Viruses: 65065167
Help
Entry
65065167 CDS
T40000
Symbol
KMC32_gp168
Name
(RefSeq) Shigella phage JK45; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
2591063
Shigella phage JK45
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_2nd
Gp34_trimer
DUF4410
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65065167
NCBI-ProteinID:
YP_010076329
RS:
NC_054940
LinkDB
All DBs
Position
NC_054940:153024..156899
Genome browser
AA seq
1291 aa
AA seq
DB search
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGF
VVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGN
DMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLL
FVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDII
HLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQK
SRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKI
KAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTR
YWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTA
TEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGL
DDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKAL
DQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQTE
TNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSD
RTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLG
TKSTETSEGVIKVATQAETITGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGS
ITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIR
RDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQT
GTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPI
NVNASGTLNANGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDGGSTYFMLTASG
DQTGGFNGLRPLSINNQSGQITIGEGLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRA
PTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTL
DSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATI
GNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
NT seq
3876 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgacatcaaacgtaagttcagagccgaagacggtctggacgccggtggcgacaag
attgttaacgtagcattagccgaccgtacagtaggtactgatggcgtaaacgttgacttc
ctggtacaagaaaacaccgttcaagtatatgattctacgcgtggatataacaaaggattt
gttgttctttatgacaaccgtttatatcaagcaataaatgatatcgtgtctccttccggg
gcatttaaccttttacaatggcgtgcagttcgtactgatgcacaatggataactgtcgct
tctgggacttatcaactttcttcaggtgaatcgatttcggttaacactggtgccggcaat
gatatggttttcacgttgccgaatacgccggttgatggcgatactgttgttttggctgat
attggcggaagaaccgggacagttaaagtacagattaacgcgtctgtgcagagcatttta
aactttagaggtgaacaagttcgtacggttttaatgacgcgtccgcgttcacaactattg
tttgtgtttagtaatcgtttgtggcagatgtatattaccgattatggtaaagaatcaatc
actgttacacctgcgacaccatatcaagcacaagcaaatgattttatcgttcgtcgtttt
actagtgcagcaccaatcaacattacacttccacgtaatgctaacaatggtgatataatc
cacctagttgatttagataaattaaacccactgtatcatacaattgttaaaacatttgat
gatacaacgtctattggtgaagtcgggactcatattgccgaaggcagaaatgactctgac
gcgttttttgtttttgatgctgcaaatagtttatggcgtatatgggaaggcgaccagaaa
tcgcgtcttcgtattatccgtgcggattcaaatattcgtccaaatgaagaagttcttatt
tttggcacaaataacgctacagccggaactattaatcttacgctgccttccggaattttg
agtggtgacactgttaaaatttcaatgaactacatgcgtaaaggccaaacagtaaaaatt
aaagctgctgaaggtgatacaattgcttcttctgttgcgttgcttcagttccctaaacgt
tctgaatatccacctgatgctcaatgggtctctgttactgaactagaattcaatggcact
acttcatatgttcctgtattagaattagcgtatatcgaagacaccgttgctggtacacgt
tattgggttgttcaacaaaacgtcccaactgtagaacgtgttgatgctggaactgatgct
acacgagctcgtttaggtgttattgctcttgctactcaagcgcaagcaaatgttgattta
gagaatactccagctaaagaagtggctattactcctgaaacgttggcaaatcgtacagca
actgaagctcgacgtggtatcgctaaaattgctacaacagcacaagttaaccagaattcc
acagcatcatttgtggacgatactattgttacgcctaaaaaactaaatgagcgtacagca
actgaaactcgtcgcggtcttgctgaaattgctactcagactgaaaccgatgctggtctt
gatgacacaacgattattacacctaagaaattgcaggcacgtcagggttctgaaacacta
tcaggtatagttaaatatgtatcaactacttctgctactcctgctgaaactcgtggtgct
gcaggcactaacgtttataataaaaccgtaaataatttaactatttctcctaaagccctt
gaccaatataaagcaacttatgctcaacaaggtgcagtaattttagctgttgatagtgaa
gtaattgctggtcaatcacaagcaggttattctcacgctgtagtaactcctgaaacacta
cataagaaaacttctactgatggacgtattggtttaattgaaattgctacgcaaacagaa
actaatgctgggactgattatacacgtgcagtaacgcctaagacgttaaatgataggaaa
gctacggaaggattatccggcatagccgaacttgctacgcaagttgaatttgatactgga
actgatgatactcgtatctcgactccactgaaaattaaaactcattttgattcttctgac
cgtaccagtgttaattctgattctggacttattgaagaaggaaccttgtggaaccattat
actcttgatatttctaaagcaaatgaaacacaacgtggtacacttcgcgtagcgactcag
gcagaatctaatgcaggaactttagatgatgttcttattactcctaaaaagcttttaggg
actaagtccactgaaacgtctgaaggcgtaattaaggttgctactcaggctgaaactata
acaggaacttctgctaatactgctgtatctcctaagaatttaaaatggattgtccagaat
gaaccaacatgggctgctactacagcaattcgtggatttgttaaaacttcatctggttca
attacattcgttggtaatgatacagttggttcaacacaacctttagaatcatatgaaaaa
aatagctatgctatatctccatatgaattaaaccgtgtattagcaaattatttgccattg
aaagctaaagccgtagatagtaatttattagatggactagattcatctcagttcattcgt
agggacattgcacagacggttaatggttcactaaccttaacccaacaaacgaatctgagt
gcccctcttgtatcatctagtactgctacgtttggtggttcggtatctgctaatagtaca
ctgactatttctaatacgggaacagctactcgactgatttttgaaaaaggacctcagact
ggaactaacccagcacagacgatgactatcagagtttggggaaatcagtttggtggcgga
tcagatacaacacgttctactgtatttgaagttggtgatgaaacgtctaatcatttttat
tctcaacgtaataaagatgggaatatagcgtttagcattaatggtactgtgatgccaata
aatgttaacgcttcaggcacgttaaatgcgaatggtgttgcaacatttggtcgttcagtt
acagccaatggtgaattcattagcaagtctgcaaatgctttcagagcaattagtggtgat
tacggattctttattcgcaatgatggaggcagcacatattttatgcttactgcatcaggt
gatcagactggtggatttaatggattacgtccattatcaattaataaccaatccggtcag
attacaattggtgaaggcttaatcattgccaaaggtgctactataaattcagatggtttg
actgttaactcgagaattcgttctcagggtactaaaacatctgatttatatacccgtgca
ccaacatctgatactgtaggattctggtcaatcgatattaacgattcagccacttataac
cagttcccaggttattttaaaatggttgaaaaaactaatgaagtgactgggcttccatac
ttagaacgtggcgaagaagttaaatctcctggtacattgactcagtttggtaatacactt
gattcactttaccaagattggattacttatccaacaactccagaagcacgtacaacccgt
tggacacgtacatggcagaaaactaaaaattcttggtcaagttttgttcaggtatttgat
ggtggaaaccctcctcagccatctgatattggtgctttaccttctgataatgcaacaatc
ggaaacttgacaataagggatttcttaaggattggtaatgtccgcattattccagaccct
gtgaataaatctgttaaatttgagtggattgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
