Viruses: 65053890
Help
Entry
65053890 CDS
T40000
Symbol
KMB92_gp057
Name
(RefSeq) Citrobacter phage PhiZZ6; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
2716728
Citrobacter phage PhiZZ6
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
AAA_27
AAA_21
Rad50_zn_hook
FtsK_SpoIIIE
SbcC_Walker_B
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65053890
NCBI-ProteinID:
YP_010065427
RS:
NC_054900
LinkDB
All DBs
Position
NC_054900:complement(31797..33437)
Genome browser
AA seq
546 aa
AA seq
DB search
MSVGGNPIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRDVKKGQLINSTNKKE
LLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAEFEQLIGMSYASFKQ
IVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRELNSQNQVLDVKKDS
IIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEEANERLVNIVLDEDP
TDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDKVVSKIKDKVSECTH
SFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLITTVDKAKKVKAAIEKASSE
FIDHADEIALLQEELDTIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKGAIIKKYIPLFNKQI
NHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSQGEKARIDIALLFTWRDIAEKVS
GVKINTLILDEVFDSATDVEGVKAISTILDSLKNTNVFVISHRDHDPQAYGQHLQMKKVG
RFTVMV
NT seq
1641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaggtggaaatcctattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttatt
actggacgaaatggcggtggtaagtctactatgctagaagccatcacatttgggcttttt
ggcaaaccatttcgtgatgtaaagaaaggtcaattaataaacagcacaaataagaaagaa
cttttagttgaactgtggatggaatatgatgagaaaaagtactatatcaaaagaggacaa
aaaccaaacgttttcgaaatcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagt
aaagatttccaagcagaatttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcag
attgttgtccttggtacagcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcacga
agaaagcttgtggaagacctgcttgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaat
aaagcactaatacgtgaattaaactcacaaaaccaagtgcttgatgttaaaaaagatagt
attatccaacaaattaaaatatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaacgggt
gacaaccttacacgtctacaaaatatgtatgatgatttggcaaaagaagctagaacgcta
aaatcggaaatagaagaagctaacgaaagattagttaatattgttttagatgaagacccg
actgatgcatttaataaaatcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactcg
tataataaagtcattaatatgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgtttgtcacaa
ttgagttccggtgataaagttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgcacgcat
tcgtttgaacagctttcaacacatcgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccga
gataatattaaaacccaacagtcgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctcta
atcacgacggtagataaagctaaaaaagttaaagcggctatagaaaaagcatcttctgag
tttattgaccatgctgatgaaatagcactgcttcaagaagaacttgatacaattgttaag
acaaaaactaatttagtaatggaaaaataccaccgaggaattttgactgatatgctcaaa
gattctggtattaaaggtgctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagatt
aaccattatcttaaaataatggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaat
gagacaattaaatcccgtggtcgtgaagattttagttatgcttcattcagtcaaggtgaa
aaagcacgaattgatattgctcttttatttacttggcgtgatattgctgaaaaagtttca
ggtgttaaaataaacacactaattcttgatgaagtttttgattcagcgaccgacgttgaa
ggtgtaaaagctatttcaactattttagatagtttaaaaaatactaacgtttttgttatt
tcacatagagaccatgacccgcaagcatacggtcagcatcttcaaatgaagaaagttggt
cgatttactgtaatggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
