KEGG   Viruses: 55628800
Entry
55628800          CDS       T40000                                 
Symbol
HWD22_gp031
Name
(RefSeq) Salmonella phage bombadil; tail length tape measure protein
Virus
2713285  Salmonella phage bombadil
SSDB
Motif
Pfam: TMP_N TMP_C HTH_Tnp_1
Other DBs
NCBI-GeneID: 55628800
NCBI-ProteinID: YP_009857922
RS: NC_048866
LinkDB
Position
NC_048866:22306..26013
AA seq 1235 aa
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAA
DRAAKSLTKMQASRGMMGITKSIDSIGAKLDDLAIAMIEVSDKLESGFTHVGKSVKAMGN
DVAAATEKVQDRLYDTNRVLSGTTRGFNDTTTSAGRASRALGNTSGSARGATRDFAAMAK
VGGSLPLMYAAIASNVFVLQSAFEQLKMGDQLNRLEKFGTIVGTQTGTPVQTLARSLQEA
AGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQE
IELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNVNSLSTFQKQQAYANAVIAESTKRFG
YLDDVLRATPWEQFAANADAALRKVQQAAAKYLGPVIDSINAVFYTSQASISASAARAQE
ETNRQIDPTNVGAVALSLSASEEGYNKALDMYKESLDKRNKLKTEFDKRMSQADASTAAA
IRLVGEGMPVGLAAGGFEVGGVRIGSSEANKKFVEETAAMGLQVARLGKEVDDSTENLNA
WKSAYQAAGAAAAKTNPEFQKQINLQKDMNDPDAVYDFNSATLKGLTEQQKAYDQAKKTA
SDLANDIQNIAQNTNTAAKTSASLSDTIKTIESLSAGTGKNADEYVKSLNLGYNTLSEMK
TASQALAGYVKLTSNETKNQLEVQQKIAEVYNQTKDKEKAQEAGRRLEIQQLEEQEAALK
RVLETNKGNKAIENEIAKVQLERIKITNQDMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMT
DTQYRLAQLKLELTIEKEKYAWYSRQAGKQKEAEQSRRAQAQINRELVEAEKQATATHVS
ALMDALEVSQTERNVTGQSQILTERLSISEKQLELSKDNTEEEIKYRNEIYKTSAALEQL
KKQRDAQMQQQVGSSVGATYTPTTGLSGDDKKYADMQNQMASYDEAISKLGALNSQATEV
GQSIGNLTNAMMQFSQGSLDTVSTVAAGMQMVSSMIAMGVSNQVSAIDQAIAAEQKRDGK
SEASKAKLKKLEAEKVKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPWSIPLMIAAGVAGAL
SLAQASSASGMSSIGDSGTDTAQYLSLGERQKNVDVSMSANAGELSYIRGDQGIGNANSF
VPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVITPMVPMKATPTDELKGSSKSTSGRPIVLNISTMDA
ASFRDFASSNSAAFRDAVEQALNENGTTLKSLGNS
NT seq 3708 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactgataagctaatacgagaactacttatagatgtaaagcagaaaggggcaacccgt
actgcaaaatctattgagaacgtttccgatgcgttagaaaatgctgctgccgcttccgaa
ctgactaatgagcagctaggaaaaatgcccaaaactctttactccattgagagggcagcg
gatagagcagctaaaagcctaactaaaatgcaggctagcagaggtatgatgggtatcacc
aaatctatagatagtattggtgctaagttagatgaccttgctattgctatgattgaggta
tccgataagctagagtctggatttacacatgttggtaaatctgttaaggcgatgggtaac
gatgtagctgctgcaactgaaaaagttcaagatagattatacgatacaaaccgtgttttg
tcgggtactactagaggcttcaatgatactaccacatccgcaggtcgtgctagtcgtgct
ctaggtaatacatctggttctgcacgtggtgctactcgtgacttcgcagcaatggctaaa
gttggtggttctctacctcttatgtatgctgctatcgcatctaacgtgttcgttctacaa
tctgcattcgaacaacttaagatgggtgaccagttaaaccgtctggagaagttcggtact
attgtaggtactcaaacaggtactccggtacaaactctagctagatctctacaagaggct
gctggttatgcaatctccttcgaagaagcaatgagacaggcatcctctgcttctgcatat
ggattcgatgctgaacaacttaataaatttggtctagtagctcgtcgtgctgctgctgtt
cttggtgttgatatgactgatgcacttaaccgtgtaatcaagggtgtatctaaacaagaa
atcgaacttctggacgaacttggtgttactattcgtcttaatgatgcttacgctgattac
