Viruses: 55802821
Help
Entry
55802821 CDS
T40000
Symbol
HYO65_gp016
Name
(RefSeq) Tenacibaculum phage PTm1; tail sheath
Virus
2547425
Tenacibaculum phage PTm1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Phage_sheath_1C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55802821
NCBI-ProteinID:
YP_009873700
RS:
NC_049340
UniProt:
A0A5S9BYY4
LinkDB
All DBs
Position
NC_049340:18931..22029
AA seq
1032 aa
AA seq
DB search
MALDPQLAKFRAPGTKILTTVQEQIPIISAPNGARLLVINSRKGAVNKILYVQTWTEFKR
YFGNISIAEERKGSFGHRSAYYMLQTAPIYVLNLRKFDDTKDKAGTVELSVDSSVKNASI
VLEAYSKLFNKQQFWNIDPRKLVKSTNTDKLLMFANVGSDNLSIFVRKSRNVRTSLTFRE
WYKNLGRTMPSFVYPEDKVADWYVDVLLFENTFDNTSSANASYGHIFDISGNVKKTVVNE
LGQTVDALGQLASIPESGYVATITGNLIQGFISETGENHDVVSLINNNVQQYGLIAKVND
NIFDNAEVWTKGASVASNAQKQLIPVDLVGHRLFDINANSTFNSSAYTARTNVRAVSYTF
PLAIQTIGQTLRETYTSSATVFGSVNSGTTLVKIDNVMTPATLAVSGTNHTYTKSSTNQI
YVFEKNKVGVGEKFVSADGNLATATKVEYVGKLSQIADYGTMKAPVQPYNLDGGIAGSNN
WDDASGNLAGFSYPATASGTPFPKDGTNSYYVYPTGHPLAGLPLVFRSTTGFVVHNPVQS
EDTASQYIYQKDASGNDIKPNFASLPGGYAPNATRQYIEAVDIQPSRVKANDTANSTTKW
TGLLNAFAGGGHNTYLVTFDKPLVFNNFDSDTTTVDASPYTTVNSDADSVLYFVDGTNRP
VFNPVSRKAHSVYKSISFDAVTTGYAPVNLSAYVARNEQFVDGTATRQKEILDMLTGSSL
RTALANRELSTFYYIVDSFKSYIEPNIKVQLKTIAKERQLCRAIYNMPSIRDFQDSTNPF
FKETTDGEFQARFIPSGGNLQLPYTNTFSIPNEDGWYAYGFGPDLMIQDGGRTIYIPPAP
VVSNNFQRKYQSGNPYDMVAGAGAGTVSGTGIVGVEYTFNEKNDGTGDRDYLNPFGFNII
LNKRATGLQIYSNVTSLNTIETPLRSIHTSESLMYIQDQVNKLLERYVFKFNTAQNRLTI
KTEADKICQRLVDDGVISNFVNQMDEKNNTSEVINARIGILDTTLYANNGMEIAIHRTKV
DGVQNTTSFELL
NT seq
3099 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattagacccacaattagctaaatttcgtgcgccaggtacaaaaatcttaacaaca
gtacaagaacaaattcctattatttctgcaccaaatggtgctagattattagtaattaat
tctagaaaaggtgcagttaataaaattttatatgtacagacatggacggaatttaagaga
tacttcggaaacatttcaattgccgaagagcgtaaaggttcgtttggacatcgttcagca
tattacatgttacaaacagcaccaatttacgttttaaatttacgaaaatttgatgacaca
aaggataaggctggtacagttgaattatctgttgattcatcagtaaagaatgcatctatt
gttttagaggcttattcaaaattattcaacaagcaacaattttggaacatcgacccacgt
aaattagtaaagagtacaaatactgataaactattaatgtttgcgaatgttggtagtgat
aacttatcaatttttgttcgtaaatcaagaaacgtaagaactagtttaacctttagagaa
tggtataaaaacttaggtcgtacaatgccatcgttcgtatatcctgaggataaagttgcg
gattggtatgttgatgtattattattcgaaaacactttcgataacacttcaagtgcaaat
gcatcatatggacatatttttgatattagtggaaacgtaaagaaaacggttgttaatgaa
cttggacaaacagttgatgcattaggtcaattagcatctattcctgagagtggatatgtt
gcaacaataactggtaacttaattcaaggttttattagtgaaactggtgagaaccatgat
