Viruses: 65065792
Help
Entry
65065792 CDS
T40000
Symbol
g053c, KMC35_gp053
Name
(RefSeq) Yersinia phage fPS-2; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
2052930
Yersinia phage fPS-2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
AAA_23
SMC_N
AAA_29
ABC_tran
AAA_21
AAA_27
Rad50_zn_hook
ABC_ATPase
DUF445
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65065792
NCBI-ProteinID:
YP_010076940
RS:
NC_054943
UniProt:
A0A449C5N2
LinkDB
All DBs
Position
NC_054943:complement(32183..33865)
Genome browser
AA seq
560 aa
AA seq
DB search
MKNFKLNRVKYKNIMSVGQNGIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRD
VKKGQLINSTNKKELLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAE
FEQLIGMSYASFKQIVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRE
LNSQNQVLDVKKDSIIQQIKIYNDNVERQKKLTGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEE
ANERLVNIVLDEDPTDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDK
VVSKIKDKVSECTHSFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQSLANDIRNKKQSLIAAVDK
AKKVKAAIEKASSEFIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKG
AIIKKYIPLFNKQINHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSEGEKARIDI
ALLFTWRDIASIVSGVSISTLILDEVFDGSFDAEGIKGVANIINSMKNTNVFIISHKDHD
PQEYGQHLQMKKVGRFTVMV
NT seq
1683 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaagaattttaaacttaatagagtaaaatataaaaatataatgtcagttggtcaaaat
gggattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttattactggacgaaatggcggt
ggtaagtctactatgctagaagccatcacatttgggctttttggcaagccatttcgtgat
gtaaagaaaggtcaattaataaacagcacaaataagaaagaacttttagttgaactgtgg
atggaatatgatgagaaaaaatactatatcaaaagaggacaaaaaccaaacgttttcgaa
atcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagtaaagatttccaagcagaa
tttgaacagcttatcggaatgtcatatgccagtttcaagcagattgttgtccttggtaca
gcagggtatacccctttcatgggtttgtcgacccctgcacgaagaaagcttgtggaagac
ctgcttgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaataaagcactaatacgtgaa
ttaaattcgcagaaccaagtgcttgatgttaaaaaagatagtattatccaacaaattaaa
atatataatgataacgttgaacgccagaaaaaattaacgggtgacaaccttactcgtctg
caaaatatgtatgatgatttggcaaaagaagctagaacgctaaaatctgaaatagaagaa
gctaatgaaagattagttaatattgttttagatgaagacccgactgatgcatttaataaa
atcggtcaagaagcagttttaattaaatcaaaaattgactcgtataataaagtcattaat
atgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgtttgtcacaattaagttccggtgataaa
gttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgtacgcattcgtttgaacagctttca
acacaccgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccgagataatattaaaacccaa
cagtcgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatctctgatcgcagcagtagataaa
gctaaaaaggttaaagcggctatagaaaaagcatcttctgagtttattgaccatgctgat
gaaatagcactgcttcaagaagaacttgataaaattgttaagacaaaaactaatttagta
atggaaaaataccaccgaggaattttgactgatatgctcaaagattctggtattaaaggt
gctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagattaaccattatcttaaaata
atggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaatgagacaattaaatcccgt
ggtcgcgaagattttagttatgcttcatttagtgaaggtgaaaaagcgcgaattgatatt
gctcttttatttacttggcgtgatattgcttctattgtatctggtgttagtattagtaca
ttaatactcgatgaagtgtttgatgggtcatttgatgccgaaggtattaaaggtgtagct
aatattataaattcaatgaaaaacactaatgtttttataatttcgcataaagaccatgac
ccgcaagaatacggtcagcatcttcaaatgaagaaagttggtcgatttactgtaatggtt
taa
DBGET
integrated database retrieval system