Viruses: 65055299
Help
Entry
65055299 CDS
T40000
Symbol
KMB97_gp087
Name
(RefSeq) Enterobacteria phage Kha5h; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
1651198
Enterobacteria phage Kha5h
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
AAA_27
AAA_21
DUF1441
Rad50_zn_hook
FtsK_SpoIIIE
SPC25_N
SbcC_Walker_B
T4SS_LegC2C7
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65055299
NCBI-ProteinID:
YP_010066730
RS:
NC_054905
UniProt:
A0A384SZR6
LinkDB
All DBs
Position
NC_054905:complement(57248..58888)
Genome browser
AA seq
546 aa
AA seq
DB search
MSVGGNPIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRDVKKGQLINSTNKKE
LLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAEFEQLIGMSYASFKQ
IVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRELNSQNQVLDVKKDS
IIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEEANERLVNIVLDEDP
TDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDKVVSKIKDKVSECTH
SFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLITTVDKAKKVKAAIEKASSE
FIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKGAIIKKYIPLFNKQI
NHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSQGEKARIDIALLFTWRDIAEKVS
GVKINTLILDEVFDSATDVEGVKAISTILDSLKNTNVFVISHRDHDPQAYGQHLQMKKVG
RFTVMV
NT seq
1641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaggtggaaatcctattgacattcaactagataaggttcaaaaaactcttatt
actggacgaaatggcggtggtaagtctactatgttagaagccatcacatttgggcttttt
ggcaagccatttcgtgatgtaaagaaaggtcaattaataaacagcacaaataagaaagaa
cttttagttgaactgtggatggaatatgatgagaaaaagtattatatcaaaagaggacaa
aaaccaaacgttttcgaaatcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagt
aaagatttccaagcagaatttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcag
attgttgtccttggtacagcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcacga
agaaagcttgtggaagacctgcttgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaat
aaagcactaatacgtgaattaaattcgcagaaccaagtgcttgatgttaaaaaagatagt
attatccaacaaattaaaatatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaactggt
gacaaccttactcgtctacaaaatatgtatgatgatttggcaaaagaagctagaacgcta
aaatcggaaatagaagaagctaatgaaagattagttaatattgttttggatgaagaccca
actgatgcatttaataaaatcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactcg
tataataaagtcattaatatgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgcttgtcacaa
ttaagttcaggtgataaagttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgtacgcat
tcgtttgaacagctttcaacacatcgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccga
gataatattaaaacccaacagtcgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctcta
atcacgacagtagataaagctaaaaaggttaaagcggctatagaaaaagcatcttctgag
tttattgaccatgctgatgaaatagcactgcttcaagaagaacttgataaaattgttaag
acaaaaactaatttagtaatggaaaaataccacagaggaattttgactgatatgctcaaa
gattctggtattaaaggtgctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagatt
aaccattatcttaaaataatggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaat
gagacaattaaatcccgtggtcgtgaagattttagttatgcttcattcagtcaaggtgaa
aaagcgcgaattgatattgctcttttatttacttggcgtgatattgctgaaaaagtttca
ggtgttaaaataaacacactaattcttgatgaagtttttgattcagcgaccgacgttgaa
ggtgtaaaagctatttcaactattttagatagtttaaaaaatactaatgtttttgttatt
tcacatagagaccatgacccgcaagcatacggtcagcatcttcaaatgaagaaagttggt
cgatttactgtaatggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system