Viruses: 6216305
Help
Entry
6216305 CDS
T40000
Symbol
CVsL_gp2
Name
(RefSeq) Mammarenavirus chapareense; L polymerase
KO
K25303
Mammarenavirus RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.1.-.-]
Virus
3052302
Mammarenavirus chapareense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Arena_RNA_pol
ArenaCapSnatch
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6216305
NCBI-ProteinID:
YP_001816785
RS:
NC_010563
UniProt:
B2C4J3
LinkDB
All DBs
Position
NC_010563:complement(442..7068)
Genome browser
AA seq
2208 aa
AA seq
DB search
MDTFLLELKDLVRKYVPELVELSFQKDALLSQVHPRLVLVEGFKLLSLLVELESCKVNAC
RHNFEQKFVDVILSDHGVICPTLPKVTPDGFNLMGKTLILLETFVRVNPNDFERKWKADM
SKLMSLKDDLARVGITMVPVVDGRGSYNTSYLPEWATERLRWLLIEILKGVKATSEIEIE
DQEYQRLIHSLAKANNQSMGFENLEFLKRRLLSYDQLLDTSLLVGIRNDVRESKIIEELI
KIKLWYKTEIFNKGLGKFKRTNKSNLLSDLLKIGLHQDSDTINCMFCSCKILELCYTLSN
KLSIDHSKEEMKDDEVGGKQPVCISYSSLLSICNKIKGSKIFNTRRNTLLFLDLIMLNFI
VDEMIQDDSVVDSLRGAGFIIGQMVVLVNDRALDILAAMKLIRHKLGNSKDWLSVCGKVL
KRYDEEMWKEVKTYIKEPDFDMLFQLAKSLVSERPIMRYTVHKDNESRCLHQNSLNISDQ
SFKAMLKALSHVSLSLINSMKTSFSSRLLINEKDYSRYYGNVRLKECYVQRFPISSRVTG
YLFYQKTGERSRCYSLYISENGELSELGSFYCDPKRFFLPVFSEDTIVSMCNEMVCWLDF
DEQLVELVKPKLRSLVLLLLCSPSKRNQTFIQGLRYFIMAYANQAHHVDLMSKLEIECKS
SSEIQLQRLAVTLFELVLSTGDDKDFGFARRFKFLLNISYLCHFVTKETPDRLTDQIKCF
EKFLEPKLNFNSVIVNPSLSGILTEAQEEIMTSSVNRFFQKNLTNISDVKEPGVSKELIS
FCVSLFNRGKLRVSGDLKVDPFRPSFTSTALDLSSNKSVVVPKLDELGNALSKYDKQMMI
SSCVTTLTEMFKTKGRYNLDPDSLDFLVLKNLSNLVSVSVSKGQMKEELSLLYDTLSEEQ
LESFEQIKQDVQLTLSRMKESKCNNVGLGNSRKVNKHLSKSELLETLWSPYQVLRAIKNE
VSIHEIKDFDPDIIEHETVKKLCDEVYQSSNKLEFFLEEPLKSVPLEFLLKNLTTIAYEE
TDYLECFKYLLIQGGFDQKLGSYEHKSRSRLGLSSEALRVQEDARVSTRESNAEAIAKKL
DKTFFTSAALRNLCFYSEDSPTEFTSVSTNTGNLKFGLSYKEQVGSNRELYVGDLNTKLM
TRLVEDFSEMITSSMRYSCLNSEKEFERAICDMKMAVNNGDISMSLDHSKWGPHMSPALF
YSFLANLNLTEPKSRAKLNLGPLLDILKWHLHKVVEVPFNVAQAYCVGKIKRSLGLMECQ
TSSVTEQFYHNFLQRENEIPSHIMSVLDMGQGILHNLSDLYALITEQFLNYAIYKLYDVD
VLSYTSSDDQISIMKLPAYEHIDEDSPDWLEIVCFHEYLSSKLNKFVSPKSVVGNFVAEF
KSRFFVMGEETPLLTKFVAAALHNVRCKTPTQLAETVDTICDQCVANGVSVSIVSKISER
VNRLVKYSGFGETPFLSVVKQDVKDWSDGSRGYRLQRNIENSLRDSKILEVMRKGARKVF
LGIKNGRIFEENLIGLIGRGGDEALRGFLLYAEVDKDEIENALRYRWVNTSTFGDLRLVL
RTKIMSSKRVLERESIPSLVKTLQSRMSKNFTKGAKKILAESINKSAFQSSVASGFIGFC
KSMGSKCVRDGSGGFIYLKDIYKKITTCECKHCSVWRGVVYCEKSVEKIFQFTRSIMWDY
FTLVLTNACELGEWVFSSVKLPTKATILDNPNLFWAIKPRTHKHIEDRLGLNHILHSIKK
NYPQLFEEHLAPFMSDLQSNQMINPSKIKFLDICVALDMVNENLGIIGHLLRGRNNTIYI
