Viruses: 65108585
Help
Entry
65108585 CDS
T40000
Symbol
g055c, KNT67_gp055
Name
(RefSeq) Yersinia phage fPS-90; SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
KO
K26043
Straboviridae exonuclease subunit 2 [EC:3.1.11.-]
Virus
2052932
Yersinia phage fPS-90
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SMC_N
AAA_23
AAA_29
ABC_tran
AAA_27
AAA_21
Rad50_zn_hook
FtsK_SpoIIIE
DUF1441
SbcC_Walker_B
Fib_alpha
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
65108585
NCBI-ProteinID:
YP_010091090
RS:
NC_055723
UniProt:
A0A449C3K1
LinkDB
All DBs
Position
NC_055723:complement(32302..33942)
Genome browser
AA seq
546 aa
AA seq
DB search
MSVGGNPIDIQLDKVQKTLITGRNGGGKSTMLEAITFGLFGKPFRDVKKGQLINSTNKKE
LLVELWMEYDEKKYYIKRGQKPNVFEITVNGTRLNESASSKDFQAEFEQLIGMSYASFKQ
IVVLGTAGYTPFMGLSTPARRKLVEDLLEVGTLAEMDKLNKALIRELNSQNQVLDVKKDS
IIQQIKIYNDNVERQKKLSGDNLTRLQNMYDDLAKEARTLKSEIEEANERLVNIVLDEDP
TDAFNKIGQEAVLIKSKIDSYNKVINMYHEGGLCPTCLSQLSSGDKVVSKIKDKVSECTH
SFEQLSTHRDNLKVLVDEYRDNIKTQQTLANDIRNKKQSLITTVDKAKKVKAAIEKASSE
FIDHADEIALLQEELDKIVKTKTNLVMEKYHRGILTDMLKDSGIKGAIIKKYIPLFNKQI
NHYLKIMEADYVFTLDEEFNETIKSRGREDFSYASFSQGEKARIDIALLFTWRDIAEKVS
GVKINTLILDEVFDSATDVEGVKAISTILDSLKNTNVFVISHRDHDPQAYGQHLQMKKVG
RFTVMV
NT seq
1641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagtaggtggaaatcctattgacattcaattagataaggttcaaaaaactcttatt
actggacgaaatggcggtggaaagtctactatgttagaagccatcacatttgggcttttt
ggcaagccatttcgtgatgtaaagaaaggccaattaataaacagtacaaataagaaagaa
cttttagttgaattgtggatggaatatgatgagaaaaaatactatattaaaagaggacaa
aaaccaaatgttttcgaaatcaccgttaacggtacacgtcttaatgaatctgccagcagt
aaagatttccaagcagaatttgaacagcttatcggaatgtcatacgccagtttcaaacag
atcgtcgtactcggcacggctggatataccccttttatgggcctatccactcctgcaaga
agaaaacttgtcgaagacctgctcgaggtaggaacattagctgaaatggataagcttaat
aaagcactaatacgtgaattaaattcacaaaaccaagtgcttgatgttaaaaaagatagt
attatccaacaaattaaaatatataatgataatgttgaacgacagaaaaaattgtctggt
gacaaccttactcgtctacagaatatgtatgacgatttggcaaaggaagctagaacgcta
aaatcggaaatagaagaagctaatgaaagattagttaatattgttttagatgaagacccg
actgatgcatttaataaaatcggtcaagaagcagttttgattaaatcaaaaattgactcg
tataataaagtcattaatatgtatcacgaaggtggattatgtccaacctgtttgtcacaa
ttaagttccggtgataaagttgtttctaaaattaaagataaagtttctgaatgcacgcat
tcgtttgaacagctttcaacacaccgtgataatttaaaagttcttgttgatgaataccga
gataatattaaaacccagcagacgttggcaaatgatattcgcaataaaaagcaatcctta
atcacgacggtagataaagctaaaaaagttaaagcggctatagaaaaagcatcatctgag
tttattgaccatgctgatgaaatagcactgcttcaagaagaacttgataaaattgttaag
acaaaaactaatttagtaatggaaaaataccacagaggaattttgactgacatgctcaaa
gattctggtattaaaggtgctattattaaaaagtacattccattatttaataagcagatt
aaccattatcttaaaataatggaagcggattatgtgtttacattagatgaagaatttaat
gagacaattaaatcccgtggtcgtgaagattttagttatgcttcatttagtcaaggtgaa
aaagcacgaattgatattgctcttttatttacttggcgcgatattgctgaaaaagtttca
ggtgttaaaataaacacactaattcttgatgaagtttttgattcagcaactgatgttgaa
ggcgtaaaagctatttcaactattttagatagtttaaaaaatactaatgtttttgttatt
tcacatagagaccatgacccacaagcatatggtcagcatcttcaaatgaagaaagttggt
cgatttactgtaatggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
