Viruses: 65059369
Help
Entry
65059369 CDS
T40000
Symbol
KMC12_gp058
Name
(RefSeq) Escherichia phage vB_EcoM_G9062; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
2508181
Escherichia phage vB_EcoM_G9062
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
AAA_27
AAA_21
Rad50_zn_hook
FtsK_SpoIIIE
SbcC_Walker_B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65059369
NCBI-ProteinID:
YP_010070710
RS:
NC_054920
LinkDB
All DBs
Position
NC_054920:complement(32694..34334)
Genome browser
AA seq
546 aa
AA seq
DB search
MSVGGNPIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRDVKKGQLINSTNKKE
LLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAEFEQLIGMSYASFKQ
IVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRELNSQNQVLDVKKDS
IIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEEANERLVNIVLDEDP
TDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDKVVSKIKDKVSECTH
SFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLIAAVDKAKKVKAAIEKASSE
FIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKGAIIKKYIPLFNKQI
NHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSQGEKARIDIALLFTWRDIAEKVS
GVKINTLILDEVFDSATDVEGVKAISTILDSLKNTNVFVISHRDHDPQAYGQHLQMKKVG
RFTVMV
NT seq
1641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaggtggaaatcctattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttatt
actggacgaaatggcggtggtaagtctactatgttagaagccatcacatttgggcttttt
ggcaagccatttcgtgatgtaaagaaaggtcaattaataaacagcacaaataagaaagaa
cttttagttgaactgtggatggaatatgatgagaaaaagtactatatcaaaagaggacaa
aaaccgaacgtttttgaaatcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagt
aaagatttccaagcagaatttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcag
attgttgtccttggtacagcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcgcga
agaaagcttgtggaagacctgcttgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaat
aaagcactaatacgtgaattaaattcacaaaaccaagtgcttgacgttaaaaaagatagt
attatccaacaaattaaaatatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaacgggt
gacaatcttactcgtctgcaaaatatgtatgatgatttggcaaaagaagctagaacgcta
aaatcggaaatagaagaagctaatgaaagattagttaatattgttttagatgaagacccg
actgatgcatttaataaaatcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactcg
tataataaagtcattaatatgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgtttgtcacaa
ttgagttccggtgataaagttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgtacgcat
tcgtttgaacagctttcaacacatcgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccga
gataatattaaaacccaacagtcgttagcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctctg
atcgcagcagtagataaagctaaaaaggttaaagcggctatagaaaaagcatcttctgag
tttattgaccatgctgatgaaatagcactgcttcaagaagaacttgataaaattgttaag
acaaaaactaatttagtaatggaaaaataccaccgaggaattttgactgatatgctcaaa
gattctggtattaaaggtgctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagatt
aaccattatcttaaaataatggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaat
gagacaattaaatcccgtggtcgcgaagattttagttatgcttcattcagtcaaggtgaa
aaagcacgaattgatattgctcttttatttacttggcgtgatattgctgaaaaagtttca
ggtgttaaaataaacacgttaattcttgacgaagtttttgattcagcgaccgacgttgaa
ggtgtaaaagctatttcaactattttagatagtttaaaaaatactaacgtttttgttatt
tcacatagagaccatgacccgcaagcatacggtcagcatcttcaaatgaagaaagttggt
cgatttactgtaatggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system