Viruses: 76970933
Help
Entry
76970933 CDS
T40000
Symbol
HOQ63_gp111
Name
(RefSeq) Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803US26; virion structural protein
Virus
2790346
Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803US26
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DUF4815
PHR
Carmo_coat_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
76970933
NCBI-ProteinID:
YP_009778838
RS:
NC_047714
LinkDB
All DBs
Position
NC_047714:73671..80891
Genome browser
AA seq
2406 aa
AA seq
DB search
MSQINLDTSPYFDDFDPSKDYYKVLFKPGFPVQARELTTLQSILQNQVSNFGKHLFKEGS
MVIPGSITYNAKYESIVINKQQGGIDVSLYASRLVGKTIQGKTSGVTAKVINFLLPPNNG
VTSPTIFVSYINSGSDAATTVFDNNEELISTSDIVYGNTTITAGTTFASTISTLSTAVGS
AAQIRDGIYFIRGFFAQVRESVVILEPFSNTPSYRVGLQITEQVITAGQDNSLYDNAKGF
NNFSAPGADRLKISTKLIKKPLDDYNDTNFVELLRVDNGEVKKIAENSDYNIIKDYLAQR
TYEESGDYTLFGMGIKVAESLSDNLGNGGVYQFDQKTEQGGTPTDDLAVVKVSAGKAYVR
GYDINNPGTVNLDINKPRTTENVEASSVPFEMGSKFFINNVTGTPVIGLDVNDNIVELYN
GRVDGAGSSTGDLIGESRVYSYSLEDAPYTGPSTPWNLYLYDTQIFTKLTLNVDATGNIL
TSYKVRGLSSNATGYVRSVSTTEVVLTQVSGEFIRNEAISVNGKISSSLSVSLVDSYRNN
DVRSISQASSSLDPNIEVDFSADTLQYSAIPTGFTASDSVTITTGGVVTCPGRIFDAFRV
GDVIGYQKAGSEVITYNQVLSLNATNTSITVDAVANVAGVCDGTLPSSETRSGIRLYNSR
LLNQEISQLYATLEERNISSVDLASSSLTFAKQINNLSTDASGVLTVNVSDLDVSGAVFE
AFDQERYSIHYSNGTTQSLSSSQVTITSSTAEFTNLLPSQTTNVTLNCTAIKTGIKSKTK
VLLRSQLLEVTKASSGISTVAQGLGQNDYYGLRVDDEEISLNVSDVTNIVAVYESLDDGT
PTFDVLGFVNGLELDTRVAVGEQIKGDVSGAIARVVTVATPASVNIVYLTESTFEVGELV
TFMESKIETNLQSITEGNYSNITNRFTLDKGQREQFYDYSRLVRNKNAKAPNKRILIIYD
RFAVPVNDKGDFYTANSYSEEDFSKGVPMLAGGTLRASDTLDFRPRVAAFTSLNSSPFNY
TSRDFGDNGNTVILVTKPSESMVLGYSYFVGRRDRIVLGSNGKFSVIEGTPAEFPTLPTI
GDGVMELAQITYPPYLYYIEDVQIIEVDNRRYTMRDIGKLEDRIENLEEVTSLSLLERET
ESLQVLDEDGNDRFKSGFFADDFTNAEFIDNDYEDTNIDVEPATSSLVTRQLFSTIPLRA
QLSESIDENIVDLSDNLPLVDTNLQKTGDIVTLSYVEVPWITQPLSSRTENVNPFNVILF
NGSITLNPASDDFVITRQIPGNTQTIDVFGDGNSSNFDQTFVESVETAQWMRSRNIAFHG
RGIKPFTQFYAFFDGTSGIDIIPKLIEITMTNGAFSVGERVVGTTGGRRIFAARVATPNH
KEGTFNSPDRTFETNPYNRDAQLASSYSASSTILNIDTNSLADITDSRFFGYITPGTRLV
GQSSGAIADVTEVKLIADTFAELYGAIWLRDPYASPTPSFRLATGVRTLKLTSSTTNAQS
TLGGTTISFAESNFQSSGLVQNRQTDTTVVTVRPLPPPPPPIIIDQTVTIVNNNTTVIDN
TVTQNIDNTQTIIREVEVDDDDPLAQTFMVDETGAFLTSIDLFMATKSETDNLIVQVRTT
ELATPTNLLIQDFAEVVLSPDQVNVSEDGTAVTKVTFPSPIYLESGITYAVVLLAPTTDE
YTSFIAVMGEENLSGEIDPNLDLNATLPEGSTQSNSNLPGTAIISQQYLGGSLFKSQNGT
IWTPTQFEDLKFTLNKAQFNQTPGTLFLNNPPLTETGILPPDPIETLPRKLKVSVSSNTY
NFSEGDIISSVGSGATNTALVTGDLETLGGPLATLDVTDPGVGFIDGSYSSVTVYPITSS
GSGAELNVTISGNVITAATVTTGGSGYRVGDTIGITTADVGAAGGDSVLTLDTIGDTDTL
FLTNVQGEKMVITESIKVYDTVTESLRTTGVDITTESEVLNPMYNGSIFVANIPNHGMEA
DNNVVSITDIQPDTIGTPLTQRVDVSSSSLTIQDSSSFSTFEGITTSIGYALVGGEIIEY
