Viruses: 55810731
Help
Entry
55810731 CDS
T40000
Symbol
HYP70_gp039
Name
(RefSeq) Acinetobacter phage KARL-1; tail fiber protein
Virus
2301662
Acinetobacter phage KARL-1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Phage_fiber_rpt
Phage_fiber_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55810731
NCBI-ProteinID:
YP_009881459
RS:
NC_049441
LinkDB
All DBs
Position
NC_049441:complement(23492..27349)
Genome browser
AA seq
1285 aa
AA seq
DB search
MALDPNINRIKHLRSKTAGAVPSPTLLDEGELAINLVDRTIFSKNGANTVELGFGKGGTV
AGPINVTGGNAVSAAQFNGALNGNAATASRLLTGRKINDVVFDGTKDITIEDSTKLYKTD
VLTAAGNSRVIRDAATIRAEGTAKGAVVIHLPKKANSVSTMMKLCIQGFDYVSGRATQSN
WSVDISGYNYTGAAWHSYQAISTGGPAPFDTVRWGQAGDHQVIILGEAGASPSSWSYYNI
SIEKIYLTANNTASYDDPNDPIYMAIEADISNYTINATMPLEGVAMAKRLEIGRTLTFTG
DARGSLLFDGTANVSTALTINSATTGQAGLVKLNNTLTSTSVTEALTAAQGKALQDTKVN
RSGDTISGRLVVTQGITTPSISNDVTVPISFLGPSVNNSNTGGIRVRNLEVNNQYGTSTR
AFGIFSKEGIVAGDSAPYASLAAIGVGNNIPFKVNDTNVYTTYGFVPFLGGNVQSSSGYR
TVTSIGVYRPGPDWADSGMYIATGSSDGASTEAFLFKGGRTIENTNGPIILKGNADSATK
LQTPRTINGVAFDGTSNIRIQQLAEGIPAGADLNTYLTEGFYYCDTDAVAQTIKNGPFTG
AAFCLLVERTAGVKQTFTIYSPGSSRTWIRNIYIYGGTTGAWREVAYTDAPTFTGAGRFI
DNLTVNGITNTTGLNNSGDLRSSGSSYLGNQNELGTIGTAGPVYIDFHSGTSNIDYDARI
MSSGGTTAIGNGALSYIAASHSFNGSIGAGIISASSISVSTGLGISNTSNTVLAGLSLYG
GAQSGKPTYGITFTGTSNAGTGKHGDLTNATWAVYLTCAASSVEKRGWIFQRSDNNENVA
SISTAGVLSTSGSIQTLNDNTMINVGNDKDLALVKKRGSKAFIGVGADTPFSVSKSNANW
VDPTHTFTELFTVSSAGVANAVGGFTGTFSGTFNGTISGTLTGSLNGNASTATTLQTARA
IGITGSGASGSVQFDGTDNAIIPLTVATQATETNNTSIATTAFVQNVNVAETGASAYAVR
LKTPRSFQITGGITTNAVAFDGQQNVVLTANAVDGSKVSGVVPEAIKAQTLAVTPQKNAK
LVASWKGTILQSMTPTLTIVDANTLRVRLADDNPGNRLAVLRFNVKIGTVYHLAFSNTML
PINGTVTYVNTGLTWVEVDLNAPNHGLSGSGLGVNVMAITYSAYGCYFEGTISQIIGTTG
PQDSQWAYVLKLNSPTTDATYNLSGSSQDAIWVADKNIWYLNPVQPVITAGAMISPDRLN
FFAADTDSSARMRSNMVTAQIWDIV
NT seq
3858 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattagatccaaatattaacagaattaaacatctaagatctaagacagcaggtgca
gtgccaagccctactctcttggacgaaggcgaattagccattaacttggttgatcgtaca
atattttcaaaaaatggcgcaaacacagttgaacttgggttcggtaaaggcggtacagta
gcggggccaatcaacgtaacaggcggtaatgctgtatcagctgcacaattcaatggtgca
ttaaatggtaatgctgcaactgcatcaagactccttactgggagaaaaattaatgatgta
gtttttgatggtactaaagatattactatcgaagattctactaaattatacaaaaccgat
gtgctgaccgctgctggtaattctcgtgttattcgtgatgcagcaacaattcgtgcagaa
ggtactgctaaaggagcagtagtaattcatttgccgaaaaaggcaaattcagttagcaca
atgatgaaattgtgcattcaaggatttgattatgtttctgggcgagctactcaaagtaac
tggtctgtagatattagtggatataattacactggtgcagcttggcactcataccaagca
atttcaacaggcggcccggcgccattcgatactgttcgttggggacaagctggcgatcac
caagttattattttaggcgaagccggtgcatcaccttcttcatggtcatattacaatatt
agtattgagaaaatttatttaactgctaataatacagcatcatatgatgaccctaatgac
ccgatttatatggcaattgaagccgatatatctaactatacaataaatgccactatgcca
cttgaaggtgtagcaatggctaaacgtttagaaataggccgtacattaaccttcaccggt
gacgcgagaggttcattgttatttgatggcacggcaaacgtttctactgcattaacaatt
aattctgcaactacaggccaagcaggtttagttaaattaaacaatacattaacttctaca
tctgtcacagaagcgttaactgctgctcaaggcaaagcccttcaagacactaaagttaat
