KEGG   Viruses: 5848323
Entry
5848323           CDS       T40000                                 
Symbol
Amapari_sLgp1
Name
(RefSeq) Amapari virus; L protein
  KO
K25303  Mammarenavirus RNA-directed RNA polymerase L [EC:2.7.7.48 3.1.-.-]
Virus
2886894  Amapari virus
SSDB
Motif
Pfam: Arena_RNA_pol ArenaCapSnatch
Other DBs
NCBI-GeneID: 5848323
NCBI-ProteinID: YP_001649216
RS: NC_010251
UniProt: Q6XQH4
LinkDB
Position
NC_010251:31..6612
AA seq 2193 aa
MDEKINSLKDFVRKQVPEIPELSYQRELLLSQVEMGMILMEGFKLLSCLVEIESCKKNSC
EHNSSQKFVDVILSDNGVVTPTLPKVIPDGFRFFNKTLILLETFVRVNPEEFEKKWKRDM
SKLLTLKEDVQKAGITLVPIVDGRCNYNTNLMPDWATERFRWLLIDLLRESRGDSKIDIE
EQEYQRLVHSLSKTGNQSLGFENIECLKRHCLNYESRLDESLLTGFNNDLRESKIREGLI
KMKNWYRKEVFVKGMGNFVKTDKAKLLQSLESLGLHANSGTSECPFCCCKILDICYKLMQ
KLKHGHSLSEGIPDEFIAKSQIEKEYLLVLSVCNKIKGKKVFNTRRNTLLFLDLIMLNFV
IDVFENNPTELCFLKESGLIIGQMLLFSNDRVLDILSARKLLKKKLEISAHWVKKCNSIL
KRAEPDLWDYVSKYITEPKFDSLTSLAEELCTERPVMRYKVQIHSGDGCSHKEFETLSEQ
QQICLFKCLSHVSLSLTNSMKTSFSSRLLVNEVDHKKYFGTVRLKECYVQKFFLTNELYG
LLFYQKTGERSRCYSLYLSDKGQLKEVGSFYCDPKRFFLPIFSDTVLLLMCAEMVSWLDF
CEELAREVDPLLRLLVLSILCSPSKRNQTFLQGLRYFIMAFVNQAHHVQLMSKLVVECKS
ASDVLIQRLSVRMFRMVLDFGSDPDAFMSRKFKFLLNVSYLCHLVTKETPDRLTDQIKCF
EKFLEPKLEFGFFVVNPSLNGTLTKEQEDAMVGGVSKFFSKDIFNIEDMKQPGVSRDLLS
YCLTLFNKGKLKVNGSLKVNPFRPSFTSTALDLSSNKSVVIPKLDELGNIVSVYDKQKLV
STCVASLVERFKTKGKFNLDPNEIEFLIMDNLTNLLAIKGSAVKEREELSMLYEQLSDDA
IKAFEELRQDVEFTLGRMRTPEKKKKTTNFYGNCTLESLWAPFNVMKAIRTETSIHEIRD
FDPNILPPEIYEELCTSVFESSLKESFFLNEVLDICPLELLLKNLTTRCFEEQEFFDCFK
YLLIHAGFDQRLGTYEHKSKSRLGLSEDVFKLRDDVRMSQRESNSEAIARRLDKSFFTSA
ALRNLCFYSEESPTEYTCISPNTGNLKFGLSYKEQVGSNRELYVGDLNTKMMTRLVEDFA
EAVAKSMNYTCLNSEKEFEKAICDMKMAVNAGDICCSLDHSKWGPFMSPALFLSFINELK
LKDHETSALIDCRPVLSVLRWHLHKAVEVPFNVAEAYCTGMLKRRLGLMSLQSQSVSEEF
FHQQLLMGKEVPSHIMSVLDMGQGILHNLSDLYGLITEQFLNYCLDLLFDVVPISYTSSD
DQITMIKFPTTNAPEGGESQSDWLEVLCFHDFLSSKLNKFVSPKSVCGSFAAEFKSRFFV
MGEETPLLTKFVSAALHNVKCKTPTQLAETIDTICDQCVANGVGVTIVGEISKRVNRLIK
YSGYPQTPFLAVEVQDVKDWVDGSRGYRLQRNVENCLSDHPQLELIRKSAKKVLTKIKRG
LIFEEHLVQLIGKGGDNAMEAFLSYIDCSEIEKREALRYRWLNLSSNGDLRLVLRTKLMS
ARRVLEKEQIPTLIKTLQSKLSKNFSRGAKKILAESINKSAFQSSVASGFIGFCKSMGSK
CVRDGSGGFLYIKDVISKVKICSCDICSLAPGIVFCDEALENVSMFSRPILWDYFSLVLT
NACELGEWVFSCVQIPPKPTLLSNPNLFWAVKPRGVRLVEDQLGLNHVLQSVKRNYPKIF
EEHLVPFMSDLQVSRTTDFTKLKYLDVCIALDMMNENLGIISHLLKGRDNSLYIVKQNEC
ASAHVRQVEYVDYDVGLSPQQICSNFKIQLTFSSFINPLVMTTSTLRSFFWFGEVLRLED
