Viruses: 77941085
Help
Entry
77941085 CDS
T40000
Symbol
PQB31_gp47
Name
(RefSeq) Streptococcus phage IPP52; minor structural protein
Virus
1916190
Streptococcus phage IPP52
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Collagen
BppU-like_C
Prophage_tail
CBM_4_9
DUF642
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
77941085
NCBI-ProteinID:
YP_010665025
RS:
NC_070929
LinkDB
All DBs
Position
NC_070929:29014..32670
Genome browser
AA seq
1218 aa
AA seq
DB search
MLLTIHDANLQKVAFVDNDKQGTLNYYDDTWTRSLPTGSSTFEFTVFKKSIKSDNALQKA
YSYLNERAWVSFKYHGKSFLFNVMQVEEDEQTIKCYCENLNLELINEIANPYKANKAMSF
AEYCEVMDLLNHTRLSIGINEISDYKRTLEWEGQETKLARLLSLANKFNAEIEFDTQLEA
DSTIKKFSVNIYHENDEKHQGVGRIRSDIQLKYGKNVKSIRRKVDKTGIFNTIRPTGKRR
VKNGKGEEVEEIVTLKGLDAWSVKNDRGIVEFYQRNESLYAPISMQLYPSTFSHGTADDQ
WTRKDFSYDTDDPKELHRLGYNELKKHCYPAITYEVDGFVDADIGDTVKAYDDDFSPFLI
VKARVTDQKISFSNPTNNKTIFSNFKALENQLSDGIQEAFERLFEAAKPYTIKLSTDNGV
IFKNQIGQSLVTPTLYKGGKPVVVGVTWRWALDGEVTTGMTYLVRGSNVTDTVTLTVAAY
IGNKEVAVDEISLVNVADGKLGTPGTPGRDGRTPYVHTAWANNATGTDGFSLDSSINKLY
IGIYTDFEPNDSTDPKKYKWAKVKGDKGEKGDKGEPGQRGLDGLQGARGEQGLPGRNGAD
GRTQYTHIAYSNSADGTKDFSVSASDRAYIGMYVDFNSADSNTPSDYNWTLVKGADGANG
VAGRAGTDGRTPYLHIAYATSNNGSQGFSTTDSTNKTYIGTYTDYTQADSTDPKKYKWAK
VKGDKGEKGDKGERGLQGLQGLQGARGEQGIPGPRGADGRTQYTHMAYADNATGGGFSQT
NTDKAFVGVYIDFNPTDSRNPADYRWTRWKGRDGANGVAGKAGADGRTSYFHIAYAASAD
GSREFSLEDNRQQYMGYYSDFTAADSRDRTKYKWFDRLANVQVGSQNLLRNTATLPIKNG
LDGTWRSTSGGNGVAEPVTLDKYPVPGILKGVRVKNNTNGGNKDLSQIINLVIGQRYTIS
CWARVSSTSDRSTVNLLVRSWTVNDTNRILFKAISNKTWVKYSLSFTADAEKNSIQFGQN
GPGNIEICGMKLELGNVATDWSLSVEDIQSQLDGKADQKLTQQQLTALTEKAQLHDAELK
AKATMEQLSDLEKAYNAFVKSNADSQKKSESDLVEAGRRIDLLTTQFGGLAELKTFIDTY
MKSTNEGLIIGKNDASSTIKVSSDRISMFSAGKEVMYISQGVINIDNGIFTASIQIGRFR
TEQYHLNKDVNVIRYIGG
NT seq
3657 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttttaacaattcatgatgcaaacttacaaaaggtggcatttgttgacaatgataaa
caaggcacattgaattattatgacgacacatggactagaagtctgcctacaggttcatca
acatttgagtttactgtatttaaaaaatctattaagtcagacaatgcattacaaaaagcc
tattcgtaccttaatgaacgagcctgggtatctttcaaatatcatggtaagagttttctt
tttaacgttatgcaagttgaggaggatgaacagactatcaaatgctattgcgagaacctc
aatcttgagttgataaacgagatagcaaatccttataaagctaataaggcaatgagcttt
gcggaatactgcgaggttatggatttattaaaccatactcgtctttccatcggcattaat
gaaatttcagattacaaacgtactcttgaatgggaggggcaagaaacaaaacttgcccgc
ttgttgagccttgctaacaagttcaatgctgagattgagtttgatacacaattagaagct
gatagcactatcaaaaagtttagtgttaatatctatcatgaaaacgacgaaaaacatcaa
ggtgtaggtcggataagaagtgatatacaactaaaatatggcaagaatgtcaaatcaatc
cgtcgcaaggttgataaaacaggtatttttaatacgattagaccaactggtaaaagacga
gttaagaatggaaaaggcgaagaagtcgaggaaattgtaacattaaaaggcttagatgct
tggtctgttaagaatgatagaggtattgttgaattttatcaacgaaacgagtcactgtat
gcgcctatctcaatgcaactatatccatcaacattctcacatggcacagctgatgatcaa
tggacaagaaaagattttagctacgacactgacgatccaaaagaactacatcgtctgggt