SNSGSGTIGITSRGVDNSIISTHNAGERVFKYELSGVSLRRINREHLIPNDSLLGNTREI
NNLPIQISRSPRVSGRDQLSFNQEQTAGGAFGRSSQNYEYTRILPNLAAFGFGDSTSIRS
VARTISGTSAGGSEVSFLDQGSIPVNLNTWNTFPSVRMVASQVNEIEYLQDLPRQKSFTL
GLTLTSTDPNLSPVVDLQQVSLITSRNSLNKPITNYADDSRVNLLVGDPHASIYVSQVIN
LETPATSLEVIISAYRDVSADFRVLYRLYGPNSNNSTEPTWELFPGYTNMLDTTGDGVGN
RIIDPSKNNGLPNARVRDSNIGEVLEYGYHVDELSEFSGFQLKIVFSGTNEARPPLFTDI
RAIALA
NT seq
7221 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcagattaacctagataccagcccatactttgacgacttcgatccgtcaaaggac
tactataaagtactcttcaagccaggattcccggttcaagcaagagaacttaccactctg
caatcaattttacagaaccaggtaagtaactttggaaagcacctcttcaaagagggatcc
atggttatccctggtagtataacttataatgcaaagtatgagtctattgtcataaacaaa
caacagggtggtatcgacgtttctctatatgcttctcgactagttggtaaaactattcag
ggtaaaactagcggagttaccgctaaggttattaacttcctactaccaccaaataacgga
gtaacaagcccaacaatctttgtttcatatatcaatagtggttcggatgcggcaacaact
gttttcgacaataacgaggagttaatttccacttccgacattgtatatggtaatactaca
attactgccgggactacatttgctagtactatttcaactctatccacagcggtaggttct
gctgcccagatcagagatggtatctacttcattcggggtttctttgctcaggttcgtgaa
agtgtagtaatcttagaaccttttagtaatactccttcatatagagttggtctacagatc
actgaacaggttattactgctggtcaggacaactcactatatgataacgccaaggggttc
aataacttctcagcaccaggtgcggatagactaaaaatatccaccaaacttattaagaaa
ccactagacgattataatgatactaactttgtagagttattacgtgttgataacggtgaa
gttaagaaaattgcggagaatagtgactataatatcattaaggactacctagcacaaaga
acctatgaggagtctggtgactataccctgtttggtatgggtattaaagttgcagagtca
ttaagtgataacttaggtaacggtggtgtatatcagtttgatcagaaaacagagcaaggg
ggaacacccactgacgatctagcggtagttaaagtatctgctggtaaggcatatgttcga
ggttatgacatcaataatcctggaactgttaacctagacatcaacaaacccagaacaaca
gagaacgtcgaagcaagttccgttccctttgagatgggaagtaagttcttcatcaataac
gttacaggaactcctgttattggtctagacgttaatgataatatcgtcgaactatacaat
ggtcgtgtagatggtgcagggtcctccacaggagatcttattggtgagtctcgtgtatat
tcctattccctagaagacgcaccctatacaggtccttctacaccttggaacctatatcta
tatgatactcagatctttaccaaactaactctaaatgtagatgcaactggtaatatccta
acttcatataaggtgaggggtctcagtagtaacgctactggttatgttcgttctgttagt
accacagaagtagttctaactcaggtatctggtgaatttatcagaaacgaagctatttct
gttaatggaaagatatccagttcacttagtgtatctttagttgatagttacaggaataac
gatgttagatccattagccaggcaagttcctcactagatccaaacattgaagttgacttt
agtgcagatactctccaatactctgctatcccaactggtttcacagcttcagattcagtt
acaatcactactggtggtgttgttacttgtcctggtagaatatttgatgctttccgagtt
ggtgatgttattggatatcagaaagctggatcagaagtaattacatacaatcaagtatta
tcactcaacgccactaacaccagtattactgttgatgcagttgcaaatgttgctggtgtt
tgtgatggaactttaccttcatccgaaactagatctggtattaggttatacaactctaga
ctccttaaccaagagatttctcagttatatgcaactttagaagagaggaatatttccagt
gttgatttggcatcatcgtcattaaccttcgccaaacagatcaacaacttatctacagat
gctagtggtgttctaactgtaaatgtatccgacctagatgtttctggtgcggtatttgaa