agaagtggagataccatttcaggacgtttagtcgttactcaaggtattactactcctagc
attagcaatgatgtcactgtaccaattagctttttagggccttcagtaaataattcaaac
acaggtggaatacgggtaagaaatttagaagtaaataaccaatatggcacatcgacacgt
gcatttgggattttttctaaagaaggtatagtcgcaggcgattccgcaccgtatgcttct
ttagcagctataggcgttggcaacaatatcccatttaaagtaaacgacaccaatgtttat
acaacatatggctttgtgcctttccttggaggtaatgtacaatcgtcttcaggatacaga
acagttacatctatcggtgtatatcgcccaggcccagattgggctgattctggaatgtac
atagctacaggatcttcagatggcgcatcaactgaagcgtttttatttaaaggcggtcga
actattgaaaacacaaatgggcctattatacttaaaggtaatgcagattctgctactaaa
ctccaaacacctagaactatcaatggtgttgcttttgatggaactagtaacattcgaata
cagcaattagctgaaggtattccagctggtgcggatttgaatacatacttaactgaaggt
ttttactactgcgacacagacgcagtggctcaaacgatcaaaaatggaccttttactggc
gctgcattctgcttattggtagaaagaactgctggcgttaaacaaacatttacgatctat
agtcctggttctagtagaacatggatccgtaatatctacatctacggcggtactacagga
gcttggagagaagtggcatatactgatgcaccaactttcacaggagccggaagatttatc
gacaatttaaccgtaaatggaattacaaacacaacgggattaaataattctggcgatttg
agaagttccggatctagttatttaggtaatcaaaatgaattaggtacaattggtacagct
ggcccagtttatattgattttcattctggcactagtaatatagattatgatgcaagaatt
atgtcttctggcggaactactgctataggaaatggagcattgtcatatattgcagcttct
cattcatttaatggctcaataggcgcaggaattatttctgctagtagtattagtgtatct
actggattaggtatttctaatacttctaatacagttttagcgggtttaagtttatatggt
ggcgctcaatctggcaaaccaacttacggcattactttcactggtactagtaatgcagga
actggtaaacatggtgatttgactaatgctacgtgggcagtatatttaacttgtgccgct
agtagtgttgaaaaacgtggatggattttccaacgaagtgacaacaacgaaaacgttgca
tctatttctactgctggtgtattgtctactagtgggagcatccaaacattaaacgacaat
acaatgattaatgtcggcaatgataaagatcttgcgcttgtcaagaaaaggggttctaaa
gcatttatcggcgtcggggcagatactccatttagtgtatctaaatctaatgcaaattgg
gttgatccaacacatacatttacagaattgtttacagtaagttctgcaggtgtcgctaat
gcagttggaggattcaccggtacgttcagtggtacattcaatggtactattagcggaaca
cttactggttcgcttaatggtaatgcatctactgcaactacgttacaaaccgctcgcgca
attggtattacaggttcaggtgcatcaggttcagtgcaatttgatggtacagacaacgct
atcatcccattaactgttgcgacacaagccactgaaactaacaacacgtcaattgccact
acagcatttgttcaaaatgttaatgttgctgaaactggtgcatctgcctatgcagtacgt
ttgaaaacaccacgatctttccaaattactggtggcatcactactaatgctgttgcattt
gatgggcagcaaaatgtagtattgactgcaaacgcagttgatggttctaaagtatctggc
gtggttcctgaggcaattaaagcgcaaactcttgcagtgacaccgcaaaaaaatgcgaaa
ctcgttgcatcatggaagggtaccatattgcaatctatgacgcctacactaactattgtt
gatgcaaatacacttcgtgttagattagcagacgataatccgggtaacagattggcagta
ttgagatttaatgtgaaaatcggcacagtgtatcatctcgcatttagtaatactatgtta
ccaatcaatggcacagtaacctatgtcaataccggcttaacatgggttgaagttgatctt
aatgcacctaaccatgggctatctggcagtgggctcggagttaatgttatggcgataaca
tattctgcgtatggttgttattttgagggcacaattagccaaatcattggcacaacaggg
ccacaagacagtcaatgggcatatgtattgaaactcaattctccgacaactgatgctaca
tataatcttagcggatcttcgcaagatgcaatatgggttgcagataaaaatatttggtat
cttaatcctgtgcagccggtgataactgcaggcgctatgatttctcctgatagattgaat
ttcttcgctgccgatacagattcttcagcaagaatgcgttctaatatggtaactgcacaa
atctgggacattgtataa
DBGET
integrated database retrieval system