ENQIDVGELTDFVLLIKKYNVDRAMMLDDLTMGFVVSEIGEPKFRLLDFEWSGVEEQTSF
PLSENSNNNEIKFTLNLQLEHKRLSTKYRLTRLVVYSYTMVCVMLVNDSRGVLKVENLTL
RASGDVKEHRFLDGVTLVSHHPTLCGKRGINILDLFRDAELPIPETRMFPEEVFLDLSDY
QSEVEDKYAYEIVGPEFSDVPLVMSGGCLVVGDKKLSHLLTELTGNVILKALGALETDGE
IGSFLMGLWPYIKATKQRVKISQEEFLFIYETHRRSLLMSFEAYNDWLEFLDFSVCFSKT
LGDLVVSDSSGNMRLRGVVCRPLRQVGTVMEIE
NT seq 6582 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatgaaaagatcaattctttgaaagactttgtgagaaagcaggttcctgaaatacct
gaactttcctatcaaagagaacttttgttatctcaggtggagatgggcatgattttaatg
gaaggctttaagttactttcctgtttagttgagatagagtcctgtaagaagaattcctgt
gagcacaactcaagtcagaagtttgttgatgtaatcctatctgacaacggagtggttact
ccaactttgcctaaggtaattcctgatggctttagattttttaataaaacattgattctt
cttgaaacctttgttagagttaaccctgaagagtttgaaaagaaatggaagcgtgatatg
tcaaaattgttaacattaaaagaagatgttcagaaagcagggatcactttagtgccaatt
gtggatggaagatgcaattacaacaccaatctgatgccagattgggcaacagaaagattt
aggtggttgcttattgacttgttgagggaatcaaggggtgattcaaagattgacatcgag
gaacaggaataccagaggttggttcacagtttgtccaaaactgggaatcagagtttagga
tttgaaaatattgagtgtctcaagagacattgtctcaattatgaaagtagactggatgag
agtttattgacaggtttcaataatgatcttcgagaatctaaaatcagagaaggtttaata
aaaatgaagaattggtatagaaaggaggtttttgttaaggggatgggtaattttgtcaaa
actgacaaggcaaagctattgcaaagcttggaaagtctgggtttgcatgctaattctggg
acttcagaatgtcctttttgctgttgtaaaatacttgatatttgttacaaattgatgcaa
aaattaaagcatggtcattctttatctgaaggaattcctgatgagttcattgcaaaatca
cagattgaaaaggaatatcttttggttctatcagtgtgcaataaaataaaaggaaaaaaa
gtctttaatactagaagaaacactctgttgttcttagatttaattatgctcaattttgtt
attgatgttttcgaaaataatcctactgagttgtgtttcttgaaggaatcaggactcatc
atcggacaaatgttgctgttttcaaatgacagagtgttggatatcttatctgccaggaag
cttttaaagaagaaattggaaattagtgcccactgggtgaagaaatgtaactcaatttta
aaaagggcggaaccagacctttgggattatgtttcaaaatatatcacagaacctaagttt
gatagccttacctcactagctgaagaattatgtactgagaggccggtcatgaggtacaag
gtgcaaattcactcaggagatgggtgctcacacaaggaatttgaaaccttatcagagcaa
cagcagatttgtctttttaaatgtctttctcatgtgtctttgtcattaaccaattccatg
aaaacctcattttcatccagattgttagtgaatgaggtggaccacaaaaaatatttcggc
actgttagattgaaagaatgttatgttcaaaagttctttttaaccaatgagttgtacgga
cttttgttttatcaaaaaacaggtgaaagatcaaggtgctactcattgtacttgtcagat
aaagggcaactcaaagaggttggttccttttactgtgacccaaagcgattcttcctcccc
atcttttctgatacagtactcttgttaatgtgtgcagaaatggtgagctggctagatttt
tgtgaggaattagctagagaagtggaccctcttttaagactactggtgcttagcattctt
tgctccccttctaaaaggaatcaaactttcctacaaggactaaggtacttcattatggcc
tttgtaaaccaagctcaccatgttcaattgatgtctaaactagtagtagaatgtaaatct