gcctttgatcaagagagatatagtattcattattccaatggaactacacaatctcttagt
tctagtcaggtaactattacatcctcaacagcagaatttacaaacttactcccaagtcag
acaaccaacgtaacactcaattgtactgctatcaagactggtattaagtctaagactaaa
gttctacttaggtctcaactattagaagttaccaaggcaagcagtggtatttctactgtg
gctcagggtttgggacaaaatgactactatggtttaagggttgatgatgaagagatctca
ctaaatgtatcagatgtaactaatattgttgctgtatatgagtcattggatgatggtacc
ccaacgtttgatgttctaggttttgtcaatggtttagaactagacactagagttgcagtt
ggagaacagatcaagggtgatgtatctggtgctattgctcgggttgttacagttgcaaca
cctgcttcagtcaatattgtatacctaactgaatcaacttttgaagttggtgaattagtt
acgtttatggaatccaagattgaaactaatcttcaatctattacagaaggtaactacagt
aacattacaaacagatttacacttgataaaggacaacgtgaacagttctatgactattct
cgtctagtcaggaataagaatgctaaagcacctaacaagagaatactaatcatctatgat
agattcgctgttccagtgaatgacaaaggtgatttctacactgccaatagttactccgaa
gaagacttcagtaaaggtgttcctatgttggctggtggaactctccgtgcctcggacacc
ctagattttagacccagagtcgccgcctttacctcactcaactcctcaccatttaactac
acttctcgtgactttggtgacaatggtaatactgttatcctagttaccaaaccaagtgaa
agtatggttctaggttatagttactttgttggaagaagggatcgtattgtactaggatct
aatggaaaattcagtgtaattgaaggtacacccgctgagttcccaacattacccacaatt
ggtgatggtgtaatggaactcgcccaaataacttatccaccatacctatactacatcgaa
gacgttcaaattatcgaggttgataatagacgatatacgatgagagatattggtaagttg
gaagatcgtattgagaacttagaagaagttacgtcactttcactactagaaagggaaaca
gaatcactacaagttttggatgaagatggtaacgacagatttaaatctggtttctttgcc
gatgatttcacgaatgcagaatttattgataatgattatgaagataccaacattgatgtt
gaacctgcaacttcttccctagtcactagacagttattttccaccattccattaagagct
caactatcagaaagtattgatgagaacatagttgatttgagtgataacttacctctagta
gatactaatctacaaaagactggtgatatagttaccctatcatatgttgaagttccttgg
attacacaaccactatcttcgagaacagaaaatgttaacccattcaatgttattctattc
aatggtagtattacattaaacccagcttctgatgattttgttattactagacagattcca
ggcaatactcaaactattgatgtatttggtgatggaaacagttctaatttcgatcagacg
tttgttgagagtgtagaaactgctcagtggatgagatcacgtaacattgctttccacggt
cgtggaatcaaacccttcactcagttctatgcgttctttgacggaacttctggtattgat
attatccccaaacttattgaaatcaccatgactaacggtgctttctccgttggggagagg
gttgttggtactactggaggtagaagaatctttgcagctagagtagctacacctaatcat
aaggaaggtactttcaatagtccagatagaacttttgagacaaatccatataatagggac
gctcagttggcgtcttcatactcagcctcgtctacaattctcaatattgataccaactca
ctagcagatatcactgactcacgtttctttggttatatcacaccaggaactagattagtt
ggtcagtctagtggagctattgctgatgttacagaagtaaaattaatcgctgatacattt
gctgaactatatggtgctatttggttgagggatccatacgcatccccaacaccatcattc
agacttgctaccggtgttcgtacactaaaactaacctctagtacaactaacgcacaatct
acacttggtggaacaacgatctcctttgcagagtctaacttccaatctagtggtttggtt
cagaacaggcagactgatactactgtggtaacagttagacccctaccaccaccaccccca
ccaattattattgaccaaacagttactattgtcaataacaatacgacagttatcgataat
