Viruses: 65059080
Help
Entry
65059080 CDS
T40000
Symbol
KMC11_gp056
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_EcoM_G4507; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
2502306
Escherichia phage vB_EcoM_G4507
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
AAA_23
SMC_N
AAA_29
ABC_tran
AAA_21
AAA_27
Rad50_zn_hook
FtsK_SpoIIIE
ABC_ATPase
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65059080
NCBI-ProteinID:
YP_010070434
RS:
NC_054919
LinkDB
All DBs
Position
NC_054919:complement(31653..33293)
Genome browser
AA seq
546 aa
AA seq
DB search
MSVGGNPIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRDVKKGQLINSTNKKE
LLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAEFEQLIGMSYASFKQ
IVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRELNSQNQVLDVKKDS
IIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEEANERLVNIVLDEDP
TDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDKVVSKIKDKVSECTH
SFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLITTVDKAKKVKAAIEKASSE
FIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKGAIIKKYIPLFNKQI
NHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSEGEKARIDIALLFTWRDIASIVS
GVSISTLILDEVFDGSFDAEGIKGVANIINSMKNTNVFIISHKDHDPQEYGQHLQMKKVG
RFTVMV
NT seq
1641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaggtggaaatcctattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttatt
actggacgaaatggcggtggtaagtctactatgctagaagccatcacatttgggcttttt
ggcaagccatttcgtgatgtaaagaaaggtcaattaataaacagcacaaataagaaagaa
cttttagttgaactgtggatggaatatgatgagaaaaagtactatatcaaaagaggacaa
aaaccgaacgtttttgaaatcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagt
aaagatttccaagcagaatttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcag
attgttgtccttggtacagcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcgcga
agaaagcttgtggaagacctgcttgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaat
aaagcactaatacgtgaattaaactcacagaaccaagtgcttgatgttaaaaaagatagt
attatccaacaaattaaaatatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaacgggt
gacaaccttactcgtcttcaaaatatgtatgatgatttggcaaaagaagctagaacgcta
aaatcggaaatagaagaagctaatgaaagattagttaatattgttttagatgaagacccg
actgatgcatttaataaaatcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactcg
tataataaagtcattaatatgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgtttgtcacaa
ttaagttccggtgataaagttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgtacgcat
tcgtttgaacagctttcaacacaccgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccga
gataatattaaaacccagcagtcgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctcta
atcacgacagtagataaagctaaaaaagttaaagcagctatagaaaaagcatcatccgag
tttattgaccatgctgatgaaatagcattgcttcaagaagaacttgataaaattgttaag
acaaaaactaatttagtaatggaaaaataccaccgaggaattttgactgatatgctcaaa
gattctggtattaaaggtgctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagatt
aaccattatcttaaaataatggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaat
gagacaattaaatcccgtggtcgtgaagattttagttatgcttcatttagtgaaggtgaa
aaggcacgaattgatattgctcttttatttacttggcgtgatattgcttctatcgtatct
ggtgttagtattagtacattaattcttgatgaagtgtttgatgggtcatttgatgccgaa
ggtattaaaggtgtagctaatattataaattcaatgaaaaacactaatgtttttataatt
tcgcataaagaccatgacccgcaagaatatggtcagcatcttcaaatgaagaaagttggt
cgatttactgtaatggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