tataacgagcttaaaaaacattgttatccagcaattacttatgaagttgatggttttgtc
gatgctgacattggtgatacagtcaaggcttatgatgatgactttagtcctttcttgatt
gtcaaggcacgagttactgaccagaaaatcagtttttccaatccaacaaacaacaaaaca
atattttcaaactttaaagcccttgaaaatcaattatcagacggcatacaagaggctttt
gagagattatttgaggctgctaagccatatactattaaattatcaacggacaatggtgtt
atctttaaaaatcagatcggccagagtctagtaaccccaaccttatacaagggaggaaaa
ccagtcgttgttggtgttacttggcgatgggcacttgatggagaagtaacaacagggatg
acttacttagttagaggctcaaatgtaactgatacagttactctgacagttgcagcttac
attggaaataaagaggttgctgttgatgagatatcgcttgttaatgttgctgatggaaaa
cttggtacacctggaactccagggcgagatggccgtactccttatgtccatacagcatgg
gctaataatgcaacaggaacagatggatttagtcttgatagctcaatcaataaactctat
attggtatttatacagactttgaaccaaacgatagcacagaccctaaaaaatacaagtgg
gctaaagtaaaaggagacaagggagaaaaaggagataaaggagaaccgggacaacgtggt
ttagatggcttgcaaggtgcaagaggtgaacaaggattacctggtcgcaatggtgcagat
ggccgtactcaatacactcacatagcttacagcaatagcgctgatggaactaaggatttt
tctgtaagcgcctctgatagagcttatatcggtatgtatgttgattttaatagtgctgat
agtaatactccatctgattacaattggacacttgtaaaaggagctgatggcgcaaacggc
gtggcaggtagggctggtacagatggtaggacaccatacttacacatagcttacgccaca
tcaaataatggatcacaaggtttttcaactactgacagtacaaataaaacgtatatcgga
acatacacagattacactcaggcagatagcacagaccctaaaaaatacaagtgggctaaa
gtaaaaggggacaagggagaaaaaggcgataaaggagaacgtggattacaaggtttacaa
ggcttgcaaggcgcacgaggtgaacaaggtattcctggacctagaggggcagatggccgt
acacaatatactcacatggcctatgccgataacgcaacaggtggtggattcagtcaaaca
aacactgacaaagcctttgttggggtgtacattgactttaatccaacagacagcagaaat
cctgctgattatcgctggacaagatggaaaggtcgtgatggcgcaaatggcgtggcaggt
aaggctggtgcagatggtaggacatcctatttccatatagcatacgcagcaagtgcagac
ggatcacgcgaatttagtttagaggataatcgccagcaatatatgggctattattccgat
tttaccgcagcagatagtagagatcgaactaagtataaatggtttgaccgactagctaat
gttcaagtgggttcccagaacttgcttagaaatactgcaactcttcctattaaaaatgga
ttagacggtacctggcggagtacgtcaggtggtaacggagtagcggaacctgttaccttg
gataaatatcctgtacctggaatcctaaaaggtgttcgagttaaaaacaacaccaacggg
ggtaataaggaccttagccagattattaacttagttataggtcaacgttatacaatatcc
tgctgggctcgtgtaagctctacaagtgatcgatctactgtgaacctactagtaaggtcc
tggacagtgaacgatactaataggatactttttaaggctataagtaataagacttgggtt
aagtacagtctttccttcactgcggacgctgagaaaaattcaattcagttcggtcaaaac
ggaccaggtaatattgaaatctgtggaatgaaattagaactcggtaatgtagccactgat
tggtccttatccgtagaagacattcaatctcagttagacggaaaagctgaccaaaagcta
actcaacaacaattgacggccctaactgaaaaggctcagttacacgacgcagagttgaaa
gctaaggctacgatggaacaattaagtgatttagaaaaagcatataatgcctttgtgaaa
tcaaatgcagatagtcaaaaaaaatctgagtctgatttagttgaagcaggtagaagaatt
gatttgctgacgacacaatttggaggattagcagagcttaaaacattcattgatacttac
atgaaaagcacaaatgagggcttgattataggtaagaatgatgcaagctctactattaag
gtatcaagtgatagaatatccatgttttctgcaggtaaggaagttatgtacatttcgcaa
ggtgtaataaatattgataatggtatttttactgcatcaattcaaattggacgttttaga
acagaacagtatcatcttaacaaagatgtgaatgtcatacgatatataggaggttaa
DBGET
integrated database retrieval system