gcatcagatgtattaatacagaggctaagcgtgaggatgttccgaatggttttagatttt
ggttcggatcctgatgcgtttatgtcaagaaagtttaaattcctactcaatgtaagctac
ctttgtcatctagtgacaaaggaaactcctgataggttaactgatcagataaaatgtttc
gaaaagtttttggaacccaaattagaattcggtttctttgttgtgaatccctctctcaat
ggcacattgacgaaggaacaagaagatgccatggtgggtggcgttagcaaattcttttct
aaggacatcttcaatatagaagatatgaaacagccaggggtttctagagacttgctgagt
tattgtttgacactgtttaacaaaggtaagctaaaagttaacggtagtttgaaggtgaat
ccatttagaccaagttttacaagcacagcattagacttgtccagtaataaaagtgttgtg
ataccaaagctagatgagcttggaaacattgtttctgtttatgacaagcaaaagctggtt
tcaacttgtgtggcatcattagttgagagatttaaaacaaaaggcaaattcaatctggac
ccgaatgagattgagtttttaatcatggataatctgacaaatttgctggctattaagggt
tctgctgtgaaagagagagaagagttgtctatgttatatgagcagctatccgacgatgcc
ataaaggcttttgaagagttaagacaagatgtagaatttactcttgggagaatgagaact
ccagaaaaaaagaagaagacaacaaacttttatggcaattgtacattggagtccctttgg
gctccctttaatgtcatgaaggcgattagaactgagactagcattcatgaaatcagagac
tttgatcccaatattttgccacctgaaatttatgaagaattatgcacatctgtttttgaa
tcgtcactaaaggaatctttctttctaaatgaggttcttgatatttgcccactcgaactt
ttattgaagaacttgacaacaagatgtttcgaagaacaggagtttttcgattgctttaag
tatttattaattcatgctgggtttgatcagagattaggtacatatgagcacaagagtaag
tctaggttagggttatctgaagatgtgtttaagctgagagatgatgttagaatgagtcaa
agggagagtaactctgaagccatcgcaaggaggcttgataaaagcttcttcaccagtgca
gctttaaggaatctatgcttctattcagaagaatcccctacagaatacacttgtattagt
ccgaacactggcaatttgaagtttggtttaagttataaggaacaagttggttctaatagg
gagctttatgtaggtgaccttaatacaaaaatgatgacaagacttgtagaggattttgct
gaagctgttgctaagtccatgaactacacctgtttaaactctgagaaagaattcgagaag
gccatctgtgacatgaagatggctgttaatgctggggacatttgctgctcactagatcac
tcaaagtgggggcccttcatgagcccagccctctttctttctttcattaatgaattaaaa
ttgaaggatcatgaaacaagtgctctgattgattgcagaccagttctaagtgttttgagg
tggcatttgcacaaagctgttgaggtgccattcaatgtggcagaggcgtattgcaccggg
atgctgaagaggagattaggtttgatgagcctacaatctcaatcagtgtctgaggaattt
ttccatcaacagttattaatggggaaggaagtgccaagtcatattatgtctgtgttagac
atggggcagggaatacttcacaacctctctgatctttatggactgatcacagaacagttt
ttgaattattgtttagatttgctttttgatgtggtgcccatttcttacacatcaagtgat
gatcaaataacaatgataaaattcccaactacaaatgcacctgaggggggggagagtcaa
tctgattggttagaagttctttgttttcatgacttcttgtcctccaagctaaacaaattt
gtaagtcccaagagtgtttgtgggagttttgctgcagagtttaagtcaaggttttttgtt
atgggtgaagaaacccccttactcacaaaatttgtctcagcagcactccacaatgttaag
tgcaaaacacctactcagcttgccgagacaattgatacaatttgtgatcagtgtgttgct
aatggtgtaggggtcaccattgttggtgagatatcaaagagggttaataggttaataaaa
