Viruses: 65064419
Help
Entry
65064419 CDS
T40000
Symbol
KMC30_gp057
Name
(RefSeq) Serratia phage PhiZZ30; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
2716729
Serratia phage PhiZZ30
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
AAA_23
SMC_N
AAA_29
ABC_tran
AAA_27
AAA_21
Rad50_zn_hook
ABC_ATPase
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65064419
NCBI-ProteinID:
YP_010075599
RS:
NC_054938
LinkDB
All DBs
Position
NC_054938:complement(32968..34656)
Genome browser
AA seq
562 aa
AA seq
DB search
MKNFKLNRVKYKNIMSVGQNGIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRD
VKKGQLINSTNKKELLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAE
FEQLIGMSYASFKQIVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRE
LNSQNQVLDVKKDSIIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEE
ANERLVNIVLDEDPTDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDK
VVSKIKDKVSECTHSFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLITTVDK
AKKVKAAIEKASSEFIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKG
AIIKKYIPLFNKQINHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSQGEKARIDI
ALLFTWRDIAEKVSGVKISCLFLDEVYDGAFDAEGIKNVAKILDGLKDTNFFIISHKDHD
PQEYGQHIQMEKVGRFSLAKIS
NT seq
1689 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaagaattttaaacttaatagagtaaaatataaaaatataatgtcagttggtcaaaat
gggattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttattactggacgaaatggcggt
ggtaagtctactatgttagaagccatcacatttgggctttttggcaaaccatttcgtgat
gtaaagaaaggtcaattaataaacagcacaaataagaaagaacttttagttgaactgtgg
atggaatatgatgagaaaaagtactatatcaaaagaggacaaaaaccaaacgttttcgaa
atcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagtaaagatttccaagcagaa
tttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcagattgttgtccttggtaca
gcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcacgaagaaagcttgtggaagac
ctgcttgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaataaagcactaatacgtgaa
ttaaattcgcagaaccaagtgcttgatgtcaaaaaagatagtattatccaacaaattaaa
atatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaacgggtgacaaccttactcgtctt
caaaatatgtatgatgatttggcaaaagaagctagaacgctaaaatcggaaatagaagaa
gctaatgaaagattagttaatattgttttagatgaagacccgactgatgcatttaataaa
atcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactcgtataataaagtcattaat
atgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgtttgtcacaattgagttccggtgataaa
gttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgtacgcattcgtttgaacagctttca
acacatcgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccgagataatattaaaacccaa
cagtcgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctctaatcacgacagtagataaa
gctaaaaaggttaaagcggctatagaaaaagcatcttctgagtttattgaccatgctgat
gaaatagcactgcttcaagaagaacttgataaaattgttaagacaaaaactaatttagta
atggaaaaataccaccgaggaattttgactgatatgctcaaagattctggtattaaaggt
gctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagattaaccattatcttaaaata
atggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaatgagacaattaaatcccgt
ggtcgtgaagattttagttatgcttcattcagtcaaggtgaaaaagcacgaattgatatt
gctcttttatttacttggcgtgatattgctgaaaaagtttcaggtgttaaaataagttgt
ttatttcttgatgaagtgtatgacggtgcatttgatgctgaaggtattaaaaatgtagct
aaaattttagatggtttgaaggataccaacttcttcataatttcacataaagaccatgac
ccacaagaatatggtcagcatattcaaatggaaaaagttggtagatttagtttagctaag
attagctag
DBGET
integrated database retrieval system