Viruses: 55015895
Help
Entry
55015895 CDS
T40000
Symbol
g130, HOV60_gp085
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_Eco_mar003J3; tail length tape measure protein
Virus
2419761
Escherichia phage vB_Eco_mar003J3
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
TMP_N
TMP_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55015895
NCBI-ProteinID:
YP_009824372
RS:
NC_048203
UniProt:
A0A3P4A8T8
LinkDB
All DBs
Position
NC_048203:complement(62984..66691)
Genome browser
AA seq
1235 aa
AA seq
DB search
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAA
DRAAKSLTKMQASRGMMGITKSMDSIGAKLDDLAIAMIEVSDKLESGFTHVGKSVKAMGN
DVAAATEKVQDRLYDTNRALSGTTRGFNDTTTSAGRASRALGNTSGSARGATRDFAAMAK
VGGSLPLMYAAIASNVFVLQSAFEQLKMGDQLNRLEKFGTIVGTQTGTPVQTLARSLQEA
AGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQE
IELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNVNSLSTFQKQQAYANAVIAESTKRFG
YLDDVLRATSWEQFAANADAALRKVQQAAAKYLGPVIDSINAVFYTSQASISASAARAQE
ETNRQIDPTNVGAVALSLSASEEGYNKALDMYKESLEKRNKLKADLDKRMQQADASTAGA
IRLVAQGAPVGLAAGGFEVGGVRIGSSEENQKFIADTAALALQVERLDKEVEDSTGNLNA
WKSAYQAAGAAAAKSNTEFQKQINLQKDANDPDAVYDFNSATLKGLTEQQKAYDQAKKTA
SDLANDIQNIAQNTNTAAKTSASLSDTIKTIESLSAGTGKNADEYVKSLNLGYNTLSEMK
TASQALAGYVKLTGNETKNQLEVQQKIAEVYNQTKDKEKAQEAGRRLEIQQLEEQEAALK
RVLETNKGNKAIEGEIAKIQLERIKITNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMT
DTQYRLAQLNLELTIEKEKYEWYSKQVDKHKEAEQSRRAQAQIEREIWKFRQDQQREMAS
GRERALNISQTSRNVTGESQRLTEQQALYQSLLEITKGNAQAQEEYKRKIQETSAALAQL
KMQRDAQMQQQVTSSVGGVYTPTTGLEGDDKANMDMQNRMASYDQAISKLSELNSEATAV
AQSMGNLTNAMIQFSQGSLDTTSLVAAGMQTVSSMIQYSVGQQVSAIDAAIAAEQKRDGK
SEQSKAKIKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGAM
ALAQASSASGMSSIGDSGAETAGYLTLGERQKNVDVSMSANAGELSYIRGDQGIGNANSF
VPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVITPMVPMKATPTDELKGSSKGTSGRPIVLNISTMDA
ASFRDFASSNSAAFRDAVEQALNENGTTLKSLGNS
NT seq
3708 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgataagctaatacgagaattacttatagatgtaaagcagaaaggggcaacccgt
actgcaaagtctattgaaaacgtatctgatgcgttagaaaacgctgctgctgcttccgaa
ctgactaatgagcagctaggaaaaatgcccaaaactctttattccattgagagggcagca
gatagggcagccaaaagtctaacaaaaatgcaggctagcagaggtatgatgggcatcacc
aaatctatggatagtattggtgctaagttagatgaccttgctattgctatgattgaggta
tctgataagctagagtctggatttacacatgttggtaaatctgttaaggcaatgggtaac
gatgtagctgctgcaactgaaaaagttcaagatagattatacgatacaaaccgtgctttg
tcgggtactactagaggcttcaatgatactaccacatccgcaggtcgtgctagtcgtgct
ctaggtaatacctctggttctgcacgaggtgctactcgtgacttcgcagcaatggctaaa
gttggtggttctctacctcttatgtatgctgctattgcgtctaacgtgttcgttctacaa
tctgcattcgaacaacttaagatgggtgaccagttaaaccgtcttgagaagtttggtact
attgttggtactcaaacaggtactcctgtacaaactctagctagatctctacaagaggct
gctggttatgcaatctcctttgaagaagcaatgagacaggcatcctctgcctctgcatat
ggatttgatgctgaacaacttaataaatttggtctagtagctcgtcgtgctgctgctgtt
cttggtgttgatatgactgatgcacttaaccgtgtaatcaagggtgtatctaaacaagaa
atcgaacttctggacgaacttggtgttactattcgtcttaacgatgcttacgctgactac
