Viruses: 6334524
Help
Entry
6334524 CDS
T40000
Symbol
LATV_sLgp2
Name
(RefSeq) Mammarenavirus latinum; L protein
KO
K25303
Mammarenavirus RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.1.-.-]
Virus
3052311
Mammarenavirus latinum
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Arena_RNA_pol
ArenaCapSnatch
RRM_Rrp7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6334524
NCBI-ProteinID:
YP_001936026
RS:
NC_010760
UniProt:
B2MW49
LinkDB
All DBs
Position
NC_010760:complement(428..7144)
Genome browser
AA seq
2238 aa
AA seq
DB search
MDDIVNQLFDLLRKHFPARPKVTEQITLVTCQNDAKMILTEGFKLLSLLVELDSAEANNC
THNSDSLTIEGILRKEGIMSIALPRIVPDGFSLYGNVLILLETFVRVNPVSFEQKYNQDM
SKLLSLKDDLSLCGITLVPLVDGRTNYYNRFVDDWVIERFRWLLLQLIKFVRESGEEIEE
LEYQRLITSLSKLENQSLGFENIEKLPQTGLKYRDELKKHMFGNLSSKMKESEIQENLIN
VLKEFFIKEYKNNKSLHKFVFTNRDGLLAKLDQITHHSEHPVDCMSCSSKLYSIIDKLGT
LKRQPLHSDYHPIYAKMWHSDSLSQAEQIYLKLLSQCNKIKSAKLLNTRRNTLLFLDLIM
VNFIVHSWKQNPEVLTEYRRCGLMAGQLALFSNDRYFDLNELRNKLINKLKNCENWIAKC
VHQLKKQEFVALDDVLVWATVPDFESLELITTSLELKRFKLQYGKDKVDHNEHPIGPLSE
ETFFRNLNVLSSVCLALVNSMKTSFTSKTVINERRASNHFGEVDLIECYCQRFFLSKDLV
GILSYQKTGEKSRCYSISLISNGELEYIGSFYCDPKRFFLPIFSQIVLLNMSREMMLWLA
DLNLNDSLVGDKLRKLILLIVTNPSKRNQTFLQGLRYFIMAYVNQFHHVELMDRLIVPVK
SYCESCLQRISFDIFRLILEGDYDNEHMTRKFKFLLNVSYLCHLITKETPDRLTDQIKCF
EKFMEPKLKFESVIVNPSLTENMTEDEEAQVLKGVDKLLGKSLSCSTDLTSPGVSKTLLS
MCVSSFNRGLLNVNGHLRQDPYRPNFTSTALDLSSNKSVVVPKLDELGNPISRYDYELLV
SSCVTNLAEGFKTKGKFKLDINCQEYTIMRNLTNLVLKNEDKSDAKIKGEKPCSFELSQW
METLSEEQLEVLEKLKGDVNIALGKLKEKGRSKSNSTLKEGVKRLDSGNTLAGCADPQQV
LVNLWSEFGVMKQILVEVSLHEIKDFDPDIIPPQMIQKLVFKVNNSNYKSLFFLDSVINP
CPLELLIKNMTTATFDDGELFECFKYLLITAGFDQKLGTYEHKNRSRFGFKFEALKVREE
GRMSSRESNSEAIARRLDKSVFTNSALRNLCFYSDESPISYSHVSPDVGKLKFGLSYKEQ
VGSNRELYVGDLNTKLMTRLIEDFSESVVSNMSYSCLNNEAEFEKAITDMKMCVNLGDMS
LSLDHSKWGPHMSPVIFAAFLQGLDLKYGPSLCKLNTDPIITLLSWHIHKVVEVPYNVIH
AYVTGMIKRQLGLMNMSGSTITESFVHRLLKEKREPLSHVMSVIDMGQGILHNMSDLYGL
VTEQFINYAIHFLFDMNTTSYTSSDDQISMIKIGSGMCNFESLKVIEEWETILNFHAFIS
TKFNKFVSPKTVAGTFAAEFKSRFFVWGEEVPLLTKFVSAALHNVKCKTPVQLSETVDTI
CDQCVANGVSVEIVSYICNRTNRLIRYSGFGEHPFLNVENLDVKDWVDGSRGYRLQRNIE
LHLESDGCTSFIRQAARKVFSNIKSGKIVEQALVDLVQEDGDKAITGFLRSVGVSEEDIA
LLCRIRWINLCAHGDLRLVLRTKLMSSRRIIETEEIPSLIKSIQSKLSKNFVKGAKKILA
ESINKSAFQSSIASGFIGFCQSVGSKCVRTGEGGFYYIKELKSKVDLYCPCEVCARWKGV
TYCSSSCLKIESFTRPLMWDYFSLVLSNACELGEWVFEDVEYPKDINFLRNPNLFWLVKP
RVSCQIEEKLGLTHILQSIRRNYPQLFETHLSPFMSDFQAGRTLGTMTVKFLDVCVALDL
ANENLGIVKHFLKNRRHDIYIVKQDESSQSHIRCQKSICVDVELTSTQVCQNFMTQLIMS
