Viruses: 65065287
Help
Entry
65065287 CDS
T40000
Symbol
KMC33_gp096
Name
(RefSeq) Shigella phage Sf23; long tail fiber protein distal subunit
KO
K26778
Straboviridae long-tail fiber protein Gp37
Virus
2024321
Shigella phage Sf23
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Peptidase_S74
Gp34_trimer
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65065287
NCBI-ProteinID:
YP_010076447
RS:
NC_054941
LinkDB
All DBs
Position
NC_054941:76116..79427
Genome browser
AA seq
1103 aa
AA seq
DB search
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDG
NVIHTGNYNQTGDYTLNGVFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAH
VRFHDSADRERGIIFSPANDGLTTQVVNIRVQDYKAGSENTFAFNGNGLFSSPEVFGWKS
VSTPVIYTNKVITNKKVKDDYDIYSMADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDN
DGITWYSGDGLDAYLWSFTWSGGIKSSHSISIGLTPGPKDYSILGPSSIALGDNDTGFKW
HQDGYYFSVNNGTKTFLFSPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNN
AFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNSSTL
MFRGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFINPSEGNRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNV
NGSFESSGVTAGNRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKN
GDIGPLRPFSIALDTGKVVIPDLESSYNTFAANGYIKFAGHGAGAGGYDIQYSQAAPIFQ
EIDDAAVSKYYPIVKQKFLNGKAVWSLGTEINSGTFVLHHLKEDGSQGHTSRFNADGTVN
FPDNVQVGGGEATIARNGNIFSDIWKTFTSAGETTNIRDAIATRVSKEGDTMTGKLTLSA
GNDALVLTAGEGASSHIRSDVGGTNNWYIGKGGGDNGLGFYSYITQGGVYITNNGEISLS
PQGQGTFNFNRDRIHINGTQWTAHQAGDWGNQWRQEAPIFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSG
ITNEGYISGVDFGMRRTTNQWAQAIIRVGNQENGSDPQAIYEFHHNGVLYAPNMVQAGAR
LSAGGGDPVWQGACVVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGVHIASWSSSHHEHTGLWATDGA
FWTETGRAIISFGHLIQQNDSYSTYVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASEKLSKINGYTYM
QKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDQDSEALLRLNYNGVIGLNTAAINEH
TAEIAELKSEIEELKKLVKSLLK
NT seq
3312 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctactttaaaacaaatacaatttaaaagaagcaaaacggcaggtcaacgtccagct
gcttcagtattagccgaaggtgaattggctataaacttaaaagatcgtgtactttttact
aaagatgatcaaggaaatattattgacttaggttttgctaaaggcggtagtattgacggg
aatgttattcatacaggcaattataaccaaactggcgattatactttaaatggcgtcttc
actcagactggtaattttaatttaactggtattgctcgagtaactcgcgatattattgcc
gctgggcagattatgactgaaggcggagaacttattacaaaaagttcaggaacggcacac
gttcgttttcatgattccgccgaccgtgaacgcggtattattttttctcctgctaatgac
ggtttaactacacaagtagttaacatcagagttcaagattacaaagctggttcagaaaac
actttcgcttttaatggaaatggtttgttttcttcaccagaagtttttgggtggaaatct
gtatcaactccggtaatttataccaataaagttatcaccaataaaaaagttaaagatgat
tatgacatctattcgatggcagacaatgttccattgtctgaaagcactactgctattaat
catcttcgtgttatgcgtaatgcagttggttctggtattttccatgaagttaaagataat
gatggaataacatggtatagtggagatggattagacgcttatctttggtcatttacttgg
agcggcggaattaaatcaagtcactcaatttccatcggtttaacacccggacctaaggat
tactcaatattaggaccgtctagtatcgctttaggagataatgatactggatttaaatgg
catcaagacggatattatttcagtgttaacaatggcacaaaaacgtttttatttagtccc
agcgaaacaactagcctaagaaaatttgtagctggatattctactaacggaaccgattta
actactcctccaactgaaaattatgctcttgctactgtagtgacataccatgataataac
gcgtttggggatggtcagactcttttaggatattatcaaggcggtaactatcatcattat
ttccgcggcaagggcactacaaacattaatactcatggcggtttgttagttactccaggt
aatattgatgttattggcggttctgttaatatagatggtagaaataattcttctacacta
atgtttagaggcaacacaacaggtagtagttctgtggataacatgacaatttctgtgtgg
ggtaatacatttattaatcctagcgaaggtaatcgcaaaaatgtcatggaaatttccgat
gcaactagctggatgagctatattcaaagacttactactggtgaagtagaaatgaacgtt
aacggttcatttgaatcatctggtgttactgctggaaatagaggagttcacacaacaggc
gaaatttcatctggagcagtgaatgctcttcgcatttggaatgcagattatggagccatt
tttagacgttcagaaggtagtcttcatattattccaactgcttatggtgaaggcaaaaat
ggtgatattggtccacttcgtccatttagtatagctttagatactggtaaggttgttatt
ccagatttagaatcaagttataacacgtttgctgcaaatggctacattaaatttgctggt
catggggctggtgccggcggttatgatattcagtattcacaagctgctcctattttccaa
gaaatcgatgatgctgctgtaagcaaatattatcctattgttaaacagaagtttttaaac
ggtaaagctgtctggtctttaggtactgaaattaattcaggtacatttgttttacatcat
ctaaaagaagatggttcacaaggccatacatcaagatttaatgctgatggtacagttaat
ttccccgataatgttcaagtcggcggcggtgaagctactattgctcgtaatggtaatatc
ttctctgatatttggaaaacatttacttctgccggagaaaccacaaatattcgcgatgca
atagctactcgtgtttctaaagaaggcgacacgatgactggtaaattgactttatcagca
ggcaatgatgctctcgttttaactgcgggcgaaggtgcttcatcacatatccgcagtgat
gtaggtggtacaaataactggtatataggcaaaggtggcggcgacaacggtctaggtttt
tacagttacattacacagggtggtgtatacataacaaataacggcgaaatatcgctttct
cctcaaggtcaaggaacatttaattttaatagagatcgcattcatataaatggcacacaa
tggactgcacaccaagctggtgattggggaaaccaatggcgacaagaagcgccgatattt
gtagattttggcaatgtcggtaatgatagttattacccgattatcaaaggaaaatctggt
attactaatgaaggatacatatcgggtgttgattttggtatgcgacgcactactaaccaa
tgggctcaggctattatccgtgttggtaaccaggaaaatggttctgacccacaagctatc
tatgaatttcaccacaatggagttctgtatgctcctaatatggttcaagctggagcaaga
ttatcagctggtggaggtgatccggtatggcaaggcgcgtgcgttgttattggtgataat
gatactggattagttcatggcggtgacggccgaatcaatatggttgcaaatggagtgcat
attgcttcatggtcttcatcccatcatgaacacactgggctttgggccaccgacggcgcg
ttttggactgaaaccggaagagctattatttcatttggacatttaattcaacagaatgac
agctattcaacatatgtccgcgatgtttatgtccgctctgatattcgtgttaaaaaggac
ctagttaaatttgaaaatgcttctgagaagctttcaaaaattaatggttacacttatatg
cagaagcgaggcctagatgaagaaggtaatcagaaatgggaaccaaacgctgggttaatt
gctcaagaagttcaagctattttacctgaattggttgaaggcgatcaggatagtgaagct
ttacttcgtttgaactataacggtgtaattggtttaaatacagctgcaatcaatgagcat
actgcagaaattgcagaacttaagtcagagattgaagagcttaaaaaattagttaaatca
ttgttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system