Viruses: 65100840
Help
Entry
65100840 CDS
T40000
Symbol
KM543_gp098
Name
(RefSeq) Orthopoxvirus Abatino; putative J6R protein
KO
K25273
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
2478919
Orthopoxvirus Abatino
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_1
Phage_hub_GP28
RsgA_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65100840
NCBI-ProteinID:
YP_010085766
UniProt:
A0A3G2KXV7
LinkDB
All DBs
Position
NC_055231:92070..95930
Genome browser
AA seq
1286 aa
AA seq
DB search
MAVISKVTYSLYDQKEINATDIIISHVKNDDDIGTVKDGRLGAMDGALCKTCGKTELECF
GHWGKVSIYKTHIVKPEFISEIIRLLNHICIHCGLLRSREPYSDDINLKELSSHALRKLK
DKILSKKKSCWNSECMQPYQKITFSKKKVCFVNKLDDINVPNSLIYQKLISIHEKFWPLL
EIHQYPANLFYTDYFPIPPLIIRPAISFWIDSIPKETNELTYLLGMIVKNCNLNADEQVI
QKAVIEYDDIKIISNNTTSINLSYITSGKNNMIRSYIVARRKDQTARSVIGPSTSITINE
VGMPAYIRNTLTEKIFVNAFTVDKVKQLLASNQVKFYFNKRLNQLTRIRQGKFIKNKIHL
LPGDWVEVAVQEYTSIIFGRQPSLHRYNVIASSIRATEGDTIKISPGIANSQNADFDGDE
EWMILEQNPKAVVEQSILMYPTTLLKHDIHGAPVYGSIQDEIVAAYSLFRIQDLCLDEVL
NILGKYGREFDPKGKCKFSGKDIYTYLIGEKINYPGLLKDGEIIANDVDSNFVVAMRHLS
LAGLLSDHKSNVEGINFIIKSSYVFKRYLSIYGFGVTFKDLRPNSTFTNKLEAINVEKIE
LIKEAYAKYLNDVRDGKIVPLSKALEADYVESMLSNLTNLNIREIEEHMRQTLIDDPDNN
LLKMAKAGYKVNPTELMYILGTYGQQRIDGEPAETRVLGRVLPYYLPDSKDPEGRGYILN
SLTKGLTGSQYYFSMLVARSQSTDIVCETSRTGTLARKIIKKMEDMVVDGYGQVVIGNTL
IKYAANYTKILGSVCKPVDLIYPDESMTWYLEISALWNKIKQGFVYSQKQKLAKKTLAPF
NFLVFVKPTTEDNAIKVKDLYDMIHNVIDDVREKYFFTVSNIDFMEYIFLTHLNPSRIRI
TKETAITIFEKFYEKLNYTLGGGTPIGIISAQVLSEKFTQQALSSFHTTEKSGAVKQKLG
FNEFNNLTNLSKNKTEIITLVSDDISKLQSVKINFEFVCLGELNPDITLRKETDRYVVDI
IVNRLYIKRAEITELVVEYMIERFISFSVIVKEWGMETFIEDEDNIRFTVYLNFVEPEEL
NLSKFMMVLPGAANKGKISKFKIPISDYTGYDDFNQTKKLNKMTVELMNLKELVSFDLEN
VNVYPGVWNTYDIFGIEAARGYLCEAMLNTYGEGFDYLYQPCDLLASLLCASYEPESVNK
FKFGAASTLKRATFGDNKALLNAALHKKSEPINDNSSCHFFSKVPNIGTGYYKYFIDLGL
LMKMERKLSDKISSQKIKEMEETEDF
NT seq
3861 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgtaatctctaaggttacgtatagtctatatgatcaaaaagagattaacgctaca
gatattatcattagccatgttaaaaatgacgacgatatcggtacagtcaaagatggtaga
ctaggtgctatggatggggcattatgtaagacttgtgggaaaacggaattggaatgtttt
gggcactggggtaaagtaagtatttataaaactcatatagttaagcctgaatttatttca
gaaattattcgtttactgaatcatatatgtattcactgcggattattgcgttcacgagaa
ccgtattccgacgatattaacttaaaagagttatcaagccacgctcttaggaaattaaag
gataaaatattatccaagaaaaagtcatgttggaacagtgaatgtatgcaaccgtatcaa
aaaattactttttcaaagaaaaaggtttgtttcgtcaataagttggatgatattaacgtt
cctaattctctcatctatcaaaagttaatttctattcatgaaaagttttggccattatta
gaaattcatcaatatccagccaacttattttacacagactactttcccatccctccgttg
attattagaccggctattagtttttggatagatagtatacccaaagagactaatgaatta
acttacttattaggtatgatcgttaagaattgtaatttgaatgcggatgaacaggttatc
cagaaggcggtaatagaatacgatgatattaaaattatttctaataacactaccagtatc
aatttatcatatatcacatccggtaaaaataatatgattagaagttatatcgtcgcccga
cgaaaagatcagacggctagatctgtaattggtcccagtacatctatcaccattaatgag
gtaggaatgcctgcatatattagaaatacacttacagaaaagatatttgttaatgccttt
acagtggataaagttaaacaactattagcatcaaaccaagttaaattttactttaataaa
