Viruses: 55620920
Help
Entry
55620920 CDS
T40000
Symbol
HWC54_gp167
Name
(RefSeq) Klebsiella phage Marfa; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
2587809
Klebsiella phage Marfa
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55620920
NCBI-ProteinID:
YP_009850441
RS:
NC_048798
LinkDB
All DBs
Position
NC_048798:148674..152522
Genome browser
AA seq
1282 aa
AA seq
DB search
MSDLIKQHFRATNGLDAGGNKVINVAKADRTVMSDGVNVEYLIQENTIQPWANDRGYPEG
FAVTMEKRIWVARADIPAPIPPAVNTFRQGDWISMRVDPKWEQYSSGTTELLPGTYANID
TRVNPVTLVLPKNKVEQGDTIVIRDIGGKPGINQALIKVQDSAPAMIFQGSILRELQLTR
PYSMLLLTFTSAGWYVTLSDLSSLARTINSTTLDAATDVGAQVQSSEYIVLYYTSNKKLT
VRLPRYANHGDMITFVEPEGETPLYHFTIKTYDANSSIGTEGATSWTSKIKGGGVLIYDG
PRNVWRINSIDMQQRVKIVTDDVVMQPNEAIAIFGANNSTVKTITVTLPTLVAPGDTVRI
GMNYMRKGQTVNIVTPPAPAGGTKDRIASTVGLLQFPKRSEYPPGAAWTQVDSLSFNGTS
DYPPVLELAYVEATPNNYWIVSENIPTVERVDWTNDTTRARVGVIALATQADLEANSSNL
VDGVAVTPHTLSKRTATEARTGIAAIASSTDVLQNSNYAFINDKIITPKRLNERTATETR
RGLAEIATQAETDAGTDDTTIVSPKKLNARKATATLDGIIQLVNTGGTPGTSRSDPGTSN
GTGVYDHTDFSKAVTPKTLREYKATELASGCVWLATKAEVRNGTPASNNIPTVVTPEALH
AKTSTTKDIGLIRIATQAEANAMSNAVSNAAITPATLNGRSASYTQTGITRYAIQEEFDG
GTLENVAVNPRKIKDYFSRPARMTTRSEAGLAQSGNLWDGWTLNIQVPTETQRGTPKIAT
QALVNAGTDDVDYLTSKKLQAKKGTESAYGIVKYATQADTNTGTANDVAVSPVHLKYVIQ
TSADWRAQDNVRGTVRVANGAVAWTGNSTTGSDNTPKESNGYAVSPNGLKQALANYLPLN
AKADNSALLNGITSDQFIRRDINQTVNGSLTLTKVTTSSANIETSAILKSSKVETTGDIR
ISNATARLLLTSDTNAWSVQAAAKSGRIAFISENDTQNVHLSVYNDSRGVTANVKFEAPV
INATTQVQLAGTGVIALAGTNSIRLATSGKGLELASSDAGNIIAAEGSTTYKVLTTKNKD
SILDSRYVKSAGDTMTGNLTMNGSALVINGSEGWYDHSTTANSEKYSRAGSWTVEIKNAA
KLATLPGYVVPIREENPLVPGSMIVTGYEEKTAAGGLLAQISVSSDYTYQTWTPYPSNAE
QAAKARTHTMWTRVYNPYLKKFDSWMRVYTSATPPTAADIGAPSSVSTSVKTLEVQEWIK
IGPVKIYPDRTSQTVKFEWVGD
NT seq
3849 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgacttaatcaaacagcattttagagcaaccaacgggcttgatgctggtggaaac
aaagtaatcaacgtcgctaaagccgatcgtactgtgatgagcgatggggtcaacgttgag
tatcttatccaagaaaataccatccagccttgggccaatgatcgtgggtatcctgaaggc
tttgcggttaccatggaaaaacgtatctgggtggcacgtgcagatatcccggccccgatc
ccgccggcagtaaatacctttagacaaggtgattggatctccatgcgtgtagacccgaag
tgggaacagtatagttcaggaaccacagaacttttaccagggacttatgcaaacatcgat
acccgagttaatccggttacactagttcttcctaaaaataaagtagaacaaggtgatacg
attgttattcgtgacatcggtggtaaaccaggcatcaaccaggcattaattaaagtacaa
gactctgcaccagcaatgatcttccaaggaagtatccttcgtgaactgcagctgactcgt
ccttatagtatgcttctgctgacgtttacatcggccgggtggtatgtaactctttcagat
ctgagttctttggcccgtactattaattctaccacactagatgccgctactgatgtgggt
gctcaggtacaaagttcagagtacattgtactttattacacttctaataaaaaattaacg
gttcgtcttcctcggtacgctaaccatggagatatgattacctttgttgaaccggaaggc
gaaacaccattataccattttactattaagacttatgatgcaaatagttctattggaaca
gaaggggccacgtcttggacctctaagattaaaggtggcggtgttctgatttacgatggc
cctcgtaatgtgtggcgcatcaactctatagacatgcagcaacgtgtaaaaatcgttact
gatgatgtagtgatgcaacctaacgaagctattgctatatttggcgctaataactcgact
gttaaaactattactgttactttgcctactttagttgctcccggtgatactgttagaatc
