagaagtaaggaagatgcgtaatgacccagta
gttagtgctggtgttgaattattgcaaatgtggatgcagcgcggcatacctgagatagtc
ccttactcagaatcagaagaagatgtaaaacgtgccaagttcatagaacagtgtatgtac
gatatggaacatacatttgacgacttgatgaaagatattacatctaatgtttggtacggt
tacgcaccaatagaaaaagtatttaaaaaacgtttagcaaatcagtctaagtataatgac
ggtttgattggctggaagaagttacccattcgctctcaggatacagtggtcgagtggaaa
acagacgatactggtagaaacattacccatttaattcaggatatcaattcagttacatct
ggggagagattgaatagattattattcacttatccagcaggtgaagttgaaatccctatg
gaaaaggtactgaattttaggtacaacggtacaagaggtaatccagaaggtcgtagtccc
tgcaagtctatatggggtgcatacaaataccgctgtcagattgaattagatgaagctatt
ggtgttcaacgaaacttgaacggtgtcccagtatactatgctccagcacagtacatgtca
ccagatgctaaaccacatgaaaaagcggtttatgaatcaatcaaaaatcagatacgcaac
taccagaataatgaacaagctggttttgtaattccgaatatatatgatgaacacagtaag
cagagattattcagcttagagccattagaagttaaagggtctaatcaatataacacaaac
gacatcatcaagcgttatgacttgaagatattaacaatgttgtttgctgatatccttatg
atgggtcaaacgtccactggtagttttgctttatctgggtctaagacaaatctagttgaa
atgaatattcagcgcaggctaaaagagattgcaactgtatttgagcaagacctatttaaa
cagacatttgagcttaatgggtgggattcaaaacgcttacctaccattaagtttacattc
cccgaagatcacaaccctgacgagtttggtaagttaatacaacgtattggtagtattaat
ttcattccacgtacaccggatatggttggttgggttgctaaagcaatgggttatccagac
tggaaaaagtttgctgaaatggaacaaaaagaattagacgaacttttcactgataatgaa
agtggttctggtgagggccaaggttcaagtggtacaggaaccacacagtctggtggagca
tctagttctacaaattcaaacaatgcctcgtag
DBGET
integrated database retrieval system