KEGG   Viruses: 65100840
Entry
65100840          CDS       T40000                                 
Symbol
KM543_gp098
Name
(RefSeq) Orthopoxvirus Abatino; putative J6R protein
  KO
K25273  Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:2.7.7.6]
Virus
2478919  Orthopoxvirus Abatino
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_4 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_1 Phage_hub_GP28 RsgA_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 65100840
NCBI-ProteinID: YP_010085766
UniProt: A0A3G2KXV7
LinkDB
Position
NC_055231:92070..95930
AA seq 1286 aa
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NT seq 3861 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system