Viruses: 55613719
Help
Entry
55613719 CDS
T40000
Symbol
HWC04_gp127
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_EcoS_HdH2; replication origin binding
Virus
2508174
Escherichia phage vB_EcoS_HdH2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Herpes_ori_bp
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55613719
NCBI-ProteinID:
YP_009843428
RS:
NC_048748
LinkDB
All DBs
Position
NC_048748:58861..61650
Genome browser
AA seq
929 aa
AA seq
DB search
MFSILQGHAGFSRDLATGIWREIKAEDYTFAKRFSKEHPEGKPASMPFKFDVIEEHDPQS
LAEMLPLMRRLTSDPHIVAVRGRCLAPKNNVRRKKGNFNVSNPSNIIAMDVDGILDTGGY
DKFNLVGMARHIIKMLNSISEDMFPLDAGFIAHASSSAGLKPGIRMHLMLESNVKVTQGQ
LKFLFTSINDSSKQKFGFDIADLAYYSSVQLHYFADPLFSDGIVDPFKAESKPRLVYVKG
SKVNLPNNLVDYETTRGEFKEEFYSLLDQIKGKKIASDKVEETISELEEAEDGVYLRIIP
KLYHRALEDGVDFAWLEREIKPALSEYIATKDNSRNIQDYFNNGRKQALKAFVNNSKREI
PLNLKGVPLKKLEVDSPPEVPYLKINIVPPKGHITFVKASLGTGKTTAVTKWLDAGVLPG
NFLAVTNTRALVSSNAKKFSAGQYDKSVDMLNFKRGAIDRMSTTIHSLHKFKSFIGQIDT
IFIDECDAVMNDLLFAPVVKQRRECIQVLRDILMTAKTVILSDGDISAETIEAYGSLIDF
DKPVAFYNHHRKMLSKAHAYEFPDESSIWVALQTSLEMGEKSILVSDCGPDELNEKGMAL
RRNTGALVKEIHSNSTSDVDIRRILDYTTNELIDQQIDCLLCSPSVTSGVDFNYFDNVFV
ITRTSNQAPNMRFQAIRRDRGAQNIYYFIDKSTSGFSAGSEQYNIDEGWLELAQQLYARR
RELESRNYTSTLRYYLLDQGATIDIFSESWGTIEGAGKEYTEERIKAILHSTPDYCAPRH
ADAYEAKLLLVRYYHLESIKDVTVEHVEQYIKDKPNDRAAFFHKMHEMFWEDIKKCSNVT
IKPFIEALKGKKKDFFLKTGQSANPKYARMYLGMMGIGKDMNTENIVDWYRTYCKIECMP
IPYKFMTDEERHMHDEAMAELGARNDSEE
NT seq
2790 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttttctatcctccaaggtcacgctgggttttctcgtgatttagcaacaggtatttgg
cgagaaatcaaagcggaagattatacctttgccaagcgattctcgaaagagcatccagaa
ggtaaaccagcttctatgcccttcaaatttgatgtaatagaagagcacgaccctcaaagc
cttgccgaaatgttaccacttatgagacgtttaacgtctgaccctcatatcgttgcggta
cgaggtcggtgtcttgcacctaaaaataacgtgcgacgtaagaaaggtaactttaatgta
tctaatcctagtaatattattgctatggacgtggatggtatcctagataccggtgggtat
gacaagtttaaccttgttggtatggcccgccacattattaagatgttgaatagtattagt
gaggacatgttccctcttgatgcaggctttatagctcatgcatcgtcttcggctgggcta
aaaccaggtatccgaatgcacttaatgctagaatctaacgtcaaggtaactcagggtcag
ttaaagttcttatttacatctatcaacgatagtagtaagcaaaaatttggttttgatatt
gccgacttagcttattattcatctgtccagctccactattttgccgaccccttatttagt
gatggtattgttgatccgtttaaagcggagagtaagccacgtctggtgtatgttaaaggt
tcgaaagtaaatttgcccaataatctggttgactatgaaacaactagaggggagtttaag
gaagagttttattctttacttgatcaaattaaaggcaaaaagatcgcgtctgataaagta
gaagaaaccatcagcgaattggaagaagctgaggatggggtgtacctgcgtattatcccc
aaactctaccatagagcattagaggatggtgttgattttgcatggctagaacgtgagatt
aaacccgctttatctgaatatattgcaactaaagataacagtcgtaatattcaagattac
tttaataacggtcgtaagcaggctctcaaagcgtttgttaataattctaaacgtgagatt
ccattaaatctgaaaggtgttccgctcaagaaattagaagtggattctccaccagaagtt
ccgtacctgaagattaacattgtgcctccaaaaggccatataacatttgttaaagcaagt
cttggtactggtaagactacggcagtaactaaatggctggacgcaggtgttcttcctggc
aactttttagcagttacaaatactagagcactggtatcttcaaacgctaagaaatttagc
gcaggacaatatgataagtctgtagatatgctcaactttaaacgtggagctattgatcgt
atgtccacgactattcactctttgcataagttcaaaagttttattggtcaaatagatacc
atttttattgatgaatgtgatgctgtaatgaatgatctattattcgcacctgttgttaag
caacgtcgcgaatgtattcaagttctacgtgacatcctcatgacagctaaaactgtaatt
ctatcagatggtgatattagtgccgaaactattgaagcatatggttctctaattgatttt
gataaaccagtagcattttataatcatcaccgtaagatgctgtcaaaagctcatgcttat
gagttccctgatgaatccagtatttgggttgcacttcagacttccctggagatgggtgag
aaatctatcctagtatctgactgtgggccagatgaactgaatgagaagggcatggcgttg
cgtcgtaatacgggtgcgttagttaaggaaatccactcaaactctacgtctgatgtagat
attagacgtattctggattacacaactaatgaactaattgatcaacaaattgattgctta
ttatgtagtccatccgtaacgagtggtgttgactttaactattttgataacgtatttgtt
attactagaactagtaatcaagcgccaaacatgcgctttcaagcaatcaggcgcgaccgt
ggtgctcagaatatctattattttattgataaatccactagtggattctccgcaggttct
gaacagtataatattgatgaaggttggctggagttagcacagcaattatacgcacgtcgc
agggagctggaatctaggaactatactagtactttacgttattacttgcttgatcaaggt
gcaactattgatattttcagcgaaagctggggaactattgaaggtgctggtaaagaatat
acagaagagcgaatcaaagccattctgcattcaactccggattattgtgctccacgtcat
gcggatgcgtatgaagctaaactacttcttgttcgctattatcatcttgagtctattaaa
gatgtaacagttgagcatgttgaacaatatatcaaagataaaccgaatgatcgagccgcc
ttcttccataagatgcacgagatgttttgggaagatattaagaagtgttcaaatgtaacc
attaaaccattcatagaagctctgaaaggtaagaaaaaggacttcttccttaaaacaggt
caaagtgctaacccaaaatatgctagaatgtatcttggtatgatgggtattggtaaggat
atgaacactgaaaatatcgtagactggtatagaacctattgtaaaatcgagtgtatgcca
atcccttataagttcatgactgacgaggaaagacatatgcacgatgaagcaatggcagag
ctaggtgctagaaatgacagtgaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
