Viruses: 55628993
Help
Entry
55628993 CDS
T40000
Symbol
HWD23_gp034
Name
(RefSeq) Salmonella phage faergetype; tail length tape measure protein
Virus
2713297
Salmonella phage faergetype
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
TMP_N
TMP_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55628993
NCBI-ProteinID:
YP_009858086
RS:
NC_048867
LinkDB
All DBs
Position
NC_048867:24218..27928
Genome browser
AA seq
1236 aa
AA seq
DB search
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAA
DRAAKSLTKMQASRGMAGITKSIEGIGDKLDDLALAMIEVSEKLESGFTHVGKSVKAMGN
DVAAATEKVQDRLYDTNRALGNTARGFNDTTTSAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAK
VGGSLPLMYAAIASNVFVLQSAFEQLKMGDQLNRLEKFGTIVGTQTGTPVQTLARSLQEA
AGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQE
IELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNVNSLSTFQKQQAYANAVIAESTKRFG
YLDDVLRATPWEQFAANADAALRKVQQAAAKYLGPVIDSINAVFYTSQASISASAARAQE
ETNRQIDPTNVGAVALSLSASEEGYNKALDMYKESLEKRNKLKADLDKRMQQADASTAGA
IRLVAQGAPVGLAAGGFEVGGVRIGSSEENQKFIADTAALALQVERLDKEVEDSTGNLNA
WKSAYQAAGAAAAKANPEFQKQINLQKDANDPDAVYDFNSATLKGLTEQQKAYDQAKKTA
SDLANDIQNIAQNTNTAAKTSASLSDTIKTIESLSAGTGKNADEYVKSLNLGYNTLSEMK
TASQALAGYVKLTGNETKNQLEVQQKIAEVYNQTKDKEKAQEAGRRLEIQQLEEQEAALK
RVLETNKGNKAIENEIAKVQLERIKITNQDMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMT
DTQYRLAQLNLELTIEKEKYVWYSKQIDKQKEAEQSRRAQAQIEREIWKARLDNISRVAA
KRQEAFENTLTGMYPLAGEMQKMEMQLEFYKQMKEFTKGNADEQMRWNSEISKTQAQMSA
LAAQRNAQMQQQVGSSVGATYTPTTGLSGDDKAFADMQNRMASYDQAISKLSELNSEATA
VAQSMGNLTNAMIQFSQGSLDTTSLVAAGMQTVSSMIQYSVGQQVSAIDAAIAAEQKRDG
KSEQSKAKIKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGA
MALAQASSASGMSSIGDSGAETAGYLTLGERQKNVDVSMSANAGELSYIRGDQGIGNANS
FVPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVITPMVPMKATPTDELKGSSKGTSGRPIVLNISTMD
AASFRDFASSNSAAFRDAVEQALNENGTTLKSLGNS
NT seq
3711 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgataagctaatacgagaactacttatagatgtaaagcagaaaggggcaacccgt
actgcaaaatctatcgagaacgtttccgatgcgttagaaaatgctgctgccgcttccgaa
ctgactaatgagcagttaggaaaaatgcccaaaactctttactccattgagagggcggcg
gatagagcagctaaaagtctaactaaaatgcaggctagtagaggtatggctggtatcact
aaatccattgaaggtattggtgataagctagatgatcttgcccttgctatgatcgaagta
tctgagaagctagagtctggatttacacatgtgggtaaatctgttaaggctatgggtaac
gatgtagctgctgcaaccgaaaaagttcaagatagattatatgatactaaccgagcacta
ggcaatactgctagaggctttaacgatacaactacctccgcaggacgtgctagtcgtgca
attggtaatacttctggttcagcacgtggtgctactcgtgacttcgcagcaatggctaaa
gtgggtggtagtttacctcttatgtatgctgctatcgcgtctaacgtgttcgttctacaa
tctgcattcgaacaacttaagatgggtgaccagttaaaccgtcttgagaagtttggtact
attgttggtactcaaacaggtactcctgtacaaactctagctagatctctacaagaggct
gctggttatgcaatctccttcgaagaagcaatgagacaggcatcctctgcttctgcatat
ggattcgatgctgaacaacttaataaatttggtctagtagctcgtcgtgctgctgctgtt
cttggtgttgatatgactgatgcacttaaccgtgtaatcaagggtgtatctaaacaagaa
atcgaacttctggacgaacttggtgttactattcgtcttaatgatgcttacgctgactac
