Viruses: 65072635
Help
Entry
65072635 CDS
T40000
Symbol
tmp, KMD34_gp52
Name
(RefSeq) Staphylococcus phage phiSa2wa_st1; tail length tape measure protein
Virus
2029064
Staphylococcus phage phiSa2wa_st1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PhageMin_Tail
Peptidase_M23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65072635
NCBI-ProteinID:
YP_010083613
RS:
NC_055045
UniProt:
A0A2D1G5S0
LinkDB
All DBs
Position
NC_055045:28042..34266
Genome browser
AA seq
2074 aa
AA seq
DB search
MEARKEVNMNEKVEGMTLELKLDHLGVQEGMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSME
KYQARIKGLNDRLKVQKKMYSQVEDELKQVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKL
ALDKSKEALKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLKNSNQATTAQLKR
ASDAVQKQSAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNEKIENSYAKTNTKLKQTEKE
FNDLNNTIKNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKL
ASQADVMSKKFSSIGDKMTSLGRTMTMGVSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQA
SSKDLKSMSNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMPGVISAAEASGAE
MATTATVMASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVS
IEDTSAAIEVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKSTAKEMKKLGIHLSDAKGEFVGM
GELIRQFQDNMKGMTREQKLATVATIVGTEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGES
KKAADLMKDNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLVDGFTHLPGWVRK
ASVGLAIFGASIGPAVLAGGLLIRAVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQ
TLFLGSTTGKTSKGFKGLAGAMLFNLKPINVLKNSAKLAILPFKLLKNGLGLAAKSLFAV
SGGARFAGVALKFLTGPIGATITAITIAYKVFKTAYDRVEWFRNGINGLGETIKFFGGKI
IGGAVRKLGEFKNYLGSIGKSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVNKFKGFMQTMGTA
SKKASDTVKVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENNRIMEKVRLNSGQITEDKAKKLLKIEA
DLSNNLIAEIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQK
IKELKEKALSDGQISENERKEIEKLENQRRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSI
DEASKAIKEAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLAIADQRHKDEVRK
AKSKKDAVVDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYA
KEQEETARRNRENIKKWFGNAWDGVKTKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSK
LSSSWSSAKSSVGYHTKAIANSTGKWFGKAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHS
KSIWKGTSKWFSNAYKSAKGWLTDMANKSRSKWDNISSTAWSNAKSVWKGTSKWFSNSYK
SLKGWTGDMYSRAHDRFDAISSSAWSNAKSVFNGFRKWLSRTYEWIRDIGKDMGRAAADL
GKNVANKAISGLNSMIGGINKISKAITDKNLIKPIPTLSTGTLAGKGVATDNSGALTQPT
FAVLNDRGSGNAPGGGVQEVIHRADGTFHAPQGRDVVVPLGVGDSVINANDTLKLQRMGV
LPKFHGGTKKKDWLDQLKGNIGKKAGEFGATAKNTAHNIKKGAEEMVEAAGDKIKDGASW
LGDKIGDVWDYVQHPGKLVNKVMSGLNINFGGGANATVKIAKGAYSLLKKKLVDKVKSWF
EDFGGGGDGSYLFDHPIWQRFGSYTGGLNFNGGRHYGIDFQMPTGTNIYAVKGGIADKVW
TDYGGGNSIQIKTGANEWNWYMHLSKQLARQGQRIKAGQLIGKSGATGNFVRGAHLHFQL
MQGSHPGNDTAKDPEKWLKSLKGSGVRSGSGVNKAASAWAGDIRRAAKRMGVNVTSGDVG
NIISLIQHESGGNAGITQSSSLRDINVLQGNPAKGLLQYIPQTFRHYAVRGHNNIYSGYD
QLLAFFNNRYWRSQFNPRGGWSPSGPRRYANGGLITKHQLAEVGEGDKQEMVIPLTRRKR
AIQLTEQVMRIIGMDGKPNNITVNNDTSTVEKLLKQIVMLSDKGNKLTDALIQTVSSQDN
NLGSNDAIRGLEKILSKQSGHRANANNYMGGLTN
NT seq
6225 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggaagctagaaaggaggttaatatgaatgaaaaagtagaaggcatgaccttggagctg
