Viruses: 5783824
Help
Entry
5783824 CDS
T40000
Symbol
12, EpJS98_gp158
Name
(RefSeq) Escherichia phage JS98; tail collar fiber protein
KO
K26782
Straboviridae short tail fiber protein Gp12
Virus
293178
Escherichia phage JS98
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
S_tail_recep_bd
gp12-short_mid
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5783824
NCBI-ProteinID:
YP_001595287
RS:
NC_010105
UniProt:
Q5QBZ3
LinkDB
All DBs
Position
NC_010105:88928..90454
Genome browser
AA seq
508 aa
AA seq
DB search
MSTNTLKHISDKSEFKSFDPTGSNFPPDITNVQEALAAISLIGVTGNVPSATETSQGIIR
LATTQEVMDGLDAYSAVTPATLKARLDIPTQATETYVGITRYATNAEAIAGTEPQAAIVA
TSLKAVMDYTFENRLSTENTTGVIKISTTPAALAGTDDTTAMTPLKVSQAIGAATAALPV
YSTATTTNEGLVRLATNAEVGNGSLSVGIAISPAGLATLTSTEARSGIIKLAGWDMVSNG
TDHTAAVTPASLLARTGNTGRIGLVRLTTTVGQGDGNTALAYNANVISTSGGEIWGTLNV
NGALRRNGVDVVTHDQLSDSVPVGTICMWGGHEGNIPGKWRACVGGTYTGGAYLNAVGGR
WGWWGAIPDFRGLYPRGANMVGGYSEGEVNPHIAGNRGEDGKGKARLGNGVGSFPQSSVQ
AQALRYHKHAGGFGEHDNYGAFGNTANSGYVGTRKGLDWDNRSYYTNEGFETTEPWNRDG
HTTLNSEGLIANETRPWTMSVLFIIKVE
NT seq
1527 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacaaacacactaaaacacattagtgataaatcggaattcaaatcattcgaccct
actgggtcgaatttcccgcctgatattactaatgttcaagaagcattggcggctatttca
ttaatcggtgtcacgggtaatgttccttcagccacagaaacatcccaaggtattattcgt
cttgccacaacacaagaagtaatggatgggttggatgcttatagtgcagtgactccagca
actttaaaagcacgtttagatattcctactcaggcaacagaaacttatgtaggtattacc
cgttatgctactaatgctgaagctatagcaggcacagagccccaggctgcaatcgtagca
acctctttgaaagcggtaatggattatacatttgagaaccgtttatcaacagagaacact
acaggcgttatcaagatttcaactacacctgctgcattagctggtaccgatgataccaca
gcaatgaccccgcttaaagtatctcaagcaattggtgcggccacagcagcgttaccggtt
tattctacggcaacgaccacaaatgaaggtttggttcgtttagctactaatgctgaagtt
ggcaatggaagtctttcggtaggtattgctatttctccagccggattagccacattaact
tccaccgaagccagaagtggtattattaaactcgcaggttgggatatggtatctaatggt
actgaccatactgccgctgttactccggcatctttgctagctcgtacaggtaatacagga
cgaattggcttggtgcgtttaactactacagtaggacaaggcgatggtaatacggccctg
gcttataatgctaacgttatttctacttcaggtggtgaaatatggggtactttaaacgtt
aatggcgcattacgtcgtaatggtgttgatgttgttacccatgaccaattatcagatagc
gttccagtaggtactatttgtatgtggggtggacatgaaggtaatatcccaggcaaatgg
cgagcttgtgtaggtgggacttatactggtggtgcatatttaaatgctgttggtggacgt
tggggatggtggggtgctattccagatttccgtggattgtatcctcgcggcgctaacatg
gttggtggatattctgaaggtgaagttaacccacatattgccggtaaccgaggagaagac
ggtaaaggtaaagcccgtttaggtaacggtgtaggttcgttcccacaatcttctgttcaa
gcccaagcattacgttatcataaacacgccggtggttttggtgaacatgataactatggt
gcttttggtaacaccgctaactctgggtatgttggtactcgtaaaggacttgactgggat
aaccgtagttattatactaacgaagggtttgagaccactgaaccttggaaccgtgatggc
cataccacactgaatagtgaaggacttattgcaaatgaaacacgtccttggacaatgtcc
gttctttttattattaaagtagaataa
DBGET
integrated database retrieval system