SLVQPLVLTSSELKKFNWFQQVLTLETDEDVDLGLLTDFALQVKKFNVDRAMHSEDLSAG
YISSTVSVTTFSLSKPIFLQQIDSDFIGGTEDRKDFIQMIKSEFTKNSIDLQFVIQISHV
KRALRFNLKRTTVYTLIVRTSILKEVILNSLGQEDQSVELVVDDLELFCSGHDGNHFTLD
AAPLIVQEPLINGNLKFDLVSRLEEEDLTFSYSESLPSFHFNFEKYKHELCNKFSYHLSG
PVIVDEPLVLDRGVILHGGRKLTTLQFDFSADRIMQALSELESLSSRDLFLFNLWVYSDQ
TKSKLYIHQDKLLLLVESYLSELNSSLARYDSWLNLGNYMICYSKSFKCLMISDTNGRNR
LKGILCRRLIEEEVQDIE
NT seq
6717 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgatattgttaatcagttatttgatctacttaggaagcatttcccagctaggcca
aaagtaacagaacagataaccttagttacctgccagaatgatgctaaaatgatccttaca
gaaggattcaaattgttgtcattactagtggaactagactctgcggaagctaacaactgc
actcacaactcagactcgctaacaattgaggggattctgaggaaagagggcataatgtcc
attgcattaccgagaatcgtaccagatggtttttcactatatggtaatgttttgattctt
ttggaaaccttcgtgagggtgaatccagtgtcttttgaacagaaatacaatcaggacatg
agcaagttgttgtcattaaaagatgaccttagtttatgtgggatcaccttagttcccctt
gttgatgggagaaccaactattacaatagatttgtagacgattgggtgatagaaagattc
aggtggctgttattgcagttaataaaatttgtgagggaatctggtgaagagattgaggag
cttgagtatcagagattaattactagtctgtccaagctagaaaatcagagtctgggtttt
gagaatatagaaaagcttcctcaaactgggcttaaatatcgcgatgagttaaagaaacat
atgtttgggaacctttccagtaaaatgaaggaaagtgaaatccaagagaatctaataaac
gtcttgaaggaattcttcattaaagagtataaaaacaacaaaagtcttcataagtttgtc
tttacaaatcgtgatggccttctagccaagttggatcaaataacacatcatagtgaacat
ccagttgattgcatgtcatgttcatcaaaattgtattcaataatagacaagttaggtaca
ttaaagcggcagccacttcatagcgattatcatcccatctatgcgaaaatgtggcatagt
gattcactttctcaagctgaacaaatctatttaaaactattgagtcagtgcaataaaata
aagtcagctaaactgctgaacacaagaagaaacactttgttgttccttgacttaattatg
gtgaacttcattgttcactcatggaaacagaaccctgaagtgttgacagaatacaggagg
tgtggacttatggcaggtcagttggcattgttttccaatgacagatattttgacctcaat
gaattgaggaataaacttatcaacaaactaaagaactgtgagaattggattgcaaagtgt
gttcatcagttgaaaaaacaggaatttgttgccttagatgatgttttagtctgggcaaca
gttccagatttcgagagcttagaattaatcacaacctcactagagttgaaaagattcaaa
ttacaatatggaaaggacaaggtggatcataatgagcatcccattggtcctctttctgaa
gagacattttttaggaatcttaatgtcttatcttctgtgtgcttagccttggtgaattca
atgaaaacctcatttacctcaaagactgtgataaatgaaaggagagcttctaatcacttt
ggagaagttgatctcatagaatgttattgccaaagattttttctatctaaagacttagtt
gggattctttcttaccaaaaaactggggagaagtcaagatgttatagcattagtttaatt
tccaatggagaattagagtatatagggtccttttattgtgatcctaaaaggtttttcttg
cctattttttctcagattgttttgttaaacatgtcaagagagatgatgctctggttagct
gacctgaacctcaatgacagtttggtaggggataaactaagaaagttgatattgctcatc
gtaacaaatcccagtaagagaaatcagaccttcctgcaaggtcttaggtatttcataatg
gcttatgtgaatcagtttcaccatgtagaattgatggatagattaatagtaccagtgaaa