aaattagaccatttaggtgtccaagaaggcatgaaaggtttaaagcgacaattaggtgtt
gttaatagtgaaatgaaagctaatctgtcagcatttgataagtctgaaaaatcaatggaa
aaatatcaggcgagaattaaggggttaaatgataggcttaaagttcaaaaaaagatgtat
tctcaagtagaagatgagcttaaacaagttaacgctaattaccaaaaagctaaatccagt
gtaaaagatgttgagaaagcatatttgaagctagtagaagctaataaaaaagaaaaatta
gctcttgataaatctaaagaagccttaaaatcttcgaatacagaacttaaaaaagctgaa
aatcaatataaacgtacaaatcaacgtaaacaagatgcatatcaaaaacttaaacagttg
agagatgcagaacaaaagcttaagaatagtaaccaagctactactgcacaactaaaaaga
gcaagtgacgcagtacagaagcagtccgctaagcataaagcacttgttgaacaatataaa
caagaaggcaatcaagttcaaaaactaaaagtacaaaatgataatctttcaaaatcaaac
gaaaaaatagaaaattcttacgctaaaactaatactaaattaaagcaaacagaaaaagaa
tttaatgatttaaataatactattaagaatcatagcgctaatgtcgcaaaagctgaaaca
gctgttaacaaagaaaaagctgctttaaataatttagagcgttcaatagataaagcttca
tccgaaatgaagacttttaacaaagaacaaatgatagctcaaagtcatttcggcaaactt
gctagtcaagcggatgtcatgtcaaagaaatttagttctattggagataaaatgacttcc
ctaggacgtacgatgacgatgggcgtatctacaccgattactttagggttaggtgcagca
ttaaaaacaagtgcagacttcgaagggcaaatgtctcgagttggagcgattgcacaagca
agcagtaaagacttaaaaagcatgtctaatcaagcggttgacttaggcgctaaaacaagt
aaaagtgctaacgaagttgctaaaggtatggaagaattggcagctttaggctttaatgcc
aaacaaacaatggaggctatgccgggtgttatcagtgcagcagaagcaagcggtgcagaa
atggctacaactgcaactgtaatggcatcagcaattaattctttcggtttaaaagcatct
gatgcaaaccatgttgctgatttacttgcgagatcagctaatgatagtgctgcagatatt
caatacatgggagatgcattaaaatatgcaggtactccagcaaaagcattaggagtttca
atagaggacacttctgcagcaattgaagttttatctaactcagggttagaggggtctcaa
gcaggtactgcattaagagcttcgtttattaggctagctaatccaagtaaaagtacagct
aaggaaatgaaaaaattaggtattcatttgtctgatgctaaaggtgagtttgttggaatg
ggcgaattgattagacagttccaagataacatgaaaggcatgacgagagaacaaaaatta
gcaacagtggctacaatagttggcactgaagcagcaagtggatttttagccttgattgaa
gcgggtccagataaaattaatagctatagcaaatcattgaagaactctaatggtgaaagt
aaaaaagcagctgatttgatgaaagataacctcaaaggtgctctggaacaattaggtggc
gcttttgaatcgttagcaattgaagttggtaaagatttaacgcctatgattagagcaggt
gcggaaggattaacaaaattagttgatggatttacacatcttcctggttgggttagaaag
gcttcggtaggcttagcaatttttggtgcatctattggtcctgctgttcttgctggtggc
ttattaatacgtgcagttgggagcgcggctaaaggctatgcatcattaaatagacgcatt
gctgaaaatacaattctttctaataccaattcaaaagcaatgaaatctttaggtcttcaa
acattatttcttggttctacaacaggaaaaacgtcaaaaggctttaaaggattagccgga
gctatgttgtttaatttaaaacctataaatgttttgaaaaattctgcaaagctagcaatt
ttaccgttcaaacttttgaaaaacggtttaggattagccgcaaaatccttatttgcagta
agtggaggcgcaagatttgctggtgtagccttaaagtttttaacaggacctataggtgct
acaataactgctattacaattgcatataaagtttttaaaaccgcatatgatcgtgtggaa
tggttcagaaacggtattaacggtttaggagaaactataaagttttttggtggcaaaatt
attggcggtgctgttaggaagctaggagagtttaaaaattatcttggaagtataggcaaa
agcttcaaagaaaagttttcaaaggatatgaaagatggttataaatctttgagtgacgat
gaccttctgaaagtaggagtcaacaagtttaaaggatttatgcaaaccatgggcacagct
tctaaaaaagcatctgatactgtaaaagtgttggggaaaggtgtttcaaaagaaacagaa
aaagctttagaaaaatacgtacactattctgaagagaacaacagaatcatggaaaaagta
cgtttaaactcgggtcaaataacagaagacaaagcaaaaaaacttttgaaaattgaagcg
gatttatctaataaccttatagctgaaatagaaaaaagaaataaaaaggaactcgaaaaa
actcaagaacttattgataagtatagtgcattcgatgaacaagaaaagcaaaacatttta
actagaactaaagaaaaaaatgacttgcgaattaaaaaagagcaagaactcaatcagaaa
atcaaagaattgaaagaaaaagctttaagtgatggtcagatttcagaaaatgaaagaaaa
gaaattgaaaagcttgaaaatcaaagacgtgacatcactgttaaagaattgagtaagact
