Viruses: 55015892
Help
Entry
55015892 CDS
T40000
Symbol
HOV60_gp088
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_Eco_mar003J3; straight fibre tail protein
Virus
2419761
Escherichia phage vB_Eco_mar003J3
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PB4_spike
Fn3-III_PB4
Fn3-II_PB4
Fn3-I_PB4
BACOVA_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55015892
NCBI-ProteinID:
YP_009824369
RS:
NC_048203
LinkDB
All DBs
Position
NC_048203:complement(57357..59354)
Genome browser
AA seq
665 aa
AA seq
DB search
MAYIQHSIYTDYDVIGRSFWLKLGEEVDRRDFTGIDTFFVMINNLTPSTTYQVQGAFYDS
IIDSELLNAKIGINLSNETNFKTKEKPIIVAARSESEPVDVGVGAPIVVVETTGEASYCT
IELKSTATEDSPWTKYYIGALGSTIKFGGVPIGDYKIRISGQVTMPDGVTVDSSGYYEFT
NILTVAYNFVPPTAPIDIVFKAARIADGKERYDVRIEWDWERGAGANVREFLVTYINSEE
YAKTGWAKAQKINVGAARAATIISFPWKVEHTFKVSSIAWGPSKQDITESAPVTFILNED
TPLDNSFVNETGIDVNYAFIKGSMKDGEIWRQTFLIDAATGAINIGLLDEEGKAPISFDP
INRVVNVDGKVITRDINAANFIMTNLSGKDNPAIYTQGKSWGDNNSGIWMGMDNTSAKAK
LDIGNATQWIRYDGTTLRISSGVVIGTPNGDVDIGTGLQGKQTVFVYKLATSLPAKPLEQ
DYPPPGWSKTPPNRTDMTQNIYATTGTLDPVTNKLLEGTSWSDVVQWSGTEGTIGHDGQR
GPGMYSMGIPGLGGWDDGQANAFFQNNFGKPPVKYDVLTQFNSNAPQTAFTRQWNGAGWI
NPAMVLHGNMIVNGTVTADKIVAGNAFLSQIGVNIIYDRNAALSGNPEAYYKMKIDLNSG
YIHIR
NT seq
1998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtatatccagcattctatctataccgactacgatgttatcggtagatcattctgg
cttaaacttggcgaagaagtggatagaagagatttcactggaatcgacactttctttgtt
atgatcaataacttaactccctcaactacctatcaggttcagggagctttttatgactca
attattgactcagaacttttaaatgcaaaaattggtattaacctctctaatgaaactaac
tttaaaacaaaagagaagccaataattgttgcagcaagatctgagtcagaacctgtggat
gttggggtgggcgcaccaatagttgttgtggaaacaactggtgaagcaagctactgtact
attgagttaaaaagtacagccactgaagacagtccatggactaaatattatattggggct
ttaggttctactattaaatttggtggagttcctatcggagattataagatcagaatatct
ggtcaagtaactatgcctgatggtgttacagttgattcttctgggtactatgagttcact
aatattctaactgtagcttataattttgttcctcctactgcacctatcgatattgttttt
aaagctgcacgaattgctgatggtaaagaacgatatgatgttagaattgagtgggactgg
gaacgtggtgctggtgctaacgttcgtgaattcttggttacttacataaactccgaggaa
tatgctaaaaccggatgggctaaagctcaaaagataaacgtgggtgctgccagagctgca
acaattatatcattcccatggaaagttgaacatacttttaaggtatcatcaattgcctgg
ggaccaagtaaacaagatataacagagtcagctcctgtaacgtttattctgaatgaagat
actcctctagataatagttttgtcaatgagacgggtattgatgttaactatgcctttatt
aaaggcagcatgaaagatggggaaatctggagacaaacattcctaattgatgcagctact
ggtgctattaacattggtctgctagatgaagaaggtaaagcacctatttcttttgaccct
ataaaccgtgttgttaacgttgatggtaaagtaattactagagatattaatgctgcgaac
tttatcatgactaacttgtctggtaaagataacccagcaatttacactcaaggtaaatcc
tggggggataataactctggtatttggatgggtatggataatacctctgccaaagctaag
ttagacattggtaatgctacacaatggatacgttatgatggtactactctgcgtatttct
agtggtgtagtgattggaacaccaaatggtgacgtagatattggaactggtttacaaggt
aagcaaacagtatttgtttataagttagcaacatctttaccggccaaaccgctagaacaa
gattatccacctcctggttggtcaaaaactccacctaaccgtacagatatgacacaaaat
atctatgcgactacaggtacacttgatccagttactaacaaacttcttgaaggtactagc
tggtctgatgtagttcaatggagtggtactgaaggtactataggacatgatggacagcgt
ggtcctgggatgtactccatgggtattcctggattaggcggttgggatgatggacaagct
aacgcattctttcaaaataactttggaaaacctccggttaaatacgatgttctaacacaa
tttaacagtaatgctccacaaacagcatttacccgtcagtggaacggagctggatggatt
aaccctgcaatggttcttcatggcaatatgattgttaatggaactgttactgcggataag
attgtggcaggaaatgccttcttatcacaaatcggtgttaatataatctacgatagaaat
gctgcgttatcagggaaccctgaagcatactacaagatgaagatagacctaaatagtggg
tatatccatataaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