gttaaacagttaaatgctgctaacacaggtatcacatataacgtcaatagtctttccact
ttccaaaagcaacaagcatatgctaacgcagtaattgctgaatctactaaacgtttcggc
tacttggatgacgtactccgtgcaactccatgggaacagtttgctgctaacgctgatgct
gcactaagaaaggttcaacaggctgctgctaagtatttagggccggtaattgattctatt
aacgcagtattctatacttctcaagcatctatctcggcttctgctgctagagcacaagaa
gaaactaaccgtcagattgacccaactaacgttggtgctgtagctttaagtctttccgct
tccgaggaaggatataataaagctcttgatatgtataaagagtctctggataagcgtaat
aaactaaagactgagtttgataaacgtatgtcccaagcagatgctagtactgctgccgct
attagattagtgggtgaggggatgcctgttggattagctgctgggggatttgaagtaggg
ggagtgcgcataggttcttccgaagctaacaaaaagtttgtagaagaaaccgcagctatg
ggactacaggtagcaaggttaggtaaagaagttgatgactctactgaaaaccttaatgct
tggaaatctgcgtatcaagctgctggtgctgcggctgctaagactaatccagaatttcag
aagcagattaatctgcagaaggatatgaatgaccctgatgcggtttatgactttaactcc
gcaactctgaaaggactgacggaacagcagaaagcatatgatcaggctaagaaaactgct
agtgatttagctaacgatatacagaacatcgctcagaatactaatactgcggctaaaact
agtgcatccctatcagatacgattaagactattgagtctctatctgctggtactggtaaa
aatgctgatgagtatgttaagagtctgaacttagggtataatactcttagtgagatgaag
actgcctcacaagctcttgctggttatgtaaaattaactagtaatgagactaaaaatcag
ttagaagttcagcaaaagattgccgaagtgtacaaccagaccaaggataaagagaaagca
caggaagcgggtagacgtctagaaatccaacagttagaagaacaggaagcagcccttaag
cgtgtcctagaaactaacaagggtaacaaggcaattgagaatgaaatagctaaggttcag
ttagaacgtatcaaaattactaaccaggacatggaagctcagaagaaagttaaggactat
acggataagattcttggtgttgatcgtgaaattgctctcctgaataaccgtactatgaca
gatacccagtatcgtttagcacagttaaaactagaactgactattgagaaagaaaagtat
gcgtggtactctagacaagctggtaaacagaaagaggctgaacaatctaggcgtgctcaa
gcacagataaatagagaactcgtggaagcagagaaacaagctaccgctactcatgtatca
gctctcatggatgccttagaggttagtcaaactgagagaaatgtcactggccagtctcag
attcttactgaaaggttatcgatttcagaaaagcagttagagttatccaaagacaatact
gaagaagaaattaaatatcgtaatgagatttataaaacttcagcagccctagaacagctt
aaaaaacagagagatgctcagatgcagcaacaggtaggttcttctgttggagctacttat
actcctacgactggtttatccggggatgataagaagtatgctgatatgcagaaccagatg
gcctcttacgacgaagctatttctaagcttggagcattaaatagccaagcaacggaagtt
ggccagagtataggcaatcttactaatgccatgatgcagttctctcagggatctttagat
actgttagcactgtggcagcgggtatgcagatggtttcttcaatgatcgctatgggagta
agtaatcaagtatccgctattgatcaggctattgcagcagagcaaaaacgtgacggtaaa
tccgaagcatctaaagctaagctcaagaaactggaagcggaaaaggttaagatccagcag
gatgcagctaagaagcaaatcattattcagacggcagtagcggtgatgcaagcagcaaca
gctgttccctacccctggtctattcctcttatgattgccgcaggtgttgcaggtgcattg
tctcttgcacaagcatcctctgcatctggtatgtcttctattggagactctggtactgat
acagctcaatacttgtctcttggagagcgccagaagaacgtggacgtttctatgtcggct
aacgcaggagaactttcttatattagaggagatcaagggattggtaatgcgaactctttc
gtacctcgtgcagaaggtggtaatatgtaccctggagttagttaccagatgggtgagcat
ggtaccgaagtaatcactcctatggttccgatgaaggctactcctactgatgaactcaaa
ggatcttcaaagagtacatcgggtagacctattgtgctgaacatcagtacgatggatgcg
gctagcttccgagactttgcttcgagtaacagtgctgctttcagggatgccgtggaacag
gctcttaatgagaatggaaccaccctgaaatcacttggtaattcttaa

DBGET integrated database retrieval system