VKQSECAGAHVRQADYVDQDLGLSPQQICYNFKVQFLLSSMINPLIVSTSTLRSFFWFNE
VLSIEEDDQIELGELTDFTLSIKTYNLERAMTLDDMTMGYVCSTLLDEVVSLESLDSCQD
LAALQFKRQDLSDFFRDLGEDFVKVGLNIQIVHQRRSTKFDISRKVVYTFRILLLINLSE
HLREEVKIPVQSLSLYASGAGNNHLFLDGVSMIPTLPLFNGSKSVNLAKVLIEHELATSN
DFKLLECVIMDFSNFLDELRDKYSYVLVGPEEQENPIVFQNGAFMADNQKLSYMRVEIFG
DTIVKALGALETDREIENLLCNLWPYLKSIKKTIDFNQADFEMIYDLHRTALLKSLCQMD
SWIEFTSFSVAYSKHLQDLVVSDNLGNLRLKGITCRPFRRDQCIQEIE
NT seq
6627 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacacttttttactggaattgaaggatcttgtaagaaagtatgtcccagaattagta
gagctatctttccagaaagacgcacttctttcacaggtgcaccccagactggtccttgtt
gagggcttcaaattgttgtcacttttagttgaactggagtcttgcaaggtcaatgcctgc
agacacaactttgagcaaaagtttgtggatgtcatcctctctgatcatggtgtgatctgt
cccactcttcccaaagtgacgcccgatggtttcaatctcatgggtaagactctcatctta
ttggaaacttttgtaagagtcaacccaaatgactttgaacggaagtggaaagctgatatg
agcaaactcatgtcattaaaagatgaccttgctagagttggcatcaccatggttcctgtt
gttgatggaagaggaagttacaacacaagttatcttccggaatgggctactgagaggttg
agatggctattgattgaaatcttgaaaggggtgaaagcaacttcagaaatagaaattgaa
gatcaggaataccaaaggctgatacacagtttggcaaaagccaataatcaaagtatgggg
tttgaaaacctagagtttctaaagagaaggctgctatcatatgatcaattgctagacaca
tcgttattagtgggtataagaaatgatgtgagagaatcgaaaataattgaggaactgatc
aaaatcaaactctggtataagactgaaatttttaataaaggtttagggaaatttaaaaga
actaataagtctaatttattatctgatcttctgaaaattggtctgcatcaagatagtgat
actataaattgcatgttttgttcatgcaaaattctggagctctgttacacactttccaac
aaactgtcaatagatcattcaaaagaagaaatgaaggatgatgaggttggaggtaagcag
ccagtgtgcatttcctattcttctttattatcaatttgcaataagattaaaggttcaaaa
atcttcaatactaggagaaatacattgctgtttttggacctaatcatgctgaatttcatt
gtggatgaaatgatacaagatgactcagtggtagattctctcaggggtgctggttttata
attggtcaaatggtggtcctggtcaatgatagagctcttgatatccttgcagcaatgaag
ctgataagacataaattagggaatagtaaggactggctgtccgtgtgtgggaaagttttg
aaaaggtatgatgaagaaatgtggaaagaggtcaagacttacattaaagaacctgacttc
gacatgctcttccaattggcaaagagtttagtttctgaaagacccataatgcgttatact
gtccataaggacaacgaaagccgatgtctccatcaaaactcgttgaatatctctgaccaa
agtttcaaagccatgctcaaagctttgtcacatgtttcactctctctgatcaattccatg
aaaacatctttttcctctagacttttaattaatgaaaaggactattctcgctattatgga
aatgtcaggctcaaggaatgttatgttcagaggttccccatctcaagtagagtcacaggc
tacctattttatcaaaagacgggtgagagatcaaggtgttattctctttatatctctgaa
aacggtgaattaagtgagctaggatccttttattgtgatccaaagagattctttttgcct
gttttttctgaagacactatagtgtccatgtgcaatgaaatggtatgctggttggacttt
gatgaacaacttgttgagctggttaagcctaagctgagatccttggtgctgctccttctc
tgctcaccttcaaaaaggaaccaaacatttatccaagggctgagatattttataatggct
