Viruses: 65065228
Help
Entry
65065228 CDS
T40000
Symbol
KMC33_gp037
Name
(RefSeq) Shigella phage Sf23; baseplate hub
KO
K26788
Straboviridae baseplate hub protein Gp27
Virus
2024321
Shigella phage Sf23
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Phage-tail_1
Phage-tail_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65065228
NCBI-ProteinID:
YP_010076388
RS:
NC_054941
LinkDB
All DBs
Position
NC_054941:35482..36654
Genome browser
AA seq
390 aa
AA seq
DB search
MSMLQRPGYPNLSVKLFESYDAWSNNRFVELAATITTLTMRDSLYGRNEGMLQFYDSKNI
HTKMDGNEIIQISVANANDINNVKTRIYGCKHFSVSVDSKGDNIIAIELGTIHSIENLKF
GRPFFPDAGESIKEMLGVIYQDRTLLTPAINAINAYVPDIPWTSTFENYLSYVREVALAV
GSDKFVFVWQDIMGVNMMDYDMMINQEPYPMIVGEPTLIGQFVQELKYPLAYDFVWLTKS
NPHKRDPMKNATIYAHSFLDSSLPMITTGKGENSIVVSRSGAYSEMTYRNGYEEAIRLQT
MAQYDGYAKCSTVGNFNLTPGVKIIFNDSKNQFKTEFYVDEVIHELSNNNSVTHLYMFTN
ATKLETIDPVKVKNEFKTDTTTEESSSSDK
NT seq
1173 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtatgttgcaacgccccggatatccaaatctcagcgttaaattatttgagagttat
gacgcttggagtaataatagatttgttgaattagctgctactattaccacattaactatg
cgtgactctctttatggtcgaaatgaaggaatgctacaattttatgattctaaaaacatt
catacaaaaatggatggaaatgaaataattcagatttctgtagctaatgcaaacgatatt
aataatgttaaaacccgaatttatggatgcaagcatttttccgtgtcagtagattcaaaa
ggcgataacatcattgctattgaattaggaactattcattctatagaaaatcttaaattt
ggtagaccatttttccctgatgccggtgaatctataaaggaaatgcttggcgtaatttat
caagatcgtacattattaactccagcgataaatgctattaatgcttatgttcctgatatt
ccatggactagcacatttgaaaactatttgtcatatgtaagagaagttgctctagcggta
ggaagcgataagttcgtatttgtatggcaagacatcatgggagttaacatgatggactat
gatatgatgataaatcaagaaccatatccaatgattgtaggtgagccaactttaataggt
caattcgtccaagaattgaaatatccattggcatatgattttgtttggttgactaaatca
aacccgcataaacgtgatccaatgaaaaatgctactatctatgctcattcatttttagat
tcttcattaccaatgattactacaggaaagggtgaaaactctattgtagtgtcaaggtca
ggtgcttattctgaaatgacttatagaaatggatatgaagaagctattcgtcttcagact
atggcgcagtatgatggttacgctaaatgttctactgtcggtaattttaacttgactcct
ggcgttaaaattatttttaatgatagtaaaaaccaatttaaaacagaattttacgttgat
gaagttattcacgaattatcaaataataattccgtaactcatctttatatgttcactaat
gcaacgaaactggaaacaatcgacccagttaaggttaaaaatgaatttaaaactgatact
accactgaagaaagtagttcttccgataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system