gttaaacagttaaatgctgctaacacaggtattacgtataacgtcaatagtctttccact
ttccaaaagcaacaagcatatgctaacgcagtaatcgctgaatctactaaacgtttcggc
tatcttgatgatgtacttcgtgcaaccccttgggaacagtttgctgctaatgctgatgct
gcactgagaaaggttcaacaggctgctgctaagtatttagggccagtaattgattctatc
aacgcagtgttctatacttctcaagcatctatctcggcctctgctgctagagcacaggaa
gaaactaaccgtcagattgacccaactaacgttggtgctgtagctttaagtctttccgct
tctgaggaaggatataataaagctcttgatatgtacaaagaatctctagaaaagcgtaat
aagttaaaagctgatctagataagcgtatgcagcaagcagatgcatctacagcaggggct
attcgtttagttgctcaaggtgcaccggtagggttagctgcaggaggttttgaagtagga
ggagttcgcataggatcttctgaagaaaaccagaaatttattgcagatactgctgcatta
gctctccaggtagagcgtcttgataaggaagtagaggattcaactggcaatcttaatgca
tggaaatcggcataccaagctgctggtgctgcagctgctaaggctaatccagaattccag
aagcaaattaacctacagaaagatgcaaatgaccctgatgcggtttatgacttcaactct
gcaactctgaaaggactgacagaacagcagaaagcatatgatcaggctaagaaaactgct
agtgatttagctaacgatatccagaacatcgctcagaatactaatactgcggctaaaact
agtgcatccctatcagatacgattaagactattgagtctctttctgcgggtactggtaaa
aatgctgatgagtatgttaagagcctgaacttagggtataatactcttagtgagatgaag
actgcttcacaagctcttgctggttacgtaaaattaactggtaatgagactaagaatcag
ttagaagttcagcagaagattgccgaagtgtacaaccagaccaaggataaagagaaagca
caggaagcgggtagacgtctagaaatccaacagttagaagaacaggaagcagctcttaag
cgtgtcctagaaactaacaagggtaacaaggcaattgagaatgaaatagctaaggttcag
ttagaacgtataaaaattactaaccaggacatggaagctcagaagaaagttaaggactat
acggataagattcttggtgttgatcgtgaaatagctctcctgaataaccgtactatgaca
gatactcaatatcgtttagctcagttgaaccttgaactgactatcgagaaagagaagtat
gtgtggtactccaagcagattgataagcagaaggaagctgaacaatcaagacgtgctcag
gcacagattgagcgtgaaatctggaaagctaggttagataatatatccagagttgcagca
aaaagacaggaagcatttgagaatacattaactggcatgtaccctctagcaggggaaatg
caaaagatggaaatgcagttagaattctataaacaaatgaaagagtttactaaaggtaat
gcggatgaacagatgcgatggaattctgagatatcaaaaactcaagcacaaatgtccgca
ttagcagcccaaagaaatgctcaaatgcaacaacaagtaggttcatctgtaggagctaca
tatacacctacaactggactatctggagatgacaaagctttcgcggatatgcagaataga
atggcatcctatgaccaggctatctctaaactatccgagctgaactctgaagcaactgca
gtggcacaaagcatgggtaacctaactaacgctatgatccagttctcacaaggatctctg
gataccacttctctagtagcggctggtatgcaaactgtgtcttcaatgattcagtatagt
gttggtcaacaggtaagtgctattgatgcagctattgcagcagaacagaaacgtgatggt
aaatctgagcaatccaaagctaagatcaagaagttagaggctgaaaagctcaagatccag
caagatgcagctaagaagcaaatcattatccagacggcagtagcggtgatgcaagcagca
acagctgttccgtatccattctctattcctctgatggttgcggctggtttagcaggtgct
atggctcttgctcaagcatcctctgcatctggtatgtcttctattggagactctggtgct
gagacagcgggttacttaactcttggagagcgccagaagaatgtagacgtttctatgtcg
gctaacgcaggtgaactttcttatattcgaggagatcaagggattggtaatgctaactct
ttcgtacctcgtgcagaaggtggtaatatgtatcctggagttagttaccagatgggtgag
catggtaccgaagtaattactcctatggttccgatgaaggctacccctactgatgaactc
aaaggatcttcaaaaggcacatcgggtagacctattgtgctgaacatcagtacgatggat
gcggctagcttccgagattttgcttcgagcaatagtgctgctttcagggatgccgtggaa
caggctcttaatgagaatggaaccaccctgaaatcacttggtaattcttaa
DBGET
integrated database retrieval system