tacgctaatcaggctcatcacgttgatcttatgtcaaaattagagattgagtgtaagtcc
agttcagagattcaattgcaaaggttagcagtgacactgtttgaattggtcttatcaaca
ggggatgataaagattttggctttgccagaaggtttaagtttttactgaatattagttat
ctgtgtcattttgtgacaaaggagacaccagatagattaactgatcagatcaagtgtttt
gagaaattccttgagccaaagctgaattttaacagtgtcatagttaatccttctttaagc
gggattttaacagaagcccaagaagagattatgacatctagcgttaacaggtttttccag
aaaaatttgactaacatatcagatgttaaagaaccgggagtctctaaggaattaatcagt
ttctgtgtttccctttttaacaggggaaagttaagggtgtctggtgatctaaaagttgac
ccttttcgcccatcattcactagtactgctttggacttatctagtaataaaagtgttgtt
gtccctaagttagatgagttgggtaatgccttaagcaagtatgacaaacaaatgatgatc
tcatcttgtgtaacaactcttactgaaatgttcaaaacgaagggaaggtacaacttggac
ccagattccttagatttcttggtcctcaagaacctttccaatttagttagtgtgagtgtt
tcaaaaggtcaaatgaaagaagagctatccttgttgtatgacacattatcagaagaacaa
ttggaatcatttgagcagatcaagcaagatgttcagcttactttaagtagaatgaaagaa
tcaaagtgtaataatgtaggtttaggaaattctaggaaagtcaataagcaccttagcaaa
agtgagctgctggaaacactctggtcaccttaccaggttcttagggctattaaaaatgag
gtttcaattcatgagattaaagactttgatcctgatattattgaacacgaaactgtaaaa
aagttgtgtgacgaggtgtatcagtccagtaacaagttagaattcttcttagaggaacct
ttgaaatctgtcccacttgaatttttgttaaaaaatctaacaactattgcttatgaggaa
actgactacttagagtgtttcaagtatttgctgatacaagggggttttgatcaaaaatta
ggtagctatgagcacaaaagtaggtctagattaggtttgagttcagaagcacttagagtg
caggaagatgcccgagtgagcacaagagaaagcaatgcagaggccatagccaaaaagctt
gacaaaacgttttttacaagtgcagctctaagaaacctctgtttttactcagaagattca
ccgacagagttcacaagcgtaagcacaaatacaggaaatctaaaatttggattaagttat
aaggagcaagttggatctaacagggagctttatgttggtgacttgaatacaaaattaatg
actagattagtagaggatttttctgaaatgatcacatcatctatgagatattcgtgttta
aattcagagaaagagtttgagagggccatctgtgacatgaagatggctgtgaacaatggt
gatattagtatgtcattggatcattcaaaatggggcccccacatgagccctgcattattt
tattcctttttagccaatctcaatttgacagaacccaaaagtagagctaagttgaatctt
ggaccactattggacatccttaaatggcatcttcataaagttgtcgaggtaccatttaat
gttgctcaggcatattgtgtggggaaaatcaaaagaagtcttgggctcatggaatgtcaa
acatcaagtgtaacagaacagttctaccacaacttcttacaaagggaaaatgaaattcca
agtcacattatgtctgtattagatatgggacaaggaattttacacaacttatctgactta
tatgctttaataacggaacagtttctcaactatgcaatttacaaactgtatgatgtggat
gtgttatcttacacttccagtgatgatcagatatctataatgaaattgcctgcatatgag
cacatagacgaggatagccctgactggttggaaattgtatgttttcatgaatatctatca
tcaaagttgaacaaatttgtcagtcccaaaagtgttgttgggaactttgtggcggagttc
aagtcgaggttctttgttatgggggaagaaactccattgttaactaagtttgttgcagct
gctcttcacaatgtcaggtgcaaaacacccacacagctggcagaaactgtagataccatt
tgtgaccaatgtgtcgcaaatggtgttagtgtttccatcgtttctaaaatttcagagaga