tactctggttatccacagactccctttttagctgtggaagtccaggatgtgaaagattgg
gtggatggttcaagaggttatagattgcaacgaaatgtggagaactgtctatctgatcat
cctcagttagagcttataaggaaaagtgccaaaaaggttttaacaaagatcaaaaggggg
ctcatatttgaagagcatttagttcagctgataggaaaaggtggtgacaatgcaatggaa
gctttcctctcttacatagactgttcggaaatagaaaaaagggaggctttgcgttatcgt
tggttgaatctgtcttccaatggagatctaagacttgtcttaagaaccaagttaatgtca
gcaagaagggtactggaaaaagaacaaataccaactttaattaagacattacaatcaaag
ctttcaaagaatttctcaagaggtgcaaaaaagatattagctgaatctataaacaagtca
gcctttcaatcgtctgtagcttctgggttcataggcttttgtaagagtatggggagcaag
tgtgtcagagatgggagtggtgggtttttatacatcaaagatgtgatcagtaaggtgaaa
atttgttcatgtgacatatgttctttggctccaggcattgttttctgtgatgaagcacta
gagaatgtctcaatgttctcaagaccaatactttgggattatttttctttggttttgacg
aatgcttgtgaacttggtgagtgggtcttttcttgtgttcaaataccacctaaaccaact
ctattaagcaatcccaatcttttttgggcagtgaagccaagaggtgtgcgtctggttgaa
gatcagttaggattaaaccatgttctacaatctgtaaagagaaattaccctaaaatattt
gaggagcatttggtaccgttcatgagtgatttgcaggtgagtcgaactactgatttcaca
aaattaaaatacctagatgtttgcatagctcttgatatgatgaacgagaatcttggtata
atttctcatttattgaaagggagagacaattcattgtacatagtgaaacaaaatgagtgt
gcatctgcgcatgtaaggcaagttgaatatgttgactatgatgtaggtttgagtcctcaa
cagatctgttcaaattttaaaattcagttgaccttttcttcttttatcaacccacttgtg
atgacaacttcaacattaagatcctttttttggtttggggaggttcttaggttggaagat
gagaaccaaatagatgttggtgagttgacagactttgttttattgattaagaagtacaat
gtggatagagcgatgatgttagatgatctaacaatggggtttgttgtctcagaaattggt
gagccaaaattccgtttgttagattttgaatggtctggtgtcgaggaacaaacttctttt
ccactatctgaaaactcaaacaacaacgaaataaaatttacattgaatttgcagctggaa
cacaaaaggctttcaacaaaatatcgtctgactaggcttgttgtgtattcctacacaatg
gtctgcgtaatgttagttaatgattccagaggtgttttgaaagttgaaaacttgacgctg
agggcctctggtgatgtgaaagagcatcggtttcttgatggggtaacgcttgtctctcat
catccaaccctatgtgggaaaagggggataaacattctggacttatttagggatgctgag
ttgcccatacctgaaacaagaatgtttcctgaagaagtgtttttggatctcagtgattat
caatcagaagttgaagacaagtatgcatatgaaatcgtgggtcccgaattttctgatgtg
ccattggttatgagtggaggatgtcttgttgtaggggataaaaaactgtcacacctgttg
actgagctgacaggaaacgtcattttgaaggcattgggtgccctggagacagatggagag
attggaagttttttgatgggattgtggccctacataaaggccacaaaacaaagggtgaaa
atatctcaagaagaatttctttttatatatgagacacatagacgttcacttcttatgtct
tttgaagcatataatgactggttagaatttttagattttagtgtgtgtttcagcaagacc
ttaggtgatctggttgtgtcggacagttctggcaatatgaggttaagaggagttgtttgt
agacctctgcgtcaagtcggcacagtgatggagatagagtag

DBGET integrated database retrieval system