agctattgtgaaagttgtctgcaacgtatttcttttgacatctttaggttgattttagaa
ggggattatgataacgagcacatgactagaaaatttaagtttttactcaatgttagttat
ctatgtcatctaataacaaaagaaacaccagacagacttacagatcagattaaatgtttt
gagaaattcatggaacctaagttaaaatttgaatcagtcattgtcaatccaagtttgact
gagaacatgacggaggatgaggaggcccaagtgctaaaaggagtagacaaacttttgggt
aagagtttgagttgttccacagatttaacaagtcctggtgtgtcgaagactctgttaagc
atgtgtgtgtccagctttaatagagggctgttaaatgtgaatggtcacctgagacaagac
ccttatagacccaacttcaccagtactgctctagacttgtcaagcaataaaagtgttgtt
gtgccgaagcttgatgaacttgggaatcctatttccagatacgactatgagttacttgtt
tcctcttgtgttacaaaccttgctgaaggattcaaaacaaaaggcaagttcaagctggac
atcaattgccaagaatacaccataatgagaaatttgaccaatctggtcttgaaaaatgaa
gataaaagtgatgcaaaaatcaagggagaaaagccttgcagttttgaactatcacagtgg
atggagaccttgtcagaagagcaacttgaggttttggagaaacttaaaggagatgttaac
atagcattaggaaagctgaaggaaaaggggagatctaaatcaaatagtactttaaaagag
ggagtgaagaggttagatagtggaaatactctagcaggatgtgcagatccacaacaggtt
ttagtgaacttatggagtgaatttggtgttatgaagcagattttggtagaagtctctttg
catgaaataaaggattttgatccagacataataccaccccagatgattcagaaattggtt
ttcaaagtgaataattctaattacaaatctttgttctttttggatagtgttataaaccca
tgtcctctagagctactaatcaaaaacatgacaacagccacttttgatgatggtgagttg
tttgaatgtttcaaatatttactcataacagctggatttgaccaaaaattgggtacgtat
gaacataaaaatagatcaagatttggcttcaagtttgaggcacttaaagttcgggaggaa
ggtaggatgagttctagagaaagtaactcagaagctattgcaagaaggttggacaagtca
gtgtttacaaactcagccttaagaaatctttgtttttattctgatgaatcaccgatttct
tatagtcatgtttcacctgatgtggggaaacttaaatttggtttgagctacaaagagcag
gttggatcaaatagagaactttatgtgggtgatttgaatacaaaactgatgactcggtta
attgaggatttttcagaatccgtggtttccaacatgagttattcttgcttaaataatgaa
gctgaatttgaaaaggctataactgacatgaagatgtgtgtgaatttaggggatatgagt
ttgtcactggatcactcaaagtggggacctcatatgtctcctgttatatttgcagcattt
ctgcagggattggatcttaagtatggtccatccttatgtaaattgaacaccgatccaatt
ataacactactctcttggcacatccacaaagttgtggaggtgccatataatgtgattcat
gcatatgttacgggaatgatcaagagacaactggggctgatgaacatgagtggatcaact
attactgaatcatttgtacatagacttcttaaggagaagagagaacctctgagtcacgtg
atgtcagtgattgacatgggccaggggattcttcataatatgtctgacttgtatgggttg
gttactgaacagtttattaattatgcaattcatttcctctttgacatgaacacaacatca
tatacctctagtgatgatcaaatctccatgataaaaataggtagcggaatgtgcaacttt
gaatcattgaaagtaattgaagaatgggaaactattttaaattttcatgcattcatctct
actaaatttaacaaatttgtcagtccaaaaacagttgctgggacatttgcagcagaattc
aaatcaagattttttgtttggggtgaagaagttcccttacttacaaagtttgtttctgct
gcgttgcacaatgtcaagtgcaaaactcccgttcagttatctgaaacagtggatacgatt
tgtgatcaatgtgtagcgaatggtgtctctgttgagattgtgtcatacatatgtaacagg