gaaaaagagcaagagcgtattttagtaagaatgcaaagaaacagaaatgcttattcaata
gacgaagcgagcaaagcaattaaagaagcagaaaaagcaagaaaagcaagaaaaaaagaa
gtggataagcagtatgaagatgatgtcattgctataaaaaataacgtcaacctttctaag
tctgaaaaagataaattgttagctattgctgatcaaagacataaggatgaagtaagaaag
gcaaaatctaaaaaagatgctgtagtagacgttgttaaaaagcaaaataaagatattgat
aaagaaatggatttatccagtggacgtgtatataaaaatactgaaaagtggtggaatggt
cttaaaagttggtggtctaactttagagaagaccaaaagaagaaaagtgataaatacgct
aaagaacaagaagaaacagctcgtagaaacagagaaaatataaagaaatggtttggaaat
gcttgggacggcgtaaaaactaaaactggtgaagcctttagtaaaatgggcagaaatgct
aatcattttggcggcgaaatgaaaaaaatgtggagtggaatcaaaggaattccaagcaaa
ttaagttcaagttggagctcagccaaaagttctgtaggatatcacactaaggctatagct
aatagtactggtaaatggtttggaaaagcttggcaatctgttaaatcgacaacaggaagt
atttacaatcaaactaagcaaaagtattcagatgcctcagataaagcttgggcgcattca
aaatctatttggaaagggacatcaaaatggtttagcaatgcatataaaagtgcaaagggc
tggctaacggatatggctaataaatcgcgctcgaaatgggataatatttctagtacagca
tggtcgaatgcaaaatctgtttggaaaggaacatcgaaatggtttagtaactcatacaaa
tctttaaaaggttggactggagatatgtattcaagagcccacgatcgttttgatgcaatt
tcaagttcggcatggtctaacgctaaatcagtatttaatggttttagaaaatggctatca
agaacatatgaatggattagagatattggtaaagacatgggaagagctgcggctgattta
ggtaaaaatgttgctaataaagctattagcggtttaaatagcatgattggcggtattaat
aaaatatctaaagccattactgataaaaatctcatcaagccaatacctacattgtctact
ggtactttagcaggaaagggtgtagctaccgataattcgggagcattaacgcaaccgaca
tttgctgtattaaatgatagaggttctggaaacgccccaggtggtggagttcaagaagta
attcacagggctgacggaacattccatgcaccccaaggacgagatgtggttgttccacta
ggagttggagatagtgtaataaatgccaatgacactctgaagttacagcggatgggtgtt
ttgccaaaattccatggtggtacgaaaaagaaagattggctagaccaacttaaaggtaat
ataggtaaaaaagcaggagaatttggagctacagctaaaaacacagcgcataatatcaaa
aaaggtgcagaagaaatggttgaagcggcaggcgataaaatcaaagatggtgcatcttgg
ttaggcgataaaatcggcgatgtgtgggattatgtacaacatccagggaaactagtaaat
aaagtaatgtcaggtttaaatattaattttggaggcggagctaacgctacagtaaaaatt
gctaaaggcgcgtactcattgctcaaaaagaaattagtagacaaagtaaaatcgtggttt
gaagattttggtggtggaggcgatggaagctatctatttgaccatccaatttggcaaagg
tttgggagctacacaggtggacttaactttaatggcggtcgtcactatggtatcgacttt
caaatgcctactggaacgaacatttatgctgttaaaggcggtatagctgataaagtatgg
actgattacggtggcggtaattctatacaaattaagaccggtgctaacgaatggaactgg
tatatgcatttatctaagcaattagcaagacaaggccaacgtattaaagctggtcaactg
atagggaaatcaggtgctacaggtaatttcgttagaggagcacacttacatttccaattg
atgcaagggtcgcatccagggaatgatacagctaaagatccagaaaaatggttgaagtca
cttaaaggtagtggcgttcgaagtggttcaggtgttaataaggctgcatctgcttgggca
ggcgatatacgtcgtgcagcaaaacgaatgggtgttaatgttacttcgggtgatgtagga
aatatcattagcttgattcaacacgaatcaggaggaaatgcaggtataactcaatctagt
tcgcttagagacatcaacgttttacagggcaatccagcaaaaggattgcttcaatatatc
ccacaaacatttagacattatgctgttagaggtcacaacaatatatatagtggttacgat
cagttattagcgttctttaacaacagatattggcgctcacagtttaacccaagaggtggt
tggtctccaagtggtccaagaagatatgcgaatggtggtttgattacaaagcatcaactt
gctgaagtgggtgaaggagataaacaggagatggttatccctttaactagacgtaaacga
gcaattcaattaactgaacaggttatgcgcatcatcggtatggatggcaagccaaataac
atcactgtaaataatgatacttctacagttgaaaaattgttgaaacaaattgttatgtta
agtgataaaggaaataaattaacagatgcattgattcaaactgtttcttctcaggataat
aacttaggttctaatgatgcaattagaggtttagaaaaaatattgtcaaaacaaagtggg
catagagcaaatgcaaataattatatgggaggtttgactaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
