Viruses: 55629971
Help
Entry
55629971 CDS
T40000
Symbol
HWD28_gp040
Name
(RefSeq) Salmonella phage atrejo; straight fibre tail protein
Virus
2713277
Salmonella phage atrejo
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PB4_spike
Fn3-III_PB4
Fn3-II_PB4
Fn3-I_PB4
BACOVA_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55629971
NCBI-ProteinID:
YP_009858919
RS:
NC_048872
LinkDB
All DBs
Position
NC_048872:32044..34041
Genome browser
AA seq
665 aa
AA seq
DB search
MAYIQHSIYTDYDVIGRSFWLKLGEEVDRRDFTGIDTFFVMINNLTPSTTYQVQGAFYDS
IIDSELLNAKIGINLSNETNFKTKEKPIIVTARSESEPVDVGVGAPIVVVETTGEASYCT
IELKSTATEDSPWTKYYIGALGSTIKFGGVPIGDYKIRISGQVTMPDGVTVDSSGYYEFP
NILTVAYNFVPPTAPIDIVFKAARIADGKERYDVRIEWDWERGAGANVREFLVTYINSEE
YAKTGWAKAQKINVGAARAATIISFPWRVEHTFKVSSIAWGPNKQDITESAPVTFILNED
TPLDNSFVNETGIDVNYAFIKGSMKDGEIWRQTFLIDAATGAINIGLLDEEGKAPISFDP
INRVVNVDGKVITRDINAANFIMTNLSGKDNPAIYTQGKSWGDNNSGIWMGMDNTSAKAK
LDIGNATQWIRYDGTTLRISSGVVIGTPNGDVDIGTGLQGKQTVFVYKLATSLPAKPLEQ
DYPPPGWSKTPPNRTDMTQNIYTTTGTLDPVTNKLLEGTSWSDVVQWSGTEGTIGHDGQR
GPGMYSMGIPGLGGWDDGQANAFFQNNFGKPPVKYDVLTQFNSNAPQTAFTRQWNGAGWI
NPAMVLHGNMIVNGTVTADKIVAGNAFLSQIGVNIIYDRNAALSGNPEAYYKMKIDLNSG
YIHIR
NT seq
1998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtatatccagcattctatctataccgactacgatgttatcggtagatcattctgg
cttaaacttggcgaagaagtggatagaagagatttcactggaatcgacactttctttgtt
atgatcaataacttaactccctcaactacctatcaggttcagggagctttttatgactca
attattgactcagaacttttaaatgcaaaaattggtattaacctctctaatgaaactaac
tttaaaacaaaagagaagccaataattgttacagcaaggtctgagtcagaaccagtggat
gttggggtgggcgcaccgatagttgttgtggaaactactggtgaagcaagttactgtact
attgagttaaaaagtacagccacggaagatagtccttggactaagtattacattggggct
ttaggttctactattaaatttggtggagttcctataggagattataagatcagaatatct
ggtcaagtaactatgcctgatggtgttacagttgattcttctggttactatgagttccct
aatattctaactgtagcttataattttgttcctcctactgcacctatcgatattgttttt
aaagctgcacgaattgctgatggtaaagaacgatatgatgttagaattgagtgggattgg
gaacgcggtgctggtgctaacgttcgtgagttcttggttacttatataaattccgaggaa
tacgctaagactggctgggctaaagctcaaaagataaacgtgggcgctgctagagctgca
acaattatatcattcccatggagagttgaacatacgtttaaggtatcatcaattgcctgg
ggaccaaataaacaagatataaccgagtcagctcctgtaacatttattctgaatgaagat
actcctctagataatagttttgtcaatgagacgggtattgatgttaactatgcctttatt
aaaggcagcatgaaagatggggaaatctggagacaaacattcctaattgatgcagctact
ggtgctattaacattggtctgctcgatgaagaaggtaaagcacctatttctttcgaccct
ataaaccgtgttgttaacgttgatggtaaagtaattactagagatattaatgctgcgaac
tttatcatgactaacttgtctggtaaagataacccagcaatttatactcagggtaaatcc
tggggggataataactctggtatttggatgggtatggataatacctctgccaaagctaaa
ttagacattggtaatgctacacaatggatacgttatgatggcactactctgcgtatttct
agtggtgtagtaattggaacaccaaatggtgacgtagatattggaactggtttacaaggt
aagcaaacagtatttgtttataagttagcaacatctctaccagctaaaccgctagaacaa
gattatccacctcctggttggtcaaaaactccacctaatcgtacagatatgacacaaaat
atctatactactacgggtacacttgatccagttactaacaaacttcttgaaggtactagc
tggtctgatgtggttcagtggagcggtactgaaggtactataggacatgatggacagcgt
ggtcctgggatgtactccatgggtattcctggattaggtggttgggatgatggacaggct
aatgcattcttccaaaataactttggaaaacctccggttaagtatgatgttctaacacaa
tttaacagtaatgctccgcaaacagcatttacccgtcaatggaacggagctggatggatt
aaccctgcaatggttcttcatggcaatatgattgttaatggaactgtaactgcggataag
attgtggcaggaaatgccttcttatcacaaataggtgttaatataatctacgatagaaat
gctgcgttatcagggaaccctgaagcatactacaagatgaagatagacctaaatagtggg
tatatccatataaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system