Viruses: 55628803
Help
Entry
55628803 CDS
T40000
Symbol
HWD22_gp034
Name
(RefSeq) Salmonella phage bombadil; straight fibre tail protein
Virus
2713285
Salmonella phage bombadil
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PB4_spike
Fn3-III_PB4
Fn3-I_PB4
Fn3-II_PB4
BACOVA_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55628803
NCBI-ProteinID:
YP_009857925
RS:
NC_048866
LinkDB
All DBs
Position
NC_048866:29583..31640
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MISNNAPAKMVLNSIMTGYTMAYIQHSIYTDYDVIGRSFWLKLGEEVDRRDFTGIDTFFV
MINNLTPSTTYQVQGAFYDSIIDSELLNAKIGINLSNETNFKTKEKPIIVAARSESEPVD
VGVGAPIVVVETTGEASYCTIELKSTATEDSSWTKYYIGALGSTIKFGGVPIGDYKIRIS
GQVTMPDGVTVDSSGYYEFPNIITVAYNFVPPTAPIDIVFKAARIADGKERYDVRIEWDW
ERGAGANVREFLVTYINSEEYAKTGWAKAQKINVGAARAATIISFPWKVEHTFKVSSIAW
GPNKQDITESAPVTFILNEDTPLDNSFVNETGIDVNYAFIKGSMKDGEIWRQTFLIDAAT
GAINIGLLDREGKAPISFDPINRVVNVDGKVITRDINAANFIMTNLSGKDNPAIYTQGKS
WGDNNSGIWMGMDNTSAKAKLDIGNATQWIRYDGTTLRISSGVVIGTPNGDVDIGTGLQG
KQTVFVYKLATSLPTKPLEQDYPPPGWSKTPPNRTDMTQNIYATTGTLDPVTNKLLEGTS
WSDVVQWSGTEGTIGHDGQRGPGMYSMGIPGLGGWDDGQANAFFQNNFGKPPVKYDVLTQ
YNSNAPQTAFTRQWNGSGWINPAMVLHGNMIVNGTVTADKIVAGNAFLSQIGVNIIYDRN
AALSGNPEAYYKMKIDLNSGYIHIR
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttctaataatgcaccagccaagatggtcttaaatagtattatgactgggtatacg
atggcgtatatccagcattctatctataccgactacgatgttatcggtagatcattctgg
cttaaacttggcgaagaagtggatagaagagatttcactgggatcgacactttctttgtt
atgatcaataatttaactccctcaactacctatcaggttcagggagctttttatgactca
attattgactcagaacttttaaatgcaaaaattggtattaacctctctaatgaaactaac
tttaaaacaaaagagaagccaataattgttgcagcaagatctgagtcagaacctgtggat
gttggggtgggagcaccaatagttgttgtggaaacaactggtgaagcaagctactgtact
attgagttaaaaagtacagccactgaagacagttcatggactaaatattatattggggct
ttaggttctactattaaatttggcggagttcctatcggagattataagatcagaatatct
ggtcaagtaactatgcctgatggtgttacagttgattcttctgggtactatgagttccct
aatattataactgtagcttataattttgttcctcctactgcacctatcgatattgttttt
aaagctgcacgaattgctgatggtaaagaacgatatgatgttagaattgagtgggactgg
gaacgtggtgctggtgctaacgttcgtgaattcttggttacttacataaactccgaggaa
tacgctaaaaccggatgggctaaagctcaaaagataaacgtgggtgctgctagagctgca
acgattatatcattcccatggaaagttgaacatacctttaaggtttcatcaattgcctgg
ggaccaaacaaacaagatataacagaatcagctcctgtaacatttattctgaatgaagat
actcctctagataatagttttgtcaatgagacgggtattgatgttaactatgcctttatt
aagggtagtatgaaagatggggaaatatggagacaaacattcctaattgatgcagctact
ggtgctattaacattggtctgctagatagagaaggtaaagcacctatttctttcgaccct
ataaaccgtgttgttaacgttgatggtaaagtaatcactagagatattaatgctgcaaac
tttattatgactaacttgtctggtaaagataatccagcaatttacactcaaggtaaatct
tggggagataataactctggtatttggatgggcatggataatacctctgccaaagctaaa
ttagatattggtaatgctacacaatggatacgttatgatggtactaccctacgtatttct
agtggtgtagtaattggaacaccaaatggtgacgtagatattggtactggattacagggt
aaacaaacagtatttgtttataagttagcaacatctctacccaccaaaccgctagaacaa
gattatccacctcctggttggtcaaaaactccacctaaccgtacagatatgacacaaaat
atctatgcgaccacaggtacacttgatccagttactaacaaacttcttgaaggcactagc
tggtctgatgtggttcagtggagcggtactgaaggtactataggacatgatggacagcgt
ggtcctgggatgtactccatgggtattcctggattaggtggttgggatgatggacaggct
aatgcattcttccaaaataactttggaaaacctccagttaaatacgatgtcttaacacaa
tataacagtaatgctccacaaacagcatttacccgccaatggaacgggtctggatggatt
aaccctgcaatggttcttcatggaaacatgattgttaatggaactgtaactgcggataag
attgtggcaggaaatgccttcttatcacaaataggtgttaatataatctacgatagaaat
gctgcgttatcagggaaccctgaagcatactacaagatgaagatagacctaaatagtggg
tatatccatataaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system