Viruses: 65065079
Help
Entry
65065079 CDS
T40000
Symbol
KMC32_gp256
Name
(RefSeq) Shigella phage JK45; baseplate wedge subunit
KO
K26784
Straboviridae baseplate wedge protein Gp7
Virus
2591063
Shigella phage JK45
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp7_5th
Gp7_6th
Gp7_helical
Rsd_AlgQ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65065079
NCBI-ProteinID:
YP_010076241
RS:
NC_054940
LinkDB
All DBs
Position
NC_054940:86372..89470
Genome browser
AA seq
1032 aa
AA seq
DB search
MTVKAPAVTSLRISKLSANQVQIRWDDVGANFYYFVEIAETKTADGEIIPPASYRWINLG
YTPNSNWFESSLDPLTSYIIRVSTAAEGFERSDWVYTEIFESFQTNAYTFQHMIEMQLAN
TFIREKFTNNNMSYVDFNNDTIMAALMNESFQFSPAYADISSIKNFIIGENEYHEIQGSI
QQVCHDINRVYLMESEGILYLFERYQPVVKVSNDKGQTWKSVKLFNDRVGYPVSRTVYYQ
TGYTTYVLGYDKLFYGRKSTDVRWSAGDVRFSSQDITFAKIGDQLNLGFDVEIFGNYASL
PANVSRIAEAIVCNDDYVYVAARDKVRFIKTSNAPIDSDPLSPTYSERLFEQETFNITGN
PKAVCYKMDSVGGKIFALIIGEVVNLNDDPRTTPIVDSADKGVYVLDHDAGTFKRVFGNT
EEERRRIEPGYTSMSTDGVELSISSSNFKFLESDIVDDPKTQIKYGLIGAVKYEYPREWL
ADKHYHMMAFISTEDSQWESFTPQPMEYYAEPFFSYSRKSGTRCWINNSDKAVVIYSDLL
YTKVIENHPLSSSDREVHEYWKDGDCTIVMPNVDFTGFKKYASGMIFYKSSGEIISYYDF
SYRVRDNVSIIWKPTNIFLTASLQNQEKDTTWTPVEEDGIADPDLRPLLTTMMPESYLLD
NTNFEAFCEAYIQYLSDGYGTHYNNLLNLIKNQYPREEHAWEYLWSEIYKRNIYLNAEKR
DLVSRFFESRSYDFYSTKGTEASYKFLFKVLYNEDVEIEIESSSGTEYDIIIESDSLTED
LVGQTIYTATGRCNVTYIERSYSKGKLQWTVTIHNLLGRLIQGQEVKAERLPGFEGEIVR
GIKGKELSQNNIDYINRGRAYYVMKIKSKLPSSRWKSDVLRFVHPVGFGFIAITLLTMFI
NTGLTLKHVETIINKYKNYKWDSGLPTKYADRVAKLDPQGNVEFDPITGKAIYEIGPMAG
QDYPLPEDYNAENNNSIFQGQLPSERRKLMSPLFDASGTTFSRFRDLVEQRLIDNVGNPR
DPVNPPQVKLDE
NT seq
3099 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagtaaaagcgccagcagtcacaagtctcagaatatccaagttgtccgctaaccaa
gttcaaatacgctgggatgacgttggtgctaatttctactatttcgtagaaatcgctgag
actaaaacggcagacggggaaataattccccctgccagctacagatggataaatttagga
tatactcctaatagcaactggttcgaaagtagcttagacccattaacttcttatattatt
cgtgtatcaactgccgccgaaggcttcgagagatctgattgggtatataccgaaatattt
gaatcatttcagactaacgcgtatacatttcaacatatgattgaaatgcaattggctaac
acttttattagagaaaaatttacaaataacaacatgtcttatgtcgattttaataacgac
actataatggcagctctaatgaatgaatcgttccaatttagccctgcttatgcggatatt
tcatctattaaaaatttcattattggcgaaaatgagtatcatgaaattcaaggttcgatt
caacaggtgtgtcatgatataaaccgtgtttatttgatggaatccgaaggaattctttat
ttgtttgaacgatatcagcctgtggttaaagtctctaatgataagggacaaacctggaaa
tcggttaaattgtttaatgaccgtgtagggtaccctgtatcaagaacagtgtattaccag
acaggttataccacgtatgttcttgggtatgataaattattttacggccgtaaatcaact