ggtatgaactatatgcgcaaaggacaaacagtcaacattgttactcctcctgctccggct
ggtggtactaaagataggattgcatccacggttggcttacttcagttccctaaacgttct
gagtatccgcctggagccgcgtggactcaagttgatagcttatcattcaatggaacttcg
gactatcctccggtcctagagttggcctacgttgaagctactcctaataactactggatc
gtttcggagaacattcctactgtagaacgtgttgattggaccaatgataccacaagagcc
cgtgtaggcgttattgcgttggctacccaagctgatttagaggcaaatagttctaatttg
gtagatggtgttgctgttactccgcataccttaagtaaaagaacagctacagaagctcgt
actggtattgctgctattgcatcaagcacagatgttttacaaaatagtaactatgctttt
attaacgataagattattactcctaaacgtcttaatgaaagaactgccacagaaacgcgt
agaggattagctgaaatagctacccaagccgaaacagatgctggtactgatgatacaact
atcgtaagtcctaaaaagcttaatgcgcgtaaagctactgctacgctagacggaattatc
cagctggttaatacaggcggcactccgggaacaagccgatcagatccgggtacttctaat
ggtactggcgtatacgaccacactgatttctctaaggcggtaactcctaaaactttacgt
gaatataaagctacggaacttgcctccggatgcgtatggcttgctaccaaagcagaagtt
cgtaatggtactccggcgtctaataatattccgaccgttgttacgccggaagcattacat
gctaaaacttctactacaaaagatattggtttaatccgtatcgctactcaagctgaagct
aatgcaatgtctaatgctgtgagtaatgcagctattactccggcaacattaaacggacgg
tcggcaagttatactcaaacaggtataacccggtatgctattcaggaagaatttgatggt
gggactttagaaaacgttgcagtgaaccctagaaaaattaaagactatttttctagacca
gctcgtatgacaacaagatccgaagctgggttggcccagtccggaaacttgtgggacgga
tggacccttaatatccaggttccaacagaaactcaacgtggtacgcctaagattgcaacg
caggcacttgttaatgctggtacagacgatgttgattatctgacgtctaaaaagcttcaa
gctaaaaaaggtactgaatccgcatacggtattgttaaatatgcaacccaagccgatact
aacaccggtactgctaacgatgtagccgtttctccggtccacttgaagtatgttattcag
acttcagccgattggcgtgcacaagataacgttcgcggtacagtccgtgtggctaatggc
gctgttgcttggaccggtaacagtactacaggttctgataatacgccaaaagaatctaac
ggatatgcagtatcacctaatgggcttaagcaggcattagctaactatcttcctttgaat
gccaaagctgataactctgctttattaaatggtattacgtcggatcagtttattcgccga
gatattaaccagaccgtcaacggttctttgaccttgactaaagttactacttcttcagcg
aatattgaaacatcggctatcctgaagtcttctaaagtagaaactacaggtgatattaga
atttctaatgctacggctagattgcttttaacctctgatactaatgcttggtctgttcaa
gcggcagctaaatccggacgtatcgcgtttattagtgaaaatgatacacaaaatgttcat
ttatctgtttacaacgattcccgtggtgtaactgctaatgttaagtttgaagctcctgtt
attaatgccactactcaagttcagttagctggtacaggcgttattgctttagctggtacg
aactcgatcaggttagctacctctggcaaaggtcttgaacttgcttctagtgatgctggt
aatatcatagcggctgaaggtagtacaacttataaagttctcactactaagaacaaagat
tctattcttgattcacggtacgttaagtcagctggtgatacaatgactggcaacttaact
atgaatggttctgctcttgttattaatgggtctgaaggttggtacgatcactctactacg
gcaaactctgaaaaatactcaagagctggttcttggacagtagaaatcaaaaatgccgct
aagttagccacacttcctggttatgttgttccaatcagagaagagaacccgttagttcca
ggttctatgatcgtaactgggtatgaagaaaaaactgccgcaggcggtcttttagctcag
ataagcgtttcttctgattatacttatcagacttggactccttatccatctaatgcagaa
caggctgctaaagcaagaacccataccatgtggaccagggtatataacccgtaccttaag
aagtttgatagttggatgcgtgtatacactagcgccactcctcctacagctgcagatatc
ggtgcgccgagctcagtaagtacttctgttaaaaccttggaagttcaagaatggattaag
attggccctgtcaagatttatcctgatcgtacttctcagaccgttaagtttgaatgggta
ggtgattaa
DBGET
integrated database retrieval system