gtagtatcattaatcaacaacaatgttcaacaatatggattaatcgctaaggttaatgat
aatatttttgataatgctgaggtttggacaaagggtgctagtgttgcaagtaatgcacaa
aagcaattaataccagttgatttagttggtcaccgtttattcgatattaacgctaactct
acttttaattctagtgcatatacagctagaacaaacgttagagcagtttcatatacattc
ccattagctatacaaaccattggtcaaacactaagagaaacatatacttctagtgctaca
gtatttggttcagttaatagtggaactactttggtgaagattgataatgtaatgacacca
gctacattagctgttagtggaacaaaccacacatatacaaaatcttctacaaatcaaatt
tatgtttttgaaaagaataaggttggtgttggcgaaaagttcgtatctgctgatggtaac
ttagctacagcaacaaaggtagaatatgttggtaaattatcacaaatcgctgattatgga
acaatgaaagcacccgttcaaccatataatttagatggtggtattgcaggttcaaataac
tgggatgatgctagtggtaacttagctggattttcatacccagcaacagcaagtggaaca
ccatttccaaaagatggtacaaacagctattatgtatatccaacaggacacccattagca
ggtttaccgttagtattccgttcaacaactggatttgttgtacacaacccggtacaatca
gaggatacggcatcacaatatatctatcaaaaagatgctagtggtaatgatattaaacca
aacttcgcaagtttacctggcggttacgcaccaaacgcaacacgtcaatacatcgaagca
gtagatattcaaccatcaagagtaaaagcaaatgatactgcaaactcaacaactaaatgg
acaggtttacttaatgcatttgcaggtggtggacataatacatacttagttacatttgat
aagccattagtatttaataactttgattctgatacaacaactgttgatgcatcaccatat
actacggtaaattctgatgctgattctgtattatattttgtagatggtacaaatagacca
gtatttaatccagttagtagaaaggcacattctgtatataaatcaattagttttgatgca
gtaacaacaggttatgcaccagttaatttaagtgcttatgttgcacgtaacgagcaattc
gttgatggtacagcaacaagacaaaaggagattttagatatgttaacaggttctagttta
agaacagcgttagctaacagagaattatcaacattctattatattgtagatagctttaag
tcatatatagaacctaacattaaggtgcaattaaagactattgcaaaggaaagacaatta
tgtagagctatttataacatgccatcaattagagatttccaagatagtactaacccattc
tttaaggaaacaactgatggtgagttccaagctagatttattcctagtggtggtaattta
cagttaccttatactaatacattctctattcctaatgaggatggatggtatgcttatggt
tttgggccagaccttatgattcaggatggtgggcgtacaatttacataccaccagcacca
gttgtatcaaacaacttccaaagaaaatatcaaagtggaaacccttatgatatggttgca
ggagcaggagcaggaacagttagtggtactggtattgttggtgtagaatatacatttaat
gaaaagaatgatggtactggtgatagagattatttaaatccgtttggatttaatatcata
ttaaacaaacgtgcaacaggattacagatttactctaacgtaacatctttaaacactatt
gaaacaccattacgttctatacatacatctgaatcattaatgtacattcaagaccaagtt
aataagttgttagagcgttatgtgtttaagtttaatactgcacaaaacagattaacaatc
aaaactgaggctgataagatttgtcaaagattggttgatgatggggttatttcaaacttt
gttaaccaaatggatgaaaagaacaatacaagtgaggtaatcaatgctcgtattggtatc
ttagatactacattatatgctaataatggtatggaaattgctatccacagaactaaagtt
gatggtgttcaaaacactacttcttttgaattattataa
DBGET
integrated database retrieval system