gttaaacagttaaatgctgctaacacaggtattacatataacgttaatagtctctctact
ttccagaagcaacaagcatatgctaacgcagtaatcgctgaatctactaaacgtttcggc
tatcttgatgatgtacttcgtgcaacctcttgggaacagtttgctgctaatgctgatgct
gccctgagaaaggttcaacaggctgctgctaagtatttagggccagtaattgattctatc
aacgcagtgttctatacttctcaagcatctatctcggcctctgctgctagagcacaggaa
gaaactaaccgtcagattgacccaactaacgttggtgctgtagctttaagtctttccgct
tctgaggaaggatataataaagctcttgatatgtacaaagaatctctagaaaagcgtaat
aagttaaaagctgatctagataagcgtatgcagcaagcagatgcatctacagcaggggct
attcgtttagttgctcaaggtgcaccggtaggattagctgcaggaggttttgaagtagga
ggagttcgcataggatcttctgaagaaaaccagaaattcattgcagatactgctgcatta
gctctccaggtagagcgtcttgataaggaagtagaggattcaactggcaatcttaatgca
tggaaatcggcataccaagctgctggtgctgcagcagccaaatctaatacagaattccag
aagcaaattaacctacagaaagatgcaaatgacccggatgcggtttatgactttaactct
gcaactctgaaaggattgacagaacagcagaaagcatatgaccaggctaagaaaactgct
agtgatttagctaacgatatccagaacatcgctcagaacactaacactgcggctaaaact
agtgcatccctatcagatacgattaagactattgagtctttatctgctggtactggtaaa
aatgctgatgagtatgttaagagcctgaacttagggtataatactcttagtgagatgaag
actgcttcacaagctcttgctggttacgtaaaattaactggtaatgagactaagaatcag
ttagaagttcagcagaaaattgcagaagtatacaaccagactaaggacaaagagaaagca
caggaagctggtagacgtctggaaatccaacagttagaagaacaggaagcagctcttaag
cgtgtcctagaaactaacaagggtaacaaagcaatcgaaggtgagatagctaagattcag
ttagaacgtatcaagatcactaaccagggtatggaagctcagaagaaggttaaggactat
actgataagattcttggtgttgatcgtgaaatagctctcctgaataaccgtactatgaca
gatactcagtatcgtttagctcagttgaaccttgaactgactatcgagaaagaaaagtat
gaatggtactccaaacaggttgataagcataaggaagctgaacaatcaagacgagctcag
gcacaaattgaacgtgaaatctggaaattccgtcaggatcagcaaagggaaatggcttct
ggacgtgaaagagctcttaatatttcacagactagcagaaacgttacgggggaatctcag
agactaaccgaacagcaagctctgtaccaaagtttactggaaattacaaaaggaaatgca
caagctcaggaagagtataagcgtaaaatccaagaaacttcggcagctctagcacagctt
aagatgcaacgtgatgctcagatgcagcagcaagtcacttcttctgttggtggtgtttac
actccaacaactggactggaaggagatgataaagcaaatatggatatgcagaatagaatg
gcatcctatgaccaggctatttctaagctgtctgaactgaactccgaagcaactgctgta
gcacaaagcatgggtaacctaactaatgctatgatccagttttcacaaggatctctggat
accacttctctagtagcggctggtatgcaaactgtatcttcaatgattcagtatagtgtt
ggtcaacaggtaagtgctattgatgcagctattgcagcagaacagaaacgtgatggtaaa
tctgagcaatctaaagctaagatcaagaagttagaggctgaaaagctcaagatccagcaa
gatgcggctaagaagcaaatcattatccagacggcagtagcggtgatgcaggcagcaaca
gctgttccgtatccattctctattcctctgatggttgcggctggtttagcaggtgctatg
gctcttgctcaagcatcctctgcatctggtatgtcttctattggggactctggtgctgag
acagctggttacttaactcttggagagcgccagaagaacgtagacgtttctatgtcggct
aacgcaggtgagctttcttatattcgaggagatcaagggattggtaatgctaactctttc
gtaccccgtgcagaaggtggtaatatgtatcctggagttagttaccagatgggtgaacat
ggtaccgaagtaatcactcctatggttccgatgaaggctactcctactgatgaactcaaa
ggatcttcaaagggtacatcgggtagacctattgtgctgaacatcagtacgatggatgcg
gctagcttccgagactttgcttcgagcaacagtgctgctttcagggatgccgtagaacag
gctcttaatgagaatggaaccaccctgaaatcacttggtaattcttaa
DBGET
integrated database retrieval system