actgttactcaaaatatcgataatactcaaactattatccgagaagtggaagttgacgat
gacgacccattggcacagacctttatggttgatgagaccggtgcgttcctaaccagtatt
gatctgtttatggctactaagtctgaaacagataacttaattgttcaggttagaactact
gagttggcaactccaaccaaccttcttattcaagattttgctgaggttgttctatcacct
gatcaagttaatgtatcagaagatgggactgcggtaactaaagttactttcccctctccc
atatatcttgagtcaggtataacatatgccgttgtactacttgccccaactactgacgaa
tacacttcgtttattgctgttatgggtgaggagaatctctctggtgagattgatcctaac
ttagatctaaacgcaacacttccagaaggatctactcaaagtaactccaatctcccagga
actgctattatttcccagcagtatctcggtggatcactctttaagtctcagaatggtact
atctggacaccaactcagtttgaggatcttaagttcactctcaacaaagcacagtttaac
cagactccaggaactctattcctcaacaatccaccactaactgagaccggaattctacca
cctgatccaattgaaacactacctagaaaactcaaggtatctgtaagttctaatacttac
aacttcagtgaaggtgatatcatttcttctgttggttcaggtgctaccaataccgcgttg
gtaactggtgacctagagaccctaggtggtccactagcaacactcgatgtaactgaccct
ggtgttggtttcattgatggttcctacagtagtgtaactgtatatccaattaccagttct
ggttcaggtgctgaactcaatgttaccatttctggtaatgtaattacagcagcaacagta
actactggtggttctggttatagagttggagataccattggtattacaaccgctgatgtt
ggtgccgctggtggtgactctgtattgactctcgataccattggtgatacagatacacta
ttcctcactaacgtacaaggtgagaagatggttataacagagagtattaaggtatacgat
actgttactgaatccctaaggacaactggtgtagatattacaacagaatctgaagttctc
aatccaatgtataatggtagtatctttgttgctaacatacccaatcatggtatggaagca
gacaacaatgtggttagtatcacagatatccaaccagatacaattggtaccccactaaca
cagagagttgatgtttcctctagtagtttgacaattcaggactcttcctcattctccacc
tttgagggtattactaccagtattggttatgctctagttggtggtgagattattgaatac
tccaacagtggtagtggtactattggtattacttctagaggtgtagataatagtattatt
tctactcataacgctggtgagagagtattcaagtatgaactcagtggtgtatcactaagg
cgtatcaatagggaacatttgattcctaatgatagtctcttaggtaatactagagagatt
aataacttacccatacagattagtagaagtccaagagtatctggtagagatcaattgagc
ttcaatcaggaacagaccgcaggtggagcatttggtagatcctctcaaaactatgagtat
actagaatcctacccaatctagcagcctttggtttcggtgattctactagtattagatcc
gtagcaagaaccatatcaggtacaagtgctggtggttctgaagtatctttcctagatcag
ggaagtatacctgtgaatctaaacacctggaacactttccccagtgtgagaatggttgct
tctcaggtcaatgagattgaatatctacaagatcttcctagacagaagtcgtttacacta
gggttgacactaaccagtacagatcccaacctctctccagtagttgatcttcaacaggtt
agtttgattacctctagaaactccctaaacaaaccaatcaccaactacgcagatgattca
agagttaacttactagtaggtgatcctcacgcttctatctatgtttcacaggtgatcaac
ttagaaacaccagctacctcacttgaggtcatcattagtgcttatcgtgatgtatcagct
gacttccgtgttctctataggttgtatggtcccaactccaataactccacagaaccaact
tgggagttattccctggttacaccaacatgctagatactactggtgatggtgttggtaat
agaattattgatccttccaagaacaatggtttaccaaatgcaagagttagggatagtaac
attggtgaagttctagagtatggttaccacgtagatgagttatctgagttttctggtttc
caacttaagattgtctttagtggaaccaatgaagcaagaccaccactatttaccgatatt
agagcaatcgcgttggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