actaacagactgattaggtatagtgggtttggagaacacccattcctcaatgtagaaaac
cttgatgttaaagattgggtggatggtagcagaggttatagacttcaaaggaatattgaa
ttacatcttgagagtgatggatgcactagctttattagacaagcagctaggaaagtcttc
tccaacataaaatcaggaaaaatagttgagcaagctctggttgatcttgtgcaagaggat
ggtgataaggcaattactggatttttaagaagtgttggtgtttcagaagaggatattgcc
ctactctgtagaataagatggatcaacctgtgtgctcatggtgatttgaggttagtcctt
agaacaaagttaatgagttcaaggaggataattgaaacagaagaaattcctagtttgatc
aagtctatacaatctaaattatctaagaactttgtaaaaggtgcaaaaaagattctcgca
gagtcaataaacaagtcagcctttcagtcttccatagcctcaggcttcataggcttctgc
caaagtgttgggagtaagtgtgtgagaacaggagaagggggattttattatataaaagaa
ctgaagtcaaaagttgacttgtactgtccctgtgaagtgtgcgcaaggtggaaaggggtc
acatactgctccagttcgtgccttaagatagagagtttcacaaggccattaatgtgggac
tacttctctttggtattgtccaatgcttgtgaacttggtgaatgggtttttgaagatgtt
gagtacccaaaagatattaatttcctaagaaatcctaatcttttttggcttgttaaacca
agggtctcatgtcagattgaggaaaagcttggtctaactcatattcttcaatcaatcaga
agaaattacccacaactctttgagactcacctatcaccctttatgagtgattttcaagct
ggtagaacccttggcaccatgacagtcaaattccttgatgtttgtgtagctttggacttg
gccaatgagaacttaggtattgtgaaacacttcttaaagaataggaggcatgatatctac
attgtaaagcaggatgagagctcacaatcacacataaggtgtcagaagagcatttgtgtg
gatgttgaattgacatccacccaagtttgtcaaaactttatgacacaattaataatgagt
tctttggtccaacctctagtcttgaccagttcagagttgaagaaattcaattggtttcaa
caagtcttaaccttagagactgatgaggatgttgacttagggttgctcactgactttgcc
ctacaggtaaaaaagtttaatgttgatagagcaatgcattctgaggaccttagtgcaggt
tatattagttccacagttagtgtgacaacattttcattatcaaaacccatatttttgcaa
cagattgattcagatttcattggtgggactgaggaccgtaaagatttcatacagatgatt
aaatcggaatttacaaaaaatagtattgacttacagtttgtaatacaaatctcacatgtc
aagagagcattgagattcaacctcaagagaacaactgtatacactctgatagtgagaaca
tccattttgaaagaggttatcctcaattccctggggcaagaagatcaaagtgttgaattg
gttgttgatgatttagaacttttttgtagtgggcatgatggaaaccactttacccttgat
gctgcacctttaattgtccaagagcccttgataaatggaaacctaaaatttgacttagtg
tcaagacttgaggaagaagatttgactttttcttactcagagtccttgccatcctttcat
ttcaattttgaaaaatataaacatgaactttgtaataagttttcttatcacttgagtgga
ccagtaattgttgatgagcctttggttcttgatagaggagtgattctacatggcggtagg
aagttaacaacccttcaattcgatttttcggcagatagaataatgcaagcattatctgaa
ttagaatctctttcatccagagatttgtttctttttaatttgtgggtttattcagatcaa
accaagagcaagttatacatacatcaagacaagcttttgctactagtggaaagctatttg
tctgaactcaattcatcattagcaagatatgatagctggcttaatctaggaaattatatg
atatgctatagtaaatctttcaagtgtttaatgatctctgacaccaatggtaggaatagg
ctcaaaggtattctgtgtaggaggttgattgaagaggaggtgcaggacattgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