gtcaatcggttagttaagtattcaggctttggagaaacaccattcctttcggtggtgaaa
caagatgtaaaagattggtctgatggttctagaggctatcgtttgcagaggaatatagag
aactccctcagagattctaaaattttagaagtgatgagaaaaggtgctaggaaagtgttt
ctaggaataaaaaatggacgtatctttgaagagaacttaattggcttgataggtagggga
ggtgatgaggccttgcgaggttttcttttatatgctgaagtggataaggatgagattgag
aacgcattgagatacagatgggtgaacacatcaacatttggtgatctgaggttagtctta
aggaccaagataatgtcaagtaaaagagttttagagagggaaagcatcccgagtctagtg
aagactttacaatcaagaatgtcaaaaaactttacgaaaggggcaaagaagatattagcg
gagtctataaataaatctgcttttcaatcatcagtggcctcagggtttataggattctgc
aagagtatgggaagcaagtgtgtaagggatggaagtggtggtttcatctacttgaaagac
atttacaagaagatcactacgtgcgaatgtaaacattgttcagtgtggaggggtgttgtg
tactgtgagaaatcagtggaaaagatcttccagtttacaaggtcaattatgtgggattat
ttcacacttgttttaaccaatgcctgtgagttgggtgaatgggttttctcaagcgtaaaa
cttccaactaaggctaccattttggataaccccaatcttttctgggcaataaaacccaga
acacacaaacacatagaggataggcttggtttgaatcatatactacattcgataaagaag
aattatcctcaattgtttgaggaacatctggctccatttatgagtgatcttcaatcaaat
cagatgataaatccatcgaagataaagtttcttgacatttgtgtggcattggatatggta
aatgagaacttggggataattggtcacctcctgagagggagaaataacaccatatacatt
gttaaacaaagtgagtgtgctggtgctcatgtacgacaagctgattatgttgaccaagat
ctgggtttaagcccacagcaaatttgttacaattttaaggtccaatttttgctttcctca
atgattaaccctctcattgtgtccacttcaactttgaggtctttcttttggtttaatgag
gttttaagcattgaggaagatgatcaaatagaattgggggaactcacagacttcacactc
tctattaagacatacaatcttgagagggccatgactttggatgacatgacaatgggctat
gtttgttcaactttattagacgaagtagtcagcttagaatcccttgattcttgtcaagat
ttggcagcactacagtttaagaggcaggatttgtctgattttttcagggatcttggagaa
gactttgttaaagtggggttaaacattcagatcgttcatcagaggagatcaacaaagttt
gacatttcaagaaaagttgtgtacacttttaggattctgcttttaataaatctgagtgaa
catttaagagaagaggtaaaaattccagtacaatctttgagtttgtatgcctctggtgcc
ggaaacaaccacctttttctagatggtgtctcaatgatacctacactgcctctctttaat
ggatcaaagagtgtgaatttagcaaaagttttaatagaacatgagttggcaacatccaat
gattttaaattgttagaatgcgtgatcatggacttctcaaactttttggatgaactgagg
gacaaatactcttacgttctagttgggccggaagaacaggaaaaccccattgtgttccaa
aatggtgccttcatggctgataatcagaagctatcatacatgagggtggagatttttggt
gataccattgtgaaagctcttggagcactggagacagacagagaaattgaaaacttgcta
tgcaatctctggccatatttgaaatccataaagaaaacaattgattttaatcaagcagac
tttgagatgatttatgatttgcatagaactgctttgttaaagtctctatgccaaatggat
agttggatagagtttactagtttcagtgtagcttatagtaagcacctacaggatttggtt
gtcagtgacaacctaggtaacctaaggttgaaaggcatcacctgtcggcccttcagaaga
gaccaatgtattcaggagatcgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