cgattaaaccaattaacgagaatacgccaaggaaagtttatcaaaaataaaatacattta
ttgcctggtgattgggtagaagtagctgttcaagaatatacaagtattatttttggaaga
cagccgtctctacatagatataatgtcattgcttcttctatcagagctacagaaggagat
actatcaaaatatctcccggaattgctaactctcaaaatgctgatttcgacggagatgaa
gaatggatgatattggagcaaaatcctaaagctgtagttgaacaaagtattcttatgtat
ccgacgacgttactcaaacacgatattcatggagcccccgtttatggatctattcaagat
gaaatcgtagcagcgtattcattgtttaggatacaagatctttgtttagatgaagtattg
aacatcttggggaaatatggaagagagttcgatcctaaaggtaaatgtaaattcagcggt
aaagatatctatacttacttgataggtgaaaagattaattatccgggtctcttaaaggat
ggtgaaattattgcaaacgacgtagatagtaattttgtcgtggctatgaggcatctctca
ttggctggactcttatccgatcataagtcgaacgtggaagggatcaactttattattaag
tcatcttatgtttttaagagatatctatctatttacggttttggggtgacattcaaagat
ctgagaccaaattcgacgttcactaataaattggaggccatcaacgtagaaaaaatagaa
cttatcaaagaagcatacgccaaatatctcaacgatgtaagagacgggaaaatagttcca
ttatctaaagctttagaggcggactatgtggaatccatgttatccaacttgacaaatctt
aatatcagagagatagaagaacatatgagacaaacgctgatagatgatccagataataat
ctcctgaaaatggccaaggcgggttataaagtaaatcccacagaactaatgtatattcta
ggtacgtatggacaacagaggattgatggcgaaccagcagagactcgagtattgggtaga
gtcttaccttactatcttccagactctaaggatccagaaggaagaggttatattcttaat
tctttaacaaaaggattaacgggttctcaatattacttttcaatgctggttgcaagatct
caatctactgatatcgtctgtgaaacatcacgtaccggaacactagctagaaagatcatt
aaaaagatggaggatatggtggtcgacggatacggacaagtagttataggtaatacgctc
atcaagtacgccgccaattataccaaaattctaggctcagtatgtaaacctgtagatctt
atctatccagatgagtccatgacttggtatttggaaatcagtgccttgtggaacaaaata
aaacagggattcgtttactctcagaaacaaaaacttgcaaagaagacattggcgccgttt
aatttcctagtatttgtcaaacccaccactgaggataatgccattaaggttaaggatctg
tacgatatgatccacaacgtcatcgatgatgtgagagagaagtacttctttaccgtatct
aatatagattttatggagtatatctttttgactcatctgaatccttctagaattagaatt
acaaaggaaacggctattaccatctttgaaaagttctatgaaaaactcaattatactcta
ggtggcggaactcctattggaattatttctgcacaggtattgtctgagaagtttacacaa
caagccctatccagttttcacactactgaaaagagtggtgccgtcaaacaaaaacttggt
ttcaacgagtttaataacctgactaatttgagtaagaataagaccgaaattatcactctg
gtatccgatgatatctctaaacttcaatctgttaagattaatttcgaatttgtatgtttg
ggagaattaaatccagacatcactcttcgaaaagaaacagatagatatgtagtagatata
atagtcaatagattatacatcaagagagcagaaattaccgaattagtcgtcgaatatatg
attgaacgattcatctcctttagcgtcattgtaaaggaatggggtatggaaacattcatt
gaggatgaggataatatcagatttactgtctatctaaatttcgttgaaccagaggaattg
aatcttagtaagtttatgatggttcttccgggtgctgccaacaagggcaaaattagtaaa
ttcaagattcctatctctgattatacaggttatgacgacttcaatcaaacaaaaaagctc
aataagatgactgtagaacttatgaatctaaaagaattggtttcatttgatttggaaaac
gttaacgtgtatcctggagtatggaatacatacgatatcttcggcatcgaggccgctcgt
ggatacttgtgcgaagccatgttaaacacctatggagaaggtttcgattatctgtatcag
ccatgtgatcttctcgctagtttactatgtgctagttacgaaccagaatcagttaataaa
ttcaagttcggcgcagctagtactcttaagagagctactttcggagacaataaagcattg
ttaaacgcggctcttcataaaaagtcagaacctattaacgataatagtagctgccacttt
tttagcaaggtcccaaatataggaactggatattacaaatactttatcgacttgggtctt
ctcatgaaaatggaaaggaaactatctgataagatatcttctcaaaagatcaaggagatg
gaagaaacagaagacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system