gacgttcgttggtctgctggtgatgtgagatttagttctcaagatataacatttgctaaa
attggtgaccagttaaatttaggatttgatgtagaaatatttggtaactacgcatcatta
cctgctaacgtatcacgtattgcagaagctatcgtttgcaacgacgattatgtatacgtt
gctgctcgagataaagttcgttttattaaaactagtaatgcccctattgattcagacccg
ttatctccgacatattccgaacgtttgtttgaacaagaaacatttaacatcacaggtaac
cctaaggcagtttgctataaaatggattctgttggcggtaaaatatttgcactgattatc
ggcgaagttgttaatcttaatgacgacccgaggaccactcctattgttgattctgctgat
aagggcgtttacgttctagaccatgatgccggcacatttaaacgtgtgtttggtaatact
gaagaagaacgccgtcgtattgaacctgggtacaccagtatgtctactgatggtgttgag
ttatctatttcatctagtaattttaaatttctagaatcggatattgttgatgacccaaaa
acacaaatcaagtacggtttaatcggtgctgttaaatatgagtatcctcgcgaatggttg
gctgataaacattatcatatgatggcatttatttcaactgaagactctcaatgggaatcg
ttcactcctcaaccgatggaatactatgctgagccattctttagttattctagaaagtcc
ggtactcgatgttggattaataactcagacaaggctgttgtaatttattctgatttactt
tacactaaggttattgagaatcatccacttagttcttcagaccgtgaagttcatgaatat
tggaaggacggtgactgtacaatagtgatgcctaacgtagatttcaccggatttaaaaaa
tatgcatccggcatgattttctataaatcatcaggtgagattatttcttattatgatttt
agttatcgtgttagagataatgtttctataatttggaagcctactaatatattcttaaca
gcatcgttacaaaaccaagaaaaagataccacatggactcctgtagaagaggatggtatt
gcagacccggatttacgaccattgctcactacaatgatgccggagtcttatcttttagat
aatacaaactttgaagcgttctgcgaggcttatattcagtatctttctgacggttatggg
acccattataacaaccttttgaatcttattaaaaatcaatatccgcgcgaagaacatgcg
tgggaatatttatggtctgagatttataaacgaaacatttacttaaacgccgaaaaacgc
gatttagtgtctcgtttctttgaatcaagaagttatgacttctattcaactaaaggaact
gaagcatcgtataaattcttgtttaaagtgctttataacgaagatgttgaaattgaaatt
gaatctagttccgggaccgaatatgatatcatcattgaatctgattcgttgacagaagat
ttggtcggacaaaccatatacaccgctacaggacgttgtaatgtgacgtatatcgagaga
agttactctaaaggtaaattacaatggactgtaacaattcacaacctcttaggtcgttta
atccaaggacaggaagttaaagctgaaagactccctggttttgaaggtgaaattgttcgt
ggtattaaaggtaaagagctttctcagaacaacatcgattacataaatcgtggtagagca
tactacgtaatgaagattaaatctaaacttccatcatctcgttggaaatcagacgtatta
cgttttgttcatccggttggatttggatttatcgcaattacccttctcacaatgtttatt
aacaccggattaacacttaaacatgttgaaaccattattaataaatacaaaaactataag
tgggattctggattaccgactaaatatgcagaccgagtggctaaattagacccacaagga
aatgttgagtttgaccctattacaggtaaagcgatatatgaaataggccctatggctggt
caagattatccattacctgaagattataacgctgaaaacaataactccatatttcaaggt
caacttccatcggaacgacgtaaactgatgagcccattatttgatgcgtccggaacaaca
ttctctagatttagagatttggttgaacaacggttaatcgataatgtaggaaatccaaga
gaccccgtgaatccaccacaggttaaattagatgaatga
DBGET
integrated database retrieval system